EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-14175 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr3:49669580-49672450 
Target genes
Number: 1             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6BMA0731.1chr3:49670097-49670114CGCTTTCCATGAATTCC+6.65
Foxd3MA0041.1chr3:49671782-49671794AAATAAACATTC-6.74
LMX1BMA0703.2chr3:49670522-49670533GATTTAATTAA+6.02
MSCMA0665.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT+6.02
MSCMA0665.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT-6.02
MYF6MA0667.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT+6.02
MYF6MA0667.1chr3:49672315-49672325AACAGCTGTT-6.02
Myod1MA0499.1chr3:49669896-49669909GGCAGCTGTCACT+6.04
NEUROD2MA0668.1chr3:49670278-49670288ACCATATGGC-6.02
PKNOX2MA0783.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA-6.02
TGIF1MA0796.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA-6.04
TGIF1MA0796.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA+6.18
TGIF2MA0797.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA+6.07
TGIF2MA0797.1chr3:49669895-49669907TGGCAGCTGTCA-6.44
Tcf21MA0832.1chr3:49672313-49672327TTAACAGCTGTTGC+6.44
Tcf21MA0832.1chr3:49672313-49672327TTAACAGCTGTTGC-7.06
Enhancer Sequence
AGTCCTAGGT TCGGTCCTCT AGCATTGAAA ATAAAACAAG CAATCCCAAA ACCTTTCCCA 60
ACTTATCTAT ACATTAAAAG TGAACATTTA GGTGATCTAC CAAAACGAAA TACATATAAT 120
GCTATCACAA GACTTGCCAG ACACCTCCCA AAATGTAGGT TACTAAATGT CCTCAGAGCA 180
GAATTCACTG TGATCAGCTT GCACGAAGAT TAGAACACAC ATACTACCAC AATTCAAGAA 240
GATAGATTCT CAGAAAAAAA TTAAACAGTC CATGGAAGCG GTTCGTGAAA GTTTAGCGAA 300
GAGCCCACAA GTGTTTGGCA GCTGTCACTA CTAAGATACA GTGAAGGAAT GAGAATGGAG 360
ACACAGGAGT TTGCAGAAAT AACCAACAGA TATCATCCCC ACCCCCAAAG TGTTCTGTTC 420
TAAGTGCCAT ATTAGGACAA TAAACAGAGT CTGCTTCTCA GAGGACTAGC GCGCAGCAGG 480
CTGACTTCTC TCTGAAGTTT CGGATTCCAG GAACATCCGC TTTCCATGAA TTCCCTCCCA 540
GCCCCTTTCT CTCTCTCTCA GTCCCCCAGC CCTCCTGCCA CCCCCGCATT CACACACTGA 600
ACACAAATCG GTCTCATCTG GCGTCTCTTG ATCTTCCTCC CCTTCCTGTG TCAGTCCTTT 660
GCCCCCTCCA ACTGACTTTG TAAGTTGGTT CCCGCTGCAC CATATGGCAG CTGAGAGGGC 720
TGGAGAGCAA TTATGTGGCT CTGAACAAAG GAGGCTGTAG TGTCACTGTG GCCCATGAAT 780
GCATGCGACA CGGTCACGTA TAGGCAGGCC TCCAGGCCTG TCAGTGGACA CTAAAGGGGT 840
GGCTGAAGGA GCTGCCTCCA CACAAGCAGA GAAGATGGAG TGGCCACAAA TAATGTCAGT 900
GTAGCCATGC TCCCTCTGTC TCTCTGCATT CTGAGTTCTA GAGATTTAAT TAAAAAGATT 960
CTGCAGCCAA TCTTATCAGC TTATTAGGAG AAGGTGTGCA CAACATAATA AGGGATTAAA 1020
CACACGACTT TATTCACCCA CTCCTGAGCA TCTCCAAACA GTACCTTAAG TATTACACAA 1080
AGATTTAAGT TCGAATAGAA AGAGCAGCTT CATAACAAGA GGGGCACATT CGCTTTCTTT 1140
CTCCCTCCCC TTAAAGAGTT CTTCTGTGTG TATAACAAGG GTTAAGAAAG TCATGAATGG 1200
GCACTATGCA GATGCCAGGA GATGGTCCAG GCACTCCTGG AGGGAGGGAG GGATGCCTTT 1260
GCTTATAAGA AGGTAGCTTT CTAAAATGCT GAAGTTACTA CACATAACAA GAGAAGACAC 1320
AGTCAGAACC CCCAGCTTAT TTCCGTCTCC CTTCTCCTTA AGATCCCCCC AACTCTGAGG 1380
TGATTTGTCT CAGGGGAAAA TTTCGGCAAA ACAGGCATAC ATTTGTTATT AGTGAAGTTA 1440
AGACCACGCT GGAAGAATCG TAAATCCAAG CTGTAAATTC ACTGATTTTT TTTAGAAGAT 1500
TCATTTATTT TCTTCCATAG GAAATAAAAT TCTACTGCAG GGGAAGATCC CAATATGACT 1560
GCATACATTT ATGAGGATCA TTTTATGCTC TGTTGCTGTG GGCTACTGCT GGTCTTAGGA 1620
GACGAAGTTG ATTCTATTTG ATGTAGGGTA AGAATACAAT GTAGCAGAGA TCAGGCCTCC 1680
CCAGGCTCTC ACCCATCCGC CTATCCACCC ACCCAAGGAG GACTGCTGGA CTGTGAAATG 1740
GCAGGACCCC TGGTGTTGTT TAAAGGAACC TGGGCAGATT TCCAAAATCT GGTGTCTGTG 1800
ACCTTTTGCA AGTAGGTAAC AATAACATTT CTTCATGAAA TAAATCAATA GACATGAGTA 1860
GAGACTGCGT GCAGGATCTT CCCTTCCTAA TCTTTAGGAA GTGGAGGGAG GTTATGTAGC 1920
TCAGTTCAGC CCATTGCCCA CATGTATCCT TTTAGAGACA CTTTTAACCA GGAAGAAGTC 1980
CTCCCCATCG TCTCTTGGCT TGAGCATCAT TTGGTGCCTG TCAATGAGGA ACACCTTTTT 2040
AAAATTCACA GAGTATTTTT CCTTTGTACA TGCAGCCTCA AGCCTGATAG TTATCTGTCA 2100
GTAGATGAAA AAGCAAGATC ACCTTGGCTT TTCAGTTATG CTCTTCGTAA ATTCCCTTTC 2160
AGAATTACCA TAAATGTTTG CTAGTGCACG AAGCAGTCGT TAAAATAAAC ATTCATTAAA 2220
ATAAACAGAT CCAAGGGCTC TCAGTGCCTG TGTTTAGCAA ATAGCAAGCC CTCTCTGTTT 2280
CTACTGCCAT GAGTTATACC GCATGTCACG TCATCTGCCA GAAAGGCTTG CATAGAGAGG 2340
ATTCTCTGAG GAACCAACAG AGAGCAAGAA ACAAAGCAAC CGTTCAGCCC TTTCTATTCA 2400
CTGCCCCCAC ATCTGTTTGC ATGGCCTCTG CTCCATCGGA AAGGCTTTGT CCTATTGCCT 2460
GCACTTTATT GCTCTGAGGG GCTGGCTGCT AGCAAGGGTT TCTTTCTCCC TTTGCCTTGT 2520
AAGACTCAGG AATTGAAATC AGTCTTGTGA AACAGATATC TGAAGACCAG GCACAGAGAC 2580
AGCAGTTGGT CCTTTCTCTG CTCTGTCCAG TTGGAGTTCT AATGAGGGTT AACTGTAAAC 2640
TCCAGAACCT TCATTAATCT TTAAAGTAAA TCAGACAGAC AAGCTGGTTT CTTTAGGGGC 2700
AGGCAGAGTC TACTGAGCTC CCAGTTCTCC TCATTAACAG CTGTTGCTTT GCCTTGTTTT 2760
AACACTCAAG AAGTTTTAGT TTTGAAAATG CACTTCCTCA CCAAAATTGT CCAAAGTGAA 2820
AGTGTGAAAG ATAGAAATAA AATATTGTAG AATTCTTACT TTAAGAATAC 2870