EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-15003 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:138519030-138522520 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 15             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr3:138521077-138521088TTTTATTGCTT-6.32
CREB3MA0638.1chr3:138519156-138519170TGGTGACGTGGAAC-6.75
Foxd3MA0041.1chr3:138520584-138520596GTTTGTTTGTTT+6.32
RFX1MA0509.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.02
RFX1MA0509.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.03
RFX2MA0600.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.39
RFX2MA0600.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.4
RFX3MA0798.1chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.06
RFX3MA0798.1chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.46
RFX4MA0799.1chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.32
RFX5MA0510.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT-6.35
RFX5MA0510.2chr3:138520148-138520164TGTTTCTATGGCAACT+6.39
ZNF740MA0753.2chr3:138519450-138519463CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:138519451-138519464CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr3:138519452-138519465CCCCCCCCCCCCC+6.03
Enhancer Sequence
TAATCTTTAT TTTAGAGCCC ATTTTAAAAT AATCCAATTT TACTTTATGA ACTGATAGTC 60
CTGAAATTCT TTTCTGCCTT GAAGCCAAAC TTGAGGCCCA TGGAAAGAGT CTCCAGACCA 120
TGAGTATGGT GACGTGGAAC TCTGTCTCAA TCCCCTTCAC CACCGACAAA CCTAGGCCCA 180
TTTACCTAAG GGTCCATAGC TGTCACCGTT CACCCTTCTG CTTGTTGTCA CAAAGTCCTC 240
TGGCCTTATG GCTTCTCATA GTCTTCGCGC AGATTTTCCT GCTCCTTCCC GCTTTGGCTG 300
GTGTCTTTCT CACCAGGATG GCTGCAATGG CCTCCCAGCT AGCCTAACTA CTAACAGCTT 360
GGCCTCTTTC CCTTTGTTCT CTGTACTGTA GTGAATAAGT TGTCCAAGCT GCAAACCTAG 420
CCCCCCCCCC CCCCCGTCCT GCTTGGAGCT CTCACTTGGT CTCCCATGGC TTGGTGGTCC 480
CTGGGTGTAC ACACCACACA TGGTGTGCTA ACCATGCCCT AGCTTAACCC TCTGGCCTCT 540
AGGTTCTCAA GCTTAAAACA TCACCTGCCT GGGATTGAAG AGATGGCTCA GCTGTTAACA 600
GCACCTCTTG TTCTTACAGA AGACTCAGGT TTGCTTTCCA GTATCTTCCT AGTACCTTGT 660
AACCCAGTTC TAGGTGCCTC CTTCTGTCCT TTCTGGACAC AAGGCACACA TATGACACGC 720
TCGTACCTGT AGGCAAAGCA CTCATTCACA TAAAATAAAA ACCAACCTTT TTCTTTAAAA 780
AAGCCACGCA TCTCGGTGAC TGTGCAGGCA GGTTACGGAG AGAGCTGGCT GCCTTCAGCC 840
AGTTTTCATG GGGCGGGATG AGGGATGCCT GAGATGGTGC ATTTCTGATA AGTCCCCTGG 900
TGCAGAGCCA TCCTGTGAGG ACCACTGCTG GCCTGAGCCT TGTCGCACGC ACGCATACTT 960
GCAGACCCCT CAAGGGACCC ACCATGCCAC ACTTTGATCC TTCTGCATCT ACTGTTGCCT 1020
GTGCAGGAGT GAGGCTCCCT TTGTCTCCCC TTTCAAACAC AGCTAGAATG TTGCTTCCTA 1080
GGAAGTTTCC TCTGTCAGCA CCCCCACCCC AATGCCTCTG TTTCTATGGC AACTTGTCTA 1140
TGCCTCCAGG AAGACTCCAT TCCCTGCACC TAAGTTGTGA TTTTATTTAT GTGCCCCCAT 1200
TAGCTCTCTA ATAAAAGACA TCATCTGTTG TTGTTTTTTT CCCTTTTGGG GGAGGGGCGG 1260
GCAAGGAGGA TGGCATTCAA GACAGGGTTT CCCTGTATAG CCTTGGCTGT TCTGGAACTG 1320
GCATTGTAGA CCAGGTTGGC CTGGAACTCA GAGATTCATC TGCCCCTGCC TCTAAGTGCT 1380
GGAATTAAAG GTGTGTGCCA CCCCTGCCCG GCTTTCTCAT TCTCCTTTCT ATCCCTGGCA 1440
CCTAGCTCCG TGCCTGCTCA GTCCTGAACA TATGAAACAT GTTGTATGAT TTAATCCTTC 1500
TTCCACCATT ACAAAGAAAA ATCCTATTTT GAATTGTATT TGTGTTAACT ATTTGTTTGT 1560
TTGTTTTAGC TCTTAAAACA TGTCTGTGGT ATTTTGCTTT TAAGTTAACA AGATCTTTGA 1620
GTACAAAAGC TGTGCATCTA AGAGTACTAA ACTTCTAGAC CGAGTTGGTG AGTGCTCTGC 1680
ATCTTGCTGC TTAACTCAAA CAGTGAGAGC CTCTTCCCAC AGAGGTTCAT GCTTGCCTAC 1740
AGATAACTGA CTTTTTACGC CTGTAGTCTG ACATACTTCC AGTCCATTTC AGCCTTCAGT 1800
GCGCCCCTCT GGTGTGTTTT CAGCCTTGGC TTTGTCTAAT GGCTGGGGGA GGGGTAAGCA 1860
ATAGAGCAGC CCATCAGGGC AAGCCTTTTT TAAATTTTAT TTATTTATTT TTTTAACTGT 1920
AAGACAAGCA AAGATTAGTG AGCTGTAAGC TTGCAACTTC CACGTTTCTA TCCAGAAGTG 1980
GATAGCTAAT CCCTCATGTT CCTTTTTTAT ATGCTTGCAT TGCCTGGGTA ATTTCCAAGA 2040
ATATGGATTT TATTGCTTGC GTAGCCGTCC CCCTCCCCAT CTCAGATTAC AAGCTCTTGC 2100
TCAAAATGTC AAGGTCCAAG TTCTAACAAA GAGCTCTCTA GACCAGACTG CCTCAGACTG 2160
TGGGCATTTC TTTAAGGCCT TCTCCTGGAA CAGTGTGCAT TCAAAGGGAA AAGCCCTTTC 2220
ATCGTCTCTG GGAAGATACT GCGGGCTCTT GGTGCTACGC AGTTCCAAAG AAGTCCCCCT 2280
CCTGGCCCCT TTTTCCTTTC CCAGGCTCTG TGTGATGGAC TGCTCCAGAT CCTGTTCTTG 2340
GCTTCGAGCC CCAGCAGTCT GTGTCCGCAA TCCCATAAAC AAGCAGAGGA CTAGCCCTTC 2400
AGGTGGATGG TGGAGACTGA ATTAAGTATT CTTGCCTCTC GTGCCCGGTC ACAACAGCTG 2460
GCCCAACAGT TTAGAACATC TGGGGTTTTC ATTGAGCTGC CCTGAAAAGA GATCACAGCT 2520
TCGTACAAGT CAGAGGAAGC CCCCAGCACT GTGGTTGTAG GCTTCTCTGA ATGTTTTGCT 2580
CATGCAGCAT GAGAATTATG TGGATCCCCT AAAACTGTGG GTGTAGGTAT TTTATAGCCA 2640
TTCATGTAAA GGAGCAGAAT AGATCTCAAA CTAGAGTCCG TTAGTGTCTC TTAAATATAT 2700
AACTATTTGG AGCACAGTTC TGGAAGGATG CTCAAGCCGG TGACAGAAGA AGGAGAATTA 2760
AACAGCACTC AGGGGCCGTC CGTCACCTTT GCTTTATCCA TGCACGTGCT CAGTGATTAG 2820
TATAGGCCCT GACTGTCCTA CTGTCTGACG TGAGGTGTTG TCATTCTTTC CAGTCCTGTG 2880
TACACATGTA GGCAGGACAA GGCCATACCT GGTATGGCAG GGAAGCTCTG AGGACAAGGG 2940
GGCCTGAGTT CATCTTCTAC CAGGGCTTTT CTGACTCTGA AAGGGGAGCT GCCTGTTAAG 3000
GTGGCCACTG TGGGAGGAGT TGGGGAGCAG GCAGGGTAAT GTCTGAGGAG CGATGGGGGG 3060
CAGGGAATAA TCTGCACAGA CTCCTTGCTT ACAGTTGGCT TTCATGTGGT TTCGTGGACC 3120
CCACAGTTTG CAGCAGTTAG TAACATCAGT CATTGGTTAG ATCAGGCAAG GCCTGCAGGC 3180
TCTGGGAAGC CAAAGAACCC TTCAGGGATT CCTGCCCCAT CTGAGGACAC AGTGTAGTCT 3240
TCTCAGTGGC CTGTGCAGCC TGACACAGCC TGGCTACTGT GAGCCTCTGA GCTGTGCTTC 3300
TCCGTTCCTG GCACTTTGTG TCCCGCTTTG TCGCCATCTG TCCGGGGCCT CAGTCCAGAT 3360
GTCTGGCTTC GGCTAGGGTG CTGTTCGGAC ATCCGCCAGT CAGCTCTTCC TTCCTTCATG 3420
GTGCCCAATG AACATGTATT TTTTTCCCCT TAATATTTAT TTTGTTTTTA TTTATGTGTC 3480
TCTCTGTGTG 3490