EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16413 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:135779610-135780700 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr4:135780507-135780522AGAGGTCAGAGGTCA+8.73
Nr2f6MA0677.1chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+7.42
RFX1MA0509.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+7.99
RFX1MA0509.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-7.99
RFX2MA0600.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.31
RFX2MA0600.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.35
RFX3MA0798.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.45
RFX3MA0798.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.4
RFX4MA0799.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.01
RFX4MA0799.1chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.04
RFX5MA0510.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC-8.42
RFX5MA0510.2chr4:135779942-135779958GGTTGCCATGGTAACC+8.51
RXRBMA0855.1chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+6.91
RxraMA0512.2chr4:135780508-135780522GAGGTCAGAGGTCA+6.88
Enhancer Sequence
TCAGTCTTAG TGTTACAGGT ACTGGGCTCA GTCTATATCC AGTGGCTTGG GCTCTCCAGA 60
GGCACCCTCA CGGTGGTCCA GAGCAAAGCA GTAAGTGGTC AGTCCACCTC CTGCTTCAGC 120
TGTAGGCTAC AGCAAGAGTT TACAGGCAGC GGGTACCTGA GAGCTCTCAG CAGAATGACA 180
AACCCAGAGC CAGTGGGAAA ACCGCGGTTG CTGATTGGTG ATAGCCGTAA TGGTCACTGG 240
AGATTCAAAA ATGGTGTCTG GGCCTGGTAT TATACTGGTC CAAAGGAGTG AAATTTAATC 300
TACAGCTCCC AGGGCTTTCT GTCCCTTTGC TCGGTTGCCA TGGTAACCAC AGCTGGCACC 360
GCAGAGCCAC AGGGATGAAG AATGGGTGCT ATTGATGCAT CCTGACCCAA GGAGAGGTGC 420
AGGCAGAAGA CCTTTCTAGG CAGGGCATCT GGGCATGGTC TGGTGCTGCC ATCTGTGGTC 480
TTTTGCACAG GCAGAAAGCA CAGGCTGAGA GCCAGAGTGG TGGAGAGTTT GTGTGTGTGT 540
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTCT CGGGTGGGGG AGGGGCACAA 600
AGGACAATAC CAGTAGTTGG AATTCAGCCC TTTTCTTGGG CTGGACAGGC CAGGCTGCCT 660
GAAGGACTCC ATTGGGCTTC CAAGTTCAAA CATCTCTTTT GTGCTGTGTT TCACGCATCT 720
TGGTCCCGTG CCTATGGAGG TTTCTGCATA GAGGCACTGG CTCTTAGTGT TGAGAGAAAT 780
CTAGGTGGCC ACCAGTCCTT CCATCTCACG CATTTATTTA TTTGTCTGTC TGTCTGTTTC 840
AGTGTACCCG TGAGTGTGTG TGCATCTTTT CGAGTGTACA TATCAAAGCA GGAGTGTAGA 900
GGTCAGAGGT CAGCTGCAGG GCGTCAGTTT TCCCCCCTCT CACCTTGTAG AATCCAGGGG 960
TCTGACTCAG CTCATCAGGC CCTGTGCACG AGCATTCTTA CCTGCTGAGC CATTTTTCCA 1020
GCCTTCGCCT CCCTGTTCTG ACGTAGAATC CAGGGCCTCA GTCTCTGCAG CACTGGAGTC 1080
CCTATGTCAA 1090