EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14638 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:97876840-97878100 
Target genes
Number: 7             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr3:97878001-97878018TGGTTTGTTTATTTTAT-6.57
Foxq1MA0040.1chr3:97877078-97877089AATTGTTTATT+6.02
Nr2f6MA0677.1chr3:97877944-97877958AAGGTCATAGGTCA+7.1
RXRBMA0855.1chr3:97877944-97877958AAGGTCATAGGTCA+6.18
RXRGMA0856.1chr3:97877944-97877958AAGGTCATAGGTCA+6.44
RxraMA0512.2chr3:97877944-97877958AAGGTCATAGGTCA+6.34
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05529chr3:97876960-97878352E14.5_Limb
mSE_10840chr3:97876629-97877769Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GCCAGGTGAG GAGCTCTCTC TTGGCTATGG GAGTGGGGGT AAACCAACCT CAGGATGAAG 60
GTGGAGGGTG TACTTCCCAG AGCCTCCTTT AGGAAGCAAA GCAGGGGGAA GGAGAAGTGA 120
GAGCTTTGTG TGGGGTGGGT TGCTGGCGAG GGAGGGGTTT TATGGGCTCA CTGTGGTCCA 180
TAAGTAGAGC AGGGGGTAAT TTAACATGTC AAGAGTTTAT GACGATGAGT GCTTAGAAAA 240
TTGTTTATTG TCCCTTTTGG AGAAACAGTT CTAAGAAACG GCCAGGAAGA TCTGGAGTGG 300
GGAAGACGGT GAGAACCACA CACTCTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 360
GTGTGTGTGT GTGTAGTAAG CACTGTAAGC CAAAGTGACA CCAAGACGGG AGGATCAGCT 420
CCCTTTTATG CTTCCGCACC CCCACCCCCA CACAGAATAG TTACCTCTCT TGCGTCCCTT 480
CCTTGACTTG GGGAGAGGGT AGCCCTTCCC ACCTTGATAT AGTAGTTAAC CCTTTCACCT 540
TGACATGGGA GTGGCCCTTC CCACCTTCAA GCTGTGGAGA CTTGAAAGAA GCTCTTCTGT 600
TAACCAAGGC ATTTTCTGAC AAGCTCTGGT TGACATCGTG GGAGAAACTA ATCACGACAC 660
AACACTTTGC CATTCTCTTG GCTGCTCAGG GTCCTAGGTA CACACACAAC CCAACTCTGA 720
CACACAGAGG AGTTGTGTTT GGGGGCCCAG AGTCTGGTGA TCCTTAGAGG GAGAAAGGCG 780
CAAGCCTGGC CAGCTCACTT CACTCCATAT AAAAGTAATG AGGATGCTGA AAAGCAAGAA 840
TTTTGATTGG GAACAGAGCA CAAGCAGCTG GAGCAGATGA ATTACTAAGC AACAAAGATT 900
CTGTTTTTAT ACAAATACCC TTAGCACAAA AACAAAAGAG AAAACTGTGT GTGGGGTGTG 960
GGGTGTGTGT GTAATGTGCA AAATAAGCAG GATTGCCTCA AAAAGAAGTT GTTCAGCCAC 1020
TCTTCGAGTG GGAGTCCTAG ACTCCGGTGT TGAGTCTAGG ACTCAACACA TAATCGGTTT 1080
GTGTGTGTCA TCTTTAGGGG CTTAAAGGTC ATAGGTCAAT CCTTAGTAGA AAACCAAATG 1140
GCAATTTATT TGAAACTCTT TTGGTTTGTT TATTTTATGT TTAAGAGTGT TTTGACTACA 1200
TGTATGTCTG TACACTACAT GTGTACCTAG TAGCCAAGGA GGTCAGAAGA GGGCATTGTA 1260