EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-19453 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr6:114831460-114835490 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARAMA0729.1chr6:114834629-114834647GAGGACACAAGGTCATGC+6.15
Sox3MA0514.1chr6:114833450-114833460CCTTTGTTTT+6.02
mix-aMA0621.1chr6:114834071-114834082CCTAATTAATT-6.32
Number of super-enhancer constituents: 14             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02801chr6:114823687-114843363HFSCs
mSE_03012chr6:114822880-114866200TACs
mSE_04097chr6:114831305-114834204Cortex
mSE_04484chr6:114831615-114834437E14.5_Brain
mSE_04929chr6:114831948-114834647E14.5_Heart
mSE_05556chr6:114832029-114834742E14.5_Limb
mSE_06862chr6:114832188-114834204Heart
mSE_07926chr6:114832145-114834188Intestine
mSE_08000chr6:114831472-114834179Kidney
mSE_08379chr6:114832092-114834078Liver
mSE_09062chr6:114832272-114834055Lung
mSE_09938chr6:114832772-114834331MEF
mSE_10810chr6:114831996-114834185Olfactory_bulb
mSE_12520chr6:114832877-114833939Spleen
Enhancer Sequence
AAGAAAAATC TTGGGAAGAG TGGCTCCCAA GGTAGAAAGG GGAACACAAA AAGAAGGGTC 60
ATAGGAGGAT CAGCCAAAAG AGATTCCTTC TGGAGTCATC ACAACATGGA ATTACAAGTG 120
TCCCCCAAAT CTGCCACCTT GTGGGCAGAG CATCAGGGGG AACCTGGCCC AGCTTCCTCA 180
ATCTCTCGGC CCTCAGTGGA CACCCTGATA GTTCCCTCTG TTAAAGGGGG GCACTCAATA 240
GCCTTGTATC GGGGAATTGA CCAGGTACTT CATTTTCCAA GTTAAGCTTC GAGGGTCTGA 300
AAGTTTACAA TGGAATTCTG AAATCAACTG CTCGTTATGT CGGGCCACAT CTCTGAGAGA 360
AGTTTTGCTC CACAGTGAAT CGACAACAGA TCTAAACAAC ACGTTAAACG ACAGTCCCTG 420
GAGGCCTACG ACCCGTCTGT ACCACCGCTG GCAAGTCATA GACGCTCGCT GTCCTCCTCT 480
GAATCCTCAT ACAGAATGAA GGAACAATGC ACTGTGGTCT CTTCTTCCCA GGGCATTAAC 540
CCCACATGAG CAGGGCTCAC CTCCTAACCT CATCTAACCT TAAGAACTCC AAAGACCTTC 600
GCACTGGAGG AGAGGGGCTT CAACTCGTGG ATTGTGAAGG ACCACAAGCC AGACTACCAC 660
AGGCCCCAGA GCTCTTTCCC TTGGAGAAAC TCTGGGCTGA AAACTATGTC TGACCCAGAA 720
CCTGGAAATT TGCATAGACA TTCCGCCATG TACACCCAGC AGCTCCTCAG ACAACCTCAG 780
CAGTGGCTGA GCCCCTGACT TGCTGATCTA ATGAGAGCCA ACGGACTCCC ACGACACTCA 840
GTGCTGAAAC TGTTCCTGTG ACCATCCATG AGCTCCCACC CTCCCTTCCT TTGCTGGAGA 900
CCACTGCTAT GTAGCCCAGC CTGGCCATGG ACTCTCCAAT CCCCTGTTTC AGCATCCCAC 960
GTGCTGGGTC ATAGGGTATG TACCACTGGG CCTGGCATCC TCGGGCCATC TCTTAGGACT 1020
CCTCAAGGGA GGCAACAAGA AGCCAATCAG CAGGAACAGC AGAGGCCGGG CTTCTCTGCC 1080
AGCCAGGGAG CTGAGGCTCC AGAATTCAGA CCCTCCTGTG GGCAGGCTTG TCTCTGTCAC 1140
CAGACCCCAG GACAGCTTTA AGCTCTTTGA GTATGCTCGG GAGATATTAT AAAAATAAAA 1200
AGTGTTTCGA CCGAACAACA CAGCAAAGCA AGAGACAAGT GCCGTGCTGG TCAAGTGTAA 1260
ACACCAGAGC TGCTCCTGCC TCCTCCTGCA GTGAGGCCCA GCGAGTAGGG AGTAGGAGAT 1320
CTCGGAGGAG GGGAGGCGCC ATCAACCCAC ACCCTGGCCA ACCCCTCAGC AGTGTCTCTA 1380
TCTTTCCTCT TTCCTCAGTT GGATCTTTCA GAGACCTAAG AGAACAGCAC TTTATTTCAG 1440
GACAGGCTGG CTTTGTGTTC CAGCAAGAAG AGTTCTATGA ACTAGGCAAT GCCCAGATTA 1500
ACCATCTGTA GTCCAAACAG CTGCACTCTC TGTCCCCAGC TGAACGCCTT GGGGCCTGGG 1560
CAGGGGACCT TCTAATTTTG AATAAATATC TTTGATGTAA CGCATCAGTC ACTCCTGCTT 1620
TGCTGATTTC GGTGTGACCC TTTAGAACAC GACCCTGCAC ACACTCTCGC TCCTGGTAAG 1680
CCTCCCTTCC CCAAAGTTCT GACCCACTTC TGTAACCCCC AGGACCGATT ACAGCCACAA 1740
AGCTGGCGAG TCCCCACACA GCCAGGATTG CACTTGGTTG ACAGTGCTTT TGTTCTGTCC 1800
CCTGGCTCCT GACACCCTTG GCATTTCTTC ATTTCATGTG TTATTCGTTA TTCAGCCAGA 1860
AAAATGCCAG GAGCAAGATG GTGGCCTGCC TGAGCAGCTC TCTGCAGAGA CTCTTAAGGC 1920
AGAGGCGAGG CCGGCCAGGA AAAGGCTGAC GTCAGCTCTC TGAGAGCAGC TCCCTGCAAG 1980
GATAAGGCGG CCTTTGTTTT CAGCTCAACT GTGAAAATGA GAAAATGCCT CCAGCCTCAC 2040
AAACAAGAAA CCCACACAGC CCAGGTCAGG CCTGTGACCT TTACTTAAAG GTACCACACT 2100
TCATTAGCAG AGGCTGTCGA CAGAACCCAG GAGGTGTGGC CACAACCACC CAGGCCACTG 2160
CTAAAAATCA GCTGTCTGTC CAGCACAGCG CAGGCTAGTT CCCCAGCTCT TACTAAAGTG 2220
TGAAAGGCAC AGTTAACCGC AGGCAAGCCA GCTCCGAGCT CACACTGCTC TGTCAAGAAG 2280
CTTTTCTTTA CAGACATAGG CTCTCTTCTA ATTTCTGCTG GCAAGTCAAT CACGTGTAAG 2340
CCAGAAAGAA GGAAAGAAGA TCCCAGCTTA GCAGTAGCTT GATTTTTGAG TTTCTGCTCA 2400
GGGGAACTAA GATCTTGGCT GTAAAACAGT TCCTTAAACA CCAGAATACC TCCAGGGATA 2460
CTGGGATGAC TGGTGAGCTC CGGGTTCAGG GAGAGACTCT GCCTCAAAAA AAAAAAAAAA 2520
AAAAAAAAAG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGCG CTGGTTTTAT GTCAACTTGA 2580
CACACCCTAG AGCCATCTGA GAAGAGGGAA CCCTAATTAA TTAAGAAAAT GCCTCCAGAT 2640
CACACTCTAC ACAAGCCTGT AGGACATGTT CTTCATTAGT GACTGATATG GGAGGGGCCA 2700
GCCATTGTGG GTGGGGCCAT CATGAGCAGC TGTAACCCCC ACCCCAAAGT ACCAGCAATT 2760
ACATTTTGAT TGTCCTGAAA CGTCAATCTG TCCAAAAGGT ACAACAATAA AGTCTCGTGA 2820
CAGAGCTAAG ACTCAGGCAT GTGCCATAGC TGCCACTGTG AGGCAGCTGC TGGGGGTGGA 2880
AGGTGGGAAA GCCTGCCGTG GCTATCACCA GCCAGAGGTG GACCCTCATA GAGTTACAGA 2940
GGTCCCATGC TGCTCCAGAG GTGGACCCTC ACAGGGTTAC AGAGGTCCCA TGCTGCTCCA 3000
GAGGTGGACC CTCACAGGGT TACAGAGGTC CCATGCTACT CCAGAGGTGG ACCCTCACAG 3060
GGTTACAGAG GTCCCACGCT GCTCCAGAGG TGGACCCTCA CAGGGTTACA GAGGTCCCAT 3120
GCTGCTGTCT TAAAAGGGGG AGAGCAGGAA CATGGATGTC CCAGAACAAG AGGACACAAG 3180
GTCATGCCCA TGATTCGGCA CACGGCTGGT ACCCAGCGCA CTCAATGGCT GCTGTCACAG 3240
AGAAGCCCTC TCTAGCAGCG GCCTCACGCT AAGTGACAGG ATGTCCACAA CCTCTGCAGA 3300
ACACCTCAGC CGACAAGCTG CCCTGGGAAG GCTCCCTGAC TTCCAATCTC AGTTGAGCAA 3360
AGTTAAGGAA GCAACATGTG CCCAACTGCT CAATCTCCGC TCAGCTCGGT CTTAATGTTG 3420
GTCACACACA ACGGGACCAA AGGGACTCAG GAAAACAAGA AGCAGGGTCG CCTCAGGGAA 3480
CAAGTCAGGG TACACAGTGA GCCTATGTGG GACAGTCAGA ACCATGGCTC TGCGAAGCAG 3540
AGGGTGCCAC GGCTCCCCTG CCCCATTAAG CAAACCCACA GAGAAGCACG AACACCATTC 3600
TTGCCAGTGA TCTGCTTCTC CCTTAGACGC GGGGTCCTTC AAACGCTTTC TCCAACCTTC 3660
TCTCACACCA ACGGTCCCAG CTTGGGGTTC ACACGTTCTC CACTCACCCC ATGGAGAGAA 3720
GAGTAAACAC CCAGTGGATC CCAAGGGAAG CAGAGAGAAA AAGAGACAAA AGACCCTCAG 3780
ACTACAAAGT GTGCGAGCTC TGGTCACAAG AACACACCAG GACAGCAGCT CACAGGGGTG 3840
ACAAGGGGCT CAACGAGGCG TTGGCCTCAG CAGGAGCCCC TGGGCTTTGC CTGCTCAGAG 3900
GCTAGAGTGG ATATTTCACA CACATCCCAG TGGTCAAAAT GGGATCCCAC TGCACCTGAG 3960
GCCTACCTGG GTAGAGGTGT CCCACAACCC AACACAGAAG CACACAGAAG TCACTCAGTG 4020
TGTGCCATGT 4030