EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14269 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:55391360-55395360 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MEF2AMA0052.3chr3:55393071-55393083TCTAAAAATAAA+6.07
NR2F1MA0017.2chr3:55392276-55392289CAGAGGTCACAGG+6.19
RREB1MA0073.1chr3:55391603-55391623AGGGGGGTGGGGGGTGGGGG-6.04
RREB1MA0073.1chr3:55391604-55391624GGGGGGTGGGGGGTGGGGGT-6.17
RREB1MA0073.1chr3:55393422-55393442CCACCCCCCACCACCACCCC+6.88
RREB1MA0073.1chr3:55393428-55393448CCCACCACCACCCCCCACCC+6.8
RREB1MA0073.1chr3:55393425-55393445CCCCCCACCACCACCCCCCA+8.29
ZNF740MA0753.2chr3:55392976-55392989GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:55392977-55392990GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr3:55392974-55392987ATGGGGGGGGGGG-6.07
Enhancer Sequence
GGTTACAAGG TATTGTATGT TTTATGTGTC TGATTGTCAC ATGTGTCTGA TGGATCCTGC 60
GAGAGTGTTT TATTGTCTTC ATTTAAAGGT AGAAAAAAAA AAATTAAGAC CCAAGGCGAG 120
ACTGAGCAAC AGATCAGAAG CCACAGTGTT GGGCCTCACC TGGTGCTGAG CAGTGACTTG 180
GCTGTGAGCA GGGTTCACAG GAGGAACACC TGAAAGTCTT AGCCAGAACC ATTCACATTT 240
TAAAGGGGGG TGGGGGGTGG GGGTGGAGCA GAAACAGTTC AGTGAACCGT TGGCGTTTTT 300
TGTGTGTGCT AACAGGCGGA ATTCCAAGTA GAAGAGGGAG TGGTTAGTAA TAACGTGGAC 360
CGACTACAGA TGTTCATAGA CTTGTTTTAT TAATTAAGCG ACCCTGAATG CTATGCTAGT 420
TGTGGGGGCC GGGAAATGCA TTCGATTTAT GTGTAATATC GTCAGAAAAA CCCAGAAGAC 480
GGGATATGGA ATGCACTGTC TGTCTCTGTG ACTAGGCCTG GAATCCAGTT ACTTAGAAGT 540
GATTTTTATA ACCAGTACTA TCCCCTGCCA CACACCAGCT GGGTGATGTG GGAGGGGCAT 600
GGAGAGTCAT TATAATGAGA AAACCCTGAA CCTACTCACT TTGAAAAAAA CCTGCCTCAG 660
CAATGCTCTC CCTACCTCCC GCCTTAAGGT TCAGGGGCCA GGCAGGCTTG CCAGCTCGCT 720
GTTTGCACCA AGTCCCTGCC TGCCCCAGCT GCTGCAGCCG TCACCTCTCC CAGCTGAGCT 780
GCTGATGCTG CTGAGGCCTG AAGTCCCCCT CCAGCTGGAA GCTGCCCTGG CTGACCCTCG 840
GCTGCCCTGT CCGTGTCTGT TCTAGAGACT AGCCTCAGGG GCAATCCTGT CTTTGACACC 900
CCCACCTCTT CTCTTCCAGA GGTCACAGGA GACTGAGCCC TGAGTCCACC GCGTCTTAGA 960
GGGATTTTAA TGAAACAGCT TCTCTATTTA TTTGTGTTGC AGCCTCTGTT GCCTGGGGCC 1020
AAGGCACGGG TCCCCAGGAG GGGAGGCTGA GGGTTGGGGG AGGGGACTCT TGCAGACCAC 1080
ATGCTCTCTT GCCAATCACC GAGCCTGAAT GCTGACCCTG TCCTGCACCA ATATAGTACA 1140
GGTTCCCGGT TGTTTTAGAC CCTTCAGAAT CCTGCAGCTG GAGGGTGGGT GGGAGTTGGG 1200
AAGATAATAG TTTGTCCCCC TTAAGGCTCT CTGATTCTTA TCAGAAGAGA AACAACGGAT 1260
CTTATGGGAT CTGATTAGTA CAGCACCATT GGACACACAC TGGGTTGAGG CTTTCCCCCC 1320
ACCCTGGCCC TCAGACTGTA GCAGCTGCAA TAGCAGGTGA GACCACACTT CCTCTGGCCC 1380
CAGAGAGGCA GCTCTCACCT GGTTTGTCAG TCTGCTCACC TATTAATGTG TTTAAATCGT 1440
GCACATTATA TATATATATT TACTTTTGTG TATGGGTGTT TGGCCTGCCT GTATGTGTGT 1500
GTACCACATG TGTGAGCCTG GTGCCCAGAA GAGAGGATCT TACATATGAA TGGCTTAGCT 1560
TGAATTTAAA AGGAGAGAAA GCCAGATATG ACAGCACACA TGGATGATCC CAGCATGGGG 1620
GGGGGGGGGG AGATGTAGAC AGGGAGATGG AGAATTCCAG ACCTACCTAT CAGGAGTCTG 1680
AGGCTATCCT CAGTCACCTA GTGAGATTCT GTCTAAAAAT AAACAGAAAA TGAGCTGACT 1740
AAATAAATAA ATGAATAGAA AGATGACATC AGGGTAAAAG AGAAATGTTA TGTTTTAAAA 1800
GGTTTGCTGG GCTGGGGATG TATCTACCGA TTGGATGTTT GCCCAACAGC TAGGAGACCA 1860
TGCGTTCCTT CCCCCAGAAT GAGGAAAGGA GGTTTGGGGG AAGGGAGACG TTTGCTGAGA 1920
TATAACTCAC ATATAACTCT GCACCCATTT CAGTGTGCGA CACGGAAGCA GATGCCCATC 1980
TTTGCAACAC CCTCAGTCAA GTTTCCAGCT CCTTCCCCTA AAAGTTTCCT GTGTCCTCTT 2040
GTCATGAACT TCTTTTCCCT CTCCACCCCC CACCACCACC CCCCACCCCG GGATCCTCTA 2100
AGCTGTCCGC TGCCTGGCCT TCTGTGAACC ATCACCAATG TGCCAATGTG CGATTTGGCA 2160
GCTGGTGGTT TCAGCCTTGA GATTCATCTC TGCCTGTACT GTTGCCTGCC CCTGCTTCAG 2220
TATTGCCATA TGGGATGGGG ATGTAGATTT CATAGCCTTT CACCAGGAGG TGGTTTCTTG 2280
ATTGTTCCCA GGGTTTAGCT GTCAAGAACA CCGTTGGTAT GAGCTTTTGT GAGGGCACGC 2340
GGTTTTTTAT TTCTTTGTGT GAATGTTCCG AAATGGAATG GCTGGTCTCA CTTGACAGGT 2400
ATATGAGGAG AAGGGTTTTT GAGGAGAAAC ATTCAGGAAG GCCGCTGGGT AGTTTAAACA 2460
GGAAGTTGAA TATTAGGGTA CTGAGTTTAA TTAAGGAAGA AATTTCTCAG CTCCAGGCTC 2520
CCCCAGGGCT TGCGGTCTCT AACCAGGTTT TGCAGCTAGC AGTGCATGTT AATGTTGGTC 2580
TAGACACAAG GGATAGGGCA AGACACCCAC TAGCTTACCA CGTAGCTCTA TGGTTGCTCA 2640
CCAGGCTTGT GTTTCTTGGC TGTAAATACC TCATAGAAGT GCGGCGGAGG ATTGATTGAT 2700
TTTATTTATT TATTTATTAT TTAATGTGTA TTAGTGTTTT ATCTGCATGT GTACATGTGC 2760
CACATGTATA CAGCTTCCTC AGAGGCCAGA AGAGGACATT TAGCATCTAA CTCCTCAGAA 2820
CTGGAGTTAC AGGGGTTTGT GAGACACCAT ATGGATGTTG AGACTCAGAG CCTGAGTCTT 2880
CAAGATCTTT CCAGTCTCCT GGTGTGGGGT TTTGAAAAGT TCATTAGGAT GTAGGGCACA 2940
GCCCAGCACA CAGGAAGCAC CCAGCAAGCA TAGCCTGTGT GTATGAGTCA GACCTAGGAC 3000
TTCAGGGGAA AGAATGCGGG CCAACTTCAT TTGTCTTCCT AGGGAGCTTA CCAAATGACA 3060
CAAAGAACCT CACTCGTCAG ATGTCACTTG GTTGGTGTGT GCCTGTTGTG TGCCAGGTGA 3120
GAAGGGCCCA TCTCCCCTCC CACAGAGCTC CTGGCAGGAG TCAGAGAAAT GATGCAGGAA 3180
GTATCCTTTT GGATATCCTG CTACTAGCTC TCCAAACCTA CCATGCATTA CCAGTGCACT 3240
AGGACTGCCC TTCAGTGTGT CTAACTCTAG CCCTGTTATT GATTCTGATT ACAGGGAAGC 3300
GAAGGCCGGG CCCCTCCTGA CCTCTTTCAG TGGCAGAAAA TCATTCTGTC CCGTATTTTC 3360
CTTTCAGCTG CAAACATTTG CCTGGTGCCA TTTAAAAATC ACACTGCCAT CTTAGGCACT 3420
GAAGATATCC ACAGGTCAGC AGCAGCAACA GCTTGTGTCA CCCCAGAGCA AGATTGGGAT 3480
AAGCACAGTG ACAGCCCTGC TTCCTGCCAG AACCTCCCAA TGCGAAGAGC ATGGAGTAGC 3540
TAGGCACCAT TTCTGCTAAC ACAGTGGTGT TGGTGTCAGG GGAGGCTCAC GGCTCGAGCT 3600
GGATGCTTTG TTCAATGATG CCAACAGCCC TGGGGGTGCT GCTAGCTGGG GGGGGGGTAT 3660
AAACTATGTT AAAGACCACT GAGGAAGAGG GAGGAGAGTA GCCAAAAAGC CATGGCCAGT 3720
CCCTCCCTGA AGCCACATGG TTCCTGCCAG AGATTTGCAG AGGAAGCTGC CTGTGAACTA 3780
GCAGAGCATT CTGGGAGACA CGTAACAGGT CTTGGAAAAT AGCAAACGCT CCTGAAAATT 3840
AAAAAGCCAG CACTGAGGTG CTGGATGTAG GGCCCATGCC AGGAGCACAG GACTGACATC 3900
TCAGACTTCT TCTATGAGAC TCAGTTAGCG AGAGGATTCA GGCAAAGGCA GTGTGGTCCG 3960
TGGTTCCACC TTGGGTCTTA TTTCAACTTC AGCTGTTCTT 4000