EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16455 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:137052980-137056580 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nr2f6(var.2)MA0728.1chr4:137055112-137055127TGAACTCATGACCTT-6.09
Nr5a2MA0505.1chr4:137055104-137055119GCTGGCCTTGAACTC-8.25
RARAMA0729.1chr4:137055109-137055127CCTTGAACTCATGACCTT-7.03
RREB1MA0073.1chr4:137054950-137054970GGGTGGGGGTGGGGTTGTGT-6.01
RREB1MA0073.1chr4:137054955-137054975GGGGTGGGGTTGTGTTTTGG-6.3
RREB1MA0073.1chr4:137054957-137054977GGTGGGGTTGTGTTTTGGTG-6.46
RREB1MA0073.1chr4:137054484-137054504CCCCACCCCACCCCCTTCCT+6.57
RarbMA0857.1chr4:137055112-137055128TGAACTCATGACCTTC-6.57
Number of super-enhancer constituents: 8             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04794chr4:137052452-137055826E14.5_Heart
mSE_06615chr4:137052507-137057012Heart
mSE_07678chr4:137052562-137055142Intestine
mSE_08175chr4:137052757-137053530Kidney
mSE_08175chr4:137053532-137055512Kidney
mSE_09367chr4:137052469-137058321MEF
mSE_10092chr4:137052479-137054816Embryonic_stem_cells
mSE_11199chr4:137052535-137059015Placenta
Enhancer Sequence
GCAGTCTATG GTATAACCTT TGAAAGGTTC ACACTCAACG CTCTCTGTCC TGTATGTACC 60
TGTGTCCCCA TGTTCCAGGC CTTGTCTGGT TTCTATGCCC TGCATGTCTC TGCGCTCTGA 120
AAGCATCCTA GTCAACCTTG ACTCCCTCCG AAGCCTCATG GATGCTACCG AGGATAGCCT 180
ACTTTCTGTC TCTTCTTTCC TTGTCCCTCT ATAGGCCTTG GATCTAGAGG TATCTCCGTG 240
TGTGTCCCTT ATCCTCACCA AGAAAACCTG GACAACACCC AGGGCATGAG TCTGCTGCCT 300
CCCAGAAGTT CTTGTTTGGC CACCTGCTTG GGTTCAGAGA GTAGCTGTCA CTAGGGACCA 360
CCCTGCCTGT ATCCTTGCCT CAAGGAGTCA CTCCCTGAAG TTAGAGGCAG ACTTTGGCCT 420
TGGCCTACGT GAGTCAGCCA CTCCCCTTCC CCTAGCAACC TACAGGTCTG GAAAATCCCC 480
TCTCTGCTTG GCTCCTTCCT TGCTGGCTCA GATCTCCCTC CAGCCCTGCC TGAGTACTCC 540
CGTTCCTCTG GGAGGAAGCA GGGCTCCCGC ATGGCCGGAG ACAGGCTACG GGGCAGGAAG 600
CCTGGGTTCT ATTTCTGCCT GTGACCTTGG AGCTACCCAT GGCTCCTTAG GACTTAAGGA 660
ACACACTTGC ACAGGCCCAG GCTGCTGCCA GCCCAGCATC CCCTTGGGCC ATTCAGGGGA 720
CTGGTCAGGT TGGAGATGGA GCCTGGGTAG CCTTGGGCAT TCATTCTGGT ACTGCCATCC 780
TGTTGGGCCT TGCAGCCTCA ATGAGGTCTA GCCCAGTGAT TCGGCTTTGC CTGGTTAGTG 840
CAGAGCTTGA AGCACAGGTT AGCCCCATGG TGATCTAGGC AGGGTCTATG GGGAAGAGCC 900
GCACACCACT ACCTCACCAC CTCAGAGGGT CTTTGTGAGC TGTGGTTCTC TGGGTGACAT 960
GTATTATACT GAAAGGGGAC CTGAGGGGGA CTCTCAGGGT CCTTAGCACT CACTGGTGAG 1020
AGGTTAGGTC TGCAGCCAGC TTCGGGAGGT CCTGGTGTGC AGGGAGCACT CTGTGAGCGA 1080
GTACTGGCTC TGCCTTGACT GTCCCAAGGA AAGGCTAGCC TGGCTAGCAC TCAGACTCTT 1140
CTACCATCAG GTGTCCAGGC CCACTCTGCT TTTTTTCCAG AGCCTCTTTC CCTCTGGCTC 1200
CATTTCCCCT CCCAGATGTG AAACACAGCT GCCTTTGCAT AGACAGCTTT TTTTTTTTTG 1260
CAAACGAACT CTCTGCCCCT GGCTGTCTTA CCTCTCCCTG AGGGCCCTGG CTGCCCCTGT 1320
ATGCTCCAAT ACTGGGGAGA GAGCTACAGG CGAGAGCAGC TGCCACCGTC AACCTGGTGT 1380
CTAGGGCTGG GGGCCTTCTG ACTCAGAGCC CTGTGCCCTT GGCCTTCCTG CAGATGTGTG 1440
TTCCTGGCGT GTTTTTTCTT GTTGAATCTC ACTTTGCTAT TTCCTGTCCG GTTCCAGGCT 1500
ACTCCCCCAC CCCACCCCCT TCCTCTCTAC AAGAAGCCCT GGATCTTGCT TAGCAGCAAG 1560
AGTTTCCTTT CCAGACAGCA GTGTCTAAGT GGTGCCAGGG ATCTGTGCAC CTTGTGCTTG 1620
GCCCCCATAG CTTTGCTCGA ATGGGCACTG GGAGGGTGTG ATCATAACAC CGTGACTTTT 1680
CCTACCTGGA AAGGACCCAA GTATGCCCTT TCTCAAAGCT CCTGTGCCCC TGATCACTGT 1740
CCCTGCCCCA ACTCTAGCCT CTTAGTCCCC TGGTGTCAAT CAAGGCCTGC TCAAGGCTGA 1800
CCCTCCAGAC ACCTCTATTC CCAGGCAGGG AAGAACAAGC CTCCAGTCTT GTTCTTAAGT 1860
GCGCCTCTCA GAATCTCATG GGTATGCACA GCTCTGTCAA ACCTGCAATG AGAAGCTGCC 1920
TCCGGGGCTC TGAGAAGGAG CCAGAAATCT GTTTTTCACC TGCCCTTGGG GGGTGGGGGT 1980
GGGGTTGTGT TTTGGTGATG GTGGTACTTG GGACCAAACC CAGGGCTTTG CGCCCATGAG 2040
GAAGGCAGGT GTTCTATCAG CGAACTACTG AGATACACCC TAGACAGGAC ACTGGTTTCG 2100
AGGCGAGACC TCAATCAGGC CCCTGCTGGC CTTGAACTCA TGACCTTCTT GATTTTGCCT 2160
CTTGAGTGCT GGTATTACAG GCATGTCATA TGTTCTGCTA CCACTCCTGG AGAGTCTGAG 2220
GTCACATACC TGCATGCATA GGGACATAGT CTGCAAGCCT TTGACTACCA CTGTGGACAG 2280
GAATGAGCCC CTTATGTGGT CAGGAGATGA GAATCAGGTG GCAGCATGGC TCTTTGGCTA 2340
TGAGGATCAG ACAGTAGGTC ACACCATGCT GTCAGGTGAG GGCAGTACAG CTCTTATCCA 2400
AGGCTCAGCA GCCGGACAAA CACAAAGTGA CCACGTGGTG CTCAGTCCCG GACACACACA 2460
CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA TATGATGGCT GTGCCTGGCA 2520
GTTAAAATGA GCCTCAGCTC CCGTGTGGAT CAACTGGCAG CAGATAAGAC AGACCCAGGG 2580
ATTTTGTGTC TACTTATGGG AACAGGAACA TAGGATGGGA GAGAGTGCCA CATAGAGTGA 2640
AGGAGAGACC AGTGGTTTGC CCATAAGTGT GTGAGTGTGT GTGTGTGTTT GAGATAAGGT 2700
CTTAGGTAAC CCACACTGAC CTCCACTTGG CTGTGCAGCT AAGGTTGACC TCGAACTGAT 2760
CCTCTTGCCC CTAGCCTAAG TGTTGGGATT ATCGGTGTGA GCCGATACAC CAGGCTAATT 2820
CTGCCTTTTT GTTACTGGGC AGTTAGAGGT GATGGCTAAG TAGATGTAAG GGATAACAAG 2880
AGTTGGTTCT AGAAACCAGA CAGAAAAGGA CATTGCAGCA GAAGGCCCTG GGGGACATGA 2940
ACTGTATAGA ATTGGGGTTT TCACAAGGAA CTGTGTCCCT TTGACCAGAC ACCGGTGGCT 3000
GAGCCTCCGC AGTGCCTGAA GCCTTTTCAC CAGAATTCTG GATTGTTCTG GGGTCATTGA 3060
ATACCTGGGC CTGGGGCCTC CCAGCCTTTG GGTTCCCTGG ATGTTTTCCT CTTAGTTACC 3120
TGGACAACGC CTTTGAAAAC ATCTAGATAT TGTCCAAGTA GATGTAGGCA TTCGCAGCCC 3180
AGAGCCATTT CTGGGGAAAG CCTGGATCAT GGGTCCCTGG ACCTCTTGCT TAGCCTTGTG 3240
CTGTGCCGCT GCCCCGAACC TCCCCCTCGC TTTCCCAGGA CAGATGCCAG AGATGCACTT 3300
GAGCTTAGCA TTAGCCTGAG GTCGTGGGGA GCTGATGTCT GTCTTGCCTC CGTTTAGACA 3360
CAAGCATTTA GCTGCGGGGC TTTGCGTGTT CTGAGCAGTG GGATGATTTA GCTGCGGGGC 3420
TTTGCGTGTT CTGAGCAGTG GGATGAATTA GCTGCAGGGT TTTACGTGTT CTGAGCAGTG 3480
GAATGTGCTG CCTGTGACCA GGCTTGGACA CCAGACCTGG TGGTGAAGGC CAAGGGCTTG 3540
AGGAGGGAGG AACTGTCACA GAAGTCTACA TCAATTCTCT TGCTTCTGCC CTTGTCCCCT 3600