EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12535 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:59513110-59515200 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr2:59514172-59514183GGGGGCGGGGC-6.02
KLF5MA0599.1chr2:59514173-59514183GGGGCGGGGC-6.02
LEF1MA0768.1chr2:59513643-59513658CATCCTTTGATGTTT-6.31
RREB1MA0073.1chr2:59514610-59514630GTGGTGGTGGTGGTGTGGTG-6.22
SP1MA0079.4chr2:59514171-59514186TGGGGGCGGGGCCTG-6.56
SP2MA0516.2chr2:59514170-59514187ATGGGGGCGGGGCCTGG-6.19
SP4MA0685.1chr2:59514169-59514186CATGGGGGCGGGGCCTG-6.77
TCF7L2MA0523.1chr2:59513644-59513658ATCCTTTGATGTTT-6.89
Tcf7MA0769.1chr2:59513646-59513658CCTTTGATGTTT-6.92
ZNF263MA0528.1chr2:59513271-59513292CTCCTCGGCCTCTCCTCCTCC-6.19
ZfxMA0146.2chr2:59514172-59514186GGGGGCGGGGCCTG+6.19
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02759chr2:59505880-59536483HFSCs
mSE_03282chr2:59508315-59521485TACs
mSE_11815chr2:59512980-59515240Placenta
Enhancer Sequence
TGGTGAGGAT TTGAAACAGA TTAGCGAAAA GCTCTATGTT TTTTTGGCGA ATCTAAGGTT 60
TGTTTTGGGG GTAGAAGTCT CAAGGCCCAG CTTTTGTTGG AGTACATTAG GCAGTCCGCT 120
ATCGTTATAA CTTCCCCAGT ACCACGCAGA GCTCCTCTGG TCTCCTCGGC CTCTCCTCCT 180
CCTTACCATA ATTATAGCAG AGAGCCTTAA GACCCATGTA GGACCAGACA TAGAACCTGC 240
TCTCTGTGAT CGCATCGCCA CGAAAACAAG CTGTAGGGAC TGTCAGCCGC TAAGGAAGCT 300
CCTTCCCCTC TGGCCTCTGT CATTTCTACG GCTGCCTTTG TTGTCCTCTC AAATTCAGAA 360
GGGATGTTTT CCCTGGCCTT GCCGGAAACA GTGGTACAGG CCGGCTGCTC TTGGTGGGGC 420
AGAGGCCAGA GAACAAGTGT GCTGTGTACA TAACCTGCTG CAGGTCTCAT TGGGAGGGTG 480
CACCAGTCTG ACGGCCTCAG GCCCACGATC TGTCTGGTGT GGAACCCAGT GGGCATCCTT 540
TGATGTTTGT CTGCCAGTAG TGGAGGGCAC ACACGGGGAG TGCGTGTGCC TTCTCAATGG 600
AGGTGTGCTA TGCAGAGGGA TGGATGGAAG GGCCTGCAGC TGCTGGGAGA TGCTCCCTCC 660
GGGCTGATCC CCTTAAAAGA GCAGGGGATG CGGGAGGAAC TCACACCAGG ACACCTGGCC 720
ATACAAACCG CCGCTGTTCA CCAGGTGGTG CTGTCCTGCA GTGGATAAGG CCTGGTGTGG 780
GAGCAGCTGG GGTGCCCACA AGCTCTGACG TTTGCCTAAC ATGAGCATGA CGAGTGGAGG 840
CCTTTTTGAG GCAACTTTAA AGATTTGGTA TGGGAGTGAT CACCTGGTCC TGGGTGTGTG 900
TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTA TTCCCCTTGT GTTTGCACTA 960
GCGAGGTCGC AGTTGGTTCT GAAGTGGGTG GAGGAGACTG GACCTTCCTC CCAGAGAACC 1020
GCTCCTGTGC TGGGTTCTCA TCTTTGAAGT CCTGGTGGGC ATGGGGGCGG GGCCTGGTTT 1080
CCAGCTCCTC ATTAAACCAA TTTAAAGGAA GAGGAAAGTC TCTACATGCA CAGACCTATT 1140
AGTACTCGGT GGCCTGCCAA GGTGATTTGG TTTGGCCCAG TTGTGACTAC CTACACACGA 1200
CCTGTCCTTC CTGGCCGGGA AGCCTAGCAG GATGGCCCTG AGAGTGTTGA CTTGGGCCTG 1260
GTTGTCATTG TTTGTGAGTG TGGAAAGTAC CCTGAGGGAT TTCACTTTTC CTGGACAGGT 1320
ACAACAACAA GGAAATAGGC CGAGTCAGTC CTGGAAGCCC TCTAGAATCC AGTGAGGAAG 1380
TGCCTTTAGC TGTGTCTGAC TAGCCTTTTT AAAAGGAATA GTCCGGTGGT GGCAGGTCAC 1440
ACTAGCCCTC TGTAACCAGT GATCCGGGCA GGATGGCACC AGTGTTAATC AGGGCAGGGG 1500
GTGGTGGTGG TGGTGTGGTG TTGTCTTTGG TTCAGAGGAA GCATTGTGGG GGTGGGGCAG 1560
GCATGCAGGA TGACTAATAA CCCCGAGTAG GAGAAAGGCT GTTGAGAGTG AGGAAAAGCA 1620
AGAAAGAGCG CTAAGGCCCT GAGCCATGAG CTCAGGAATG GTCAGGCTTG AGGAAAGCTG 1680
GAGTTTATGA CCGAGATAAG ACATGTGCGG AGGAGAAGTC AGAAGGACTC AGATTCACAA 1740
GGTTGCCTTA AATCCTGAAA CCACTTCACA GCAGACTGGG CTGTAAACCT CATGTGGTGG 1800
AGGTGAGCCT GCGGTTTCCA GCCTTGCTGG TTGGTACTTG CTGCAGGGCC TTGAGGCTAG 1860
GCCAGAGTGG AGCTGGGAAG GAAGTTCTGA GCCGCACTGC TCTTTCCAGT GCAAGCACCC 1920
TTGTCTTTTC CTCTCTGTCT CTACTGCTCT GGGGTTCTCA GCAATCCCAG GGCTGCTTCC 1980
AGGGCGTGCG CGTTGCTCGT CTCACAGGGT AAGTGTGCTG ACGTAGGCTT GCTGGTGCCT 2040
TACAATTAAA GCATTCACAC TTACAGTGTA GAAACTTTAG TACTTTATTT 2090