EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-19613 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr6:125303440-125306840 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gfi1bMA0483.1chr6:125304240-125304251GGCTGTGATTT-6.02
NFYAMA0060.3chr6:125305483-125305494TCTGATTGGTC-6.14
NFYBMA0502.1chr6:125305484-125305499CTGATTGGTCAGTTG-6.56
NR2C2MA0504.1chr6:125305967-125305982GGAGGTCAGAGGTCA+8.03
Nr2f6MA0677.1chr6:125305968-125305982GAGGTCAGAGGTCA+7.42
Nr5a2MA0505.1chr6:125304149-125304164GCTGGCCTTGAACCC-7.23
RXRBMA0855.1chr6:125305968-125305982GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr6:125305968-125305982GAGGTCAGAGGTCA+6.91
RxraMA0512.2chr6:125305968-125305982GAGGTCAGAGGTCA+6.88
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02667chr6:125293650-125306033HFSCs
mSE_03020chr6:125280555-125319373TACs
mSE_07589chr6:125298722-125305926Intestine
mSE_09023chr6:125302643-125306295Lung
Enhancer Sequence
GGAGATTGTA TCTACTCATT TGAAATAACT ATAGCTTCTG ATAAGAGCCC AGAGTAGATA 60
TGGATAGTTC GTGTTATTCA ACCAGAACAG GCGGCTAGGT ATCCGAGGAG CTTGGGTGGG 120
GAGACATGAA TCATCGACGG GGGGCTTCGT GGGTGGAAGG TAGGATTGCG GCAGCGTGGC 180
AGCGCTCTCT GAGGAGGTCA CACCGAAGAG CTCCTCACCA CCGTAGGTCT TGACATTAAG 240
TGGAACACAG TTTAACCTAA TGTGCACGCT GATGTGGGGC TTAGTGAGTG GGTCCCCAAA 300
AGGTGGCTGG GTCAAGTTTG ACCACAGGGT CCATTTCATC TTCGCTCCCC TACTCAGCAG 360
CCCCGGCACA GGAAGTCACA CTTTAAGGCC TCTCTAGGCG GAAGCTGAGG AGTAGTTAGA 420
GAGGCCTTGC CACCTCCTCA GCCATCTCTC CTCTCCTCAG GCACCCCCCA GCATCCTGCC 480
CCTCCTCTGC TCCAGGCATT CAAGTTTGGG CCAGGACCTG TGTCCCTTGT CCCTTGTTGG 540
CCTCACAATG CAACTGGTAA TAGGGTGCCT ATTGAAAGAG CCAGAGGGCC CTGGAATCCC 600
TGGAGCATGT GAGATGAGAG AGCTGGCTCT GCACCTGCTC CTTCTCTTTT GTTACCTTGT 660
TTTTGTTGAG AGTAGACCTG GCTGTCCTAG AACTCACATT GTAGAGCAGG CTGGCCTTGA 720
ACCCAGGGAT CTGCCTGCCT CCACCTCTCA GAGTGCCTGG ATTAATGTCT AGCTTCCTCC 780
ATCTCTTCTA ACCTTAAGAG GGCTGTGATT TTTGTTCCAT AGCTACTTGA CCTGGGGAGA 840
ACTGGCCCTG TCTCTTAAAG GTTGTCTAGG GAGCATCCAA ACCCAATGCA AGTGGCCAGA 900
ACCAGGCAGG CTATGGGAAT GTGGTGAACT AGGGCGGGAG GGCACCCTGG ATTTGATTCT 960
TGTTGGGATT GGGGAGTGTC AGGGGCTGCC AAAGGCCCAG GGAGCCAGGG AGCAGGGATC 1020
CTGGGAAAGG CTTTATCAGC TGAAGACGAT GTTGTTTCCC TTTGAGGAGG GATCAAGGCA 1080
GCTCCAAGTC CAAAGGAAGG ATGTCAGAGA TGGAGGAGGT AGATCCTCTG GGAGGAGCTT 1140
ACTGGCCTGA CAGGGAAGCC AGGGGTCAGA AAGACTTCCC TTTGGGATGG GATGGAAGAG 1200
GGAGGCATTT TCCCGAAATC TGAGCCCAGT GGGACAGGGG TTCATTGCCT GGACGAATGG 1260
TCTGAGTGGG GGTGGGTGAG AGAGAGAGAG AGACTGTGCA CCCAGGAGGG AGCAGATGGG 1320
GTTCCACTTG CTGCTGGTTG GCTTTTCTGC TGATTCACAG CCCTTGTTGA GCCGGGAAGC 1380
TGCAGTTCCC TGTCCACTGT CCTAGATCTC CCTCCCTGGC CTGAGTCACT GGGGCGGAGC 1440
TGCTGGGAAA AGATTTCCCT TTCCCGGATT TGACTTAACC CCCAGAGTTC TGCAAAGGAA 1500
GGACACGTGA CCAAAGAAAC AGGCTCCTTC TCTGGAGGCT CGTCCATCGC TGGTTGAGAC 1560
TCGCCCCCAC CCCCACCCCC GCAAGGCCGT TCTTGGCCTG GAGCCCACAT CTACCTCTTC 1620
CTGACACTGC CTGATCTGTT GGTTTGGCTT CAGGTTCTCT GATGGGGTTG GAAGTACCAC 1680
TGACCTTAGG TGCTCCAAGC ATTTCTTCTT CGGGGAAAGG AACCACACTT TCATGATTGG 1740
GAAGTTCTTA TCATAACTAA CCCTTCCTGT CACCCTGGAA GCCTCTGTGT GTCGTGAGGG 1800
GTGGGGGTGC ACCCCTGCCT GAGAGATTGC TGGTGTGCTT TCTGTGTGTG GCTTCTTGGG 1860
TCTATGGCTG AGGCAAGGGG CTTCCTGGCC CGTGCAGCTG CTGTGCCGAG GAGGTAGCAC 1920
TTCTAGTAAC AGCAGCTGAC AGCAGGGTGC AAGCTGCCAG CCTCTTTCCA AACGGAGCTT 1980
TGGGGGTTGC AGAGCCCCCA AAGGCAGCTG TGAGTCTAGG TGTTAGGTCT CTCCTGAATG 2040
TGATCTGATT GGTCAGTTGC TTCTGCATCT GTCTTGAAGA CCTCCGCTAT CTTGACGTAA 2100
CAACGCTATG CGAGGGGGGG AGGGGAGATG AAAGAAGGAA GGCTGAGGGA AACCCAAAAC 2160
CGGGAGAGAT CAAAGAGCAA GGTCTACATT GAAACTAAGA GGGCTTTGCG CTCTCCATAC 2220
TGAAGCTGTT TACATACAAG AAAGCCAGTT GGTTGCTATG AGCTTTGCCA AGATTATAAA 2280
GCCAGCCCTC TAGAATGCCC TGCTTTGGGA CTCCTGGCAC ATCCTCAGCT CCTGAATTGA 2340
GGGTCATCTT GAATCAGATC ACCAATCTCT GGTCAACTCT AGTACATGAC ACATTTGTCT 2400
TTGGTCTTAC TTAATCCTTG TCGCGCCTGC ATGCTCGGAG TTCTTCCTTT TGTTTCTGTC 2460
CCGCAATGGT GCTTGGGAGA GCATTATCCC CAGGTGCGCA TTCATATCTG GGTGTTTGAG 2520
TGTGCACGGA GGTCAGAGGT CATCCTCAGG TGTTTGCTTC CCATCAGTTG GACTAGGTTG 2580
CTTAGACAGA GATCATCAGG GGCCTACCTG GTGGGCTCCC CTCCATCACC GGGAATACAA 2640
GCCCGTACCT GGCTTTTTAT GTAGGTGATG GTGCTCGATG TCAGGTCCTC ACGTCGCACA 2700
GCTGACACTT TCCTGAACCA TCTTCATGAC AGCCCTCCCT TCAACTTGAT TTCCCCCCCC 2760
CAGTAGTACT TTTTGAATTA CTGTCATGGA ATCCAAAGAG GTTTGTAGAT CCTAATGGCT 2820
CACCTCTAGG AAGTGTCCAC AAACAGGCTT AGTGTGAAAC CCGTACCCAG ATATAGAAAT 2880
GCCAAATGAG TAGTAGGATT GATTGTCTGT TGGAAAAACA GGCTGTAACG GAAACAGCCT 2940
GCTACTTCTG GCTAACATTT CTTGGTCGGG CAGAGGGCAT TGCAGTGCTT CTGTGTGAGA 3000
CCTGGAGCTC CACCCTCAGC CCTGCAGACA CACGGGGAAA CTAAACATTC CTTGACCGGC 3060
TCTCTTGTGA TCAGCACTGG GAGCCGCTTC AGGGAACTGA ACGGGATAAA ATGCAGCTGG 3120
GGCCTGAGAC CTAATTGCTC AGTTGTAGAA ACAAATGCTA GCATACAGAG CCACCAGAGA 3180
CCAAGAAAAT ACTAGACTGC ACAGTCGCCA CCATCTAGGG GAGAGTGTCC CTAGGGGGTG 3240
GGGGGAATGT GAACTTGTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTGT 3300
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTCAA TTTGTTGCTA CCTCTAAGGC 3360
CCCACCCCTG ACAGTATTTC CTCTTTCTGA TTGTTCCCTC 3400