EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-19892 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr7:6812570-6815060 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Ascl2MA0816.1chr7:6813486-6813496AGCAGCTGCT+6.02
Ascl2MA0816.1chr7:6813486-6813496AGCAGCTGCT-6.02
EWSR1-FLI1MA0149.1chr7:6812683-6812701GAAAAGAAAGAAGGAAGG+6.84
EWSR1-FLI1MA0149.1chr7:6812687-6812705AGAAAGAAGGAAGGAAAG+7.22
EWSR1-FLI1MA0149.1chr7:6812695-6812713GGAAGGAAAGAAGGAATT+7.24
EWSR1-FLI1MA0149.1chr7:6812691-6812709AGAAGGAAGGAAAGAAGG+7.68
RFX3MA0798.1chr7:6813616-6813632GGTTGCCTTGGAAACA-6.11
RFX3MA0798.1chr7:6813616-6813632GGTTGCCTTGGAAACA+6.21
RFX5MA0510.2chr7:6813616-6813632GGTTGCCTTGGAAACA-6.1
RFX5MA0510.2chr7:6813616-6813632GGTTGCCTTGGAAACA+6.24
RREB1MA0073.1chr7:6813513-6813533ACCCTCCCCAACCCCCACCA+6.02
SP2MA0516.2chr7:6813272-6813289CTCAGCCCCCCCCCCCC+6.07
ZNF263MA0528.1chr7:6812747-6812768TGCCCCCCCCCCCCCGCCTCC-6.42
ZNF263MA0528.1chr7:6812750-6812771CCCCCCCCCCCCGCCTCCTCC-8.87
ZNF740MA0753.2chr7:6812749-6812762CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr7:6812746-6812759CTGCCCCCCCCCC+6.33
Enhancer Sequence
ACACACATGC TCACACACAT ACTCTCACAC ATACACTCAC ACACGTTACA CACGTGCTCA 60
CATGCACCTA CACACACAAG TACACGGGAA AGTACATATA TATATATACA CTTGAAAAGA 120
AAGAAGGAAG GAAAGAAGGA ATTATTTAAC TTAAAAGGCA TGCTGGTTTC TCCACCCTGC 180
CCCCCCCCCC CCGCCTCCTC CTGGCAGCTG CCAGGATTTT CAACACCCCC CCCCTTTTTT 240
TCATTCACAT TTTAAGAAAA TTGTCCTTGA GCTTCCTTAT GAATCTGCTT TTAAGTTCTT 300
TCACTGATGA GGCTAAGAAC CAAGAGGTAT CCTTTGATTT CCCAGAATTC CACCTGGGAA 360
GTGTGAACTC CTAGCTTAAA TACGACTACA AGTGGGGCTT TGGGAGCTAG GGAATGACTT 420
GCTGCCCAAG CACAAGGACC TGAGTTTGAT CCCCAGCACC TAAAGCCATG TGTTGTACCA 480
GGGAGGTAGA GGCAGGCAGA TCCCTGGCGC AATAAGAGAG CCAGTCTCAA CAATCAAGAT 540
GCAAGCCAGC GAGAAGGCTC AGCAGGTAGA AGGAAGGACT TGCAGCCAAA CCCAAAGACA 600
TGAGTTTGGT ATCTCAGTCC CAAATGGCGA CAGGAAAAAA CTAACTTTGG AAAGCTTTCC 660
TTTGACCTCA ACATTTGTGT TGTGGGGCCC CTCCCCTCAC CTCTCAGCCC CCCCCCCCCG 720
TTCCCACCTC CACACACACA GACAGTAAAT ACTTTTTTTT TTCAAAGATG GATAGGAGAT 780
ACCAACATTA TCATCTGGAC ACGTAAGCAT ACATTTTGTC CCCAGCTCTG ACTGAAAGAA 840
AAACAAAAAG TTAAAGTTTA AAATTGCAAG TGATGCATAG TTGGCCATGA TAAGGAAACT 900
ATGGAGACAG AACGGGAGCA GCTGCTGGGA GGTCTGCACT CCCACCCTCC CCAACCCCCA 960
CCAGAGCTAG TCTGACGTCA ATAGATGTTT GTTCCCACTT AGGAACATTT ACCTGCCGGT 1020
GAGACACTCA TTGGTCTAGC TTAGGCGGTT GCCTTGGAAA CAGCAGCACT ATTGGGAAAG 1080
AGGAGGGGGT CTGCAAGGGA GCCGGAAGGG CCTCTGAGGT TGGAATTTTC CAGGCGCTGA 1140
ACTGTTACTG ATGTTTGCTT TGTAATCAAT GAATACCCCC AGTAATTCTA TTGATCCTTC 1200
CTCAGTGAGG AAGATTCTCA AAAGAGATGA GCATGAAATA TTCAGCCCAG CCTTAGATTC 1260
CCTTATGAAC CACCATGTTT TACCCATTAG TCCCTTTTGG ATTATCACCT ACCTGTGCAG 1320
CTTATCACAT AGGTTTTTTT GTTTTTTGTT TTTTGGTTTT TTTTTTTTTG GTGGTGGTGG 1380
GGTTGTTTGT TGGATGTTAA GTCTTTTACG AATTTATTTT ATTTTTAATT ATATTTATTG 1440
TCCTAGTTCT GTTTCTGTGA TGAATACTCT GATAGAAAAA ACAAGTTAGA GAGGAAGCCT 1500
AGGGGGCCTC GTCTCTGCTT ATGCCTACAG GTTCCAGTTT ATCACCGAGG GAGGGCAAGC 1560
CGTCCGTGAC ACCCACGGTT AGGAGCAGAC AGGAGTGTAT GCATCCATGC TGCCCGCTGC 1620
TTTCATCCAG CTTCTTCCAT TCTCACACAG TTCAGGATTT CCTGCCTAGG GATTGCTTTC 1680
TTTGAGTGAA AAGAAATAAA ATCTGACTTC TCAGTATGTT TTTTATGTCA CTGATATTTG 1740
AGTCAAATAT AATTTGGGCC TAATTGCTTA AGAGTTGATC CATTTAGCTG TAATTCTAGC 1800
TGTGGGTCAA AACATATTTA AAGGAAGGGG GATTAGAGCC GAAGAGATGG TTTAATCAGT 1860
TAACTATTTG TCATACAAAT AGGAAGACCT CAGATTCATC CCCAGCATCA CATCACCACC 1920
ACCACCACCA CCACCACCAC CATCATCATC ATCATTTTAA AGCTACACGT GGTGGCACAT 1980
GCTTGCAGTC TGAGTTCGGG GAAGGTGGAG ACTGGTGCAT CCATAGGACT TCTAGCAAGC 2040
CAACCTAGGC TACTTGAGTG AGCTCCAGGC TAGTGAGAAA CCTAAACAAA GCCAAAGTTG 2100
GGGCTGGAGA GATGGCTCAG CACTCAAGAA AGCTTAATTC TCTCGTGGAG GACCCGAGTT 2160
GTGTTGCAAT GGACAATCGC CAAAATCAGA CACTCATAAA CGCCTGGAAC TCCAGCTCTG 2220
GGGACCTGAG TTCATCAGGC CTGGTGGCCT CCTTACTTGC TGGCCCTCAT TGTCTTATTT 2280
TAATGCTGCT CCAGCAAGCC TTTAGAGAAG GCCACTCTCA CTGTTTGATT GTGTGCTCAC 2340
ACCGCAATCC CACTCCAATC CTTGCAAGGC TCCTGTGTGG AGCACCCAGT ACTAAAAACA 2400
AACTAGAGCT CTGGCTGATA ATGTGTGACA TTGCTTTAGA TACGTAAATG ACCCTTGGGC 2460
TTGCCCAAGG CCTGGGAGAA ATGGAATGGT 2490