EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-17274 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr5:65201480-65204560 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxa2MA0047.2chr5:65202700-65202712TGTTTACTCTGG+6.11
Lhx3MA0135.1chr5:65201911-65201924TAATTAATTATTA+6.18
RREB1MA0073.1chr5:65203329-65203349GGGGAGGGTTTGGGGGGGGG-6.19
SPI1MA0080.4chr5:65204052-65204066TACTTCCTCTTTTG-7.1
SPICMA0687.1chr5:65204052-65204066TACTTCCTCTTTTG-7.95
ZNF263MA0528.1chr5:65202366-65202387GGAGGAGGGACCAGATGAGGA+6.13
ZNF263MA0528.1chr5:65203328-65203349GGGGGAGGGTTTGGGGGGGGG+6.15
ZNF263MA0528.1chr5:65202424-65202445TCCCCCACTCCCCCCTCCCCC-7.93
ZNF740MA0753.2chr5:65202727-65202740CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:65202728-65202741CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:65202729-65202742CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:65202730-65202743CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr5:65202731-65202744CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05447chr5:65201377-65204554E14.5_Heart
mSE_06506chr5:65199188-65205172E14.5_Liver
mSE_06887chr5:65198279-65205168Heart
mSE_07232chr5:65198900-65204952Intestine
mSE_09159chr5:65198719-65204805Lung
mSE_09776chr5:65201003-65204783MEF
mSE_10185chr5:65199157-65204811Embryonic_stem_cells
mSE_12417chr5:65201000-65204643Spleen
Enhancer Sequence
GTAGTAACGG AGTTGTAGCA GTCCTGCTTA TCCCTCCTAG GAACAGGGAA TACCAGCACG 60
TGCCCCCTCA CCAGGCAGAA GTACCATCGA TAGAAAACAA GAAAAACTAT CAACCACAGC 120
TGGCTCCTGT CCCCTACCCT CTTACCATTC ATTCTCTCTG TCCCCTACCC GCTTACCATT 180
CTCTTGTAGA GCTTCAAAGC CCTTGCTACT GGGCTTATTT AAAAGACCTC CATGAGTGGG 240
TAAGGGGGGA AAAGTTGTTT TAGGATGATG GTGGGAAAGA CTCCTATCTA GGCCAGGCTA 300
AGGTTGGGGC AGTAACTTTT AAAAGGAAGT TTTGATCACT AATTTCCTAT AGGGCTGGGC 360
CCTTCCTCCT CCTTGGAACC TGTTGAGGAA CATTTCAGCT GCAGAAGTCC TTCTCAAGGC 420
TTGGTCACTT GTAATTAATT ATTATTATTG GTGGGGAGGG GTTGCTTGTC TTGTTGTTAC 480
TTCCCCTGGG CCTAGCACAG AAACTACTTT GTTTTCAGTA TCCCTTCTGA GCCTTCTATA 540
AGGTGTCAGG GAAGGGACCT GCCTGGACCC TATTGGTAGG GGTAGAAGAC ACATCCTTCT 600
AGCTTGTCGA GGTAAGAGGC CAACCTGGAT GGAGTGGGGA GCAGTCTGCT GGCCACTGTA 660
GGGTGGGGAG AGCCTTGAGC AGGTCTTTGA AGAATTAGGA GGATTTAGAT AAGCCGGAAG 720
GGGAGGGGGC ATACCACACT GTTGCCCAGC ATCGGGGCCA GAAACGAACA AAAGCTTGGC 780
GCTGGGGAGG GGGAGTCAGG GCCCCTTGGG GAGCCTGGGC TGTTTAGGAA GCTGGTGACT 840
GGCACAAGCA GCTAACCACC CTACGCTGGC AGTCCCAGGC TCCCTTGGAG GAGGGACCAG 900
ATGAGGAAGG GACTGCTGGC AAAGGGGTTG GCCTGCGTTA CTTCTCCCCC ACTCCCCCCT 960
CCCCCGCACC CCACCCCCCA TCCCCTTCAG CGGGAGACCT GAGGATCTGG TCCCAGAGGC 1020
TGTGGTGGAA ATGGAGAGAA AAGGGGTGGG GCAGACTTCA CAGATGACCT TAGGTTTCCA 1080
TGGTGAAAGA CGAGAAAATA AGGCAAATGG GAGTTAAGGA GGGGCAACCT CTTAGAACAG 1140
GGACTGGAGG GAGGAGGAGG AGGCTTGGGC TGGACTGGAG CCATGTTGCC CAGCCAAGGT 1200
TGCAAGTGCT TTCTGGTTTG TGTTTACTCT GGAAGGGGAG GGCACCTCCC CCCCCCCCCC 1260
CCCCGCACAG TTTTGTATGG AAGGTGCAGT CCTCTGAGGT AAAGTTTAGA GAGACTTCAT 1320
GCACTGGGAA CTACACCACC CTGACAGTTC TTTCTGGTTA TTTTTAAGGT TCCAGCCATC 1380
CTTGGTTCAG GGTGGAATTT CCAGGAACTG GCTTCAGCTT GGAGCCAGTC GGGTCCCTCC 1440
CAGCCTTCCC ACTCCCTGCA GGGTGGGGCC CCATGGGTGG AGGCCCAGCA GGGTGGAGTG 1500
AGGTGGGTCT CCAGTGATAG GGAGGGCACC TAGTGAGCCA GGCAGATGAG AGGCCCCGTG 1560
GCCTCACGCA GCCTTTCTGG ATTTGATTAT GTAAGGCCTC ACCGAGGAGA ACCGGGAGGG 1620
CTTAGGCGAG GCCTTTGGAG CTGTGTACAC AGCAGGACTA AGACATTGTG GGTATTTTTC 1680
AATTGATCTT GGGTGGCTTG CCCTTAAAAC TGAAACACAG AATTGTCAGC GAGCATAAAG 1740
GAGGAAAAAC AAATGTGTAA CCCAAGTACC AACCAGGTGC CCTTGAACGT CAGAGCCGGC 1800
CTGGAGAGTA ATATACATTT GGGTCTCCGC AGCCCTACCG GCGCTCTCGG GGGAGGGTTT 1860
GGGGGGGGGG GGTTGGAAAG CTGGAGAGAG TCTGCCCCGT CCCTGCCTCT CCACCTGTCC 1920
TTATTTACAT GTAAAATCAA TTGCTTCACT TGGTCTTTCC GAAGTACTGG GTGTGGGCAG 1980
AATCTTATCT GAAGCTATGT CCTGTTTGGA CAAGTTGGAC TCGCCCTGGC AACTCTCCAT 2040
GGGGTGGAGC CGATGGGTGG AGGCAGAAAA GTAAAATTGG GTGGCTTGTT CACGGAGAGG 2100
GGAGGGCGGA TCGCCGGCTC CCTGGGTCAT TGCATCCCAT CTGAAGCCAA GCAATGAACC 2160
TCTCCCTTTT ACAAAACACG TTAATGCAGA AATAATTGAT GAGAGGCACA GATTCGGAAA 2220
TATCCGGTGG AATTCTGTTC AGGTCAACAG TGGAAGAGTG AGGTGGGTGA GTCCTTGGGT 2280
GGTGTGAAAA GTGGGCACCC TTCCAAGGTA GGTGCCAGCC CCGCTAAGCA AGCCTGGCTT 2340
AGGGTGCCTG CCCCTCTGCG TTTCTGGTCA GGCCATTGCA TGGTACTTCC TGTAGTACCG 2400
GTCACAGGGA GCGCTCAGAA AGTTTGCTAA GGAAATGTAA AGAAAGGGTT CTCGACAAAG 2460
GAAGTTCAGC TCCAGGGACG GCGCTTGCCC TCCTGGCCAA GATCCACAGC GAGCTCAGAT 2520
CTTTACCCTG TCAGTTCCTT TGGAGAGTGA GGGTGGGGAC TAGCAACATA CTTACTTCCT 2580
CTTTTGAAAA TTCGCTTGGG AGCGTGAAGA AGGTGCTGGC GATTGTTGCT TGTTGGGTTG 2640
TCTAAGTAGT CTGTTCTCTG GACACCTGGC TGAGGTTCCC CTTTGAAGGG AGCAGGTAAT 2700
TGGGGCAAGC CTTAGGGTCA GGCCTGAAGA GAGGAGAGGG AATGTCAGGC AAGTCTTGCT 2760
TTGTCCTCAG CAAACAGAAC TCTTGGCTCT AGTTAGCCTC CACCTCCATT CATTGCCTCC 2820
CTTAGGAAGT AGTTGTACCG GGAGCCTCAC AGACTGTAAG AGCTGTATCA TTTCTAGAAG 2880
TCGCCTAAAT GATTCTCCAG GCTTCTAATA TATACTTCTA CAGTTACATG CTGACAGAAA 2940
CCTGACCCTT GGTTTGATAA TCTGCAGTCA AAAGTAGAAG AGGGGAGGGC TCCCGAAGGC 3000
ACATCACTTT TCAATGAAAA TTCGGTTTGA CTAGCCCTTC CCCACAAAAT AACCCAGTTG 3060
TCCCCATTAT GGGAAATTAT 3080