EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16645 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:148059440-148063020 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EGR4MA0733.1chr4:148060392-148060408GAAGGCGTGGGCGTGT-6.23
Nr5a2MA0505.1chr4:148062912-148062927GTTGGCCTTGAACTT-7.32
RREB1MA0073.1chr4:148062465-148062485CCCCACCCCACTCCCACCCT+6.03
RREB1MA0073.1chr4:148060149-148060169CAACACCCCACCCCCACCCC+6.59
RREB1MA0073.1chr4:148060407-148060427TGTGTGTGTGTGTGTGGGGG-6.95
STAT3MA0144.2chr4:148060843-148060854CTTCCCAGAAG-6.14
TFAP2B(var.3)MA0813.1chr4:148060637-148060650TCCCCCCAGGGCA+6.08
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr4:148060637-148060650TCCCCCCAGGGCA+6.06
TFAP2C(var.3)MA0815.1chr4:148060637-148060650TCCCCCCAGGGCA-6.1
Enhancer Sequence
GAGAGAGAGA GCCAGTATCA CCTTCTGGTT TGGAAGCCTG AGAGCCTCGT TCTGAGCCAC 60
TTTGTTTCTG ACCCCAGCCT TTGCTTTGCT ATGGGTCCTG CCTTCTCCAC CAGAGGCAGG 120
AAGAGCTGGC ATGGAGCTGC TGGGCAGCAC GGGCCCTGCT TCCCCACATC TAGTGTGCGG 180
ACAGAACTAT GTTCCAGCCT GGGCTGGTGA GTAAAGCTCT GGTCTGCAGA TGCTGTGCTC 240
CTAACAAGGC ACACCCTTTC ACCCTTGCTG GCCCCAGAGT TCTATGGACA TTCCATGGTC 300
TCCAGCTGCT TATACCCAAG AGCCGTGGGC ACAGTGTCTG CTCTCAGTTA CCACCCTCAG 360
TAGCCATGGC TGCCCACCGC TCCTCGCCTC CCTGATGGAG TCTTGGGGGT GCTGTTCTCG 420
GAACTGGTTC CCTCTCCTGA GAGGCCATGG ACAGTGGGTT CGGAAGGAAT AATGACAGCG 480
GTGGATGATA TGGCCAAACA CTTCCAGTGT GACGGACAGA GCCGAGCCCT TGCCTTGACA 540
CATTTCCTTG TCTGCCTTGT GTCACTCACA CGGGGGTGGG GGTAGGGGTG AGGGTAGGGA 600
TGGGGGTGGG AAATCGAGGG CAGTGCCTGG CACAGGGTAA GCCCTCAAGA AGATTTGCTA 660
GGACTGGAGT GATGCTTCCC GCAGTCTAAC GAGCATGGGG ACCTGAGTTC AACACCCCAC 720
CCCCACCCCC AAGACCCATG TGGTCTTGGA AAAAGTCGGG TATGGCAGAG TGCCTGGAAT 780
CCCAGAAGTG GGGAGGTGGA GAGAGCAGGA CACCTGGGGC TTGCCAGTCT AGCCAAATCA 840
GGAAGTTCAG ATTCAAGGAG CGACCGGGTC TCAGAAAGTG AGTTGGAGAG TTATGGCGAC 900
TGCAGGCATG CGCAGTGCGC ACACAATTTG CCGAGGGACA GAGGCTTGAG GAGAAGGCGT 960
GGGCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGGGGGTTG TCGGTGGCCG ATCGCCACCC TCCTCCTGTG 1020
TTTCTTCTCC AGGAATGGTT GGTAACGGTG GGTGTCACCA CCTGAAGTAT GTGCCACCAA 1080
TGGTATTATG GCACAGGTCT AGACGCCACA CCTTCTCCCT TCGTTTTGGG TGAGTCTGTC 1140
CACTTACCCC CCCTAGCCAC CCAGGAGAGA ACTACCCTGG GCCACGGGCC CCTTCTGTCC 1200
CCCCAGGGCA GTGAAGGGCT GGGCGCTGGC CCTGCTACAG CTGCTTGGGG CCCAGGGAGG 1260
AGAGAATCAA AGGCAGGCCA TGTGGGCCCC TGCTTTCATC TCTCAGCTTC AAAGAGGTGC 1320
AAACAAACCC TGTCCCCATG CCAGGCGCTG CAGCAGCTCG CCGCTGCTTA CAGCCCCAGC 1380
CTGTCCTTCC CCATACGCTC TTCCTTCCCA GAAGGAAGAC AGGGCCTAAA TCCTGGTCGC 1440
TGGACACCCA GAAGGCCGGG ATTGCTCGCA GAGCAGGCAA TGCCGTGCAG GGGCCATGGT 1500
GCAGCAAAAG GCGGGTCTGA CAGGCGGGAA TAGGGGTGGG GTGGTGGCGC AAGGCCAAGG 1560
CGACTGAAAC CCTTCATCTC ACACTTTCCC ACTGTGGGCC AGCCTGGGAT CTGGGACCCA 1620
CACACTCTGA ATAGAACCTT CCAGTCAGGA GGTGCACTGC TCAGGGTGGG GGGGGTCATG 1680
CGTGGCTCTT GAGCACCTGG GGTGCGACCC CTGAGAGTAT AGAAGGGTGT GGCACAGCTC 1740
ATGTGTCACT TTTACACCAG TTCCCACTGA AATGAAGACA ATGGATACTA CTGGGGTTAA 1800
AAATGTTACT AAGATGAACC ACCAGGTCCC CCTGACCCCT TTGAATGTGT GCCAAGGACG 1860
TTGAAAACGG CCCGGGATTC ACTTTACTCC TCTGAGAGCA TTCAGCTCCG GGTTGCATTC 1920
CCATTCTGCA GATGAAGGGT CTGAAGCTCA AGGGGTTTTG TCGTTTGGTT CCGAGGTGAC 1980
GCTCAACCAG GGATGGATAG ACAGGTTGGC AGCTGGGGCA AGGTGTGTGA TGCTGACTTT 2040
CAGGGGGAGA CACAGATGAG CCCTGGTCAT GAGCAGACTC TGGTCCAGAG CTTGGTGGGC 2100
GTGACCGTAG AGTCAGCTCC CAGTTCCCGA GGACACTCTG GCCTCCGAAC AACAGGGAGA 2160
GATAGATGTG CCTCATGAGG GATGTGCGGT TCAGACCGTG CTGGGTTTTG CTGCTTCACC 2220
TGATGTGTGG TCTTGGATCA GGATTCATTT ATTTATTTGT TTGTCTGTTA GTTTTGAGAT 2280
AGAGTCTTTT GTAGCCCAGG CTGGCCTTAA GCTCCCTACA TAGATGAAAG TGACCCTGAA 2340
CTTTGATCGT TTCTCTCGGT CTGCCTGGGC ACTGGGTTCC TTCTCCCAAG GCTGATTCCC 2400
TCCTGCCTTC TGGGACTGTC ATTTCTTCCT TGACCCTCTC TGACCCCATC CACACACCCT 2460
CCCAACTCTA TTTCTGAGGT CCTGAGGCCC GTGAGTGTGG CTTTGGGACT TCGAATTGGA 2520
ACGTCCCCAG GTAGACAAGC CTCAGGGCTG CTCTAATACA GGATCTGGGA GAGGACAGAA 2580
GGGGTTCAGC ACACCAATCG GGGAGGGTAC GTGGAAGCTC CAGTGAAGGA GTAGAGGGAC 2640
CAGGGCTCCT GGATGGGACT TGGAAGGCTG TAGTGGGTGC TGTGAAATCC CAGGGCACCC 2700
CAAGAAGAGG GAGGGCAGTC ACCATAAAGG TCTGAGGGCA ATGAGATGAA ATATGCTCGT 2760
GGTGGAAGCC AAGAAGCAAG GTCAGGTCAC TGGGGACCCC AGTGGGCAGA AAACTTGCTA 2820
AAGGCTGAAG GAGGGGGGCT GCTCCCACAG CTGGAGAATA GGGGTTCCCA GAGGTGGTAG 2880
CAGGAAGTGA GTCAATTGGA ACCAAACAGG GCCAATGGGA ACCAGATGTG ATTAGGGTCG 2940
GGGGCTGGTG CAGGGAGAGA TGTTTTCTCT TTCCTTCCAA GCTGTGGCTG GGGGAAGGGG 3000
ATAGGGTACA GCATGGTGTT CTTTCCCCCA CCCCACTCCC ACCCTGTCTC CACCTCTGGC 3060
TCAGTGTAGC ATCAGGAGCT TAAGATAAAC CAGCAGTCCC CAACAGGTAA GGAAAGCCAC 3120
GGCTGGGAAG GAGTTTGTAC AATTGCCCAG GTGCCCCACA GACAGTCTCC AGGAGGCAGG 3180
GCAGGGCACG ACCCTCCCGC CCTAGCCTCT GCCTGTAGCT AAGGAGGTTC TTGGGGATCC 3240
AGGCTCTTGG GGTACAGACT GCCTCACCCT AGTTGCTTGC CTGCTGGTAT TGCAGGTTCC 3300
TTGCTGCTTG GCTTTAGAAT CTAGGCTCAG TGCCTGGTTC TACACACTTT CCTCTTTGAT 3360
CCTTAGGTTG GACCAAGTAT TCAATCCATA TTCCCAGGGC CCTTAGTGCT TTTTGTTTGG 3420
TTTTTGTTTT TGTTTTGAGA CTTGTGACTA GCCTGTAACT CACTGTAGAT CGGTTGGCCT 3480
TGAACTTGAA GCAATCCTCT GCCTCTACTT TCTAAGTGCT TGGATTATAG ATGTGTACTA 3540
CCACCCCCAG CTTCCTTCTA TATTTTGTTT ATTGGTTGAT 3580