EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-17096 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr5:33870240-33872720 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr5:33870778-33870795GTTAATTAATTAATTAG-6.16
Alx1MA0854.1chr5:33870775-33870792TGGGTTAATTAATTAAT+6
Alx4MA0853.1chr5:33870778-33870795GTTAATTAATTAATTAG-6.1
EWSR1-FLI1MA0149.1chr5:33871493-33871511GGCAGGAATCCAGGAAGG+6.15
EsrrgMA0643.1chr5:33872523-33872533TCAAGGTCAT+6.02
GATA2MA0036.3chr5:33871858-33871869AGAGATAAGAA-6.32
Gata1MA0035.3chr5:33871858-33871869AGAGATAAGAA-6.32
HSF1MA0486.2chr5:33871524-33871537GAAGATTCTAGAA-6.78
HSF2MA0770.1chr5:33871524-33871537GAAGATTCTAGAA-6.82
HSF4MA0771.1chr5:33871524-33871537GAAGATTCTAGAA-6.92
Lhx3MA0135.1chr5:33870780-33870793TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr5:33870781-33870794AATTAATTAATTA-6.78
Lhx3MA0135.1chr5:33870777-33870790GGTTAATTAATTA-6.98
POU6F1MA0628.1chr5:33870782-33870792ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr5:33870782-33870792ATTAATTAAT-6.02
RORAMA0071.1chr5:33872522-33872532ATCAAGGTCA+6.02
mix-aMA0621.1chr5:33870785-33870796AATTAATTAGG+6.32
Enhancer Sequence
GCTCTGAGCC TCAAGGCCAC AAGCATGCTT CAGAAAAGTG TTCCAGCTGT TTTCATGTGA 60
ATCCCTGTGG GAGCCTGCAT ATTTCCATTT CAGCATCTCT GAGCCTGTGT ACTCCACGTG 120
TACACGTGGG ATTCTATGTG CAGGGTGACA TACCTCCAGG CTATCTCCAC ACGGTCCCAA 180
GGACAGACAG AGCAAGTGGT CAGGTCAGAG TCAAGGCTGT CTCAACTACC AGAGGGGCTG 240
GACATCAGAG CTCGCATAAC TACTCCTACC TTCCATAAGG GGCTGTAAAT GGCCCCCTCT 300
ATAACCTGGT GAGGCAGCTC TCAGTACAGC TTCCACCTTG GTCCTCACAG CCCCAGACCC 360
TCACTGTGGA TGCTACAGTC CTGTCATGGC TTTGTATATA CGTCTATTCT GGTGTTAAAA 420
GCTCTGGGCC AGACAGGGCT GGGGTCCCGA GGTGGCTGAG GACACACTAC CCAGACCCCC 480
ACGAACACAA CCTCGAGTGT CGATTCCACG TGACTAACTC ATTGATCGCC TCGCCTGGGT 540
TAATTAATTA ATTAGGGCAG TGCAGAGGCC AGTGGGTTGG GCCTAGGGAA CGGATCCTCC 600
ACCGGGAGTT TTATTAGTAC ATAAAATGAG TGTTTAAAAC CCACACGGCC ACGAGTGCGC 660
TGTCTCGGCT TTTCATTAAA CAAACCTATA AAATTACTTG CCTCATTATG TATTTTCGCG 720
ACTTCCTTTG CCTCCGATGC TCCCTCCCTG CCTGCCTCCC GCTCTAAGTG CCTATTTGAA 780
ATCAATTTCT CTAATAATGG GCTTAACGAG CTCATCAATT AGGGCTGCCA TAACCGAGTG 840
TCGCCGGCTC CCGTTATCAG TTAAACTCTG GAACTAATTT CCATGCTCCA TCTATCACGG 900
GGTGTCCACG ACGTCTGGCT CCTGCTCCGG GACGATAGGG AGACCCCAGG CCCTTCCCAC 960
TGGCCATAGA CATCTCTGGG AGAGGACAAT AAGGAGAGAG AGGCCCACCT AGCCCAGGCT 1020
TGGGCATGAG GTGTGGCCTC CACCAGCCCA GCGTAATTAG CAGTAATGGA TGACAGGGCA 1080
GCCCCGTAAG ACCTTCCGCA GAGCAAGCCC CATCCTGCTT TCTCACACTC CGGGCGACCA 1140
CCTCAACCCT CAGCTCTCTT TATGTCACCC CACATCCTTG GGATCCCCAA AGCAAATTTC 1200
CTCCAAATAT CCAGGCTGGA GCTGGAGCTG GCCCAGGAAT GAAGCTAGAG GAGGGCAGGA 1260
ATCCAGGAAG GGGCCAGTAG AGCAGAAGAT TCTAGAAAGC TCTGCTGGGG ACTGTCCAGA 1320
AGGGAACTGC CGGGACATCT AGGCTTCCCA GCAGAGGAGG ATCCATGACC CAATAGTGAC 1380
CTGTGGAACA AGGGCCAGGA CCAGGGCAGT ATCTGGACCA AATATCCAGG GCCCACTGTT 1440
GCTGGCAACA CCCTAGGCCT CAGGACGGGC TTACATATAT ATGCAGTATA GGCTCAACAC 1500
AGATGTATGA GCAAGACAGA TGTCTCTGCT CTAGCTAGGC GTGTCTCACA TAGACAGCAA 1560
GGCCCCAAGA TGCTATCAGT TACACATCCT ATCCCCGCTC CAGGCTGAAG TGGGCACTAG 1620
AGATAAGAAC CCAGTACTCC CTCCCCCATC TTTCCCGCGT CCTGGGAAGC CCAAGCTCCT 1680
TACCCTCAGC CTCCGGTCAA GCTGATTTGT GCCTAGAACC CAGAAAAAAA TTAGATACCC 1740
CTGGCCCAGA TGCATGGCCA AAGAAAGTGT CACACAAAGT GTCCCTCCGT GGCTGGTTGC 1800
AGCCCCTATG CCCACCAGGA AGATGGTTGA ACAGCGCTGA GGGTGAGCAG TGAGGTGCCG 1860
ATGGGAGGCA GGCAAGAGGG CCACCGGCAC CCACCCACCT GAGGCCCAAT CCCAGGCTGG 1920
GGGAGGGGCA CTGGCCTCTC CAGGTGGTGA GGGGCACCCG TGTCACCGCT TAGCCTGCTG 1980
CTCCTTGCGA TTTGTCATAA TCAGTCAGCT TTTCTCATTA GCGAAAAGCC ATTAGCTTGG 2040
TTTTATCAGC AGCTGGAGGG ATGGCTGGCA GGCCTGGCCC TTCCAGAGCA CCACCCCCCA 2100
GGCCGCCCAC CGGGTCACTA CCAGAACTAG TTGGAGACCA CACTGTCCCT AAAACAAGCG 2160
TGGTGCCTTC TGAACCAGCT CTGGGCACCC CTGCCTAGAC TTGGGGAGAA CTGAGCGGAG 2220
TGTTTCAGGA GATAGCCCAG GGGGGGGAAA TACTTCCTGC ATGTTATTAG CCTTGATTAG 2280
GAATCAAGGT CATGACCCCG TGCTGGCCAC CAGCCCAGAG GCCCGCCCAA GGACAAGGAC 2340
TAAGGCAGAG ATGGATGAAA AGCTTCTGGG GGTGAGAAGG CAAGAAAGCA AGTGAAACCA 2400
CAGGTGAGGG CAGGGCCGGG GCAGTGCGAA AGGAGAAGAG AGCTGAAGGC AAGAGCTGGC 2460
TGGGGCTGGC TACTCACCCA 2480