EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16185 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:128574420-128577780 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6BMA0731.1chr4:128576269-128576286TGGATTCATAGAAAGGA-6.37
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:128577494-128577512CCATCCCTCCTTCCTTCA-6.56
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:128577498-128577516CCCTCCTTCCTTCATGCC-6.65
Gata1MA0035.3chr4:128574583-128574594AGAGATAAGGA-6.02
ZNF263MA0528.1chr4:128575484-128575505TCCCCCCCCCCCCCCACATTC-6.15
ZNF263MA0528.1chr4:128577490-128577511TTTCCCATCCCTCCTTCCTTC-6.15
ZNF263MA0528.1chr4:128575491-128575512CCCCCCCCACATTCCTTCTCC-6.31
ZNF263MA0528.1chr4:128576207-128576228TCCTCATCCCCTTTCTGCTTC-6.58
ZNF740MA0753.2chr4:128575485-128575498CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr4:128575486-128575499CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr4:128575488-128575501CCCCCCCCCCCAC+6.92
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03700chr4:128574790-128578393Cerebellum
mSE_05898chr4:128574788-128577843E14.5_Limb
Enhancer Sequence
AGGCTTCTGG CTATCTGAGG GGCTGAACAC ACCTGCTTGG TCTCTTTTGT TCTTCCTGTC 60
CCTTCTCTCT GTCATTATCT CCTCCCTCAC TGTCCAGAAG CCAACTGTGG CATGTCTCCT 120
CCAAGCCATG ACTGCTATCA TTTCCCCTCT TGGACTCGAG GATAGAGATA AGGACTCTGA 180
AGCCAGGTGT CATGGGACAC ACCTGTAACT CAGCCCTAAG GAGGCTAGCA CAGGAAGGGG 240
TTGAGTCTCG GGCCAGCCTG GGCTACATGG CAAGACCTTA TCTCAAGATG TTGGGGGAAC 300
CTGATTCTAT CTCTGAGAAG TAGAAGGAAA TTCTGTTCCG TGGTCTCTGG TTATAGTGAC 360
AGCAAAGAGC CTTTTATCCT AGCACAGGAA GGGGTTGAGT CTCGGGCCAG CCTGGGCTAC 420
ATGGCAAGAC CTTATCTCAA GATGTTGGGG GAACCTGATT CTATCTCTGA GAAGTAGAAG 480
GAAATTCTGT TCCGTGGTCT CTGGTTATAG TGACAGCAAA GAGCCTTTTA TCCTTACCCT 540
GAGAGGAGTC CTCATGTCCA GCCTAACAGT GACCCTGTGA CCCTGGGTAA AGCATATTCC 600
TGACCCACCT GTCCAGACAG TGGGAACTCC GACCAGTTCA ATCTAGGACA TCGGGTCTGG 660
AAGCAGAGTT TCACATACTC GGGAACTCTG GGAAATGACT TTAGGCTGAC CCTGCTCTTC 720
AAGATCAAAA GTGGTGCAGC TGGAACAGAG CCTTGGGGGT CCCCTGGCCT GGAGAAGCCA 780
TTGGTCACTG GTAACCTCCA CCTGGAAATC AGCGGTGGCC ACCACCCCAC AGTGTGGTCT 840
TGGGAGGGTC ATGACAGACA TTCAGGACAT TCCAGAGGGC CTCTGAGCAG GGCCCCTCAG 900
TGGGAGAGAG ATGAGAGACT GCCACGGGGT TGCGACCTCA GTGTTTCTCC TCTTAGTTTC 960
TCTGTCCAGC AACTCCACAC TGCTCCCGTG AGGAGAAACA GATGGGAACC TGTTTGAATG 1020
GGCCTGTTCT CCCCTAAGGC GGCTTCCCTT GTTCACCCCT CTTCTCCCCC CCCCCCCCCA 1080
CATTCCTTCT CCTCCACTGA CCTCCTGCCC GCCTTTCCTG TCCATCTGTG TGCTGCTGGG 1140
GCCCCACCCC CTTCACTTTC CCCAGCCTGG CTTCCTGTCT GGACCCGGTA TATTTATATA 1200
AGAAATGCTG ATGGAAGTTT TGAGGCTATA TTTCACCTGG TGTCTGACTG GCTTCGATGC 1260
CGCACCTGCC TGCCCTCCAA TGGCCTCGCC TGGGGGAGCC TGTCTGCTCT CCCTCCTCCA 1320
ACCATGTTTT CCTTGGTAGG CTCTGAGATG ACATGTTTTT GGCCGAGTGT TTCTGAAAGG 1380
GCCACAGCCA CCCCAGACCC AGTGTGTGTG TGGGAATGTG GTAACCTAGA CTGCCTTCCC 1440
CACCAAGGAA CTGAATGACA GCCCAAGTTC AATCCCGGGG ACCCCCCAAG TTGAAAGTAG 1500
ACATGAGAAC TCAATACCTG CCCCCCAGAC CTAGCACAGT GCCTGATCTA TAGTGACTAA 1560
TTGTCAAGCA AATTGAGTTT AAAAAAAAAA ACCTAACAAT AATAATAAAG TAGGAAAACG 1620
TAACCCCAAC GAGGAAATTT CAGCCCGGAG AGACTGGACA GACAGCCAGA GCCCCCAGCC 1680
CCTCCTGCAG CTTGTTTTAG TGGCAAGATG TATGACACTG TGAAGAGTTT GGAGGACCCC 1740
ATAGGGTTGT GTGCAGCACT CCTGGACTGA CGCTCTGATA TGCCACTTCC TCATCCCCTT 1800
TCTGCTTCCA TCCTCTTTCT CCATCCGTCC TCTCTTCTCC TGGGGATGCT GGATTCATAG 1860
AAAGGAAACG TAGTCTGCCC CAGCTTTGTG GTGCGATCTT AAGCAAGTCC CTTCACCCCT 1920
GTCCCCTCCA TCCCTGACCT CCAGCCTGTG CCAGCCCTGG GGTTGCACAC AGACAAGGGA 1980
ACATGACATT TCAACCTAGG AAGGGCTTGT GCAAGGACTA GAGGGACAGA TTGTGGGAGA 2040
GACAGCAGAG AAGAATGCTG GCCTGTCTAA CACCTGAAAA AAAAATGAAG CAAAGTCTCT 2100
GGGGAGGCGG GGAGCTCTCC CCCCCACTAG GTCTTGGGGA GACACAGAAA CAGAGACTAA 2160
CCCAGACAGA CAGGGTAGCC CTGGAAGACT GCTCCAGAGG GTACAGGGAG GTGGAGCCCA 2220
TCCCCCCCTG ATGTGGCTGC TTCACCCTCT CTGGGTGAGA GACTCCAGGA GGCCTCTGGC 2280
AGCCCAGTGC CTGCATCCCC AGCTCCTCAG TCGACTCCTT CTTTGTCTTC CTGGCGTGTT 2340
GGGTGGGCAT GCGCAGGGAG GCTGGCTCAC CGCCAGGAGT TCTTCTCGCA GGCCGGCAGC 2400
CACCACAGGA AAGAACAGGC CCTAATTGAG CCTTTCTGGA GCCTCCCACA GAGCCCCAGG 2460
CACTGAGCAC AGTGGGGTCT CTGACTCTGT GAACTGCCAG CCAGAGGCCC ACAAAAGTGA 2520
AATTGCAGAG GCAGGCCCCA CATGGTGGCT ACATCCTGTG TCGCCTGAGT GTCAGTGTTC 2580
CTCAAGCTGC CCCCTCTGCC TGCCCACCCC CATCCCAAGA GCCTGATCAG AAGCTATCTC 2640
TCCATGGGTA TGCCTATTAC AAACCACATC AGCTTTCTTT CTGCACAGGG CCCATCTGAT 2700
AAACATCTCC ACCACTCCCC TGCAATGAGG CTTGTGTAAC CCCTCATAGA GAGGGAGACT 2760
GAGTAAAACC AAGCTTAGGT AGTTGAGCCC ACTACAGCTA GAGACCCAGT CACTCCTGTG 2820
CGTCCTCTTG GGCCTAAGAG AGTGTCTCTG TGTTCAGACC TCCCTTGACA GTGTGGCCTT 2880
GTTCCCACAG CAAAGGTCTT GGGGGGAGCT GTATGGGCAA ATAACTACCA AGATTTGTCC 2940
ATCCTGTGCC TGTTTATGAG TGTCACTGAC CGCAAGATCC CCTTTGTCAT CCTTTAGAAC 3000
CTATAGATGC GTTGTTTAAA TGGCAGACCA CTAAGTCTGG GGTTGGACAC GTAGGCATCC 3060
CCTACCTAGC TTTCCCATCC CTCCTTCCTT CATGCCAAGC GTCTGGGCCG TACCACCCAC 3120
TCATGTCCTT CACAGCCTCG GTGGCCCCAC TGTGCCTTTG ATGGACCCCC ATGGAACAAT 3180
GAGATGAGCC CTTTCGCCCT GTGCAGGTCC CATCTCACTC CCTTGCTTAT CACCTGTGTG 3240
CCGTCCCCTG CCCAGCAAGC CTCCCCTCCC CCATCTTTGT GTCAAGGCTC CCCCTCCCAC 3300
TGGCCACTGG ACACACGTAG ACTTTCCCAC AACCCCTGAC AGTTGCTTCC TTGCCCCCTG 3360