EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-15376 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:45509860-45514100 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr4:45511389-45511407AGAGGGGAGGCAGGAAGG+6.15
IRF1MA0050.2chr4:45512337-45512358TGTTTGTTTCTCTTTCTCTTT+7.39
Klf1MA0493.1chr4:45513873-45513884AGCCACACCCA+6.14
NFYAMA0060.3chr4:45512284-45512295TCTGATTGGCT-6.32
RELMA0101.1chr4:45511379-45511389GGAAATCCCC-6.02
TCF3MA0522.2chr4:45513057-45513067AACACCTGCT+6.02
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02986chr4:45494673-45526870TACs
mSE_07212chr4:45511904-45515395Intestine
mSE_08357chr4:45512291-45513887Liver
Enhancer Sequence
TTCTCTGTGT AGCCTTGGCT GTCCTGGAAC TCACTTTGTA GACCAGGCTG GCCTCGAACT 60
CAGAAATCTG CCTGCCTCTG CCTCCCAAGT GCTGGGATTA AAGGTGTGCG CCACCAACGT 120
CTGGCCATGT CCATGTTTTT GACAGGCATG GCCCATCTAC TACCACTCCC CTCACAAGGA 180
AAAACCAGGA CTGCAGTGGG GCTTTCTTGC CGTGAGAGTG GGCCCCAGGG TGGGGTATCT 240
GCCACGTGCT CACCGGGATG GTCTGCAGAG CAAAGCAGCA GAGCCTGGGA GCCTGAGGCC 300
TGCACAGTGC AAGGTGGGAC CTTCAGAAAC CAGGCACCCA TCACCAAGCA GAGCCCATCC 360
CTCCAGAAGC CCTCTCTCTG TGCTGAAGCT ACCAGGACAA GGGGAGGCTG CTGGCCCGGG 420
TGCAGCTCTG GGCACACGGT GCATCTCAAT AAGCAGCAGC CAACTGTACT GAGTGAAGGG 480
TCATTTCTCT CTGAATGGGG CCCATTAGAA TGATTCATGC ACAGCTCCTC TCCGAGCCCA 540
GAGGCAGACC AGGGCATCGT TAGGCACAAG AGCAATAAAG AGCTGCCCTC CCCCAACAGA 600
CACTTTCTTT TTATTGACAA CACACAGCAT CAGCCCCAAC TACTACCACC ACCACCACCA 660
CCACCACCAC GAGATTCCCG ATTATGTTCA GCTTCATAGT GAATGCTCAG GAACCGTTGA 720
TTTACTTAAA GTAATGCTAT CTGCTTGTCA TGCCCAGTGG CCAATCCTCA ACAGAGTTCT 780
TCATGTAGGT TAATAAACTG TCCTAACACC CAAAATGCCG TCTCACATGC CCTTGACACT 840
TGGTAGCAGA ATTCGGGTAC CTCACAAAGA CCTGGGCTGC CTGCTGTTCA ATTGTCCCTC 900
TGCCCACCGC AGGCTCTGGT CCATAACCTT TAATAGGCTT GTCTTTTCCT ACTTCCCCTA 960
GGAGGGAGGC TCTGAAGATT ACCCCTTATT TAACCTTAGC ACAGTTCCTG GTGGACAGCA 1020
GGGTTCCAGC AAGGCATGGC GGGCAAGAAG CAGGGGTATG GCAGAGATGG CAAGTGGTGC 1080
TGGTCTGAGC CCTGACTGCT AACTGCCGCT GTTTCCAGGT TTCTGCCAGC TCTGGGCTCT 1140
GGGCAAGCGG CATCCCTTTT CTCAGCTTGT GCCTTCTAAC TCTCTAGGAA GCCTCCTTCC 1200
TCCTGTGTAT GGAGGAGACG GGATAAAGGA ACCAGAGGAC AGCACAATGC TCAGCACACT 1260
GTACTGGCAC AGCAAGGGCC CTGGGGGACA CACAAAGGAT GCCACCATCT TCCCTTACAG 1320
TCCACAGGCC TGTGTGAACT TCCCCAGATA CGGATCTTTC ATCCGGACTG CCATTCAAGT 1380
GGCATATTTG GCAGAAGACA CTTATGAGAA GACAGGGAAA TGAGCCTGAG AAGGGAGGGT 1440
AGCTAGAAAA ACTGGGCTGC AGGGTCAGCT GAGTGGATGT GCTCCAAGAA AGCAACAGTA 1500
AGAACCCTCA AGCAGAGGTG GAAATCCCCA GAGGGGAGGC AGGAAGGGGC CCCTGGGGAG 1560
AGACTGACGG GACCCACGGA GGCCTTTCTG CTCAGTTCAT CCCAGCGGAA CCAGAAGAAC 1620
ACCAAGCACA CTGTGCTGGG CTCCCATCAC CCTGTCCCTT TTTCTGTCCA CACATTTGAT 1680
CTCGTCATTT CAATTTCTTC ACTGTGAAAG AGGAGACCAA TCTTCCATGA TGAACCTCCC 1740
TCTGGGATGC TGAGCAAATT CTAGAGGTAC TGCCCAGGTC TCAGAAGCCG CCTTCTCTCG 1800
AGCAGGAAGC TTCTCCAACA ATACCGGTAG CCTGTCCCTT CATCGTCAAA ATAGGTGCCT 1860
GGACAAAAAT CACAGGGGAC CTGGTGGGCC TCGAGTGACA GTCGTCCCCA GGGAGGTAGA 1920
GACAGAAGGG CAGGCACCGA AGGCCACATA AACATGGAGA GCCCTGCCAT CTCCTCCTCC 1980
CCCAGGGCTA CCAGAGGCCT CACCTCTGCG GCTTTCGGGC TTTGGTTTCT TTCAGACTTC 2040
AAGCTGCATG GAAGAGGTCT GCAGGGAGCA GAGAAAATGC TCTCTTGGGA TCGTGGGCAT 2100
CTAAAAGGCC TGGCTCAGTG TACTTCGTTT CTTGGGTTAA GTACTATAGG GTTTTATTTA 2160
TCAGGGATTT TGACGTTTAT GGTCCCCAGG GACAACGTCA TGACATGTGG CTTGTGCAGT 2220
CACATAGGCC AGGGCTTGAA TTAATGTCTT TCTGTCACTG ATTTGAAAGT TCTTTCCCTT 2280
TAGCATAAAG GATTGAACCC AGGGCCTCCC AAGTGTTAAG CATGGGCTAC TTCTCTCAGC 2340
TACACTCCCA GCTCTCAGTA ATTCTTTAAT GACGTGATTT ACATTACTTT GGGAGGGGGC 2400
GGTCCCGCAA TCCATGCAGC TGATTCTGAT TGGCTTCCAC ACCCAGAAGT TCCCTTGGAG 2460
CTCTTGGGGC TTTTTGTTGT TTGTTTCTCT TTCTCTTTGG TATCCCTCGC TGTCCTGGAA 2520
CTAACTGTGT AGACCAGGTT GGCCTCAAAC TTACAGAGAT CCACTTGCCT CCCAAGTGCT 2580
GGGGTTAAAT GTGTGTGCTA CCACCACCCA GGCTCACATT CCTAATGGCC TCTTCTCCCC 2640
AGCTCGGCAG CATTTGCTAA ATTACACATC CAGTGCCCGT TTCCCCATCA GCGGGGGACA 2700
GATGTCATTT TAAAAAAGAA CAAAGTCGAA GCACAAATCA AAGTTCAGGC CGCCCGCCCA 2760
GCTTTTCATG TCTGTGGTTC CGCGGACACC ACCAAGCCTT TGGGACGCAG CACAGCAAGG 2820
CAATGACTGT GTGGATTCCA CAGTAATGGT GTGTGTCTAA CTAAGGTCCT GGCCTGGGCC 2880
AGTCCTCTCC CCAGGGCTTC TCCTGGACTC CCCCTGAATT GTCTCTAGAA AGCACCATCA 2940
CAATTTTCAG AGAAGAGCTC CGTGAGTCAG GCCCAGAACA GCTCGTATTT ATTAATGCAC 3000
ATCGTAAAAT CTCCTTCCAA ACAGGCCATA ATTCACCAGC CACAGGACAC ATCTCATCCT 3060
TAAAGAGGTA TGCTGAGCTG AACACCAGGC TTATCAATCT AAAAAAAAAA AAGAAAAGTG 3120
CAGTCTTTTA CAGTGGTCTT GCTAGGTAAA CTGGGAGCTA AGGAAGGGAT GAGGTCTTGT 3180
TGATAAGACA ACTATCCAAC ACCTGCTCCT CTCTGCTGAG ACCAGGCTTG GCTCACGGGG 3240
TTCCCTAAAC CACTAGTGCG AGGACACTGG AACCTCAGAC CAGACCTTGA AGGCACAAAG 3300
AGCGTGGGAA GCAGCCATAG GGGTATTGCT GAGGGAGCAC CTCCCGAGGG CCGGGCTCTT 3360
GGAGCTGGGT TTCCGATATC ATCTTAGTTC ACCAACCTAA CCTCTGAGCA GATGCGTCAC 3420
CCCCAGTGCT GGCTCTCCCA TGCCACCCAC TTTTTCCCAG TAACAGGAAA TCTCCAAAGG 3480
AAGGCTTGAC AGGAAGAGGA GGAGGACGCT CTGCCAATTT GGCTCAGATG TGCCAACCCT 3540
AGGCAAGGGC GGCCCTAACA CTCCCTCGTC AGCCAGTACT GGAAGTCTCT CTTCCTCAGA 3600
CAGCAGCAGC CCTTGTGACT TACTTCACAC ACCTGCCACC TGCCGGGGCC ACACCTGGGG 3660
AAGCAGGGCT TCCTCCTGTG GCCTGTGCTA ACAGGCTGCT GGCTTCTAGC TCTCACCTCC 3720
CTCCATCTCT ACACTAGGCT CATCCTGCCT AGGAACCCCA CGGCCCCGCC CACAGCAGTA 3780
CACTGACACG GGCCTCAACC TTAGAGGCTG TGAATGATAT GATGCCACTC ACAGTATCCC 3840
GTGAAAGAGG CCACTGGACC TCCTCTCCTG ATCCCCAAAC CTTTCCACAA AAAATGTCCT 3900
CTGAACAGAG GAGGGAATAA AAGCCAGAAG GGAACCGGGA ACTTGCCTCC CTCCCTGAGT 3960
GAGCTGAGTT CGGAGGACTG AGTCCTGAGT GGATATGTAT GTTTGAGATA CACAGCCACA 4020
CCCAATGCCT CAGACCCGTG GATACGGCCA AGCCGTCCCT GTACAGGCAG GGTGAAGCAG 4080
AGTGACAAAG CTCTCCACTG GTTCAAGCAC TAATATTGGT GGGTTGGACA AATATTAATA 4140
ACCTCAGCTT TCTCCCCCTA GGCTGCTCCC CTATAAGGAC CTCCAACAGA GAGGAGTGAA 4200
GCCCTCCCTA GTGCTATACA AGATGGAAAC ACTGAGGTTC 4240