EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14652 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:99043140-99046900 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr3:99045569-99045580ACCACGCCCCC+6.14
SP3MA0746.2chr3:99045568-99045581CACCACGCCCCCT+6.29
SP8MA0747.1chr3:99045569-99045581ACCACGCCCCCT+6.52
ZNF263MA0528.1chr3:99045552-99045573CCCTCTTCCTCTCCCTCACCA-6.08
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05814chr3:99044014-99045914E14.5_Limb
mSE_09668chr3:99044260-99045899MEF
mSE_09668chr3:99045926-99046929MEF
Enhancer Sequence
CGAAACCAAA TCCCAACTCA ACAGTGTTGA ATCAGCTGCT CACTCTACCT GGCCCGCCCA 60
GTGTGATCTA CAGCTCCCCC ACCCCGATTG CTAACGGTTA CCTGGGGACA AATTAAGAAA 120
TTGAAAATGC TGAGCTTGAG AAGTCGAATT CCTTACACTA TCTGGGGTCG TTAATCACGG 180
ACCAGAACCG GCAAACAGGA AAAGCTCTGT GTCTGCGCGG TGTGCAGGTG GCAGGGCTCA 240
AAGGAAGATA AGTACCGCAG GCCGCACAGT CTCGGAATGA CCCTCAAGCC CGCAGTTGAC 300
AGGTTCTGGG AATCAATGGA CTGCCCTGCC CGTCCCAATT TATAAATGAG GAATGTGCGC 360
TCAGTCATCA GACTTGTGGG AGGTTATCCC TGACTCGGTG GCCCCAGAGA ATCGGTCTGC 420
ACTCTCACTT GATCTAGAAG GAAGGTTTCT CACCCGAGGT GTGATGAGAA CAGAGCTTCA 480
GCGAGTCCTA AAGTAACTCT AAGAGTGGGC TGGCTTGGTG GAAGTCCTGT TCTAAGAAGA 540
GTGAGACACA GAAGATTTAC AGATGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 600
GTGTGTGTGT GTGTGTTGTG CAGACCAATA AGTGGTGGTA GCTGGCTTAG GGGTAAGCAT 660
CTGTGACAAT TGAAACCTAG CTGGGAAACC TGGGGCTTGG GATCTGTTGC CTGGCCAAGG 720
GTCTTCCCTG GCAGATACAT TAGCCTAGGA CGCCTGCCAT AAACTACGAC CTTTTGCACC 780
TTTTGGTCCC CCAGTCCAGA CATCCTCCTC CTTCCTCCTG AGTCCTTGAC ATGGGATCCT 840
TGACATGGAT CCAACTTACT GACCTCATGT CAGTAGGTAC TGAGACACTC TGTGTGCCAG 900
CACATCAGAG GGTTCCAATC ATAATCCTCA CAGTGTTGAG CAAAAAGGTT TGCTTCCACC 960
ATCTCTTCTC AGCAGCCCTA TATCTGTGGG GACAATTTGT TTAGTGAAGC TCCAAAGACA 1020
ATGGAAAGTT CCGGAGTTTT CCTGGACGTA GTGTTCAGGA GGCGGGGCCG GGACCCGCTG 1080
ACGGCGGTTT CTCCGGCCCC GTCCCCCCCC CCCCGCCCCC CAGCCACAGG GCAGCAGAAG 1140
GAGGCAGGCA CCCAGCCTAC TCCTGCCCCT CGGCCGGCCG GAGGACCTGC GGCTGCCTGG 1200
CCCACCACCT CTGCACCTGC CTGGCTGAGG TGAGATGCCC GGCATAGTGA GGGTGGTGTT 1260
TACCTGCCAG CACCCCGCTG CTGGGCTGCC AGGGGTCGCT GACCTCCAGT GATGGGTGGG 1320
AGAAGGGATC AGAGCGGCGG GTGGATACAC CACTGGAGTG GGAAGGCAAG AATATTTAGG 1380
TGACACAGAT GAAAGTCCTA ACTTTGCAAA TCAGAAACTT GGGGCCAGTC CACAAAATTA 1440
TAGAGACTCT GTTTTCCTTA TTGAGAAACG AGAATAATAA CATATTGTTC CCTCCCACCC 1500
AAAGGGATGA CAAATCTCTC TGGTCTGAGG AAAGACCTAG TGGGCGGTTG AGAGGTTGTG 1560
GGATCCTGGG CACGAAGATA AGGAGCACTT TCGATTGTTT TAATCTACCC TATCTTAGTA 1620
AGAGTTGAGG AAAATACCGA ACAAAGCAAA ACAAAACTCT AAAATGTAAA TCGTAAGAAG 1680
CGGCCGACTC CGGAGCCAGG TCCAGCTCAC TGAGCCGGAG ATCCGGAGAT CGCTCCCGGA 1740
GATGCAGCGC TCTAGCTGAA ACAAGGTCTA GCTCTGCCGC TTGGTCCCTA AAGTTGCTAG 1800
GAGCGTGGGG TGTAGCAGTC CTAGAGCGCG CCTTGCTCGG AGGCAGGTCG GCCGAAAGTG 1860
TGCGCAAGAA AGAGCACGCC TCTGTGCCTT TTGTCCTCCG TCCCCAGATA ATTTCCCGTA 1920
GCAAAATCGA GAGGTGAGCA ACTTCTCCCG GGTTCTCAGA TCAATTTGCA GCCAGCTTAT 1980
TCGGTCGTCC AAATTTGATT GTCTTGAGAA GTGGCTGAGC TCCCCGGAGC ACAGCTCGGG 2040
CAACCCTGCT ACCTAGCTCA GCACTATCCG CGACGGGGGA TTGGGGATGG AAGAAAGTGT 2100
CCCGGGGTCC CAGGGAAGTC TGGCCTCATC CATCAGTCCG TGTAGTCAGT AGCTCACACT 2160
GCGGGTTCAC AAAGAAACAA AACAACCAGC GAGAGTCCAG TTAATCTCCG CACGGAACTG 2220
ACCCGGGTGG TCCGAATAGC GAGAATCCTA ACCTGTTTCT CCCCAGTCCC TTGGGCGAAG 2280
CAGCTGGCAG TGCCTCGGAA AGCTAACGGG AATCTCTGAC AGCTAAATCT GCCCGGACGC 2340
GACGACCTCG GGGGAGGGAG GTCGGCTAAG TATTGGAGTA TTTGTTTAAT TCCACAGTCT 2400
GGGATCAGCC ACCCCTCTTC CTCTCCCTCA CCACGCCCCC TGAGCCCTCA GCCTCCTGGG 2460
GAAGTGCAGG GGCCCTGGGG CTCTGAGCCT AGGGGCGAAA GCAAGGAGTT GGGGAGATTT 2520
TGTGTTCAGA ACCAGTGCGG CAAATAGCTT CTCTACTACT CAGCCCACGA AGTTAGAAAG 2580
ATAGAGAATT TAAATACTAT AGTCCAAACT CGCTATACAC AATACTTTGA TGTTGGGCAT 2640
TCATGACCAC CTCCCCACCA CCACCCCGGC GAATCTCACT TAAGTACCAG AAACAGACAC 2700
TTTGATCCCT CAAAGTAGCA ATTTATAGTT CTTTAAATTT TTTCTGTTTT CTGTTTTTTT 2760
TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTTTTTTTT TTTGACTGGA CTAGGGAAAA ATAATCCCGT 2820
GAATGCAGGA CTGAGACCAG CTTTCAGGCC CTGGCCGGGT AGTGAGTTCA GGGCACCAGG 2880
ATCCTGTGTT CACCCGGGGT TGCCTGGCGC TCATTTCTCC TCGCCAATGT CTTTTGAGTC 2940
TCTTCTTTAG GAGGACCAGT TGATGTGATT CACCCCCAGG CTTTATTTGC CTCTGACTAT 3000
TAAATTCGGA GGGGTCGAGC GGGGGAACTT GAGGAAGGGC TAAAGTTGGG GCTCCAGTTC 3060
CCGAGATCAA CTGGAAAAAA GTTGGGGCTC CAGTTCCCGA GATCAACTGG AAACTGAGGA 3120
GACGCCCAGA AATAAAAGCA CTTTTCCAGG AGGGGAGGGC TAGGGGATAT AGTGGGCCGC 3180
TGTCAGCCAG TTCTCATCCA ATTCCATCGC TGCCAAATGT TAGGCCGATG TGAAAGCTTT 3240
CTCTACACTT TGCTTAACAA CCCAAAATTG GATTACAGAT AGGGAGGGGC GGACATATAA 3300
AACAGCAAAC ACCACTGGCT TCCCTCCAGC ACCAACCAGG CGCAGCTCAG GGTCTCTCAT 3360
TTTTCTACTA GGCCGAAATG GCAGAACTCC CCGCTCCCAG GGTCGGCTTC CTGGCTCCCA 3420
TTTCCCAGGG ACCCGCAGGC TTCTGTCTTT CTTCCCAGAC CCCCACCATA GCTGTCTCTT 3480
TCTTTCCCTG GATGCCTTAC ATCAATGCTT GGGGAAGAAG AGCAAGAGGT CCATCCTACT 3540
GGTCCTTCAG TTGACTCACA GGCGCAACAG GCTTTCAGTG TTAGGAACCC TCCATAGAGC 3600
ACTTCACTCG GGCTTTGGGG CTGCTTTGCT ATAGCTGACA TTCTGACATT TGGGGCTTTT 3660
CTCCAAGTCT CCTGCAGGAT TCCTGCTCTC TCTGGACAGA TTTACCCCAA ATTGGTATTG 3720
TGCGAAGCTT CTTGGAAAAA AATAGGTGGA GGTTAAAGAT 3760