EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-20089 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:29735520-29739390 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARAMA0729.1chr7:29736096-29736114ACTTGAACTTATGATCCT-6.04
ZNF740MA0753.2chr7:29737753-29737766GGGGGGGGGGTGG-6.44
ZNF740MA0753.2chr7:29738473-29738486GTGGGGGGGGGGG-6.92
Number of super-enhancer constituents: 15             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02671chr7:29714023-29737629HFSCs
mSE_02941chr7:29685677-29757914TACs
mSE_04790chr7:29736286-29739458E14.5_Heart
mSE_05577chr7:29736456-29739386E14.5_Limb
mSE_06621chr7:29736323-29738947Heart
mSE_07138chr7:29733550-29738112Intestine
mSE_07138chr7:29738371-29739397Intestine
mSE_07958chr7:29735342-29739481Kidney
mSE_08513chr7:29737032-29738188Liver
mSE_08981chr7:29736403-29737999Lung
mSE_09360chr7:29727482-29739485MEF
mSE_10047chr7:29737800-29738345Embryonic_stem_cells
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mSE_10783chr7:29738416-29739473Olfactory_bulb
mSE_11204chr7:29733991-29736231Placenta
Enhancer Sequence
ATGGGAAGGG TGTTGGACCT GACCGCGTGA TAAAAGTTCG GTGCAGTCAT ACCACAAAGC 60
ATGAGCATAC AGTGCTGTAA AACTCCAGAC TCCAAAGTCA CCCAAGCTTT AATCAGACAC 120
AGGTGCGTAC CGCATTGACG ATCACAGAGA TAATTGAAGC CTTTGTCTGC TTTACTGTAG 180
TGCAGTTTGG GGGTTCCCAC TTTAGAAGTC AGTTCTGGTT TGGCTTGTCC AAGGAGCCCA 240
GGAGGAAAAG GCTGCAATGT CCAGGTTCCT CACCACGTTA TCAGCACTTG AGGAGACAAA 300
GCTCTGAGAT CCCTGAGCCA GGTGGACTCT GACACCTTCC CCACTGTAGG GAACAGCTAA 360
GCCACCACTG GAGGAAAGCT TCAACCTTCC CTCCAGCTCC AGAGCTATTC CCAATCTCCA 420
GGCTATGGTA GAGCTTAGGA ACAAGAGCAT AAACCAGAGA GCCATACCTT TGCTCGACTC 480
TGGCCTGTAT CAGTTTACCT CATGGCTACA TTGATTATTT GAGCTAAACA CAATCATTTT 540
CATTTCCTTT TTTGAGACAG TCTGTCTCTC TTGCTCACTT GAACTTATGA TCCTTCTGTC 600
TCAAACCCCT TGATTAAAGA TGGGTGTTAT TCAACCCAGT CCCTGGTTCC ATTGCATGTA 660
CTATGAGGTT AAAATCTACT TCAGAGGATT ATGTGCTGAC AGTCCACAAT ATACCAGAGT 720
AAATTGCTAG CTGACATTAG TTTATAGCAC AGAACCCAAG CTATCTGGTT TACTGTGTGT 780
GTCCACACTA ACCTTTGCAG GCACATGTAG AGGCCAGAGG CTGACACTAT CATGTCTTCC 840
TCTATTGCTT CTCTGCCTGT TTTCCTGAAG AGTATATATG TGAACCTCAT CCATCTGAGT 900
GCCCAGAGGT CAGAAGAGGG TATTAAATTT CATGGAACTG GAGTTATAGG CCAGTTTGAA 960
CTGCCTAGTA AATACTAGGA ATCAAACCCT AGTCCTCTAC AAGAGTACAG GCTCTTAACC 1020
AAGGTTATGT CTCTAGCCTT ATTTTTGAGA CAGGCTCTCT CGCTAAGTTG GAAGTCGCTG 1080
CCCTGACTAC ACTGGCTGGC CAGCAAGCCC TCCAAATCTG CCTGTCTTCC TGCACATATG 1140
TACCTTGTGG TTCCAGACAC GTGTTGCCAT GGCTGGCTTT TACATGTGCT AGGGACCCTA 1200
GATCAGGTCC TGGGCAGCAA GCACTTTGCT CACTGAACCA TATCCCCAGG CCCCTAGCTT 1260
CCTTATGTAC ATGTGTGGTG TCCCTGTCCC CACCAACCTC CAAGGCAACT GAGAACATAT 1320
AGAATGAGAT GGAAGAAGGC CTGCATCTTT TTAGTCCTCC AACTTCCTTA GTTTAGTGGT 1380
CACACACCAA TCCCAAAACA GTCCCCAGAG GCCCTGAACT CTTGACAAAA CTGAACCCAC 1440
TAGAGCCTGA ACTGCCACTC CTCAGAAATC TCATTTTCCA ACTATGCTTG GAATGTTTGA 1500
TAGGAACAGA AATTTATTTT TAGGCAAGAA AAGTTGTCTC CTAAGCTAAC CCTACAGTCT 1560
TAGTGCTAGC AGGCCGTATT TGGCAAGGGT TGGCTTGGGC TTGTTTATCA AAAGGCCCAG 1620
AATTTTCTTA AGTCTACGGT AGCTGCTCAG GGAATACAGT GGCCTGTGGG TTTTCTATCC 1680
CACTGAGTCT TGTGGTACTC CTGTGTTGCA GTAGAATCCA ACTGACCATT CCACATCTTC 1740
CCCAGCTTGG GGCCAAGATT CATTAACCAG GCATCCAGAA AGTGTTCAGA GTTATCAGTG 1800
TACTGGATTT TCTTCCCTCA GTTGACCCCA TCACTGGGTT ATAAAAGCTG GGCATGATGG 1860
TCTATAATAC CAGCTGAGAC AGAAGGATGA CAAGTTTTAG AGGCCAGGCT TGACTATGTG 1920
GTACCTGGCC AGTCAGGGTT TTGTACTAGC GGCTTCCTCA AAGTGAGGAG AGGTTGGCAT 1980
GCTAGGGATG TGGCACAGGG GCCGTCTGCA GAACAACCAA AGGCCCTGGA CCTAATTTCT 2040
AATATCAAAA AAAAAGTTTT AAGAAGTGGC CAAGGCAGGT GAGTGTGTTG GGGGTTGGGT 2100
ATGTGCCCAC ACACCTTTAA TCCCAAACAC TTGGAAAGTA TGGCCACAGA CAGATCTGAG 2160
CTCTGCGTCA GCCTGATCCA CATAATGAGT TCCAAGTTAG TTAGTACTAC ACAGTAAGAC 2220
CCTGTCTGAA AAGGGGGGGG GGGTGGTGAC TAAGAAGTCC CTCCACTCAC TGGTGTGTCT 2280
ATTTCCTGAC CACCCCACCA AGAACCATAG GAATGGGTGA CTAAAGCCAA CATCTCTGAA 2340
AAAGACATCT TGATACAGGC CGTTCTGTTT TACAGAAAGT CAAATCTACC ACAGTCTTGG 2400
CAGCACAGCT CAAATGATCC AAAAAAAAAA AAAAAAAAAA AGTAACTGCC TCACAACCCC 2460
AGCGATGTTT ACCGTCTGGA TACCTTCCAG GACTTGAAAA TCTGAATCAT GACTGCTTCA 2520
CAGACAGCCT GCAAGAAGGG CCAATTCATC AGACTGCCCT TGAACCAGCC TGGCAAGTCA 2580
CTGCTTCCAG ACATTTTGAA TTTTGAAACT GGGTTTACTT CATAGGCCCA AACTAGAAGA 2640
TTATGTTAAG TCTTAAAGTT AAAAAAAGAA AGGACAAAAA GAACAAAGAA ACCCCAGCCT 2700
TTCCCAAAGC AAGCCATGTC GGCACCAGCC AGGGCCACAC TTCTCACAAG GATTTTAGTT 2760
TCATCAGGAA TTTAATGAGC CATGTATCTT AAAGGAAAGG TTGGGGGTGT TCTCAGAGCT 2820
GGAAAGATGT GGATTTTTAA AAAGTTTTTA TTTTTTAATA GTGCTCTTTA TTTGCTCTTG 2880
GGGTCTGATG AGAACTTTAG AATTTTAAAT TTGTGTTTGT AAAAAACAGG CAAAAGATGA 2940
AGACACACAT GGAGTGGGGG GGGGGGGTGT TTAGTAGCTC AGGGGTAAAG CTGTTCCTTA 3000
ACACATGTGA GGTCCTGGGT TTGACCCCCA GCACTGAGAC AATAAAAGGC CACATAGCTG 3060
AAATTCCAAC TCTAAAAGCC TAGAGAAAAA GACCCTAGAG TGGCTACAAA GGCACCAGCT 3120
GCTGTGCATA TCCCTTATCA ATAAAGTAGG CTGGCCCAAC TTCTCTTCTT GTCAGGGAAC 3180
ACAGCCACTC ATACCCTTCT GGGCATGGCC ACTGTGCAAG ACATGTGGGC ATTTTCCTGT 3240
AAGACCACCT GGCAGCAGCT TTTCTGCCCA GGGGCCCCTG GATTGGGTGC AGCACTCCCC 3300
TAAATAGTAA GCAGACTGTG TTTCCATGGT GAGAGCAATT AAATACCTTC TATTCACGCC 3360
AGAGTTAGTC AGACAAGAGT GCTAATGTGC TAATCTAATC TACACACACA CACACACACA 3420
CAGAGAGAGA GACAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGACAGAGA CAGAGAGACA GAGAGACAGA 3480
CAGAGGCAAA GAGAGGCAGA GAGACAGCAC CAGTGTCCTG ATGCTGCTGA CTGAAGCCAG 3540
TTTCCAGGAC TGGCTTTGTT TGGCCTTTAG TGATCAAAGG CCTGTCATTC GGATACCTGA 3600
ACAGAAGACC CACAACTCCT CTTCCTGCCT GAGATACTCC CTCAAGCAAC CCTGTCAGGT 3660
CATCCTTTTG TCCTTCCCCA CCCCCTGGAT GCTGAATCAT TTGCAAGCTT CCTTCCATAA 3720
GGCAGTTTAA CCTCAAATTG GCTTCCTCTA CTATAGTGGG GAGTCAGGGA CATAGCATTT 3780
CACTTGTTGC TGTACCTCAC TCTGGAGTGC TGTTAGAGAC ATTCTTAAAA CTGCACTTAA 3840
AACTAGAGAT AGCTCAGTGG TTAAGAGCAC 3870