EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12904 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:93426580-93428940 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
GATA5MA0766.2chr2:93428144-93428154CAGATAAGGA+6.02
Gata1MA0035.3chr2:93428143-93428154ACAGATAAGGA-6.14
IRF1MA0050.2chr2:93428387-93428408AAACAGAAAGTGGAAGTCACA-6.62
IRF1MA0050.2chr2:93428381-93428402GAGATGAAACAGAAAGTGGAA-6.66
STAT3MA0144.2chr2:93426661-93426672CTTCCCAGAAA-6.02
Enhancer Sequence
CCGTGGACCG CAGGGTCACC AACGGGTTCA GAACTGAGCT GGACCTTGGG CCACAAGTCT 60
TTCTCCAGAG CCCCCGCTCC TCTTCCCAGA AAGGCCTCGA GGACTGGCCT GTTCTTGATG 120
CATTCTCAAA GCTCCGAGCC TGGGGAGGAA CACAGGAGGG AACTGTGACC ATAGAGGCTT 180
CTTCCCCCAG GCACGTTCTA GTTTCCCAGA ACACTAAGCC CCCATCGTCC ATGGTGTAAT 240
CTCACTTCAT CGCCAGCCAA CCCTGTCTCC CACTCTGGTG TGGCTTCTGA GCTTACCCCC 300
TGTGTTACTC ACAAGGACCC CATCTCCACA TTCACCCCTC TGGGATCTGT AATGAGTCAG 360
GCCCCTCCAA ACAGCATACG GTTCTGAAAG AAGAACCTGA CCCAGGACTC TCATCTTCAA 420
GCTGGCGCTG AAAAGCTCAG GGGCAAGGTC TTACCTGGCC CTTGGGAGCT CTATGGGATT 480
TACCTCACTC GACCCCTGAC CAGCTTTGTC TTGGGCCTGG GTCCCTCTTT GGTTTTATAC 540
GTCTCTGATG TTCTCACGTG AAAGCAAAAG CTAGGCTGAG CATAAGCGCA CTCACTGCTC 600
CTGACTGGGG ATCTATGATG CTTCAGACTC CCCTCTGTGT GTCCAGGGCC TCTCCACAGA 660
GCTGTGAACC AGACGGAATC TGACCAGCAT CCCTACTGAC CCACCAAGAC CTGGTAGACA 720
TAAGACTTGT GCTTTCTCAG CTTGAAAAAA AGGGAAAGGT CCAGGGTTTT CCCCCTGGGG 780
CTCCTGTGGC CAACTGAGGG CCATTTCACT CCAGAAAGCT CCTCGGAACT TAGAAATGAC 840
AGAAACCTCC TGATCCTGAG CTTACCCTCC TGGGCTTGTC TGTGGCAGCC ACTGATAGTG 900
GGGACACTGT GGTGGCCAAC TTTTCTCCTT CCCACCAAGG AGAGCTGGCA GATTCCTCAT 960
AACTTAGTCT CTCAGCCCGT GGCCCTTTCT TTAACATCAT AAATTTTAAA ATGTTCTTTT 1020
ATTGAGAGAG AGAGGAGGGG TGGGAGAGGA CCAGGAGGGG AGAGGGGCAA CTATAAACAA 1080
AGACTAAGAG TTGTTTAATG GACAGCGTAA TGAGGCCTCG AGGAACGAGC CTGGCATTGA 1140
TTTCCCTGAC ATTTCACCTA TTAAATTAAG AGCTTCATAA GGAAGAGCTC GGATTTTCCT 1200
CCTCCTTCTT CTTTTCAATC AATTAAGATT CTTTACTGGA GAACAAAGCT GCTATTGTCT 1260
GAGCTCGGAG GAGCCGAGGG GCTCTTTAGG GGGCAGGGAG CCTGGGGGTA CAAGGTATCT 1320
CTTGATTTGG GAGACCTGGT GGTTAGGTCC AGGCCAAGAC CCAACTCCAT GAGCCTCTTC 1380
TGAAGGGATG TGTTGGGCTA CCTGGTTCTG TCCCCCCAAG TCAAGGCTAG AGCCAAGACA 1440
AGTAGAAGAT TCCTTCAAGC AATACTGCCA TGAGAATTCA GATGGGTCTG CAGTGGGGAG 1500
AGCCTCTCGT CACAGATTTT GGTTGACACC TAATGCTGTC GGGTGGGGAG TGGGGTCCAT 1560
TTAACAGATA AGGAAACCAA GGTGCTCAGA GGTTCATGCT TTGCTGGAAA CAATGTCTTA 1620
TGTTTCTGTG GCAAAGTCAG AACCCTTCCC TGGTCCCTGA AGCCCACAGG TTATGCCGTC 1680
CCAGGGCAGC GTGTGTTACC ATGGTTTCAC TGTTTGACCA ACTGCCCCAC CCATTTCCAT 1740
ATAAATCTCA TTCCTAGTTC ATCCCCAAAT AGGTGTGAAT ACTCACTAAC AAGCCCTTTC 1800
AGAGATGAAA CAGAAAGTGG AAGTCACAGG GTCACCATGG GGGAATTAGC CACATGTGGC 1860
AGCTCATGAA CCTATTAGTA TGGCTTAACT ACTGATGCCA GTGGGTGGAC TCAGCACCTC 1920
AGGCAGACCT GCACTTTCCA TGCCTAATAA ATAAACCAGG TGGGGCTCTC TCTGCCCAGT 1980
GAGAACCTCA CTTTAAGTCA CAGTACAGTA TCCAACAGGA TTAAAGCTGC TAGGTACTGA 2040
GAGGCCTACT ATGGGCCAGC CCGCAGACCA ATCACCCATC TTTCCTGATG TCATTGCTGT 2100
AGATGCTGTT GTAGTCTGTT TTCACCTTAT GCATGAAAAA AACGAGTCAC AAGAAGGTTT 2160
AAAGGATGGG CTTGGGGTTC TATAGGCAGC TAGCTTCTTT TCTGTGCCTG TGTACCTCCA 2220
GAGCCTGTTG TTTCCACTGC CTGGTCTGTC CAGGGCCAGC AAGAACCTCA ATGTACCCTG 2280
TCCTGATGCC ACACAGGGTT TGGCTGAGTA TGCCCCTTTA AACTCATCAG CAGAAAGTAG 2340
AACCTATTTC GGGCGCCATC 2360