EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-15504 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:58542490-58544900 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr4:58544578-58544589ATGACCTTGAA-6.62
EsrrgMA0643.1chr4:58544578-58544588ATGACCTTGA-6.02
Foxd3MA0041.1chr4:58542783-58542795AAACAAACAAAC-6.32
IRF1MA0050.2chr4:58542515-58542536GAAAAGAATCTGAAAGTAAAG-6.43
Nr5a2MA0505.1chr4:58543629-58543644GATGTCCTTGAACTT-6.5
Enhancer Sequence
CTGGGAAGAA ATTACACAGA GACGTGAAAA GAATCTGAAA GTAAAGTTCA GATGCAGGAA 60
GCATCGTAGC CGCATATGTA GCAGAGGATG GCCTTGTGGG ACATCAGTGG AAGGAGAGGC 120
CCTTGGTCTT GAGAAGGCTC AATGCCCCAG TGTAGGGGAA TGCCAGGACA TGGAAGCAGA 180
AGTGGGTGGG TTGGTGAACA GGGGGAGAGG GATGGGATAA AGGGTTTTAA GAGGGGAAAA 240
CAGGAAAGGG GATAACATTT GAAATATAAA TAAAGAAAAT ATCTAACAAA ACAAAACAAA 300
CAAACAAAAA ACCACACACA ACTTTTGGTG TAGAAAAAAA AAAGCCCAAC CTACAGAAGT 360
AACAAGTGTA AAGAAATAGG CCAAAACCAA AATACCCCAG ATTACATGCA TGGTGGCTCA 420
TGCCTGAAAT CCCAGCACTT GGGAGAGTGA AGAAGAAAGA TTTCCATGAG TTTGAACCAG 480
TCTGGGATAC ATAGAATTCA AGGCTAGACT GGGATGCAGA ATGAGATATG TCTCAAAAGA 540
AAAAAAAAAA GAAAAAAAAA AATAAGTCCC AGAATTGGAA GACGACATGA GTCCACAGAA 600
TCAGAAAACA GAAACATTAA AAACAAAATA GAAACAAAAC TGAATTTTCT AGATCACTGA 660
TTAACACAAT ACATTTGATA TGCTCATCTG TGAGTGTGAG CATTCTTAAG CCCCAAACAA 720
CGTGCCTGCA GATCTCACAA ACCAGCCTGG TAGTGCTAAC AGCGTCTGTC TCTGGTGTCT 780
GAGTCTTTCT CTTGCATTGG TATCTAGGGA GTGGGGAGGG GGTTGGGAGA ACAAGAAAGC 840
CAGTCAGGGA TTCTTGATGT TGACACACAT CTGGCATCAA TTTTGACTCT TGGGAACCCA 900
AGCAGTGGAA GCAAAAAGAC CGGAAAACAA GGTAGGAACT GAGACCACCT GTCTTAAAGC 960
ACATAAAAAT TTACAATCCC CAGCAATCAC AGGGGCAAAG TCAACATTTT CTAAGGCCTT 1020
TCAAGACAGG GCAGAAGAAC AAACATCATC AAGAAAAGAG ACAGAGCTGA AAATGTTTGC 1080
CTGCTGGTTC TCTTTTTTAG TGACATCAAA AGTGCATCAG ATATAAAACT TTTTGGTAAG 1140
ATGTCCTTGA ACTTTCTGGA GGCCACAAAT CATAATCAGC AGTAGTAAAA ACTCAGACCC 1200
CAGGCGGAGC GCTTTCCTGC GACCTTTAAT ACATACATAT TATTATCTAA TGATAGGAAA 1260
ACCTCTCTGC CTTCTTGGGC TCACACAAAA TATCATGGCT CACCCTCTTC TTCCAGAAGG 1320
CTGTTCCCCA GGCAGAGAGC AAGAGCACCA GAATTCAGAA GAAAGCTTCA ATGTTTTCTA 1380
TCCAGCCTTT ACCTGGTCTT TAAAGGGATT CTGGCCAAAT TCACAGAGGA CACAACAGGG 1440
AAAGATCAGG CCATCAAAGA CAGTCGGAAA GCACGTCATT CCTAGAAACA TTGCAACCTG 1500
CAAAGAGTAA ACTTCAATGG CGATGAGAAC TATCCTGGCT TTTTCATGTG CGCATACGTG 1560
GGTGATGGGT GGGTCTATGT TTGGTTTTAA TGATCAATTG ACTACAGTTT TACTAGACTT 1620
CTCTCAGCAC AGTTTATAAA ATGGTATTGA TTATAAAATT TAATACAGCA TCTCTCATGA 1680
TTGGCAAGAA ACCCCTAGAG TTGTTACTTA GTTCTTCCTT TTATCCAGTG TTTTAATCCT 1740
AACAGAATAT CTGCTGCGGA GTCTCTAGTG AGTCCTTCAG TTACAGGAAG CTCACTACCT 1800
TCCAAAGCCA GTGGTAAATT CCTTGGGCAG GTCACATAGG ACAAATTCTT TCTTAAGAAA 1860
AGTTCAAACC ATGGTACCTA AAAAGTCCAC CAAGGTGGGG AGGGGGTGTA GCTCAGTGGA 1920
ATGGTACTTG CCTATGATGT GCATGACCCT GGGTTCAATC CCCAATACCA TAAAATAATA 1980
ATAATAATAG TAATAATAAT AAATACATGC AGCTAGCAGC TCTCCTGGAT CCAGGATCCA 2040
AACCAGATTG ATCAAACCCT CCAGGATTGT CAGATGATGA AATCAAAGAT GACCTTGAAG 2100
GTTCTCTTCT CTCCTCTTTC TCCCATCCCT ACTTCTGCTT CACAATTGTT TCCAACTTCT 2160
TTTTGCTCTC ACAGAAGAAT AGTATTTCGT CCCAAGAGTA TGTATATCTG GGTACTCAAA 2220
CACATAGCCT CTTTTGAGAG CACAAAAGCA GACACAAAGT GACTAGGTAT ATCTCGTGCT 2280
TGTCGCTAAT GGGATGGCTG AGGGCATAGT AGAGCCCTGG TGATCTTGTC ACCAGTCTAA 2340
AGCAGTTATC TAAAACAGGC TTCTAAGCCC TTCCACTCAT GACCCCACTC GGCACAGGGT 2400
GTATAAAGTT 2410