EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14653 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:99058000-99063040 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr3:99061410-99061427CACATTAATTAATCTTC+6.33
Arid3bMA0601.1chr3:99058591-99058602ATAATTAATAT-6.02
Gfi1bMA0483.1chr3:99061344-99061355AAATCTCAGCA+6.32
IRF1MA0050.2chr3:99058408-99058429TTTCTCTTTTAGTTTCTCTCT+6.24
Lhx3MA0135.1chr3:99061411-99061424ACATTAATTAATC+6.03
MSCMA0665.1chr3:99058729-99058739AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:99058729-99058739AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:99058729-99058739AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:99058729-99058739AACAGCTGTT-6.02
POU6F1MA0628.1chr3:99061413-99061423ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr3:99061413-99061423ATTAATTAAT-6.02
Tcf21MA0832.1chr3:99058727-99058741GGAACAGCTGTTGT-6.65
Tcf21MA0832.1chr3:99058727-99058741GGAACAGCTGTTGT+6.99
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05814chr3:99057197-99062373E14.5_Limb
mSE_09668chr3:99052790-99059948MEF
mSE_09668chr3:99059986-99062682MEF
Enhancer Sequence
CCACCCGGGT GAGTGTGTCG GATCGGACGA CGGGAGGCGG GTGGAGAAGG AACACCAGCC 60
GGTATCCCCG CGAGTGGAGG GAGGCCCTGC CTGCTGACTC CCTGCCTCAC TCCGACGGGG 120
GTTCCTTTTT CTTGGCATAA ATACCTTGAG CCTCCCTAAA TTCGCCGGAA CCAATTTGGG 180
GGCCTGGCCC GAGCCTTGCA TTTTAATCGC CAATTTCAAG GCCTACTTGC GTCCATCCCC 240
CTTCTCTTGT GTCAGAGACT GAGGGCTGCG GGTCCCTGGG TTTGAAAGAG CTCAGTCAAA 300
GACACTGGAG AAAGAGCCCA GTGGATCTGA GACTTGCTTC CGTGCTTCTG AGAGCCCCCG 360
AGTGCTGCCA GACGAAGCCT ATAAGGCAGC CATGGGAAAT GTTCCGGTTT TCTCTTTTAG 420
TTTCTCTCTC AACTAAGTTT TAGATGGTGG AGTATAATTA TTTCTATTTC ACTGGGGACA 480
TAGTAGATAG ACACTGTATC CTGAGACCCA GGTCTTTAAT CCGTGCCCAC ATCTCAGTAT 540
TTGGGTGGGT GCACGTTTCA ACTAATTTTC TTAGATCTCT CCATATTGTA CATAATTAAT 600
ATGCACAAAA CACTTAAAAC TCAAGGCGGA TGTCAATGTG TGTATTTTAA CAGAACCCTA 660
AGAGGGAGAA AACAGCTTCA CATTTTGTAT TTAGTGCCAA GATTTCAACA GTGCAAAACA 720
GCCCGGGGGA ACAGCTGTTG TCAAAATCCT GTAAGCACGC TCACAAACAC TACACTCATA 780
ACTCGGTTTA GCGGCTTCAG AATATTTTCA ACAACTAGTA TTTTCAGCCC AGATTTCTAA 840
GGCCCTGCAG AAGGTGTCCC TGCGGACCAG CTAGGATCCA GGACTAGACT CCTTGTCCTA 900
CACGGCTTGG GGGTGGGGGG GAAGAGTCAG GCAGCCGCCC ACACAGGAAT GGGAGCAGCA 960
GTAGGCTCGG GAGCTTGAGG ATCCTGGCCT GAAAGCTAGC CAAAGCCCGA AGAGGGACAG 1020
CTGTCGCTTA CATTTTCTCT TTCAGCAGTG ACAGTTCAGT TTCCACGCTC CCGAGGCTAA 1080
TAATAACTCG ATTAGCCAGA GACCTGCAGA GACAGAGTTT CATGAATTCT CCGTGTTCTT 1140
GCGGCCCGTT ACGGAATTTG GGTTTAGTGC TGGGGAATTA TTTTTATTAG TCGATGAAAA 1200
GAAAATTAAA AGGAGATTTA TTTCATCCAT CCACGACTTT CTCTCTTTGG GAGCAAGGGC 1260
AGGTCCACTC GGTCTGCTGT GTGGGCAATC CAGGAAGGAA CCGAAGATAG CTAATATGTG 1320
TCCTCTATTC TGCCATCCCG TCACCCAATT TATCTGTTGT CAGGATTTCA GTAAGGGTCT 1380
GTACAGTTAT TGGAATGACT TATGGCAACT TTCGATTTGG GAATCTCTTG TTATTTTATC 1440
TTCCTGACAG TGGATAAGGG AGAAATTATT CGATTTAGGA AGACTGATGT CAAGGGTGCT 1500
TTTCTCTGGG GGAAGAGTCT GGGTTGCTGG GAGTGTGTCT GGTGTGTCTA AGCTCAAAAG 1560
GGCCGGCATG TGGGGGTCTC TGAAACCATT GGTATAGTTC AAAGCTCTCT CCTTCCGTCT 1620
TTCTCACCCA TAAGTGAGGG AAGCAAAGAG AGGAATTGGA AAAGAGAATA TTCCAGTCAC 1680
GTGAATGTGG AGAGCTAGTC TCCAGAATTT TGTTTAGTAG CTCTAGTCTT GGCCTGACAA 1740
AGATTCGATG GAATATAGAG CTAACCCTTA GTGACACACT TCAGCCGCTC TGTTCCATTA 1800
TTTGATTGCC TGTTTTAAAA GGAAGAGGGT ACACTGAGGC TAGGAAACAA CGAAATGAAT 1860
TAATGAGCAA GGTTCCTGAA GAAGGGATTC AAAATTGAGA ACATTGGGTA GCCCAGCATG 1920
GCCTTTGGCA GATGAGACCC TCAGGTTGGA GCTCAGGCAA GGACTTAAAG GCTTTCTTAT 1980
CCTCTGGATT TGGGATGAGA AATTATCCTT CAGGGAAAAA GGGGAGGGGG CTTGGTGTGG 2040
AGACAGGCCG AACCCTGCCA TAGCTGCCCA TTCTGGACCC AACCACACAA TTTGTGAGCA 2100
GAAATTGCCA GCTGCGTAGC TTTTCTTCCT CCTCTAGTAT AGTTCCCTGT CCCCCACTCA 2160
AGGCCACATT TAGAAACACT TATGAAAGAA TAGCTTAGAT GGCTGAGCTA TCCTGTGCAG 2220
AGCAGTACCT TTCTTCTACT GTGTTTCAGG ATCTGTCTTC TGCTAGGGTG GGAGAAGTTG 2280
CTGTGTGAGT TGTTGGTCTT AGGCAGAGGG GGGAAAACAC AAAATAAAAC CAAACTGCCT 2340
GGGGCCTGGG GCAAGATTAA ATACTCATCC GGCCAAAGTA GCTGTGTTTG TCCTTCTCAC 2400
CATCTTCTCT TGGACCGATG ATTCAACTAT TTTCGGCTGG CCCTACCTGA GCCTGAAACC 2460
AACAGGACCG GCAGACAACC CAGGGCCCAA ATTGTAAAGT TGAACAGCAA AGCAAACTTT 2520
TTTAATTCAG AGACTCGGGC CGGCCCTTTG CCTTTTCAAG ACCCGATTTT CTTTCCGGGT 2580
CTGGACAAAG CTGGCTTTAG TTGGCGCCTG AGCACCCGAA GCCTGGGGCG CCAACCTGTA 2640
GCAGGGGGAT AGGTGTAGGG GGGCAGCCAG CCAAGACCTC CACTCTGGAG GGTACTCATA 2700
GGTCAGAGGA CACAGCACTA TTTCAAAAAC TTCCATGGAA GCCTTGTGGC CTCCCAAATT 2760
TCAAGGCCTG CGGGTACAGA TGCCTGCCCT AGTCTCTTAA GGGCACTCGC TCTCGCACTC 2820
TCTGTCTTTC GGATAAGTCT CTAGGACTTG GAGGCCACCG GCGGGAGAGA GTCTCCAGGC 2880
CCTGGCCGGT GGATAAGCCC AACAGAAGAA ACTTTTCACC CAGGATTGGC GGAGCAGCTG 2940
CGGTGACTGC GGCCTTGAAA ATGTATTTTG AGCGCGGGGC GGCGCCCTCT GCACTCGGAC 3000
CATCCAACGC TCCACTGGGC TTCCTTCCCC CATCTTTGGT TTGGACATTT CCCGCCCGAA 3060
TCTTCAGCGA AGTACAGCCA AGGCCCGGTC TCCTGCGGAG CGAAATAATT CAAACCTTCT 3120
GGGGGAGGGA TTTCTCCTTT TCCAGCCTGC AGGCCGAAGG CCTTTCGGCC AGCCACGGGT 3180
TCCACCGGCC TAGAGAGGTG GCATCAGTCG CGGGTGGGCA GGTACAGGCA GGCACACTCA 3240
AGCACACTCA CAATCGAACT AAGCAGAATT TCTTAACATT TTCGTTTGCA TCCACGCGCG 3300
CAAACCCTCA TGAAATGAGA CAGGAGAAAC TTCTGTCCAA GCAGAAATCT CAGCAGTCCC 3360
AAAGCACTTT GTTTCTAGTT ACTAGTAACT TCTAGTTTCT AGTAATTGGT CACATTAATT 3420
AATCTTCCAG TGTATTGTTT GTTTGCTTGG AGCAAAACTG AGATTTTAAT CCTGACATTA 3480
AACCCACCCC ATTTCCATGG GGTGAAAGAG CAAGTGAGTG GGCGCTGGCG TTGATATTTA 3540
AGAAATGGAT ACAGAGGGAT GAGCTGGGTG GGAATACTGA TGTCAAGCAC TAGGTTCAGG 3600
TGGCCAGGGT AAGGTGTGCG GAACCTAAGC TCCTGCCGAG GCTCTGCCTG GGTTGAGGCC 3660
TGCGCATGGG ACTGTTATTC CTCTGTGCTG TGGGCACTAC CCCGGACACA TTCATGCGTC 3720
CAGGGTGTAC CCGGCACCAG AGAAGGGATT ATTAAGTGGG ACTTGGAAAT CTGCCTTCAA 3780
AACAGCCTTC CTCAGAGGCC ACCTCTTTGG TAAGTGATCT TGTGTGAAGA AGAAGCAGAG 3840
GAGGAGGTAA GGATCGAATT TGTCTTTGGT TGGAGAGGAT GGTCCAACCA AAGACATTCA 3900
GCTATTCACT GGAAGATAAG GGCCAAGGAG TGTCTTTTCA AACGTGTGTC AGTGTCTAAG 3960
GCAGACGTCT GTGGATGCGC GGGGCTTGGA GAACGGGACC GAGGCTAGGC AGTAGGAATT 4020
GGTTGTGGAG ACTCTGTAAA ATCCCAGTGG TGGTAGGAGG TAGTGGTTGA AAAGACAGTA 4080
ATCCCAATTA CACCTCACAG AAACAACAGA GGCCCCGGAG TGAGGGAAGT AGATGGCCAG 4140
GGTTTCTTGT GAGGGGCGGC TACGTGGGCC TTCCTACGGT TTAGTTCTTG GTAGCTAACC 4200
CCATCCCCAA GCTTCTGAAC CCGAGGCTCA GGCTGACAAA CTGATCTGCA TAATAATCGC 4260
TGAGGTTCGG GCTCCCCGAG GAGTCACCCC TACACCTCTA GACTACAGTG CTCCGGATCT 4320
GATTCCTCTC TTGCACCCCA CCTCCACCCC CAACGAAGGC TTCCCTATGG AAATCTGTTC 4380
ACAACCCAGG GGCCTTGAAA GTCTCAATTC GTCTTTCCCT TGGATTCTCC ATCTCTTACA 4440
TTCTTACATT AGTCTTAGCC GTCGAACAAT GCTTCCGAAT TTCCATCCAG CCACTTTGCA 4500
TCTCCTGAGT TTGTAGATGA GGTTCCCAGA GTTCCTCAGA TGATGGCTGT GCAGGGAGAA 4560
AGAATTACAT TTCTTGGAGC GAAATTCAAA CGGAAATTAA CTGCACCCTC ATATCAATAA 4620
CCCCTGAGAT GTAAAATTTT AATTTTGAAA GACAATTATA AATGCAAAAT ATTTTTAGTT 4680
TGTGTGGTGT GAGTGAAGAA TGCTCTAGAG CTCCTAACCT GAGGATCAAA TAACAACAAC 4740
AACAACTAAA CAAAATAGTA ATGTGTATTC CCTGCTTCTC TGTACAGTAT TTGTTTTTGC 4800
ATGTGGACAC AACCCTAATG GAAATGTACC CTCCATCTTT AATCACTCAG ACTAGACAAA 4860
TGCAAAAAGT CAAATGCAGC CCAGTTCAGA AGACCTAAAT GTTGTTGACT CAAGCCTACG 4920
CTATGGTATT CATTGCTTTC ATTAAAAAAA CAGAATATTC CAGATCCATC ACAGCAAGAC 4980
TGTTAGCAAA AAAAAAAAAC AAAAAAAAAC CAAGATATTA ATATGAGAGA CAAATTCTTT 5040