EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-20284 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:52405780-52407510 
Target genes
Number: 55             
NameEnsembl ID
Josd2ENSMUSG00000038695
Pold1ENSMUSG00000038644
Nr1h2ENSMUSG00000060601
Vrk3ENSMUSG00000002205
Nup62ENSMUSG00000043858
Il4i1ENSMUSG00000074141
Atf5ENSMUSG00000038539
Akt1s1ENSMUSG00000011096
Tbc1d17ENSMUSG00000038520
PnkpENSMUSG00000002963
Ptov1ENSMUSG00000038502
Med25ENSMUSG00000002968
FuzENSMUSG00000011658
Ap2a1ENSMUSG00000060279
Cpt1cENSMUSG00000007783
Prmt1ENSMUSG00000052429
Gm15545ENSMUSG00000087138
Irf3ENSMUSG00000003184
Bcl2l12ENSMUSG00000003190
Scaf1ENSMUSG00000038406
RrasENSMUSG00000038387
Prr12ENSMUSG00000046574
NosipENSMUSG00000003421
Prrg2ENSMUSG00000007837
Rcn3ENSMUSG00000019539
Rps11ENSMUSG00000003429
Rpl13aENSMUSG00000074129
Flt3lENSMUSG00000089989
Pih1d1ENSMUSG00000003423
Aldh16a1ENSMUSG00000007833
Slc17a7ENSMUSG00000070570
Ccdc155ENSMUSG00000038292
Dkkl1ENSMUSG00000030792
Tead2ENSMUSG00000030796
Cd37ENSMUSG00000030798
Rpl14ENSMUSG00000046721
Trpm4ENSMUSG00000038260
Ppfia3ENSMUSG00000003863
Lin7bENSMUSG00000003872
SNORA67ENSMUSG00000084519
Snrnp70ENSMUSG00000063511
Ntf5ENSMUSG00000074121
Gys1ENSMUSG00000003865
Ruvbl2ENSMUSG00000003868
AC151602.1ENSMUSG00000076036
Ftl1ENSMUSG00000050708
BaxENSMUSG00000003873
Tulp2ENSMUSG00000023467
DhdhENSMUSG00000011382
Nucb1ENSMUSG00000030824
Bcat2ENSMUSG00000030826
0610005C13RikENSMUSG00000085214
Sphk2ENSMUSG00000057342
Cyth2ENSMUSG00000003269
Grwd1ENSMUSG00000053801
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA5MA0766.2chr7:52406749-52406759TCCTTATCTG-6.02
Gata1MA0035.3chr7:52406749-52406760TCCTTATCTGT+6.14
ZNF143MA0088.2chr7:52406096-52406112AGGTGCATGGTGGGAA-6.56
ZNF263MA0528.1chr7:52406234-52406255GAAGGTGGAGGAGGAGGAAAG+7.36
Enhancer Sequence
CACCCCCAGA AGGGAAGGAA TCAATATACA TAAACAGCCA GCAGAGCCAC TTCAACTCCT 60
TCTGTGAGCT TGACCCCTGC TTCATGCTGC TTTCTCTTCC TCCTTACATT TCCTGCTGTT 120
CTGAAATCCA ACACCTACCT TCCACTTTCT GATGTTTTTC CCTTACCCTG ACAACTGGGC 180
CTTTTTCATT CTTTACTTTT TTTTTCCTTA AAGCAAAATG GGCTCAGTGC GTCCCGTGTG 240
TCTGTAATTC GGACACTTGA GATGGAGAAG CAGGAGAGCA CTATGATTTA GAGGGCAGCC 300
TAGGCTACGT GAGACAAGGT GCATGGTGGG AAAATGGCTC AGTCAGCAAA GCACGTGCCT 360
TGCAATGATG AGAACCTGAA TTCAATCCCC AGGATCCGTG GGGAATCCCA GGAAGAGTGG 420
ATCAAGGCAC ACACGTCTAC CATCCCAGTG TTAGGAAGGT GGAGGAGGAG GAAAGAACAG 480
CTAGCCTTGC CTACATGGGC AATTCCAGCC TAGTGAGAGG GCAAGTCAAA AGGAGGAAGG 540
CCAAGAGCTG ACTCCAGAGC TAAGGGCTCC TGCAGGCTAC ATGTTTGGTT TTCAGACAGC 600
TCACAGCCAC CTGCAGCTCC AGTTCCTGGA ACACACATAG CGTGTGCGCA TGCATACACA 660
CAGACACAGT AGTCTTACAG AACAAGGGGT GCACGTGGGA GGCAGGTAAA CTGCTTGTGA 720
GTTCAGGTCA GACTGTCTAC GTGGAACATT CCAGGCCAGC CAGGAAGGAC TACATAGAGA 780
AACCCTGTCC CAAAATGCAA ACAAAACAAA CAAAAAAGAA CCAAATCTTT TAAAAAGAAA 840
AGAGAAATTG TCATGCAAAT GTTCCAAACT GGAACAGAGC CATCGTGAAG TGGGGCCATG 900
TGAACATGAA CCGGGAACTA AGCACTGTGA CTGACAGTTA GTGCTATGGC AGTGTTGGTT 960
GTATAACAAT CCTTATCTGT TAGAAATAAG GACTCAAATA TTTATGTGAA AGTAGCACAA 1020
CAGCCGGCAC TGTATAAACG ACTCTCGAGA GAAAGGGAGA AAGCGCCGCC AACACTGGCC 1080
TGCCCTCACA GAGCTGTTGA AGCTCAGTGA TGGATGCATG GGAGTTCCTA ACATCAACTG 1140
CTGTGGAAAA GACGGAAAAC AAACTCCCAC AAGAATGTCA ACGGGGTCCT GGCAGGCCAC 1200
GGGCCTATTG GACACCAAGA GCTTTCCCAA AGTAGCCAAG ACAATTGGTT CCAGATGAAT 1260
TCTGTCAGGG AACTGGAGCC AAACGGTCGC CAAACTTTGG AATTTTATTT TCAAGAGAAA 1320
TTGGTATCCA GGATGTTTAG ATGGAATTAA TTGTACAATA AAATGACTTT TCCAAAACAA 1380
AGCTCAAGCC AAAGAAAACA AACATGTTTT CTGGTTGAGG TGCCCATAGA GTGTAAACCT 1440
GAGACCTTTG TTGGAGTAAT GGGGGCAACT GATTGGTGGG GGGCACACCA GAATCCAAGG 1500
CGTGGTGACA GGCCCAGCTC TTTCATTTTT TGAGACTGCT TAGCTGATTT GGAACTTGTA 1560
ACTCTCCTGC CTTGGCCTTC CACATGCTGG GATTACTGGT TTGCCCACCA TATCCAAACT 1620
CCTTTAAGCT CTGTGTACTA TGGACAAAAT TACTTCCCTC ATTAGCCTTG TGTTCTGTCA 1680
CTAAAAGAAC AGAAATAATC CCCTCTCTGA CGTTCTGAGG ATTAAGTAAA 1730