EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-16128 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:125267220-125272340 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA5MA0766.2chr4:125268656-125268666CAGATAAGGA+6.02
KLF5MA0599.1chr4:125267970-125267980GGGGCGGGGC-6.02
NFIAMA0670.1chr4:125267798-125267808ACTTGGCACC-6.02
POU4F1MA0790.1chr4:125269097-125269111CATTAATAATGTAT-6.61
POU4F3MA0791.1chr4:125269095-125269111AACATTAATAATGTAT-6.03
RARA(var.2)MA0730.1chr4:125269510-125269527TGAACCTTCATTGACCT-6.05
RARAMA0729.1chr4:125270050-125270068CCATGACCCTGTGACCTC-6.51
RESTMA0138.2chr4:125267937-125267958ATCAGCACCTCGGAGAGCTCC+8.86
Rarb(var.2)MA0858.1chr4:125269510-125269527TGAACCTTCATTGACCT-6.16
RarbMA0857.1chr4:125270053-125270069TGACCCTGTGACCTCT-6.23
STAT3MA0144.2chr4:125271704-125271715CTTCTGGGAAA+6.62
ZNF263MA0528.1chr4:125270957-125270978CCCACCTCTCCTACCTCCTTC-6.66
Enhancer Sequence
TGTTGTGCAG GAACATGAAT GTATGCATGT GAGAGAATAC TTCAGCGAAT GCACATGTGT 60
GTAAGAGTCA CTCTGTGCAT GTAAATGCCC GCATACATTT GAGTGAGCGG ATGTGTCTCG 120
GCGTACTCTT GGAGAGAATG CTGACACATA GTGACTGCTT CATACATGTA ATGACAGCAT 180
GCTATTGGCC TGTGAATAGA CTTGTGTGTC CATGATATGT GTGTCCCCCC AGTTTCTGTG 240
TATCTGGCCA GCAACTCTGC ACAGCCTTTT TTAACTGTGT GCTGGCATGT GTGCTCACCC 300
CACCCCTCCC CCATGAGGAG GTGTGTGCGT GTACACTTGA GAGCCAGGCG CCTGCTAAAT 360
ATTTGCTTTG CTGGGCCCTG GGGAGCACAG TTGGCAGAGC TGCCAGCCCT GCATGCTGTG 420
TTTTTGACAG CTCGAGAGCA CGGCCTCAGA ATGTGTGAAC TTTCTCAGGG TAAACAGCTA 480
ATGATACCGC CTCGCCTGCG CTGACCCCCT AGCAGGCCTC CTTGCAGGCT GGGAGTTGTT 540
AGGCAGCTAT CAGCTGGTGC CTCCCTCCCT GTTCTCTCAC TTGGCACCCC AGGCCATGAA 600
GGCCTGTGGT AGGACAGTGG GACTCAACAT CCCCTCCCCT CCTCTCTTCC CAGCCAGCCG 660
ACTTTGTAGT AGAAGAGAAA AACACCTTTT CTTAGTCAAT CCCTCCCCCT CTCAGATATC 720
AGCACCTCGG AGAGCTCCCC ACGTACGCTT GGGGCGGGGC GAGGCTACCA GCGCAGCCCA 780
GTGCCTCCCC CTGATTTAGT TCTGGAGTAC CCAGTAAGGG CAGGGCCTCT GGGCCTGAGT 840
CTCTAGCCAC TGTGGGTCTC TGGATCAAGG AAAGCCCTGG TTAGGGTATG ATGCCTGGCT 900
AATGAATGCA ACATCTCACT CTTGCTGGAA TTGGGTCACA GCTTCCCGGA GCTCTTGAAA 960
CCCTGGCATA GAACTGATTT TACTGAGGAG AAAACTGGCC CTTAGTCCGT TGTGCCAGCA 1020
GCATCCTCCC TGAGACCCCT CAGCCCTACC ACTGCCTCTG AAGTGTCATC CTCTTGTCCT 1080
TGGAGAGACA CCTTTGTCCT CAGCTGTATG AGACTCTGAG ATACAGGCTT GTTTGTAACA 1140
GTATTGTGTG CCTGGACAGA TCAATTAGAA CATACGTGTG TACATATGTG TGTTCAACCA 1200
ATGATTAGAC TCACATGGAT GTTTTTTGTG CTTGTCTTAA GACAGAGGCT TCCTCAAAGC 1260
CATGGGGGGA CAGAAGATGT CTAGGTACCC CTGTCTCACA TGGGTCTCGG CTGCCACAAG 1320
GTTATCCACT GTGGGCGAGA CAAGGATGAA CACTGGGTTC TGACCTATAA GCTACATGAG 1380
GTAAGCAAGA GTTGGAAGAG GACATTCCAT ATGACAGTGT TCTCTTTCCC GGTTTGCAGA 1440
TAAGGAAACA GAGGCCCTGT GAGCAAGCTG ACTTATATAA AGACACCAGG GGACCACCAG 1500
GCCCCACTCT AATCCCGACT CTGCAGGTGG TCTAGGCTCT TGCTGGTGGC CTGCTCCTTC 1560
TGCATTGAGC CCCCAGAAAA GCAAGCAGCT TTGAGCAGCT CTCTCAGATC TCAGTCAGGC 1620
TTGAAGAAGC TCTGGATTCT GTTTCCTGCC CTGCTCAGAG CCAATCTAGC CGAGGTCCCT 1680
TTAACAGGCA GATCCAGCCC CCTGCCCCCA ACCCCCTGCC GCTGAGCTGA AGAGAGCAAA 1740
CTTTTCCAGA CAGCCCCTGT CTGTGTCTCA TTACTGAGAC ACAGCCATAT TCCATTAATT 1800
CCTCATTTGC TGTGGGCAAA GCGCTGATAT GTACGTTTTT ACCTGGGGTG GTTTTAATCA 1860
GTTAATTTAA CCAGAAACAT TAATAATGTA TTTCTTTGCC ACTCGACTGC CCATCTGTTG 1920
AACAACTTAC CTGTTGGAAA GTAATGTCAC CTCCTGTGAC TCAGAGCCCT CGGCTGCCCG 1980
GGAACAAGAT GAGATGTTGC ATAGTTAATG GTTTCTTGGA GCAAGGGTGA GGGCCAGGCG 2040
GTGCCACGTG CGTCCCAGGA TGCTGCTTTG AAGCATGGCT TCGCTCCACC TCGGCTCTGA 2100
TGGGCTCCGA CGAATGCCAC CTCCCACTCG TGCCTATGAT ATCTGCTTTG TTGAGGGCTG 2160
TGGCTTATGT GAGAGGCTGA AAGATTACTC GAAGCTCAAG GAGGAGAGAC GGTTGGGAGG 2220
GGATCTATCT GCAAGGCTGG ATCTGAGCTC TAGCAGTTTA TGTTGCTGGT CCTTGGTCAC 2280
ACAGCTCATC TGAACCTTCA TTGACCTCCC GATGTCCTGG GAAGGCTCAG GGAGAAAGAC 2340
CATTGGCGCT TGATCTAGGA AGAGTTCCTT CCTTCCTTAA TAAAATATTC TTGATCCTAG 2400
ACCATTGGGA TCCATCCCAT GAGGGCTGCA AGCCTGAGTG AGCTTGGTGA GCCGAGGATC 2460
CCACTCAGCA TATGTAACCA CCAGTCTGGA GGGCAGAAAC CTCTGGCAGC CCAAGCTATA 2520
CTCATGTGGC CTGGCACAAT TGGCCATCTA GTTGCTGGGC CACAGGGTGT TCCAGGAGGG 2580
GATTCCTCAA GAGGGGGTTG AAGCAGCCGA GGCAACAGGG AAGGTGCTTG GTTGGACGCC 2640
CCCCAACCTC CTTCACCTCT TCCCTTCTGG GATATTCACT GTCCGTCTTC CCCAGAAACC 2700
ATGAAGCAAC AAAGCTCTTG GGATCTTTGG GGAACCTCTT CCACTGCTAA AGCCACTTTC 2760
CCACTAAAGG GCTGAGGCTG TGCTGAGATC AGCTTCAGTA CAAGGCACAG CCGTATTCTA 2820
TGACCTGGTT CCATGACCCT GTGACCTCTC ACTCCGTGAA TCCTGGAGAG AGGTGTGAAT 2880
GCAAATATGC TGCTTCCTGA AGCTCCCAGT GACCCCAAGG TGAACAGAGG ACTTGTCTTG 2940
GATAAGGTCC AGGGTGGGTG CAGTGTTCTC GCAGGTCCAA TCCTCTGTGG GAGCACTTCC 3000
CCCTGCTCGG AGCTGTTTTG CTTTCTTAAA GCTAGAGACA CTGGCAGCTG TAAGCACAGA 3060
CTTTTATGTA CTTCTCTAAA GGGAAAAAAA GAGCCACCAA TTAAACTATG ACACGGTGCC 3120
TTCTTATCAT CTATTGCAAG ACCCATCTCG ATTTCAGGGA TGTTAAAATG AAAAAAAAAA 3180
AGTGTGATTC GGGATCAGTG GAATATGGAA ATGAAAATAA TGTGGCTGCT GTTTATCAAG 3240
GGCTCTGTGC TCCAGGGACT CTGCTGACGG TGGCATCTCA TTAGATCCTC GTGGAACCCT 3300
GTGATTGGAG CGTCTGCTCA GAGAGGTTGA AGGGTGGAGA GTCACACAGT GATCCCCCAA 3360
GAGCTCTCAA GTAGCATTGT GGATTCACAA GATCACTTCC TCGGTCTTCA CTTAAGGACC 3420
ATGAGGTTCG AATTGCTTGC AGGTGGCAGA GGGCTGCTTG GTCAGCCATT CTACTGTCCT 3480
ACGACCAGCT AGGAGGGACG AAGCTGGGCT CCCAAACCTG CTCCACTTAC CTGATGCCTG 3540
TGCTTCAAAG AGAGCAAAGT CTTCAGACGA AGTGGATTGT GTCTCTGGAT TGGCCCCTGC 3600
TCCCCTACCC TCACTCCCCA GTATGGGATG GTCCTTTCTC AGGTCCTCCA GCCCTCTACA 3660
GGCTGTCCCC AGTCCAGCCC AGTCCACCTC TGAACAAGCA TCCACTTTCC CTGCCAGAGG 3720
CCTGGTGGAG GGTGATCCCC ACCTCTCCTA CCTCCTTCCG ATTCCTAACA GCCAGGAATA 3780
TGTGAGCAGA GCAGCAGGCA GGCAAGGACG AGACAGAAAC TGAGATCGAG AGCTGCCGCA 3840
GAAAATTCAC AAATTGGTCC CAGAGAGCAC TGGAGCCTCT TTTTTTGCCC ATCAGCTCAC 3900
TTCCCCAACC ATTACCAGGC AGCTAGCGTG AGGCCGGTGG CTGGAGCAAA AGCCAGGAGT 3960
GGGCGGGCAT GGGGAATGGT ATGGGGTAGA GTGGCTGCTC TCCAGATGAG CACAGAGACC 4020
TAAGGCTGCA GCCTAGTTCA ACATCCTCCA GTAAGAAGTG GGGCTGGACC AGGGGATCTG 4080
CTGTGCCAGG GAGGTGGTGC CAAAATGTAG TTCAGCTCCA TTTAGATGGA CAGAAGAAGC 4140
CAGGACTACC TGATATCTGT TCTGGGACAG GAGGTGCTTT CTGACCTTAG ACATAAACAG 4200
AAGATAGAGT TGGGTCCAGA TATTGCAAAT TCAAAGACCA GCCTTCTTGT GAGTCTCATG 4260
TGTAGAGCGG AAAAGAAGGA CCTGCTGTTA TCAAGGTGCC GCCTGTCTGT GCCAGGCACA 4320
AGGACATCCT TGACCCTGTC CAGAAAGAAG TCTTGGAAGG CGAAGTTGTC ATTTCAGAGA 4380
TGTAACCAAT GACTTGCAGA GGGAATAAGT AACAGCTGGC TAGTAGCTGA GAGAGGTGCA 4440
AACTGCACCA GACTAGCCAA GGGCCAGGCC ACTGCATTCT GGTCCTTCTG GGAAAAATGA 4500
TGCATGAAAC ATGAAGCCGG GCAGGGCAGG GTGAGCTCAC GGAGGGCCTC AGGCATGTTT 4560
GTAGTTACTT AGAACCACGC AGGGCCTGGG ATTGGACACA ACTTGCTGTT GAGAACTGGG 4620
AGCCCAGTGC TGCCCACTCT GTACAGTCGG CTGCAGATTG CTTGCTGTCC TGCCAAGAAG 4680
AACGTCACTT CATTTCTGAA GACCTCAGAT GTCCTGGCTG TAGGAAGGTC TGAGAGGCCA 4740
CTTATACATC CCCTTGTGCC CCCTTGCAGA GCCTGGGCTG CCTAGAGAGG AGGCGCCATT 4800
GCTAGTAAGC TAGGCACCAG ACAGTCTGGT AACACTGTAA AAGGGAGTCA GGTTCTACAG 4860
GCAGAAAAGG TTGACCTGAG GAGAGATGAC TAGGCAGGCT ATGACTTTCA CACCCAGCCA 4920
AGGTGCACAG TGCCTACCGG GCAGTCTCTC TGCTGCTCTG TCTCTGTCTG CTGCCTGCCT 4980
CTTCTCCTCT GAGGAAGCTC TTGGACCATT CCCTTCATCC TTTGTCCTCA GAGTACTACA 5040
TCCACAACAG AGGAGCGTCC TGTGGTTGGT GATTGGTTGC TATTACTCTT TCCCCACCCC 5100
TGTCAGGCTA TGAGCAGGGT 5120