EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-15265 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr4:32438140-32440500 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BATF3MA0835.1chr4:32439056-32439070TGATGACCTCATCT+6.01
Foxq1MA0040.1chr4:32439498-32439509AATAAACAATT-6.02
JUNMA0488.1chr4:32439058-32439071ATGACCTCATCTC-6.11
JUND(var.2)MA0492.1chr4:32439057-32439072GATGACCTCATCTCA-6.6
STAT3MA0144.2chr4:32438726-32438737TTTCTGGGAAG+6.02
Number of super-enhancer constituents: 4             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01452chr4:32325268-32527284Th_Cells
mSE_02291chr4:32438831-32453702Macrophage
mSE_12514chr4:32438167-32438616Spleen
mSE_12514chr4:32438629-32439204Spleen
Enhancer Sequence
CTAATTGTCT GTTATACTCA ACTCACTGTA TTGGTTCTGA AAGTCCCAAC TGGTGAAGAT 60
ATAATAGGCT ATTCATTCCT TTAGTACAAA AACTGACAAA CAGGTCAGAA GGAAGCAGCA 120
GAGAACAAAG GGAGCAGCGA GTCCTGGGGT GACAAGCAGC AGGCACCGTT TCTAAAGGAC 180
CACCGTTAAC CTGGCGACCA CAGCTCTGCA GACCAATAGC GAAGGGCCAT TTATAGCTCA 240
GTTCCCACGA GGGCACAACT GTGCTCTGTA CAGCACGTCG GAGGGGGACA GAGAGTTTAT 300
TGTTGAACAA TGGTAGTGGC TCCCCGCAGG AAGTAGGGTG AATGTCTGGG TTAGCGGCAC 360
TGGTGACTTC ATTGATCTGA CCTGGGTAAG GATCAGACAG GACTCTGAAC AGGAAGAGTT 420
GTGGGTGGTT TATTCATGAG AACTGTGCTT TTTATGGGTT TTGCTTTTTT AGTAGTGAAA 480
GCATTACCCA AGATGTTTCC TTGCTTACTG TCTATCCTGA GATTTTTGTT TCAGGGAGCG 540
AACTTGATGG GGAACAAAAT ATCCACCTTC CTGTAAGGAC AAAGGGTTTC TGGGAAGCTG 600
CCAGTCACTG TCTCGGGTTT GAATTGTAAA AACCAACAGA CGCTTCTTCG GAAAGGATTC 660
TGTAAACCTT TTCTGTTGTT GTTTTTTAAG TTAACCAATA GTCTGCGAGA AAGCAACTGT 720
TAACTCGTTT TGTTATTTAT CTGTGTTTCC CAACCCGTGT GCCGAGGGGC TCTGGGACAG 780
CGTGTTAAGT CCGAGGGCAG CTCCAGAGTT GGCGGCATAC ATTGTCCATC GTGGGGGACA 840
CGCCTGTAGA GCCCTGTGCC AGTATTAGCC GGAAGCAGGT CCTACTACAT CAGCATTCAA 900
CTGCACCACG TTCTCTTGAT GACCTCATCT CAATGCTAAA GTGAGAACAG GAAGGGAGGG 960
TGGTGGGGTC TATGCTGACG CCACAGCCTG ATGTTCTGCA ATACTAAGAG ATACAGAGAT 1020
GATCTCGTAA TACGTTTTTA CAAGGTTATT TAAGAAGGAA ATAAAAGTAG TGCTTTTTAC 1080
TGTATAAGTG TTTGTCCAAC AGTGACTAAG TCATTAGTCC ATAAATAGTT ATATTGTCTG 1140
GGGTCAAATG ACCTAACAAA CAAATAGCAC CATTGAGCAC TTGTATTATA ACACAGGCAC 1200
TGTTAAGTAC TTACTGGTAC TCTAAGAGAT TTACACGTTA TTTGGGAACC TGTAATGTGT 1260
GTTCCATCCC ATGGACACCC ACACACAGTT TTGAATTTAT TATTTGCCGT TTGCTTCACA 1320
TATTATGGAA GTCGTATAGA ATATTATTTA AATTTTGTAA TAAACAATTT GCTTTTACTT 1380
GACCTTCCAT ATTTTTAAGC CAGCCCTCTA AGGACTTGCC GCTCTTCCCC TTTCGTCGGA 1440
GGTCTGGTCA GACTCCTCGC ACAGCCTGCT TGTTTAGATA GCCAGTATCC GGCAGTTCCA 1500
TGGGCTACAC CCCTGGAAAA CGATTCCCAG GATCAAAGAA CAGGGACTTT CTAATGCCTG 1560
TATTATCCAG ATGGAGGGTG TGCATGCCAA GCTGCCCCTT ACAAGACATT ATATTGATTC 1620
CTTTCCCTTG AGAGTGTTTG AGATTACCTC AGCCAAACCA AGGACTGCAT TGGGGAATTC 1680
AGTCATTGGT GCTCAGGGTT GTGAACCAGC CAAAGATGTC CCTCCTTCCC AACCACGGAG 1740
TAAGTGCAAG GCCAGTGAGA AAGCTGGCTG AGTCTGTGCT GGCCAGAAGT GCGCAGAGCC 1800
TCCAGTTCAG GAACTGCAGC AGGAGCTAGC GGTTGCTCAG AGCAGCATTT GAGAGTGGCC 1860
ACACAGGAAA GAGGAAAGCC GTTGCTAGGA AACTTCTCCT TTTGGCTCAT TCCAGGCTTA 1920
TCTAAACAGG ACCCTCCTCC ACAGGTTGCA CTGGAGAACA AGGATGTAGC TCAGTGGTAC 1980
AGTGCTGTCT GAGCATGACA AAGCTCATCA TTTGATCCCA TTACCAAACA AACTCAGTGT 2040
GAGTGGAACA TGCCTGTAAT GAGAGGCAGA GAGCCAAGGT CTGGGTCCAG GGAGGTAGCT 2100
TAATTACATG TTGCTAGCTG TCCATGTAAG CCTAAGAGCT GAGTTCAAGT CTCCAAGATC 2160
CTTAAAAGCT AAGCATGGTA ACATGAGCCT ATAAGCCCTG TGTCAGGGTC AGAGAAAGGG 2220
AGAGATCCCT GGGGCCTGCT GCCCAGTCAG TCTGGCTAAC TCAGTGAGCA ACCCTGTCTC 2280
TAAAAAGAAA ATTAAAGAGG GCAAGCAGTG AAGACAGCAC ATGACACTGT TAAACTCTGG 2340
CCATCACACA CGCACACACA 2360