EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14859 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:122176750-122180170 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RFX1MA0509.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.54
RFX1MA0509.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+7.56
RFX2MA0600.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+7.23
RFX2MA0600.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.32
RFX3MA0798.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+6.88
RFX3MA0798.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.43
RFX4MA0799.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+6.6
RFX4MA0799.1chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.22
RFX5MA0510.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA+6.82
RFX5MA0510.2chr3:122179769-122179785GGTTGTCATGGCAACA-7.15
RREB1MA0073.1chr3:122179599-122179619GTGGTGGTGGTGGTGGGGGG-7.04
STAT3MA0144.2chr3:122176763-122176774CTTCTGGGAAG+6.14
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04130chr3:122176687-122177466Cortex
mSE_07650chr3:122176067-122178954Intestine
mSE_11302chr3:122176084-122177664Placenta
Enhancer Sequence
TTTGCTGCTG CTCCTTCTGG GAAGTAGAAC ACCCCAGGGC TGCTAGTCTC TTGTGTCTGC 60
CTCTCTCAGC GCAGAAGCTG TGTTTTCTCA GGTCAGCTTT GTGCACGGAT CACACAGTGG 120
AAGCCTAGCC TTCCGGTCTT CCCATTCAAA AGGAAAAGGA GAGCTTCCTC CTCAATTCCA 180
GTTTGAAAAA TCCCAGGGAA GCTCTCAGGT TCATCTCAGG TTGGTCATAT GTTCACCCTC 240
AGACAGCTCA CTGTCCAGTA CTCTGACTGG ATTACACATC CAGCTCGCAA GGGTGAAGAC 300
ACATGCTATC TAGTAACTGA GCTATTGAGA AGCACTGAAT TAGGTTGTTA GGTCCGCTGT 360
CAACAAGCAG TCACTGATAA GCAGGAGGCA GGAGACACTC CCCCACCCCC ACTCTCTAGG 420
GCTGCCAGCT CTGAGAGTTG TAAGGTTACA GGAAGTCTGC TAAGTGACTG AGCCCACATC 480
AGAAAAGGGG CAGGCTTATT CGTCAGTCCA GCCAATGGGA GAAAAGGACA GGAAGTTCTC 540
CTAGTCAGGG AACTTCTAAA GATGCCCTCT TATGCCAAAT CAACGTACCA GTCGTCTCTG 600
CCCTTTCTCT GCTGTGTCTC CCTGTCTGCA GCATTATATA TTAAAAGACG GTTTCGTTCT 660
CACTAGTCTC TTGAATTTGT TATGATCATA TTTCCAACAC CACCATCTGG TATTTACACT 720
TTTCCCCATA AATGTTTTAG GATCATAGTA GGCTATTTTT CTAATTATCT CTGTCTTCTT 780
GGGATACACA TATACTGTGT TGACACATGA CTGCTAAACT CTGCAGATAT TCCTCCCCAT 840
ACCCTTTTCC ATCTTCTTAA AACCTGTACA CAGCTCTCTG CAGTTTCACT CTCTTTGGTT 900
TATTTATGGG CTGGATAGTT TCGTGGTGGC CACTGTGACA GAGGAGATAG AAGTGGGCCC 960
TTGGGAGAGC TGTGTATCAC CTGATTATCA CCTGTGTGGC CTTGGAAAGA TTTCTACATC 1020
TGTTATCGCA AGTGACCCAG CCCTAAGACA CAGTGTTCCA GATAATGATC CAGACTCTCC 1080
AGACCCATTC CTGCTGCTCA CCCTGGTACC TCCCCCTTCC TCCACCCAGC CCTCCCACTT 1140
ACTTTGGAAG GAGTGCCGTA AGGTGCACAG GGACAGGGTG GGGGTTGGTG GCATTCTACT 1200
AGCCTTTGAA CACTGGCAAA AACAACCCAT TGTCCTCACC CTAGGCACCA AGTAAAGAAA 1260
ATATTGACCT TTTAGATGTC ACTTCTGAAG ACATCGTTGT ACTTGGCAGC CATCAAGGAA 1320
GTGAAGACAT TGGCTGCCGA TCAATGCAGT CTCTCACAGA GAGCCTTCGG ATCCGGCCTT 1380
TCCCCACCAA GGGCACAGGA GGTCTATACA CAGAGAGGTG TTCCTGGCTT GTGCTCAACA 1440
CCTGAGGCTT GCTGCCTCCT GGTCCAGAGA TTCTGTTCTC AGCATCCCCA ATCTATGAGC 1500
TACACTTCCC TGACTGTTAT ATGTTGTCCA GTATCCCTGA CATTGCGGAT GAACCCTCAA 1560
CCTGTGCTGC TGGACTATCT GTCACTGGAT GAGGGGAGGT CTGCCTCCTG GATTTGCTTT 1620
AGATTAGAGT GTTCTGGTCC TGGCAGTCAG GTGTGATGCT TCTGTTAGCA CATCAGATAA 1680
AGCAGGTTCT GGCTTGCTCT CATTACTCAT TCTAAGAACT ACTGCTTGCT GCCCAGACCA 1740
TGGTGATAAT GATGCCCCCC TCCTAGTGTG CTAAACGAGA CACTGGTAGA ATTCTCAGCA 1800
GAAATTCTGG CCCTTGGGAA CATCACACAC TAGGAAATGA GGTAGAGAGA TGTGGGTGAC 1860
CGCCATGGCC TTTCTAGATG CACTCCCCAG ATGTGTGGCT GCCAAGAGGT TGCTGAGATC 1920
AGACTTGTAC ATATTACACA TTTACTGTGA TACACAAGGC CCTCCCACCA GAGGAGCACA 1980
AGGGCTTGTC TTTTTCACAG GGGAAAGCTA CTTCACAGCC ATAAGGGGTC TCAACACTGC 2040
TTGCCTGGCT CCTCCTCTTA CCAGTCACAG CCCTGCTAAG CCAACCGGTG TCCATGGCAA 2100
CCAGACAAGT GTTTTGCAGG TCCAGTCATG ATCACTAGGC TATTTTGCTC ACTTCCTTTC 2160
TACTGGCTAT TGAAAGCCTT TCTGAATCTT AGACTGGTGA CCTGACTCAG CAGGTAAAGG 2220
TACCTGCCAT GAAACCTGCT GACCTGAGTT TGATTCCCCA GAACCCACAG GGTGAAGGAG 2280
ACAATAGATT CCCACATGGA AGCTTGGACA TGCGCGCATG CATACACACA GACACTTTAT 2340
CTATTAAGTT ACTTTTTTAA AAAGTGGATA ACCAATCAGT GGGGACTTCT AGGTCCCCTA 2400
AGTGTTTGGG AATTGAGTAT AAGCTCTAAC CTATTTCTCC AGTGAGCACA TTATCACCCA 2460
GTGGTTCGTA TGGATCATAG AAGCCATACT TCACCTCCCA GTTAAGAGCT CCTAATACAG 2520
ACTGATTTTC AGTGCTGTTT TGGCAGAATG CAGGATTAAT CACTGTCTCA TTCAGATGAT 2580
AATAGCCAGG TTGTTTCTGA CTGACAAAAG ACCATTTTTC TACTGAAGTG TTTTTCATTC 2640
AGGTAGCTAA ACTTTATTGC GAAGGGATTA ATTCCACTGT TTTCTGTCAG GGTTGGAATG 2700
AGTGTGGTCT CCCTCGGTGC CTGCCTGCCC TGTGCCTAAG CAATCCTCAC TGTGACTGGT 2760
GGATTCCTGC TGTTGCAGGC TTAGGGGAGG CAGAGAATAG TTTCTCCGGG GAATACAGAC 2820
AGGCAGTATA AATTAGAACA GCATGGATGG TGGTGGTGGT GGTGGGGGGA GAACGGCACA 2880
ATCTTCATGA GGCTAGACAC AACATGACTC TAGAAATAAG TTAAAATCAG ACAGTCCAGA 2940
AATTTGGACC AGAGCAGTAT GAAGAAATTA GGCACCTGGG AGATGGTTCT CAGGGCACTC 3000
TAAGCAGAAG CCAAAGATCG GTTGTCATGG CAACAGCCAC CCAGCATGGA GGTGTTGGAG 3060
GAGTGAGATT GGCAGGACAG CAGGTCAGAA CATAGACTAA AGTCTAATTT TGCAGCCAGA 3120
GACAGGGACA ATGACAGGGG TGGTGGTGGG GTATCACCCA GATCTCACGA ATTACCCATA 3180
GGTACTCAGT CAGGTTGGCT GGAACAGGGG TATCCAATAG TAGATGGGCT TTGGGGTGAG 3240
CATGGAGACA AATACTGTGG CTTTGTGTCC TGCCTGTTTC CATCAACAGC TCATCAGATA 3300
ACGATGATGC AGGGGACCCT CTGAGACATC TGAGCAAGTG TGATTAAAGA TCCTTCGTAT 3360
GTCTTCCGAT TATCAGGTTT TGAAGTTGAG GATTAAAATA TACTTTTAAT GCTAAATACT 3420