EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-19170 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr6:88270410-88272360 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Gata4MA0482.1chr6:88270448-88270459TCTTATCTCCT+6.14
Nr2f6MA0677.1chr6:88272184-88272198TGACCTTTGAGCCC-6.41
PKNOX1MA0782.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA+6.52
PKNOX1MA0782.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA-6.74
PKNOX2MA0783.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA+6.52
PKNOX2MA0783.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA-6.62
RXRBMA0855.1chr6:88272184-88272198TGACCTTTGAGCCC-6.59
RXRGMA0856.1chr6:88272184-88272198TGACCTTTGAGCCC-6.27
RxraMA0512.2chr6:88272184-88272198TGACCTTTGAGCCC-6.43
TGIF1MA0796.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA-6.62
TGIF1MA0796.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA+6.74
TGIF2MA0797.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA-6.62
TGIF2MA0797.1chr6:88271133-88271145TGACATCTGTCA+6.74
Enhancer Sequence
TCTGGCTGGA AGCAAAGCTC TCTGTTGGTC CTGATGGGTC TTATCTCCTT GCAACTGGCC 60
ACTTGTGTTT TTTTCTAACT CTACTTTAGG TCTCTTAAAA CCTGAGCATC CATTTGAACC 120
TTACGGCTGG AGAGTCACAA TAACTTCTGG CTGGAACCAA TAGCTACTGG CAGCTTTTTA 180
TAAATCCATC TACAGCCACT CACTGGTTAT ATAACCCATG CACATATCCT CTATGAACCT 240
CAGTTTCTCC TTTTGCTACA TAGTGGGTAT GGAGGTTATC TGCATGGACC CAGACAGATG 300
ATCGCTAAGG GCCCTCCTTC CTTTCCGCAT CCTGTATGTT GACCCTTGCC CTTTAATGCT 360
GCTGCTGGGC TTTCCCATCT CTTTACTTGT AGTTCCCAGC CAGGATCTCC ATCCCTTTCT 420
TCTTGCCCTG TTCCCTGATT AGCTGCTAAG CCCCACCATG TGATACTAGG CCCACTCTGT 480
CAACCTTACC TCTCTCTACT TGTGATGGCT ACCACCTGGA ATTCCGGTTC TCTGCAAACC 540
TTGGACTAAG ACAATCCCAA CAATAAGTGA AAAGCTGTTA TACAATCTCC CATGACCAGA 600
CCTGGTTCAG TCCTTGGTGA GTACTTGTGA GAAAGTGATA GAAAGAAAAA ACCCAAATGC 660
TGCATAGCCT GGTTCCCAGG TAAAGGCAGA CTGTTCTTGA GCTCCTGGGC ACAAGCCCCC 720
AGCTGACATC TGTCAGAATG GCCCATCCAT AACCACTGAC AGGCCAAGGG AGCTCAGAAG 780
AACAAAACAA AAGCTAGGCC TCTCTGCTTT CCTAGCTACC TACAGAGCCT ATGCAGGCAG 840
CGTGTGCCAC AAACAGTTAA GGAATTAAGC TACTTGCTCC ATCTAACCCC AGACAACAGT 900
TTAATCTGCC ACAGAGCCAG TGAGTTTGAA TAGCATGGTG TGTCATGCAC TCCTACAGTG 960
GGAGTCACAC AGGGTCACTG GGTACATGTC TGCCGCACTA ACCAGTCCAG GGGTAGGTAG 1020
GAGAGAAGCA TGGTCCCGTC AACAGGGCAA GGCCAGCTGC TGTCAGTGCA GCTCTGTTCG 1080
TTAGAGGAGA CCCAGGGTGA TGTGCAAGGC CAGGTTTTCA GCCAAGCTGC CATGGCTGCA 1140
CTTACAGAGT GGGGACTCTT CTCAGCCTGA CCCTTCCTAT TAGATCCTCT GTGGCGCAGA 1200
TACAGCATAC TTCCTGCCTG TCCTAACTGC ACATGAAACT CAGCCATGTC TCAGGGCGGG 1260
TTTCTAGTCG CTGGTGTGGG GGTAACGTAA CAGAAAGAAG ACTCTCTGTT ACGAACGAAA 1320
ACCCAGGGCA CGGCCAATAA AGCAGCCATG TAGCCTGTGG GAACCAGGCC TGACTTTCAA 1380
TGAACTTCCT TCGACTAAGC CCTGAGTCCT TCCTTCTCAT ATAAACCTTA ATATATGACC 1440
ACAGAGAAGA AGCCAAGAAA AAGCCTTGGC CACTCCTCAG CCCCAGGGAG CCACGCCTTT 1500
TCTTTACCTG CAGCACACTG TCTTGGCCCC AAGAGTAAGG GACTCTGGAC TGGATTTCAT 1560
TTTTCTCCAA GTCTCTGGCT CCATCTACTG TCTCTGAACG CGACACAGAA CTGAGGCTAG 1620
AAACACTGTC CGGAGTGCTC TAGAGCTGAG GTAAAGCTTG GAGGGCAGCA CAGGAGACGC 1680
CTGCATGTGG CCAAGCTACA TTCCAGGCAG CAGATCCGCC CCCACTCGAG GAGCCTGGGA 1740
GGGTTGCAAG GTACTGGCCA GAAGGCTGTT TGCTTGACCT TTGAGCCCAC TGCAGTCTGC 1800
TTCCAATTAA GCACAAAATA AGTCTAGTTA CCAGGTTACA TTATGTGCCA TAGTTCACCT 1860
CAAAAGCCAG AAATACAGGG TGACCTGGAA TCCACCCACA GTGCTATGGC TGCTGCTAAC 1920
AGAAACAACA AATAAAGACT TGGGAATTAG 1950