EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16736 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:150168220-150169650 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr4:150168461-150168476TGACCTCTGACCTCC-8.03
Nr2f6MA0677.1chr4:150168461-150168475TGACCTCTGACCTC-7.42
PKNOX2MA0783.1chr4:150169183-150169195TGACACCTGTCT-6.44
RFX1MA0509.2chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG-7.47
RFX1MA0509.2chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG+7.51
RFX2MA0600.2chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG+7.37
RFX2MA0600.2chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG-7.41
RFX3MA0798.1chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG+7.44
RFX3MA0798.1chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG-7.52
RFX4MA0799.1chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG+7.87
RFX4MA0799.1chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG-7.91
RFX5MA0510.2chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG-6.71
RFX5MA0510.2chr4:150168780-150168796GGTTGCCATGGTTACG+6.75
RXRBMA0855.1chr4:150168461-150168475TGACCTCTGACCTC-6.84
RXRGMA0856.1chr4:150168461-150168475TGACCTCTGACCTC-6.91
RxraMA0512.2chr4:150168461-150168475TGACCTCTGACCTC-6.88
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02298chr4:150162815-150174097Macrophage
Enhancer Sequence
TAGGGGGGAT GGCTTAATAG GTAAAGGTGC TTGCTATATA AGAGCAAAGA CCTCACTCAG 60
TCCAGATCCC TGGACCCGAT ATAAAGCCAG ATGTGGTATC TGTAACTCCG GCACTCCTGC 120
AGGGAAATGA GAACTGGAGA CAGGGGCATT CCTGGAGCTT GTGAGCCAGT TACCCTGGGT 180
GTGCAGTAGC AAACAGACAC TCTCTCAGGC AAGATGGGGC ATAAGGAACA GCCCGTGAGA 240
CTGACCTCTG ACCTCCGCAT GTGTGCTTAG CATACACACA TCACACACTC ACGGGTAAAA 300
ATAATGAAAT AAAAATAAAC CCCTGTTCCT TTCTCTTGAC CTCATTTCTT GACCTGGTCC 360
CTGGACTAGA TTAGTAATGG CTGTCCTTCT CTAGGGCCTC ACGCTGGAAG CCAAAGTTAA 420
CATAGCAGTG CTGTAGGGCG GGAGAGTCTT GGTGGAAAAC ACTTTCATTT TAAATAGGTC 480
ACTTCTTCCT GAGGGAGGAC AAAGGATTGG GTAAGTTTGA GCCTCACTCC TGATGACATC 540
CCCAGGGATC GGGTCATCTT GGTTGCCATG GTTACGGCTC TCCTTCCAAG GGCCTAGTCA 600
GCATCTCAGA CTGCATCCTC CTCCTATCTA CAGTTTACAG AGCTGGTCCT TACATACACG 660
CTCCCTGTAC TCGGCCACAC AATCATGCTC ACACAGCATT TGTCTTGTCA GTCATCCCCG 720
TGCCCTTGCC ACCAGCCAAC ACGACCTGGT CCAGCCTTTA GGCAACTGGG ATCATATCTA 780
TCGCTATTCC CTAACACTCC CCTACATGGT GATCCGGACA CATGTTTGGC AGGTGGTGAG 840
TCCTCAGAAG ACTCTGAGGT AACAGCAGAC TCCATCCTTG GCATCGCTGA CTTCAAACAA 900
TTAAAGCAGC AGCTGCCTCT GCGTCTCCCT GTGGTCAGTG CAGCCTGGAA TTACTCATGG 960
CTGTGACACC TGTCTGCTAG TGACAACACA GAGCCAGGTG ATTTGGGACA CGTTTCTACT 1020
GCAGGCCAGG GTGTCATCTT AGGCATTGCA AGGTGTGTCT GAAAAGGGAT ATGAACTGAG 1080
TGCAGAGAGC AGGGCTCACT GTTTACCCAG GAGCCCCAGG CAAGGTCTTA ATCCTACTAT 1140
AGTCTGCTCT ACTTTCTCTT GTCTCTAGTG AAAGGACTTC TGTTTCTCCC CTGTCTGACA 1200
GGAATTCTCC TCACCTAACG TGCTTTCTTC CCGGCCCCCA GACTTCCTTA TTCAGTAGCC 1260
AATTTTAAAC TCTGGGTGAA TAAGAAAAAT GTTCCCTCTG TGAGACGCTA GTGGTTCAAG 1320
CGGAAGGCTT ACTGATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT CTGCTGTGTG AGTGTGTGTG 1380
TGTATTTGTG TCTGTGTTTG TATGTCTGCT GTGTGAGTAT GTGTATGTGT 1430