EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16509 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:139134190-139138980 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr4:139138476-139138487GCAGGGTGTGG-6.62
ZNF263MA0528.1chr4:139136967-139136988AGGGGAGGGAGGGAGAGAGGT+6.05
ZNF263MA0528.1chr4:139136962-139136983GAGGGAGGGGAGGGAGGGAGA+7.85
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02613chr4:139137371-139156823HFSCs
mSE_03926chr4:139136405-139138020Cerebellum
mSE_09441chr4:139134036-139139144MEF
mSE_11727chr4:139136120-139138237Placenta
Enhancer Sequence
ACTTATCTAG CATGCAGACG GGATATTGGG TTGCAATAAG TAACTATATC TGAGCTGCTA 60
GCCTACCTCC GGTTCTTTGA CTACTAAGAG GTCACAGTTT AAGAGATGAG ACCAAGGTGT 120
TTAGCTGCCA GGTCCCTAGA GTACCAAAGG TATGGTGGCT TCCTGGAGTG TCTAGTGTGG 180
AGCCTTGCGT TGAGCACTGG AGAGGTCCTG GCTGGAGAGG GAAGGGCTCC AGGGCTGTAT 240
CTATCCAGAG GACCCCAGAG GCTCCTGCTT GCTTCACTAA GTGGTAAGCT GGCTGTATAG 300
CTAGGTCTAG AGGCTGCAGG TGTCTGTGGT TCCGTCTCAT GACTTGTTCC TAGCCACGTT 360
GCACCTGTAG TTTTCCGGTT TCGCTGAGGT AGAATCGGTC CATCTTAAAG CCACCGAGTT 420
TTAAGTATAG CAGTGATTTT TAGAAAATGT AGAGCCATGT ACCCATCTCC AGGGTCTGCT 480
TTTAGAACAC CCCCCACGCC CCCAAACTCC TTCCTGCCTG TTTGCAAACA GCTCCCCTCT 540
GGAGCAGTCC CTGCCGGTGT CTCTGCCCAT CTGATTTTTC TGAATGACTC AAAAGCTGGA 600
TCCCATGATC CGAGGTCTTC TGTCCCTGAC TTCTTTTACA CAGGCCGTGT TTTAGTGATG 660
TGTTGTGTTT GTGTGTATTT GTAGAACATC CCTCCTGATT GCTAAGTCAC ACACACAGAT 720
GGGTATGGGT TTGTCTGTTT CTTCACCTTA CATAGTCTTG GTTCCAAGTT TTAAGTGCAC 780
ACACCACCCA GAGCAGAGCT TCTGGCCCCA GCGTGCCCCC GCCCTGACTC TGCTCACCGC 840
TTCTTTGGTT TCTCTTTGGC CCAACCTGCT CTTTACCGCG TGGGAAGTGT GGTCACCGAG 900
GCTGTATGGA GGGCAAAGTT GTGAAGCGTT GATCTGGAAA CCAAAACAAA CACTGCTGAC 960
TGTCACCACC CAGTCCACCA AGATCTCTTG TTCTGAGTTT GCAAGTCGGG GGGCTTTCCC 1020
CCGGGAGAAT CCTGACAAAA TATCTGAACT TTAAATACCT GCCTTTTCTG AATTAGTCTC 1080
CGAGGGACCT GGACTCCCTT GGGGGATCCC AGGGTGTGTG TCATGGCTGA TCTTTTTGCC 1140
TTTTCAGATG GCTTTGTGTT TATTGTGCTT TCTATAGGTT CTGGGCATCT CCACTTTGGA 1200
TGGCCAGAGT CTATACCATG ACGTGTTCAT TTATTGGAGA AGGAGGGTGG GTCACTTTAT 1260
GGTCGTCAAG CAAAAGTTTT ATGCAGGTCC CACTGGCTGT TGTGGGGAAG TTGTTGCCAC 1320
CATTCCAGGA AGTGACAATT GCTGGCACAG GCAGCCCAGC TGCCTGCCGT GCAGGGTAAC 1380
TTTCTAGTGT CCCGAGGTTC AAAGCCCCGA GCCCTGTAGG CCCTGTGATT ACAGGCTGGC 1440
CGACTTTCTA CCCTTGCTGC AGATAGACAG GCAGAGTTTA TGTGCTCCTG GCTGGCTTAG 1500
TCCTTGGTAT TTGGGGCAAT GGAGGGCTGT CAGAACATCT GAGGGACCCT TGTAGTCTTT 1560
TATCTTGGTG GGCCCTTCAG ATCCCCTGAA CCCATAGTAT GGTGCCTCAT GGGTGAGTCT 1620
GGGGACAGTT GGAAGCTGAG CCCCAGATAT TTGATCCAGG CCAACCACAG GCTCTTTCTT 1680
CCATGATTCT AAAGGATAGT CTGTATAGAA ACAGGTTTGC TATTGATAAA AGAAATCACC 1740
AATTCAGCTG TGTACATTCC TGTCAGAGGT GGAGAAACTG AGGCCCGGGG GGTTGGGGGG 1800
GGAGCTGCCA TCCACAGCTG GCTTTGGGAA GCCCTTCTAA CTCATCCTAA CTCTGATGCC 1860
CACATCTGCC TCCAGCGGGG CCTTCTCAAA GGCCTTCTTC TACTGCTGTG CTCAGAGTCT 1920
TTTAAAAAAG CTCGTTCCTA GGACAGGAGG GACTTCTGTC ACAGCTATTT CTGACTGTGA 1980
GACGGAAGGG GCTGGGCTCC TAGCTAAAAT GGAGGGCTCC AAAAGGGGAT GTTAAGTGGG 2040
CAGCTGGAGT GTCCCTGACT TTCCCAGCAT GTCCCAGGGA GGCCCTCCAG CAAGTGGGTA 2100
CTGGCCGCTT AGTGCTCCGA GCTCCAAAGA CTGTCTCAGA AGATTGTCCC CAGGCCTCTG 2160
GCACTTTTTA CATTTCTGAA GCTCCCAATA ATAGGGTCCT TTAATAATAG GGGTTTTCAT 2220
TTCTCAGTGA GGCACCCTAA GATGATGTGA AAGTGTTCGA ATCCTGACTC TGCCGTTCTG 2280
TCTGATCATG GGCAAATCTC TTGGCCTCTC TGGGCCTGGC CCTCTGTACA GAGGGATGCT 2340
GGGGAAGAAT AGTTTAGTTC TTCAGTGAAG GCCCCACAGC CTGGGAAGGT CTGAGGATGC 2400
TCTTTATTGT AGCCCACAGA GTCTGTTCCC TTAATTTATA GGGCCCTCTG GGCACAGCCC 2460
TGGGCTGCCC AACAAATCCA TTTCAGGACA CATTGCCTCT GTCTGTGTCC CATGGAAGGC 2520
GCCAGAGCCG GTGCTGGGGG TGGAGGGAAG CCTGGCCTCC CCTTTGTCCT GCTGAAGGGC 2580
AGTTCGGCCA TTCTAGGAGT GATTTGTGCC TCCGGAACTC TCGATTCCCA CACCAGCCCT 2640
TTGTCTTAAA GGAATCCACA CCCATATCCC CTCCTTCTAG GACCTCAGTT CACTGGAGAA 2700
CGGGGTTACT AAGTCTCTTG GCCAGCTAGG CATCTCCCTG GGGGACAGAT TTGGGAAGGC 2760
CTCTCAGAGC CAGAGGGAGG GGAGGGAGGG AGAGAGGTCC CAGAAAAGAA GGGAAACCAG 2820
GGGACAGCTG ACTCTGAAGA TTCCTTCCTT CCCGGAGGAA TGCAGGCGAG GCTTTCTGCC 2880
GCTGCTGGGG CCCCACCGGA TGCATGCCTA CTCACCCCCA CCCCCACCCC CAGCCGCTGT 2940
GCACAGCCAC ATGTATCCGT GCACAAAACT CGAACATGCT TGCAAGCACC TGGTCTCTGG 3000
CTTGAATCTC CACACGTGTC CTGTCAGGTC GCTGTTGAAG GACACTGAAG GGGAGAGCAG 3060
ACTCTAGCAG ACTCTCTTGC ATGCATCCTT TGCTGCAGCT AGATTCCGTG GCTTCTGGTG 3120
GCAGAACTGA TCGAAGCCCC GCTGGGTATC AGATCCTGGA GGACTGGGTG GGACTTTGTG 3180
GTCCCCTCTT TGTTGGCATT GGGGACATGA TGCCAGACGG GCATTCTGTG TAGTTTTGTG 3240
TCACAGATGG CTGGAGTCCT GAGACAGGAC TACCTACCCT TGGTTCCCCC TGTGCTCAGT 3300
AGTAAATGTG TGAGCCCACT GAGACTGCAC TTCCTCCCAC CCTGTTGCCC CCACACTCTG 3360
AACCCTAACA GGCTGGGATG TGGCTGCTCT CCGGTGCTCG GCAGCTCCGC TGCTCCCAGC 3420
TTCCTTCAGT GTTCACAGTG CTCAGTCAGA CCGACCAGAG TCCACAATGA ATAAATATTT 3480
GTGCAGTCTG GGAGGACTGC AAGTCTGGCT GCTGGCTGCT ACTAGGTGCC CAGGAGACAG 3540
AGAGGTCAGG TGGCACAGGC TGGGCATCTT AGGGGTCTGG CTTACTGGGA GGAAGGGTCA 3600
ACATCTGGAG TTAGAAGGCA CAGCTTCAGT CCGGATATAG CAATTCTGTG AGCTGGCATG 3660
ATGCCCAGGC CTAGCACAAT AGAGAAAAAC TGTGGGAGTC TGGGCAAGGT GGTAAGCCTC 3720
TCCCAGTCTC AGTTTCCCCA TCAATAGAAT GGGAAGGCTG CTCATTGTGG TACCATGCGT 3780
CTACATGTCT GTCATCCTGG TGCTAGGGAG GCTGAGGCAG GAGGATCTCC ATGTGTTTGA 3840
GGACAGCATG GGCTATACAG TGGGTTCCAA ACAGCCAGGA CTACAACGTA AGCTTGTTTA 3900
GAAAAGCCAG AATGGATCAG TTGGATCAAC TGGGGAAAGC TAAGCTCCTG TATCAGGATG 3960
TGGCAGGAGC CAGTGGGCTC ACATGGCTAC AGAAAGGGTA TACACGGGAG GTAAAGAGCT 4020
ATGTGGGGAG AGTTTGCAGG GTGGTGTGGG GGATGGACTG GCTCTGCGTA GGCTGAGCAC 4080
TGAGTGCCTG CTTGGGAACT AGGCAGTAGT TTAGGGGTTG GACATACTTC TGGGTGCACC 4140
ATCCTGCGAG GTTTAGGGAA AGTCTGAGAC CAGGTGGGAG CCTCAGCTGG TGAGCATTTG 4200
GTTAGCCACG TCAGGGGAGC ACCTCCTGTC CACGTCAGGG GAGCACCTTC CTGTCCATGT 4260
CAGGGGCTGA TGGGATGCCT TCCTAGGCAG GGTGTGGTTT CTTATACAGT CACTGGTACA 4320
AGAGGAACTG TCACCCAGCA TAAAGCTAGC AAAAGGACCC GGCTGAGCCC CCTCCCCTCC 4380
ATCGTGGGCT GCTTGAGCCC GTGGAGTCCA GTCCTTGTAC AGATCTGTCT AAGGGTGCTA 4440
GGCCTTCCCA GGTTGGCCTC CTGGGAGGTG GGGATGGGCT TGCCCATGCC CGTGACTTCC 4500
TGTGTTCCTT GTGACTTTCC TGGATAGGTC TGGATTTGAC GAGGTTCATT GTCTCTCTTA 4560
CACCTTAGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCAACACT TGGGAAGCAG AGACAAGAGG 4620
ATTGTGGAAA GTTTAAGGCC AGTTTGGGCT ACAAGGCAAA TTGAATAAAA ATGTTCATGG 4680
CCAGCCTGGG ATTCACGATG AAACTCTGTC TCAAAAGGAA GAGGGGCTGG CAAGATGGCT 4740
TAGCGAGGCA TAAAAGCTTC CTTCTGGTCT CCCAAGAGTT TCAGTAGGCC 4790