EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14200 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:51553000-51554580 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr3:51554203-51554220TGACCTCTCTGTGACCT-7.56
RREB1MA0073.1chr3:51554439-51554459TTTGTGTGTGTGTTTGGGGG-6.56
RREB1MA0073.1chr3:51553723-51553743CCCCACCCCACCCCCGCCGC+6.68
Rarb(var.2)MA0858.1chr3:51554203-51554220TGACCTCTCTGTGACCT-8.38
Enhancer Sequence
GGATACAGTT TTTACCAGGC AGATGGCTCA TTTCTGGTCT GTAGCCTCAT TTTTCCAGTG 60
TTCCTCATGT ACTTGTGAAG TTCTGCCCCT GGAGTCAGGT CCTAATTGGT GTCAAACGCT 120
CAGAGACAAA AGTGAGGTTT GCGCATCATT CATGCGAAGG CTGTAACTGC AGTGACGGGC 180
GGGCCCTGGC TCCAGCCACG CCTGTGGCCA GCAGGACCTG CTGTTGCAGA CCTGCTCAAA 240
ACTACTGAAT GCCAGGCTAA ATACCTCTCT GTCATCACTG CCCATCTCCC GACTCTAGCA 300
TGTCTTTATG CTGGGGTCCT CTTTAGGTTA TCTGTATGTT GACCTTAGTC TGGCTCTAGC 360
AAATCTGGGT AGGGTTGAGG GGGACCCCCA TTCATCTCAC TACAGATTTG GGGGCCACCC 420
AGCAGACAGG TAATCCTAAT AGCCAGGACT CTGCAGTCAG CGAACGGCCG TCTGATTGGA 480
TGCACATTCA TCTTCAAATT ATGTTGTGTG ACAGCCTGGG CTGCTGAACA CCATTTTAAC 540
ATGCAGATTG ACTCCTCTGA GGCTGTTCAT TATGCATTTA GCGGCCTGTT TTCAGACTAA 600
CCAGCATGTC AGAGAGGCCC TATCCTTTTT CCACCTGGGT GGAAGAAATC GCTTGCTGAC 660
TGTGGGGGAG CATGGATATT AAAATGCATG TTTATTTTTC CGAGTATCCA CATATAACAA 720
CGTCCCCACC CCACCCCCGC CGCCGCCAGT GCAGGAGGAG AGAAGAAAAG GGGCAGACAG 780
CTTTGACTCT GAAGCAAAGA AAATGGCTAT GCCAAACAAG CCAGTCTCTG TGGAAGACAG 840
GAGCTGACAA GGCCAGGCCA GCCTGATGCC TCCCGGCTGC CCTGGCTGCC CGCAAGCCAG 900
CCTGGGTGCG TCCACACAAG CGCTCTTCTG AGACATGCAC AGACCCTCTC TTCTCTTGTA 960
CACACAGCCC CAAGTATTTT AAGCAGCACA CTTCCAATTT CCTGTTTCTA AAATTGTCTC 1020
GCATCTCCAA TGGCATTCCA TGCAATCCTG GCAAGTCACA GGCTCAGGGG CTGAGCCAAT 1080
TCCACTCCAA GGACAGTGAG AGTCCTGTGT CTGCTGAGGA ACAACCAAGT AGGGCCCTGG 1140
GTCACTCACC CCTCATCTCT TCCTGGTGTG ACTTAACCTC AGTCTGCTGG GACTTTGTCT 1200
CCATGACCTC TCTGTGACCT CTAGCTGCTA TTGGGCAAAC ACCCAATAAC ATCTCTCTCT 1260
CTCTCTTTCT CTCCCTCTCC CTCTGTTGTG CCTATGACCC CTAGCTGCTA CTATGTGAGC 1320
ACTGCCATTT CCTCTGTGTG TGTGAGGGTG GGATATGAAT ATGTGTGTCT GTGCATGTAT 1380
GTGTGTCTGT GTGTCTATGT CCTTCAGCTG CTATTGGGTG AATACTGCCA TTTCCTCTGT 1440
TTGTGTGTGT GTTTGGGGGG CGAGCTATGG GTATGTCTTG TACCTGGTGT GTGTGTGTGT 1500
GTGAGATCTC CAGTTGCTAC TGGGTGAGCA TGTCCATTTC CTGTGTGTGT GTTGGGGGAA 1560
GGGGTATATG TGTTGTGTAT 1580