EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12534 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:59509530-59512990 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC1MA0032.2chr2:59512574-59512585TAAGTAAATAT+6.14
Foxa2MA0047.2chr2:59511585-59511597ACAAAGTAAACA-6.18
GLI2MA0734.2chr2:59512239-59512254AGACCCCCCACGTAG+6.25
GLIS1MA0735.1chr2:59512239-59512255AGACCCCCCACGTAGC+8.73
GLIS2MA0736.1chr2:59512240-59512254GACCCCCCACGTAG+6.99
GLIS3MA0737.1chr2:59512240-59512254GACCCCCCACGTAG+7.64
RREB1MA0073.1chr2:59512749-59512769CTGGGTGTGGTGGGTTGTGG-6.07
RREB1MA0073.1chr2:59512584-59512604TGTTTGTTGTTGTGTGGTGG-6.58
ZNF740MA0753.2chr2:59509574-59509587CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr2:59509575-59509588CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZfxMA0146.2chr2:59510639-59510653GCAGCCCAGGCCTG+6.2
Number of super-enhancer constituents: 3             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02759chr2:59505880-59536483HFSCs
mSE_03282chr2:59508315-59521485TACs
mSE_11815chr2:59509693-59512629Placenta
Enhancer Sequence
TTGCCTATCA AGTAGGTCTG TTCTAATATT TTTGAGCAAG GGAACCCCCC CCCCCCCCAG 60
TGCCTTTATG CACCGTGCTG AATTTATTGC TTGGTTCTCT GTTTCATACA GGTTCCATCC 120
CAAGGTAGTT ACTGCTTACC TCACTGATTG CAGAGCCCTA CTATGTCAAC TCATTTTATT 180
AACCTCAAAG CAGGAGAAAT GATAACCTTT ACAGAGTATG GAAGACTGTC TTAAAACACA 240
CCCATTTAAA TGCTGCCTTC CCCAGGAGTT CTGGATGATT GAGTTGACTG AGCCCACAGG 300
CTTTAGCTGT AATTCAGAGA GGAAGGGCGT GGCTTCCACC CCACACTGGA GCCCTGTACT 360
CTGAGAAGCC CGTAATCTGG TGAAGGGGCT TTTACCATCA AAAAGGTAGG TGAGGGCATG 420
ACGGCTGTGG TGGGAGCCAG GGGAAGTTCC ACATCCAAAT GGCAGTGCCG AGTGGTGCGC 480
CCTGACTTCC GAGAAGGGCT GCCGGGGTCC TGGGGGTTAC CAGGAGACAG AACATTGAGG 540
TTGGCTGCAG ACCCCATTGT GTGTTAGAGA ATACTTGGGT CTTAGAGACA GTTCGGCCTC 600
GTCATCTTCG TGCTGCCCAG GGTCATCTTT CTGAGCCGGT CCTCGTGTGT CTTGTCTTGT 660
ATTGTTTTGA TGTCCCTGGG TGCTTTGGGG AATTGAAAGG CTAAACTGTG TATTTTCTTC 720
TGTCAGACTT TACTTCTCAG GGCTGTCATT GTGCCTTGAT CTGACAGTCC CTCCACCCTC 780
TTAATTACCA GTGGCATGGG AAACCAGATC CTCCCTCCTG TGAGAGTTGT ATCCCAAAGG 840
AGGTGAATTG GCTGGAAGGC TGGATGTGGG AGGAGGTGGA GGTTGGGACC TCTCTGCTGG 900
ACTCCGGTGA GCTTAGTCCC TGGTTGTGAC AACTCCAAAC GTGTTACTAG GTTCCTAGCT 960
GTCTTCTGGA TGAGTTTACA GCTTGTGGCC TGTCAGGCTG CCCTAGTCTT GTCTCACCAA 1020
CAGTGTTTTC TCACCCGTGC CCAATTCAAT TTTATCATGA AAAGGAAAAA AAAGAACATT 1080
TTATCGGATG GTGAGGACGT GGATAGAGGG CAGCCCAGGC CTGAGGGAGA GGCCTTTTCT 1140
GATAGTCCAG TGTTCTGGAA ATCCATGGGA CTTTCTGAGC CATGGCATGG ACTTTACCAT 1200
TATGTTTTTA GCAGGTAGAA TTAGCAGACC TGAAACCTGC AGTTAGAAAT AGCCTTGCAT 1260
CCTGGGCGCC TGTTGTGTGA TGCATAGAGA GGCTGAGATC CAAGGGGCAT TTGACCTTAA 1320
AGGGGCAGCA GCACTGGAGA CCCAGGGAGG ATGTCAGAAG ATCCAGGAGG AGAAGAGGCA 1380
ACAGGCCATG AAACCGTCCC CGGGAAGTCG TCTGTGTTAG GGGGAGGCTG AACCGCTCAT 1440
CCGGAGAACT CACTTCAGGG GAATGGAAGG ATTTGTGAGG GAGACGCAGA CTCCTGGGTT 1500
CCAGCTCCGA GGATTGGCTG TGGGGCCTGA GAATGGCCAC ATCACTCTGG ATACAAGTGA 1560
GGAACACTAA CAGAAGATGA TGACTCAGGC AAAGGTCTCC CACCCCAGGA GAAGGAAATT 1620
AGGAAAGAGA TAACCAAGTA GAACAGGGTC AGGGGGAAGG TAGAGAGCTA AAGGAACCCT 1680
TTAGAGTGAC AGCAGTTAGC AGTGCCCGGT GGCCATCCCT TCCCACATGG CAGCCATAGG 1740
CATAATCGCT CTTCCCCTCA CCCCCCAAGG GCTTAGGGTG GGTGTGTTCC TTACAGATGC 1800
TTTGAGTTGC TGCTTCTCAC CTTTATCTCC TGCCTGCCAG AGCAACCAGG TTTAGGGACA 1860
GTTTATTCAG GACTTAAGCA ATGGCCCCTT CTGTCTCTAG TCTTGTCTCC CTGGGGCCAC 1920
AGCTTGCACT ATTCTAGTGA TCACCTGATG AAGTTACCAT TCGCTCTGCC TTTCTCACTT 1980
CTTCCTCAGG CCTGTTTGCT TTTCCTCTTC TCATCTCCTC TGAGATGTAA GTTTCCCCAA 2040
CCCGCCCTCA AAAGGACAAA GTAAACACCC AGGCAATGGG TCAAGGGTAG TGGTTCTCGA 2100
TCCTGGCTGC CTAGGAGAAT CAGTAGGTCA GGCTGACGAA ATGCTAATGT TTAACCCTGT 2160
AGCTCTTCAT TCTTCTGAAC ATCAGAATTA TGAAAACGCT CCAGGAAATT CGAATGGGTG 2220
TTGGGGATGG AAAGCCATCT CCTTGTGGGG CTAGCAAGGT GCCTGTCTCA GAGAAAAGAA 2280
AGTTTTGCAA GATTTGAAAT GGAAACTAAT GCCCTTTGTA GCTGGGCTTG GTGACACAGG 2340
CCTGTTTTCC TGGGTACACA GTAGGCAGAG GCAGGAGGAT CTGTGCCCAA GAGTTTGAGA 2400
GCAGTATGGG CAATGCAATG CAATACCTCC CCAAAAAAGA GTCCTTTGCC AATCCAGCTT 2460
CAAAAGCCAG AGGAATTCCC TCAAAGGTCT CCTCCTCCCT CCCTCCCTGC TAGCCAAGCC 2520
TGGTTTCTAT TAAGCTCAAT TATTCAAGCC CTCAGGGTAC AACATAAACC CAGGCTTGTT 2580
TGGTTTGTTT TAGGTCTGGG GTACTGTTCC CCTTGGTTGC ACTTGAGTGT GACTTGAACC 2640
TCCTCATGAA CTGTGGCCTC TGTCCTGTTG TTGAACCTCT GGCTTCTAGT CAGTGTTATT 2700
CAGAGCTGTA GACCCCCCAC GTAGCCCTTG GACTGTCCCA GGGCCCAGTG ATGACATGAT 2760
TTGGTTCATG AACATGTACA GTACAGACCT TGTTTTATGG TCTGAGGTGG CCGGGCTTAG 2820
GATACTTCTT GGGAAGAAAA AGTAGGATTT TGGATCACTA CTTCTGTTGG ATAAACAACT 2880
TTGAAGTGTA TTCAGTTTTG AAAGATAGTG GGGAGCAAAG ATAAGCCCTA GTAATTCTAT 2940
TCAACAGCAG TAAGGCGTAT GTGAACCTAC GACCTCACAC ATGCTAAGCA GGCACTACCA 3000
TTAAGCTCTA GCCCCAACCC ATTTCCCAGT TTTTACTTAG AGAATAAGTA AATATGTTTG 3060
TTGTTGTGTG GTGGACCGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG TGTGTGTGTG 3120
TGTTCCAGGC AGGCCTTGGA CCTGTGATGC CCTTTGATAC CCTCCAGCTG AGTGGCATCT 3180
TCAGGCCTCC TTCTGTTTTC TAAGAAGTTA GTTGGAAAGC TGGGTGTGGT GGGTTGTGGG 3240
TGTAATTCAA ACCTTTGAGG GACAAAGGCG GGAGGGTCGC TACTAGAGGT ACAATGGTCT 3300
ACACAGTGCA TTTCAGGCCG GCTAGGCATA GAGATGCCGG CCTGAAAAAC CAAAGCAAAA 3360
ACAAGCAAAA ATGGAAGTCA GTTGGAAATT AGGTCTGGAA ATTAAATGTT AGGGAAGTGT 3420
GGGTAGGGCC CTCAGGTTCC CTAGACTTGA GTTTCAGGGT 3460