EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-15902 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:108019820-108024490 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 20             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr4:108021957-108021968ATATTTACATT-6.32
NR3C1MA0113.3chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC+6.17
NR3C1MA0113.3chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC-6.21
NR3C2MA0727.1chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC-6.26
NR3C2MA0727.1chr4:108020881-108020898TGGGACATGGTGTCCCC+6.32
Nr5a2MA0505.1chr4:108024443-108024458GCTGGCCTTGAAATC-6.91
Nr5a2MA0505.1chr4:108024151-108024166GAGTTCAAGGCCAGC+8.25
POU1F1MA0784.1chr4:108022849-108022863AATATGCAAATTAG+8.42
POU2F1MA0785.1chr4:108022849-108022861AATATGCAAATT+7.22
POU2F2MA0507.1chr4:108022850-108022863ATATGCAAATTAG-7.04
POU3F1MA0786.1chr4:108022850-108022862ATATGCAAATTA+6.74
POU3F2MA0787.1chr4:108022850-108022862ATATGCAAATTA+6.74
POU3F3MA0788.1chr4:108022849-108022862AATATGCAAATTA+6.92
Pou2f3MA0627.1chr4:108022848-108022864CAATATGCAAATTAGA+6.86
RUNX1MA0002.2chr4:108022773-108022784AAACCACAGAG-6.14
SOX10MA0442.2chr4:108021717-108021728TCCTTTGTTTT-6.32
Sox3MA0514.1chr4:108021718-108021728CCTTTGTTTT+6.02
TFAP2AMA0003.3chr4:108020320-108020331AGCCTCAGGCA+6.32
TFAP2B(var.2)MA0812.1chr4:108020320-108020331AGCCTCAGGCA+6.62
TFAP2C(var.2)MA0814.1chr4:108020320-108020331AGCCTCAGGCA+6.62
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04643chr4:108023176-108024152E14.5_Brain
mSE_05360chr4:108020575-108021913E14.5_Heart
mSE_05360chr4:108022457-108024536E14.5_Heart
mSE_05661chr4:108020508-108021974E14.5_Limb
mSE_05661chr4:108022034-108024326E14.5_Limb
Enhancer Sequence
AAAAAAAAAA AAAGGAAGAA CTGCCAAGAG GGAGTGAACC TAGAAGGATG ACTCACGGGT 60
AAAGCGCTTA TTGTGCAAAC ATGTGGAACA GAGGTCAGAT CCTCAGAACC AAGAAAGCCA 120
GGTGGGTGTG GTCATCGTCC TACAATCCCA CAACTGGGGT GATGGAGGCA AGGGATCCCC 180
AGAACAGGCA GAACTAGTTA GACTGGTCCA CATCAGCCAT CTCTGGATAC AGGTGAGAGA 240
CCCTGCCCAA TAAGTAAGGT GGAGAGTGGT CAAGGGAGAT ACTTGCTGTC AGACTCTGGG 300
CTCCACTTGC ATGCACGGGT AAACATGAAG GCCCACGGAT ACCTGTCTCA CAAACATATC 360
AACATGCAAA AGACTTACCT CATCCCCGAC TCCACAATGA CCTAAAACTC TCCCTTAAGG 420
GCCCTCCTCC CAGAGGTTCT GCCACCTCCC CACAGCAGGG CTCTGGGAAC AAAGCTTGTC 480
CATCCGTGAA GGGACAGGTG AGCCTCAGGC AAGCACAGCC TTGCCCTCCG CTCCTCCTTA 540
CTCCCTCAGC CAGCACTGCG GCTGGATGCT GGGGACACAG AGCCCCTGAC AGCATTTGTC 600
ACTTAGGAGC TCATGGTCCC CATCATGACT GACCACTGTC TGAGTACAAA CTGTTCTAGT 660
CCTCTCCACA ACCCTACAAG GAAACGTTTA TTCTCTCCAT TTTTCAGACA GAGAGACCAA 720
GTCTCGGCCA ATGTAGCTAG TAGGAACACA ACAGACCCTG TGGACAGCAA CTGGGATTAA 780
GACTTGGTCC TGAGCCGGGC GTGGTGGCGC ACGCCTTTAA TCCCAGCACT AGGGAGGCAG 840
AGGCAGGCAG ATTTCTGAGT TCGAGGCCAG CCTGGTCTAT AAAGTGAGTT CCAGGACAGC 900
CAGGGCTATA CAGAGAAACC CTGTCTCGAA AAAAAAAAAA AAGACTTGGT TCTGCCTGCA 960
GCCTTCCATT CAGATGCTGG AAACCAAGCA GCACACATAC GGTATCTTGA GGCTTGAGTA 1020
GATTCTGGGG AACAGGAGTT AGAAGCTAAG GCCAGCTGCA GTGGGACATG GTGTCCCCAC 1080
AGCTCCCTCT GTGCTCCAGA GTCCTCTTGG CTTGGCTACA CGGATGGCCC AGGAGAACAT 1140
GCCTAAGCTG GCTATTCTGC TCACCTTTAG CAAACTGCCC CTGGGCCAGG GTTCCCTGAG 1200
GGAACCTGAA CCAAGCTGGG TTCCATTACT CCAGGAATAG CAGCTGACAC TGCTCCCCAC 1260
CCACCGATGG CTTCTGACCA GGTTCCCCGA GGCCCCAGCA GTCTCCAGAA GCCAGTGGCA 1320
GCAAGCTGTG ATCAGGAAGC TGCTGTGGGG TAGGTAGGAA TAGTGACCTT AATTGCCTTC 1380
TGTGTACAGG GGCCTCCTGG AAGAGAGTGC CTGGGAGGAA GGCTGGGGCC TGTTTTGCAG 1440
ATGAGGAAAT GGGATGGGGG TGGGGACTCA GATATAGTTT GCCCAAGGTC ACGGTGAGTG 1500
CGTGGTAGGC CTGGAGTTGA GCTTAGACTG GCCCTGCTGT GACCCTGATT CTGTGAGAAG 1560
GAAGGAGTAC TCTTAGGACC TCAGAAGGGT CCTGGCATGG CAGACAATTT CCCAGGCCTC 1620
AGAGTTGGTG CCTCAGGGGA ATGTGGCCCA GAATCCTATA AACAGCAGGG ATGAGGGACT 1680
GCGTATTTAT AACCCTAGCC CTCCAGTTGC TACAGATTCA AGGCCTATAG AATGAGTTCC 1740
AGGCCATCTG GGGCTACAAA CTTAAGACCC TGTTTCAGAA TAACAAAAGA AAAGAAGAAG 1800
ATCAGACTGA CTCTCAAGTT AAGGCCCAGC AGCTACATGT AGGTGTTATG CAGCAGTAGA 1860
GCCCAGCTGG CCTTTAGCTC TCTTGGAGTC TAATGTTTCC TTTGTTTTGC ACTGTCTAGA 1920
CTTAGCTTCT AGTAGGCACT TGGCAGGAGG AAATGAACAA AAGATGCAGG GTCCACTCAG 1980
GACCTGTACC TCTGCAAAGG GTGGAATTTG GATTAAAATT CCTGGTCAAT GTTTGGTTTG 2040
GGCTGGACTT TTTCGGTGCT CAACCTGTAG GTCATGACCC CTTTGGAAGT CAAACCACCC 2100
TTTCAAAGGG GTTGCCTAAC ACCATCAGAA AACACAGATA TTTACATTAC AATGTGTAAC 2160
AGCAAAATTA TAGTTATAAA GTAGTAACAA AATAATTTTA GGCTTGGGGT CATTACGACA 2220
TGAGGAACGG TTAAAGGGTT TCAGCTTTAA AAGGCTCAGA ACCACTGGGC TAGAGGGTCT 2280
TTAGGCTTCC TTCTCTCTCT GCCCTCAGAG CTTCATAGAA GACATGGCAC ATGCCAGTGG 2340
CTGGCAGTAT CTGTACAATT CCCACTGTCC CCAAAGCAAA TTTACCAAGC ACGCTAAGCT 2400
CTCGGAGCCA CAGGTGGTAC ATCTTGCGTG AGGGACTCAC ATGAGCTAGC TAAAAAGCTG 2460
AACCTTTCTC CTCTGTCACT GGGGAACCAG AGACAACCTC ACCTCTGGGT CTGCTTCCGC 2520
TCTAGCCTCC AGGTTCAGGC CTTGAGCTCC TGCCCCGGTT TCCCTCAATG TGGAGGTGTA 2580
AATCAACTAA ACCCTTTCCT CCCCCAAATT GCTTTTGGTC ATGGTGTTTA TTACAGCCAC 2640
AGACACTACA CTAGGACACC CCGCGTTTTC AATTATATAC TGGACCCTGC AAATTATGTA 2700
GTTTGTTTCT GTAGCTGCTG GGCTCTGGAG TGAAAGGCAT CTGCTCCGGA CCTGCAGTGG 2760
TTCTGGGATC TGTCAGAGGC TTGTCAGTTC TGTGAGCCCA TCATTTAGGT TAATGACTGA 2820
GTCACCAACA GACAGGAAGG AAGCTAGCCA CAGCCACACC AGGCAGGTCT GGTTGCTACT 2880
GCAAATCTCT TCAAGATTGT AGAGATTACC AGGGAGAAGC CTGGTGCAAG ACAAATTCTG 2940
GGGATCAAAC TGGAAACCAC AGAGGAGAAA TGTGTGATGT GAGGGGTCTT AGGCTCAGAA 3000
AGACTCCCTA ATAGCCAAAA TGTAATCACA ATATGCAAAT TAGACCCCCA ATAAAGCTGT 3060
CAAAACGCGA CTGCGATGTT GGCAGCTGAT AGAGACAGAG CAGTTCCTGT GTGAGAAAGT 3120
TGAGAAAGTT ACTGTACCTC ATGGAAAGGA ATGCAATAGC AGCTTGCCGC TGCACAATGG 3180
TCTCCACGGG AGGTTAAGTC CTATCTCCAC CACTTGTTAG CCATGTGTGT GACTTGGGGC 3240
AAGTTATTTG GCCTCTCTGA CCTTCCATTT TATCACCTCA AAGGTAAGGA AGAAAATATC 3300
CCCTCCCCTG GATTTGTGTG AGGATAAAAT TTACATATAT ATAAACTTGC TAGTAGAACC 3360
AACATAAATG AAGTACAACA AGCAGTGTTA GTCATTTTAT CTAATCCTTA GAACAACTCT 3420
ACAGTATGGG AACGGCACAG AGTCCCCCTG TAAACGGAGT CTTGGTGAGG TAAGTGGCTT 3480
GCCGTTCACA GCACTGAAGT AGGTTCTGTC CTAAAAGTTA AGTCAGACTT CATGGCCATT 3540
ATCCTAGAAT TTCAACCACA GTAGGTGTCT AACCAATGTT CTCTAAGCCT CTGGGAAATG 3600
AGTATCAGAC AGATTCCTCT CTGAGCCTTC AGAACCAATC CCATTTGCTC CCTCCCTCCC 3660
TGCAGGCACA GTCCACGCTC AGTCTCTCTG GCCTCTGAAC TCACCTCGGT CTGCTAGTCT 3720
CGGCCCCTCA CATCTGCACA GCATTCCACG GTGTCATGTT CTCACTTTCT GTGTCTCATT 3780
GTTTTGTGGC CGCCTTCCTG GCACACAGCC CAGTGTGCCA GTCCTCCAGA CAGATCCCAG 3840
CCAGCCAAGG CTGCCGGCCC CCAGAGACCA TCGAGCCACA TGGGAAGGGG CTGTGCAGTC 3900
TAAACACCAG GAACTCAGGA GAGGCTATGT CTGGGTGTGT TTGGAGTCAC TCGCAGAGTG 3960
TGGTAACAGA GGCAAGGCCA CAGGGCCTGT CCACTCTCCT ACTTAATGTA GCTCATGTGA 4020
GATTCCAGAG TTCCTCACTC TGCTCCAGAC TCTGAAGTTT GTCCATTGTG CCTAGGAACC 4080
TCCATGGTCC TTTATAACTA CTGAGGGCTA ACCCCTACAG CCTGTCTCTG TGACAGGGTC 4140
TTTTGCCAAA TTCCCAGCAG GGCTTCTATG CAAAATTACC ACAGGAAATA CAGGAGATGG 4200
ACTGGGGCTG CAGCTCAGTT GGTAGAGCGC TTGATAAGTC TGCCTGACAC CCTGCAATTC 4260
ATCCTCAGCA CACATGTAGT GGTATATGCC TCGAAGCCAA GCACTTGGAG GGGTGGATTG 4320
GAGAGGATCA GGAGTTCAAG GCCAGCTTGG GCTACATAAA ACCCCGTTTC AAAAATGTAA 4380
ACCAAAAATC TGAAGACACA AAACAAATTA CCCGAGTTTA ATACACTTGG AAGATCACTC 4440
TTCATCCGCT GCTGCTGAGG GACCAAACCC AGCCCAAGTG ACCCATTGGC AACAACAGCC 4500
ACAGCCCACA ATACTGAGCC TTTTAAATTT TTATAGCAAT GTTGTGAGAT AGGTACATTT 4560
TTTTTTCCCG AGACAGGGTT TCTCTATAGC TCTGTCTATC CTGGAACTCA CTTTGTAGAC 4620
CAGGCTGGCC TTGAAATCAG AAATCTGCCT GCCTCTGCCT CCCCAGTGCT 4670