EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-19197 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr6:90652160-90655050 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr6:90652289-90652307GCAAGGCAGGAAGGCAGG+6.77
EWSR1-FLI1MA0149.1chr6:90652285-90652303GGCAGCAAGGCAGGAAGG+6.93
HNF4GMA0484.1chr6:90652481-90652496TGCCCTTTGGCCTTT-6.04
MEF2AMA0052.3chr6:90653397-90653409GCTATTTTTAGA-6.52
MEF2BMA0660.1chr6:90653397-90653409GCTATTTTTAGA-6.22
MEF2DMA0773.1chr6:90653397-90653409GCTATTTTTAGA-6.14
RARA(var.2)MA0730.1chr6:90654513-90654530AAGTCACACAGAGGTCA+6.19
RREB1MA0073.1chr6:90654897-90654917GCTCTGGGGGTGGGGGGTGG-6.03
Rarb(var.2)MA0858.1chr6:90654513-90654530AAGTCACACAGAGGTCA+6.82
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01042chr6:90648777-90661936Myotubes
mSE_02799chr6:90634249-90658536HFSCs
mSE_04317chr6:90652264-90654884Cortex
mSE_05069chr6:90651696-90658038E14.5_Heart
mSE_06955chr6:90651949-90654903Heart
Enhancer Sequence
GCAGAAACTT CCCCAGCAGG GCTAGATGGA AGTGGAGTGG GGCATCAGGT AGCATCAGAT 60
TTCTGCTTTT ATCCTGTTCC CAAGTTTGCA CTAATGAGGA CACAGAAGAC CCAACAACCC 120
AGCAAGGCAG CAAGGCAGGA AGGCAGGAGC CCTCAGAGGC AGGAGGTGGA GCTATATTCT 180
ACTCCTCCCA CCTCCAGGAG GGCAGCTTAT CCTCTTGGCC ATTCTCTTAC ACACATTTTC 240
CCTTGCCCAT CTGTTGGCAC TTTTAAAGCA GAGCCAGTTC TGACCACTTG GCTGGCCTCC 300
CTGCCACCAA CCAAAGGACA CTGCCCTTTG GCCTTTTAAC ATAGCCTCTC CTGTAGGTCC 360
TTCAGAGCCT CCTATTACCT GACCCCTTCC TATAACAGCA GTGATATAAT CAAAGCATAT 420
CTGCAACCTC ATGGCACCTC ACCTCCCACC CAGGTCTGGG AAATCATGTC ATCACTATGA 480
CCCAGAAGGC TCACAAGATC TAGTCATGCC TCTTGCCCCA TCTCCCCAGG ACCCAAAGGA 540
TCACCAAGCT CAGTTTAATC CCACTAAGTC CTGGCTATTC ATCTACAATC CAGCTCCTAC 600
CCAGGAATCT TTTTATATAC TCTGAATGGC AGCTGCTTGC CCTGGTAGGG TGAGGAGGAG 660
AAATGGGGGT TGGAGGTATA TGTGGGAGAC TGTGGCTAAG AAAGAAAATG AAAGATTGGG 720
TGGGAGTCTA GGTATTGGAC ATCAGGCAGG GCAATGGTTC TGACATCGAC ACAGGGGACA 780
GAGGCAGGAG GAGGGTGTTA GGAGGAGCTG CCAGAAGCAT GGCTCTGAGC AGGGCTGGGC 840
TCCCTTAGGT CTGTCAGCTG CCCACTCCTC CATACCACAA CAATCCACAG CCTGAACCCT 900
GCACTGGGCA GCTCAGGATC ACTTTGGCCC ATGCTTGTGA TACAGAGTGG GGTCTAGGAC 960
TCATGGCTTC TGTGGTCAAA GGCATCCAGT GCACTTGGGA AACCTTGGGA CTACTCTAGC 1020
ACAACCCAAC TACCACCTTC ATGAGGATGC TGGCCTATCT CCAGTTTCAC AGCTTTAATG 1080
ACTTGCTACT GGTCCCAGCT GGAGACAGAT ACACTGCAGC CCTGCTCCAG CCCACAGCGT 1140
GTGGCATTCT CTGACTGCTC ACACCAGACT GCCAGAAGCC ACCTTTATAT ATGTAGAAAA 1200
ATATGGGTCT CCAAACAATG GGCTTTTCAG AGCAGTGGCT ATTTTTAGAG CTCTGCTTAC 1260
CGAACTAACA CTCAGCATTT CCCCAACTTG TCAGCTGCTG CCCAGAACCA GGCAGGCAGC 1320
AGGCGGCAGG AGGAGCAGAG GTCAGGATCT GGGGGCTTCT TGAGCCATTT GGGGGCCATT 1380
CTGGTGTGCA GGCACAGATG TCAGTTTGGG GTTGCCCCAG GCTAACAGGA GGCATGGCTA 1440
GCAGCCTGCC CATGTGCCCC ACCCAGTTCA GCATGGAACC TGCCCTTCTG ACAACTGTTC 1500
CTTTGTCCAC TGTGTTCTGG GTTGGAGTTG TATATCCAGG ATTGAATACC AGCTTTTTCT 1560
GAGCCTCAGT TTCCCTTCCT CATGTGAGGC AATACTGCCC CTCTGTAACA ACACAGAGGA 1620
GTTGGTGAGA GTGTCTGGGA GCCCAGAGGG CAGGCTAAGC AGGAACTGTT TCCTCAGTGA 1680
CCTGGGCAGC TGACCTCACT GTCTGTTCAT CAGTCCATCA CCACAGGGAA GGAAGAAAGG 1740
GCTCCATGTC CCTTGACCCA GACCCCGCAG CTAGGCTCTC ACAGTGTCCT GTCCTGTCAA 1800
CAACATGTTC TAGAAGGCTG GTCATCCTTC CGGCCTCTGA GCCAGCCCTC CCTCCCACTG 1860
TAGGCAGGAG TGGTGGGTAC ATGGGGTGGG ACAGTGAGGC AGAGTGGACT GTCCCCTGGC 1920
TCTGATTGAG TGGCTTGCTC CCATAGAGCT CTGAGGATCA ACCTAGGCTT TGAGCCAGCC 1980
CCAGACAATG AAACCATCTA CAACCCCATC AAAAGGAACA CAAGGGTCTG GCTATGCACA 2040
AACAGTCCCT AACCCAGGGA GAGGGAAGGT CTGGCACCCA TGTGAACAAT GCAGGTGTCT 2100
TGGGAGCCTA GCCATGAGCC CCTATCAGCA GCACACAGGA GTGAGAAAAG TAACACCTAC 2160
AGTTACCATG CTTGGTCTCT CCCCAGGAGA GCATCATTAG AGGGCAGAGG TATCCATCTG 2220
CTCACAAGGC AACCCCAGTA CCCAAATAGG GCTGGTCACA GCAGGTGAAA TAGCTAAATG 2280
ATGCTGATAG TGAAGGACTT GAATAAGTGG GACCAGCTCT TTTGACCCAG AATCCAGTGA 2340
ACAGGCAGGG TCAAAGTCAC ACAGAGGTCA GAAAGGACAA GGATATGGTC TGGTGCTGTC 2400
TCCCTCCACC ACCCACTGTC TCTCATGGGT GAGAGGCCTG TAAGAGGGAG GCAAGCCTAT 2460
GTGTGGAAAT GCCATAGACT CCACATAGGC ATAAACTCAT CACATCATAG CATACTTCTT 2520
GGGGCTCAAC TCACCAGGTA TGGAGGACAA TGCAGAAGCA CCCTTTTGGA CACACTGGGA 2580
TCAGCTTCAG GGCCACTTCT CACAAACCCA GGATGCCTCT AGAAGCTATG CCTTGGCAGG 2640
CCAGACAAAG GCAATAGGAG CAGAGTTCCT GCCTGACACA GGCTGGCAAC CCACACCCTC 2700
ACTCGGGAAG AAAGCCAGCT GGCAAAGGGG ACAGGAGGCT CTGGGGGTGG GGGGTGGGGG 2760
CAGAAGCAAA CACCCTGCAA TCAAGCCCAG CCAGACCTCA GTCTGGCAAG GTGTCATTCA 2820
CACAGTCACC ACTATCATTC TGCAGAACAC CCCATCATGC CTGAGGATGC TGCCCCACAT 2880
CCCAAGACAA 2890