EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14252 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:55155140-55157130 
Target genes
Number: 3             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CrxMA0467.1chr3:55155589-55155600CTAATCCCCTT-6.32
GSCMA0648.1chr3:55155588-55155598GCTAATCCCC+6.02
MEF2CMA0497.1chr3:55155765-55155780TTCTATTTTAAGCAC-6.29
RFX1MA0509.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6.13
RFX1MA0509.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.14
RFX2MA0600.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.28
RFX2MA0600.2chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6.2
RFX3MA0798.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6.38
RFX3MA0798.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.43
RFX4MA0799.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG+6.3
RFX4MA0799.1chr3:55155851-55155867TGTTTCCATGGTGACG-6
RREB1MA0073.1chr3:55155999-55156019TGTGTGTGTGTGGTGTGGTG-6.11
ZNF263MA0528.1chr3:55156063-55156084GGGGGAGGTAGGAGAGGAAGG+7.21
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04199chr3:55155043-55157216Cortex
mSE_11093chr3:55154103-55158702Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CCTGCCAGAG GTGGGAAAAA GGAGGGTTGA GACCACAAAG ACTCCAGGCC CCTTACAGCC 60
GGTGTCTCTC TAGAACACAA GGCCAAAGCC CTCCCTTGCA GTGACATGAA AAAGGACCTG 120
ACAGGAAGTT ACCAATGGCC AGTGCCAGGG AAAGTTGTCC CTTTGAGTAA CTTCACCTTT 180
GCTAATTGTC AAACGAAGTT TCTACATGTG GAAGAAGGAG GCTTCTTCTG TCGCCTTATG 240
TGCTTCCCGG CCATTGACGC CTGGAACTCA TTTGCCACTT CCTCAACGCT TGCTCTCCAG 300
TTCACACTTA CAGTGCTTCA TTTCTCCATA TTTTGTTTTG CACAGAGCAC AGGAGCCAGT 360
GTCAGCCTTT CTGAGGGCCT TGCCCATGTC ACACCTGCTA TTGTTGATCC TCCTAACCTG 420
TGAGTCCCAG CGGAGGGCTA ATCGGAGGGC TAATCCCCTT ACCAGGGATG CTGTTTCCAG 480
GGAGAAGCTG CTATCTGGTT CTGCACACCT CTAAGAAGAA CAGCAGTGGA GCGGGATGAA 540
GGGAAAGGGA AGCCACTGTC AGCCGCGCGC TGCATATGCA CAAAGATGCG CAGGTCTCCC 600
TAATTGCTGT TTTTATTTGC AGAGTTTCTA TTTTAAGCAC ACACACTCAC ATGTGGGTTG 660
ACAGGTACCA GCCAGTAATG GCTGTGTCTG TCTGTAGTGC CTGTGAATGC TTGTTTCCAT 720
GGTGACGAGA GGCACTGCAG AGACAGGATT ATGGTGCTTC TGGGAGCAGG GTGCTGCCAC 780
AGGAGGCCTT CTGGGTTCTG GGGTGTGTGT GTTTGCCTCT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT 840
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GGTGTGGTGT GTTAGGGTAG CTTGCAGCTG 900
TAAAAACCAA AGGGACAGGG AATGGGGGAG GTAGGAGAGG AAGGCAAAGC TTGAATGTTA 960
GAGAAGTCTA GGGAGGGAGG AGAGCTGGGT CAGGATAATT CTAGAAAATA GAAGAAAAGA 1020
ACTATGAATA GAAACGAGAA AGGCACACAA CAAAACCCCC TCCTCTCTGC CAGATATCCC 1080
CCCCTGGGAC TCGAAAGGCT TCTGGTGGCA GAACACAGAT GACAAAGAAA AAGGATTTGG 1140
AAAGCAGAGG TGGTTGGACT TCCTAATTTT CTGGAATTCT AGGGTAATAC TGTGCCACCC 1200
CCTCGTCCTC CTCAGCGTTG CGGCTGGAGG AGAGACAGAG TGTCTCCCAT CCACCTCGAG 1260
ATGCCGAGGT CTTAGGTCAT GTGAGGCTGT TGATTATCCC CCAGGCTCTG TTCAGCTCGG 1320
ACCCAGGATG AAGACCACCC AGAGCCGGCT CACAACCATG CCGTCTGGTC TGAGGGGATG 1380
ACTAAACGGT GGCCCAGTTT CGGCTGCCAA CGTCTTTCAG AGGCCATGAG AGGACGCCAG 1440
CCCGGTTCGG TCTATGCTGT TCTTTGTCAG ACTCTTTGAT GACTAAAGAT GTTTCTGAGC 1500
TAAAAGTCAG GCACCTCTCC AAGGGCCATG GACAAAGGGA ACCTCCCAAG ATGGTTCTGT 1560
AGTCACTAGT TACGAACGGT GTTGGCTCCC TGGTTCCGGC CTGGCACTAG TGACACCCAG 1620
TCATCGCACA TGGAGTTTTC TCACGGAGTA GCTTGTCCTA ATGGTGGTGA TTGGTGACAT 1680
TTTATAAACT CAAGGCCCAA GGATGTTGGA TAGTAGAGGA GATCGAGTAA GCCAGATGGC 1740
TGGAGCCAAT GCTGTCGTTT ACAGCCCCTA GTTTCCTCTT GAGTGCAAAT CCTTCATCTG 1800
AACTCTGCTT GTAAAGAACT GTGAAATGCC CAGGAGATGC AGCCTATGTT TGGCTGTTCT 1860
TGGTCCATGC AGAGCTCTAG TTTCCGGATA TCTGACTCTG TCTTCTGGCA TCCATGAGCA 1920
CTGCAGACAT ACGGTACACT TAGATCCGTA CAGGCAAGCA AGCCTATGAG TAAAATAAAA 1980
ATAAATATTT 1990