EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-18118 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr5:132000300-132003800 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr5:132000906-132000917AAGCCATAAAA+6.62
E2F6MA0471.1chr5:132002159-132002170GGGCGGGAAGC+6.02
FOXD2MA0847.2chr5:132001288-132001301GTTAAATAAACAT+6.36
Foxd3MA0041.1chr5:132001291-132001303AAATAAACATAC-6.11
GATA5MA0766.2chr5:132003064-132003074TCCTTATCTG-6.02
MecomMA0029.1chr5:132000923-132000937TTTTATCTTATCTG-6.68
Nr5a2MA0505.1chr5:132003548-132003563GGTGACCTTGGACTT-6.76
RREB1MA0073.1chr5:132000371-132000391CCACCACACACACACACACA+6.41
RREB1MA0073.1chr5:132002140-132002160GGATGGGGGGTGGGGGGGGG-7.13
SP1MA0079.4chr5:132003685-132003700TAAGCCACACCCCCC+6.01
Sox3MA0514.1chr5:132003475-132003485CCTTTGTTTT+6.02
ZNF740MA0753.2chr5:132003689-132003702CCACACCCCCCAC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:132002152-132002165GGGGGGGGGGCGG-6.64
ZNF740MA0753.2chr5:132002149-132002162GTGGGGGGGGGGG-6.92
Enhancer Sequence
TACTGCCACA TATGTGACAA TCTCTAAACA TACATCAGAT ACATCAAAGA TATGCTATTC 60
ATGTTCCATT CCCACCACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACACATCGAA 120
AAAGTACAAA TTCAGGCCCA GGTTCTCCCT GGTGAATTCA AGAATTGAAT TCTCTTCAAA 180
TGAGAACTGT TCCTACTTTT TAAAGCCTAG CCTGGGACAA GTAGGTAAAA ATAGTTTGAT 240
GTTCACTCCG GGCTAAATAA AAGACAGCTG AGTGAAGGTT CAGGCACCAT GAAATTAATA 300
AAATCACCAT CTCACCCTCT CTATTGCAGG TTCAGGAATA AATCGGGAGA AGAAATCTGT 360
GAGGCACAGA GCGACCTACT CAAGTGTGAA GCAATCATTT TCTCCACTGA CGTCTTCCAG 420
CGTTTTCTTC CACAGTGCAT TTACAGGATT CCTAGTTCAC CAAAGTTGCT TCCTAAGGCT 480
GACCAGCACT GGATTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT GAGTCATCGA GCCCAATTCT 540
GTTTGCTAAA TAAATTCCGG GCAAGAGTGC TCTGACTCTT GCCCAGGCAA GGCAAGGGTC 600
TAAGGTAAGC CATAAAACAA TAGTTTTATC TTATCTGAGG GACCCACTGT ATTCCGGTGT 660
GTGTGTGTGA GTGCCTGCGT ACATGTGAGT GTATGTGTGT GTGTGCACGC GGAGCCTGTG 720
AGTGTGTATT TTTACTGCCA AAATAAAATA AATGGAATCG GCACACACAT GATAACGCAC 780
TCTTTGCTAA CTCATACTAA TTGCTGGGCT AATTGATGTT TGTTGAACTT TCTCCGTTTC 840
ATTGAGTGAT TAGGTACAAA GCTAACAGTT GACATCTGTA GGCGCTTAAC TGGCGTCTGT 900
AATTACTGTT AATGTTAAAT AATTGTTAGT TAATTGGAGT GGTAACTGAC TGAATGGAAT 960
CCAGATTGGG AAGCAGAAAA GAAACCTAGT TAAATAAACA TACATTTTTT GGGGGGGAGA 1020
AGACAACGGT TTTTTGGTTT GAGTTTTGTT TTGGTTTGGT TTTTTTCTTG CAGGTGTCAG 1080
AAACTAGAAA TAACCCAGAA GCCTGGGATA GCCCAAGGGC TTCCTGAATG AAGGAAACCC 1140
AGCCTGGGGC GGAACAATGT GTTAGAAAGC CTCACTTAAA GAGCAGGCGG CTTTGGTGGC 1200
TAACCCCTCT CGCTGCAGGT CTACAACACA GACTTGGTGT TTTAGTTGTA ATAATTGCTA 1260
TCACAATGGC CTATGTGAAT GTATTCCTCT CACACCCAGA CACCCAGACA CCAGACCAAT 1320
GTCTAAAGGA AACACTACAT ACACATACCC ACTGATGGAC TGAAAGGGGC TTGCAGAACA 1380
TTCAAGCTTT TCTCTGAAAA CCACTGGGTA TATGGGAAAC GATTTCAGAC AAAGGATACA 1440
GAGGTCACCC AATAAAGGAA GTGAAGGGCT TTCTAGTGGG CTCAGAAATC AATCAGCATA 1500
TCTGTTTAGA AACATCCATG AAAAGAATCT AGTTTGAGGC TGGAGAGATG ATGGCTCAGT 1560
CAGCAAAGTG TTTACACAGA AGCAAACACA GCCCAGGGGT CAGATTCAAG TGTGCTGAAG 1620
TGATCTACAA TCCCAGCACT GGGAGGCAGA GACTGGTGGA TCCTTTGGGG ATCACTAAGC 1680
AGTCACTGCA CACAGGTTCA GTGAGACACC ATGCCTCAAA ACCTACAATG GAGAGCAACT 1740
GAGAAAGATG CTGGACACAA GTGCACATAT ACTCTGTATG CACTCGCAGA CACAACACGT 1800
TACATAGCAA ACATTTCCCA AGTGGTCACA GGGACATTCA GGATGGGGGG TGGGGGGGGG 1860
GGCGGGAAGC GCTGGTCTCT TCCTCCTTCC TTCTGGAAAA GTGGCAAGAT GGCCAATGCT 1920
GAACCCTCAA ATACAACTAA AATCATGTCA GATGCTCTCA ACATCTTAAA ACTCAATTCT 1980
TGCCTCTATT CCTCCAACAT GTGTCCCACA CGTCCCTTAG AAGGCCATGG ATGAATGTAC 2040
TCAGTAAGGA GGCCGGGCTG TAGCTAAAGT GTTTATTGCA CAGGTAGGAA AACCTGAGTT 2100
TGATCCTCAA ACTCACATCC ACAAAATCAA AAACTATTCC TGGCAGCCCA CATGCACACC 2160
TGTAATTCCA GCACTAGGAA AATGAAGACA GGAGAGGGGC CCCAGCCAGC TAGCCTAATC 2220
TGAGCTCCAG TGTCAGGGAG AAAGAAAGCT GACCTCACAC TATAAGGTTA AAAAAAAAAA 2280
AATGGTCAAG GAAGACTACT CAGCAGGACA TCTGGCTTCC ACATGTGTAT ACACACTTGT 2340
GAATCCAGAG AGAAGCACTT TCTCGCCACG TGGAATATTT CTGGTCTCTG CTGGGTAATT 2400
TTACACTCAC AGGACAAGGC ATCTGTTTCC CAGAATTCTC CAGGAATAAT TCTATACAAC 2460
AGCTTCTGTG TGTGAGAGTC AGATTTCCAT AGGAAGGCCA ATTTCCATGA CAAAGGGGGC 2520
CTGATTGCGT GCTATTTGTG GTATGGGTTG GGAGAAGAAG GAACTACTTC TAACTCCTTT 2580
GTCTCACATC AAGCACCAAT TACCCTTCAA CACTATTTAA TTCTCCACAT GTAAGACATT 2640
TCTATCTCTC AAAGCCCCAA GAAAGCCAGC TCTGAAGCAG CACACACACA CATACACACC 2700
CACACACACA CACACACACA ATCCCAGAGG GAGAAAAATA AAAAATGAAC AATATTCTAC 2760
CTTTTCCTTA TCTGGGATTT AAGAGTCGAT AAAAAATAGA ACTAATCTGC AGAGGCTAAA 2820
ACTGGCTCAG TTTCCTGTGA CAAGAATCAG GTCTGGGCTT GACACAACAA TCTACCTTAC 2880
ACAAAATGCA AGACACCACA AGAGGCTGTA AAATGGGCTC CTTGTGTTCA TATAAAGGGA 2940
TATTAAATCT AAACCACACT TCCCTCCTTA AGCTATACCA CAGTCAACTG CATTAGTTTT 3000
AGGTGTAGAA ATGCTTTAGG AGAGCGACTT TTCTCAAGAG ACAATATTGC CTTTTTTGTA 3060
TTCAATGTTA CCTTCTTTGT ATTCAAACCA AGAAATCCTT TCCCTTCAAA GCTAGCAAAA 3120
ACAGTTGACA TTGTTGCTAT TAAACAAGTT ACTAGACCTG ACGTTGCTTG CAATACCTTT 3180
GTTTTTCGGT TTTTTGAGAC AGGCCCTCTG GCTGGCTTTG ATCTCACTAT GTAACTCATA 3240
TTGCAGAAGG TGACCTTGGA CTTCTGATCC TCCTGCCTCT ACCACCTCTA GAGCCCTGGG 3300
ATTACAGGTG TGCACCACCA CGTCTGGTTT ATGCAGCGCC ATGAAGAGAA ACCAGGGCTA 3360
CCAGTAAGCA CTGCTCTACT CCCATTAAGC CACACCCCCC ACACCCCAGC AACATGTTTG 3420
GGTAATCAGT TTCTCCTCTC ATCAACTCCT CAGATCTCAG GCAGTGATGT TGATAAAAAA 3480
CATATTGCCC AAACACTCAA 3500