EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14491 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:87952290-87956500 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr3:87952647-87952658GGAGGGTGTGG-6.32
Klf1MA0493.1chr3:87952649-87952660AGGGTGTGGCT-6.02
MEF2AMA0052.3chr3:87954142-87954154GCTAAAAATAGC+6.44
MEF2BMA0660.1chr3:87954142-87954154GCTAAAAATAGC+6.92
MEF2CMA0497.1chr3:87954140-87954155AGGCTAAAAATAGCC+6.68
MEF2DMA0773.1chr3:87954142-87954154GCTAAAAATAGC+6.22
Nr5a2MA0505.1chr3:87955472-87955487GAGTTCAAGGACAGC+7.06
PKNOX1MA0782.1chr3:87954578-87954590TGACAGCTGTCT+6.37
PKNOX2MA0783.1chr3:87954578-87954590TGACAGCTGTCT-6.22
RREB1MA0073.1chr3:87953557-87953577TGTTGGGGGGTGGGGTAGGG-6.35
TFAP2A(var.2)MA0810.1chr3:87954329-87954341TGCCCTCGGGCA+6.52
TFAP2BMA0811.1chr3:87954329-87954341TGCCCTCGGGCA-6.27
TFAP2BMA0811.1chr3:87954329-87954341TGCCCTCGGGCA+6.32
TFAP2CMA0524.2chr3:87954329-87954341TGCCCTCGGGCA+6.27
TFAP2CMA0524.2chr3:87954329-87954341TGCCCTCGGGCA-6.52
TGIF1MA0796.1chr3:87954578-87954590TGACAGCTGTCT-6.14
TGIF1MA0796.1chr3:87954578-87954590TGACAGCTGTCT+6.37
TGIF2MA0797.1chr3:87954578-87954590TGACAGCTGTCT+6.18
TGIF2MA0797.1chr3:87954578-87954590TGACAGCTGTCT-6.27
Number of super-enhancer constituents: 19             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_00302chr3:87942001-87953696pro-B_Cells
mSE_00963chr3:87951356-87954756Myotubes
mSE_03381chr3:87951343-87955470Bone_Marrow
mSE_03706chr3:87952398-87956460Cerebellum
mSE_04034chr3:87951668-87954087Cortex
mSE_04034chr3:87954138-87957278Cortex
mSE_04772chr3:87953551-87955532E14.5_Brain
mSE_04772chr3:87955562-87956919E14.5_Brain
mSE_04814chr3:87951519-87955386E14.5_Heart
mSE_06617chr3:87940866-87956355Heart
mSE_07268chr3:87951488-87953967Intestine
mSE_08116chr3:87952506-87954072Kidney
mSE_08116chr3:87954103-87955339Kidney
mSE_08760chr3:87951798-87954039Liver
mSE_09535chr3:87952348-87954664MEF
mSE_10721chr3:87951658-87956921Olfactory_bulb
mSE_11312chr3:87951321-87954065Placenta
mSE_11949chr3:87941884-87955672Spleen
mSE_11949chr3:87955850-87956509Spleen
Enhancer Sequence
CACTTGTTGT ACTAGCAGGC AGCCCTAAAC CAGCCCTAAT AGCATGCTCA TCCCAACAAC 60
GCCTGTCAAG ATGAACTGTC CTCAAGGCCC CAGCTGTGAC TTTCACTTCT GTCTCCTGAG 120
ACCCCAGGGG GAAGTAGGGT AGGGAGGTGG AAGGTGACAC ACCAACGGTC CCAACTGCCC 180
CACCTCTCCT CAACTAAGGC ATCCAATGGC CAAGATCCCC CGTGTGCTTT TCTTGTTTAG 240
ATGGCTAAGG TGGGCCTAAG GTTGCCATGG CAGGATTGGC TATGAGAGAA GGGTAGTAGT 300
TAGATAGGAC TACTAGAAAA GACTTCCCAG AGTAGAGAGG CTTCGGGGCT TCCGTATGGA 360
GGGTGTGGCT GTAACTGGAC AGGTGGAGGT TAGGCTGACA AGTACTCAGG GGCTGGTTGT 420
CTGCTAGCAT CCATGGTAGG AGCAAGCACC GTCATGACTC CCATATGTCC TGGTCTTGGT 480
TAGTTAGCTT CTGACAAGGT GAGCTTGAGG CCCAGAGTCT GCTATGAGTA TAGGACCCAG 540
CCTTTAAAGT CTTGTTTGAA ATGTAGTGCT GCACTCAGTG GAGCAGGATA GGAGAGGCCT 600
GCTGCTGCTG CCCCACCCTG AGACTACTGG CTGGACTATG TGCCTCTGAT CCTTTCCCTA 660
GACAGGAATG AAGGTCCCAA GGATGGGAGC TTCAGGCTAC ATCCCTGTGA ATTGAGGGTT 720
GCTTTCTGGA ACAGAGGATG GAACCATTTC TGAGGTCTTG AGGGCCACTG GATGGCCTAC 780
ACTCGGGAGT GGGAAGTTGA ATTTGGAGGA ATAAGGGTGG AGACACTATG CAAATGACCA 840
TGCAAATGAG CACCAGTGAG TCAGGCTACT TGGCCTGTTA GGCAGAGCTA AAGCAAAGTA 900
CAAACTTGGA TTTCAAAAAT GGGCCACACT AGTAACAGTG ACCTTGGTTG GGCCTAACCA 960
AGGCCAGGAC CTTAGAGGCC CCGAACTCTG GGTTCATAGG TATTTGGGGG AACCTTGATA 1020
ACTGCAACTG TCACCAGGAC CTCCTGTGCT CCACCTGGCA CTGTCCCCAA CAGAGTGGCC 1080
CCGAGCCAAC TCTCCCTCAT CTACTAGGGG TGACAGTTGA GAAAATGTCC TGGATAGGCT 1140
CCAGGAAGCC TCCCTCTGGC CTCCACCTAG CCTAGCTCAC CGGCTGAAGA GAGCCTAGCC 1200
CGGCACTTCT CCTTTACTGC AGGGCTGACT TTTCTCCCAG GGAACCTCAC CATTCTGCCT 1260
CTCTCTCTGT TGGGGGGTGG GGTAGGGGGA AACTGTGCCT TAATTTAGGC ACACATCAGT 1320
ACAAGCTAGA AAAGCCCAGC CCAGCCCCTG CAAACTCATC CTTTCTTCAT GGCCTGACCT 1380
CACTCACTGA TTCACTACCA GGACGCAGTC TTCAGTAGCC CCTAATAGTT AGGCCCAGCG 1440
GGTGGCTCTG GGAACTGTAT TGTGGGTGGG AGGAATTTTA GCTAGAAGGA GGGTCGGGAG 1500
CACTCTTCTG CTACTGGGGA GTGAGAGCTA GACTACAGGA AGGACAGGGA GTGGGACACG 1560
GAGGGGAAAC ATCCCCTCTT GGAGAAAACA GGATAACAAT TTCCCAAGAG GTTTGCTAGA 1620
TGGGAGAGGT GGGAAGCTGA GGGCGGAGTA TGGGAGAATT GCCCTTTGGA AGCTAGGGGA 1680
GAGCTCCTAG GCCTCCTGGG TGCTTCTCAA GTCAGTTTCT GTTTTTACAG GCCACAGTGC 1740
CTGGGACCAC CCCGCCCAAG CCCTGCTTTC CTGGACTCTC CCCCCCCCCC CAACTCCACC 1800
AGCCCGCCCC TCAGGTCTCC TGTTGGTGAG TTAAAATTAG CTCACTGCCC AGGCTAAAAA 1860
TAGCCCCTGC CCAGCCCCAA GCTGCTGTCT GGGGGAGGGG ATGGTGGGAC TTGGTGGGAA 1920
CCCGGGTTTT AGGTAGTCAG CCTGACAGAA CTTGGGCTTG GGCCTGTGCT TTTGGATGGT 1980
GATGGGAACT GTGGAGAAGA AAGGCAGCTT GGGGCCAGGA GAAGCGAGGC CCTGAAGGGT 2040
GCCCTCGGGC AGGCTGCCGG GGCACCCCTT GGCTGCTCAG CCCAGTCTTG TGCCTTTGCC 2100
TCACTGGCCC CTTTCTGTCT TCTTCCTCTG TCTGTGCATC TGTCCCCACC TTGCCCACGC 2160
CTCCTCCCAC TAGCAAGCAG GCTGCCCGAC TGTGGGGGTG ACAGGTGGAT TGGATTGTCG 2220
CCCCCTCCCC CAGCGCATGC TGCTTATTTC ATGCCCTGCA GCCCTACCAG GGAGAGGGTG 2280
GAGGAGGGTG ACAGCTGTCT TCAGTGCAGC CTGCCTTCCC GAGTTCCAGC CTGAGGCCCC 2340
CCAGCGGCCA GGAAGGAAGG GGGAGCGCCT AATGAGAGCA GTTCCCTAGC TGTCTCCCAC 2400
TCCCTTCAAG AAGTGCTCAG GCTTGGCCTT TCTGGCCTCT GCTCTGTTGG AGCCTGCTGG 2460
TATAGGGCTC CAGAATCTGA TGCATGCAGC TTTTTAGAGC CTCAGGACAC CAGGACACAG 2520
TGCTCAGGGC AGAAGGGAGT GAGGGAGCAG AAATGGGGGT ACACTGCTAA AGAGTGGAGG 2580
GAGGACAAGA CTGTGGGGAA AGGCGCTTGC TTCCTCCCTG GCTTCTCAGC AGTGGCTACA 2640
GGAACCTGTC TTGACCTCAC TCCCGTCTCC ACCCAGGCCC TTCACACAGG AACTGTGGTG 2700
CCTCATTCTG AAACCCCAGA GTGGTTTGCG TATAGCTCAG GTACCAAGAG GTGTGTAGGG 2760
AGATGGGCCT AGTCTCCATG ACCCTCCATC CAGCACCCCT TCAGTTTATC ACTTGCCCCT 2820
CTTTTGCATA TAAACAGTGC CAGTTGCCAT GGGATCCTAG CTCCCAGACT TCCCTGCCCC 2880
CATGGCCACC CTGCTGTTGG CTTCCTACAG ATCTCACCAG CCAGTGCTTT CTCCTTTCTG 2940
CTGCTGTTGT CACAGCCTGC GGGTAATACC ACCCTGCCCA GCTAGAACCT ACTGAGGGCC 3000
ATTGCTGCTG TAAGGTCAGG ATGGGAAGGC CCCTGGGGCC TGGCACCCTC AGCATGAGTG 3060
CCCAGAGCTG TAGACTAGAC TTAGAAGAGC AGCAGCCCAG CCAGTGCAGG CCACTAAGCC 3120
CAGCACTCAG GAGACAGAGG CAGGCAGATC TCTGAGTTCA GGGCCAGCCT GGTCTACAGA 3180
CTGAGTTCAA GGACAGCCAG GGCGACACAG AGAAACCCTG TCTGGTTGAA AGGAAGAGGA 3240
GAGAAGAAGA GCAGCAGCCC AAAGACCAGA GCCTCAGAAA AGAGGGGCTG GCTAGGTTAG 3300
GTGGGAGCAC AGCCTGCATC TGGAGAGCAG ACGCCCCGGC CTCTGGCTCC TGGCAGTTAG 3360
TTAGGTTGTT GAGCAGAAGA CTAATTAGGC AGATCCAGGT GTTCATTAGA ACTTCCTGAT 3420
AAGACTGGGC AAGTTTGGGC AGGACAGCTC CATACCTTGA ATGGGGTCAG TTTGGGGTAC 3480
TTTGTGACCA TCTCAGCCCA AACACCATTC TTCCAGGACG AAGATTGAGT TCATATTCTT 3540
GTCCCAGGGC TTCCAAAGAA CCTGAAGCAA TGTGGAACAT ACAGCAGAGG GCACTGAGCC 3600
TGCTTTGTAA GAGAGTTTAT GGTTAGCTAG GAGGAAGGAC TGGCCAAGGC AGGATCTGTC 3660
CTCTGGCAGG GTAGTCCTGG CAGAGGAAGA GAGTGAGTGA GAGAGACCCT GGGAGGCATG 3720
GGGTTATAAA TGGCTGAGCT AGTATAGAGC AAGTCAGGGT TGTTGAGGCT TGGCCTCTTA 3780
GACAGACAGG TTCCGTCTGA TAAAGGATGC TCACTAGGTC TCTCTGGCTT CCTTGCCTTC 3840
TCAGCCATGA TCTCTCTCAT ATCCTAGCTC CCCCAGCATG CGGCAGGGAT GGGGGGGCAG 3900
TGTAGGAGAT CAGCCAGGGA GCTGGTTGCC AGGCGACAGT TGCCTAAGCA ACCCCATCCT 3960
CTCCATCTCC ATGTGCTCAG GGCTGCTCCT TAGAAGACTT AGAGTCTCAC CCTTTGCACC 4020
AGCCAGCTGA GTGTAGGGAG GGATGAGGGT GAGGGTGGCA GGGTTGGTTG GAGAGTTGGT 4080
GATGTCTGAA CCAATAGGCT TTGAGGGCAG CTGGTAGAAG GTTCTAATTC CACAGAGGAC 4140
AGTGAGAATA GCAGGGCAGA CAGAGATTAG ACTGCAGGAA GGACTTCTAC AGGCTCATAA 4200
TATTTTCTTT 4210