EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14518 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:88962900-88963700 
Target genes
Number: 38             
NameEnsembl ID
Arhgef2ENSMUSG00000028059
2810403A07RikENSMUSG00000028060
Rit1ENSMUSG00000028057
Syt11ENSMUSG00000068923
nENSMUSG00000065236
Msto1ENSMUSG00000068922
Dap3ENSMUSG00000068921
Ash1lENSMUSG00000028053
Rusc1ENSMUSG00000041263
FdpsENSMUSG00000059743
PklrENSMUSG00000041237
Clk2ENSMUSG00000068917
Scamp3ENSMUSG00000028049
Gm16069ENSMUSG00000086718
Fam189bENSMUSG00000032657
GbaENSMUSG00000028048
Thbs3ENSMUSG00000028047
Mtx1ENSMUSG00000064068
Muc1ENSMUSG00000042784
Krtcap2ENSMUSG00000042747
Trim46ENSMUSG00000042766
Dpm3ENSMUSG00000042737
Slc50a1ENSMUSG00000027953
Efna1ENSMUSG00000027954
Gm15998ENSMUSG00000086389
Efna3ENSMUSG00000028039
Efna4ENSMUSG00000028040
Adam15ENSMUSG00000028041
Gm10702ENSMUSG00000074467
Dcst1ENSMUSG00000042672
Gm15417ENSMUSG00000074466
Zbtb7bENSMUSG00000028042
Flad1ENSMUSG00000042642
Cks1bENSMUSG00000028044
Shc1ENSMUSG00000042626
Pygo2ENSMUSG00000047824
Pbxip1ENSMUSG00000042613
PmvkENSMUSG00000027952
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RESTMA0138.2chr3:88963258-88963279TTCAGCACCACGGACAGCAAA+9.12
Enhancer Sequence
GCAGGTGAGA GCGAAAGAAT AAAGAGGACT GGAAAGAACA ACGCAGAATA GGGGACTATT 60
TACAGGGAGT GAATGTTTGA GAATGGAAGA TACTGTCTGG GCCTCCGATT GTGTTTCCAA 120
GCTCCAGAGA CACACCTCAT TTCTTCAACT GAAAGCTGTC CTTCACTGTC CCCAAGGGCA 180
GGGCTGATTT TCTCCCCTAG CGACCTTGAT GTAGACGTAC AGCCTGAAGG GGACAGTGAA 240
ATGGCTACAT CCCAGTTCTC TGTCCCTTTT CTCTCCGGGA AACACCTGGG CGGTGGCTGA 300
GCCCCTGCTT TCCTTCCCAA TCTTTCTGAG TACCCGCCCC GCCCAGCCGC ATTCCGCCTT 360
CAGCACCACG GACAGCAAAC AGAGCTGTGG ACCCGACTGA CCCCTGTTCT TCTCCAGCGT 420
TCCCAGCGTC CCTGATCTGT TCTACTGAAC TGGGCAAGTG CTCGGTGTGT GGTTAAAGCG 480
TGGTAGAGAG TGGAACTAGG CTTCTTCCTC AGGTCTCCAA GCTTTGGGGC ATGATATAAT 540
TTCCCACATC CCCAGAAAAC AGTACTGAAA AGAGGCAAGG TTTCCAAACT CCGATGCTCT 600
CTGTGGTCAT TGAGGTTCCT GCATTGGGTG CACTAAGTCC TCGGAGATTA CCTGATGTTC 660
GCTGTCCCTT ATGCTTCCCT AACCTGACAA AACACTGAGG ACCTCGGGGA AACCCGCCTA 720
GGAATTCCCA GGCTGGGTTG GGGGAGGTGA CTCCACCCGG CCGGTAGCAC TGGTGTCCCT 780
CGCTCTCCCC GTTGAGCCCC 800