EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12352 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:35300770-35304560 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr2:35303101-35303122GAAGAGAAAATGAAAGCAAGC-7.63
KLF5MA0599.1chr2:35301972-35301982GCCCCGCCCC+6.02
POU1F1MA0784.1chr2:35303243-35303257AGTATGCAAATTAG+6.88
POU2F1MA0785.1chr2:35303243-35303255AGTATGCAAATT+6.14
POU3F2MA0787.1chr2:35303244-35303256GTATGCAAATTA+6.04
POU3F3MA0788.1chr2:35303243-35303256AGTATGCAAATTA+6.2
Pou2f3MA0627.1chr2:35303242-35303258CAGTATGCAAATTAGC+7.06
SP1MA0079.4chr2:35301969-35301984GAGGCCCCGCCCCTT+6.18
SP4MA0685.1chr2:35301969-35301986GAGGCCCCGCCCCTTTG+6.41
ZNF740MA0753.2chr2:35300893-35300906GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr2:35300894-35300907GGGGGGGGGGGGG-6.03
ZNF740MA0753.2chr2:35300891-35300904GTGGGGGGGGGGG-6.92
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02924chr2:35287656-35303029HFSCs
Enhancer Sequence
ACACAGAGGC TCCAGGCCAT TAACACACTG CTCAAGGTCA GCTAAGAGAC AGCTAACCTT 60
AGTGATTTCT GCGGTGTTTG TGCATGCATG TGTTTTTATC TTGGTGTATC TGTGTGTGTG 120
CGTGGGGGGG GGGGGGGTGC ATGTATGTGG CCTTGCATGT GCGCTGCATC TGATCCTCCT 180
CTCTCACCTT GCTTTAGGGT TTTCTAACCC TACTGTGGCA CCAGGGAGGA GCAGCACTTT 240
TTAGTACTCT AAGCCTTAAG CAGTACTTTG CTCTTCAGTT ATGAGGCTAC GCCCTGCGTC 300
CTCCCTTAAA TCAGAGTGCA GGGTAGCAGG CTAACACCAA AGCTGCCTTA AAGGCAGCAG 360
ATACTAAGTC AGCCTTCCCC TCTTACCCAG TCACCACCTC CTTACCCTCC AGGGTTCTGC 420
CACTCACTGC CAGGAAGTTA CTCACCAGGT TACTCCCTCT TGTGCTCAGG CCGCTGTCTG 480
GACACGTGCA ACGCGCTGCC TGATGTCCAC CCCACACACA CTCCCGTGGT AGATATAAAC 540
TGCCAGGAGA GGTGGCTTCA AGTGTGCTTG CTGGTATTGA CTTGCAAATA ATTTGTTCAC 600
AGAGCTCATC TCACGAAAAG ACTCCTCCCA GCCCAGACAG ACACCTGTGC CAGCCCCAAC 660
CCCTCAGCTG TGGAATGTGG AAACGAGGAC TCATCTGAGG GTTTCATAAT CTCACATCAG 720
GACTTTTGGC AAACTATGGG AGCCAGGACA GGTTCTCACT CGCTTTAAAC TTCTGTTCAC 780
CTCAGTTTCC CTAGCTTCGA AAGGAAAGTT TAGCCTGTTT TGGTATCTTT CCACCTCCGA 840
CTGGTGCAAT TTTGGTTAGG AGGCTCTATC CACCCTCTCA TCTTTCACTC AAAGTTCCAC 900
TTGGATCCCA GTGGCAAACA GGAAGTGTGA CCTGCATAGT GGGGCAAGCA GTATGTAGCT 960
GGCTCTGTGG CATAAGCTGC CTAAAAGGGA CCAAAGAGCA TCTGCCATCT TTGCTAAACC 1020
CCAGCACCGG GCCCCAGGCC ACCACCCTCC TCTTCAGGGT TCCCTGGCCA CCGCACTTCA 1080
CCCATTCATA AGAGGCTGGT AGCATAGAAC GAACAATTTG GGGCCAGTAT TTTAATGACC 1140
AAAGGAGACT GGGTGGAGGG GCTCAGGACT AAGGAGCTCT GCCTGGCCCC ATGACCTCAG 1200
AGGCCCCGCC CCTTTGTAGG CTGGACTTCC TTTCTCCCTG CTGGCTTGGA GGTCTTCTTT 1260
CTGCTGTGTG CACCATCTCA TTGCCTTGTC TTAGTCCCAA CCCCCTTTCT TCCCATGTGG 1320
TTCTAGAGCA TTCCTTAATC TGTGTATCTC ATGTTCCCCC TTTGTAAAGC CAGAGCACTA 1380
TCCATCCCTG TCACTTAGCT GCCAGGATGA GGAGCAGGCA AAGATGTCAA ACGTGGCCCC 1440
GGCATGGTAA CTGCCATGAA GAACGAGTAA AGGTAAGCAT GAGCTATAGA GAGAGTAATC 1500
TGGTTCCTGG ACCACCTCCT TCGCCGGAAG CTTGCCCATC TGCAAAAGCA GTGAGCAGAT 1560
CTCGGGCAGT GAAGACCATG TCCCAAGTGG CATCCCTCTG AGAAAGCAAA TCTGAACATC 1620
AAGTTAAGCC CAGCAGAGCA GGAAAAGGAA ACTGCATGGG AGGAATGGCA GGAAATCCTA 1680
GACACGGCCC CAGAGCACCA GGATGAGGGG GCTGGCTGCT GGGTATGGAG AGGCTGCGGT 1740
GGACTTTGTA GACTCTTGCT CGGGAAGGCA GAGTGACTTC CGGCTGCCAA AGGCACTGCT 1800
TCCGGGTTTG TTTCCGTTCC AAACCTCTCT GCTTCAAACC TTACAAGGTC CAAGAGTCCC 1860
AACAGAGTGA ACGCCAGCCT CTGTCTGGAG GGAGCCATGT TTTACCTCTG AGGCCTGGAG 1920
AGTGAGGGGG ACAACACCTC TTTTTCTGCT TTTCACCGGC AGACAGCAGA GCCTCCATTC 1980
CAGAGGTTTC CAGACGTATG ATGGATGACT TAAAACTTTC AACTTTCTGA TGGTAGAGAT 2040
GCTATCCTGT GCTGTTGAAA CCACACTTTG CATTTCAGAT CTGCATCTCT TCTAGGTGAA 2100
TGGTATGCAG TAAGATACCC TATCATGACA CTGGGCAGTG GCTGGACCCC CAATCCTGAA 2160
TCAAAAAACT GAGACCCTAC ACATACTCCA CATAGGGCCC TGAGCCCGGA GTTCCTCTAG 2220
CTAGCCACAC TCAACAAATT TTCGATTTAT ATTTATTTTC CAGTCATTAT GGATTTGCCC 2280
TAGCGCAGCC CCCATCATGA GTCAGCCATA GCTCTACCTG CTGCAGGGAT AGAAGAGAAA 2340
ATGAAAGCAA GCTGGGAGGT TGCATGTCTT CCCCGGGCAG CTGCCCTCGC CATGTGACCC 2400
ACAGAATCCT GAAATTTGAG TCATTTTACT GTAACAACCA AAACACCAGT TCCCTGAGTG 2460
CTAAGAAAAA AGCAGTATGC AAATTAGCAG GGCTGTGTTC TGACTCTCGG GTCCCAGTGA 2520
GTTGTGGGTT CAAGTCAGAG TCGTTTCTGT CAAGCCAGGC ACCCAGGTTG ATCACCTGTC 2580
CCCTGACCCT AGCACATCTT GCCTAGCAAC AAAGGAAACA GCCTTGCATT TATTTTCAGC 2640
TGGCTCCAAG AAAGGAAGGC CCAGCACTGT TGAGAAGGTC TGCTCCCTCT GACCACAGCT 2700
CAGGAGGTTA GGCCGAGACT AACCATGGGC ACCAGAGGGA AGCCATTTTG AATTTAGTAT 2760
GCAATAGCCG CTGGTCAGGA GGAAGAAAAT GACCTGTCCC GAGAATCAGT ACCTCCCTGT 2820
TCCTGGAGGT CACTCAGTTG TGGGTCTCTG ATATGTTGTT TGGAAGCAGT GCAAGGGGCC 2880
CCAATCTTCC CTGGGATGCT GAGCAAATAT TAAGCACTGT TCAAAGAATT CATCAAAGTC 2940
ACAGTGCTAC TGAGTGCTTT CTGCTATACT GCAGGCATTT CCTCTGATGT TCCTGCTCCT 3000
AAAGAGAAGA CCCTGATTCC CTAATTAACA GCCTTCAAAC TCTTGCTCCC AGGGCTGCTG 3060
TGAGCAAAGT GACTGTCATC CTATTAACCA GCCTACCCTC ATGGTGGCAA CAGCTGCCTT 3120
GAGCACTCAA TGGAATCCTT GGGACAATTC CACAGCAACG ACTGCAGTCC CGGCTCCTGG 3180
AAGTACAGCC TCAGCCAGGG CTGTCTGAAG CAGCCTGTAC CTCGCCTTTT GAGAGCACAA 3240
GCCTTGATTC ACTCAAGATA ACACTGTAAC CATTTCCTGG TAAGCCAGAT GTGGAACATG 3300
ATCCATGGTG GTCCAGCACC ACATGGTGGT TTGTGGCCCC ACGTAATGGT GCCTTTCCGA 3360
ATGAATGAGC CATAGATTAT GTGCAACAAT GAAAGGCTCT GAACACACAA TGAGCTAAAC 3420
TCAACTTAAA ATCAAACATG CAGTGAATCA GAGGTGCTGG CCCAAGCTGC ATCGCAGGAC 3480
TCCACTCTGG CCTGTTCTGA ACACACAACA TGCTACCATG CCACTTGATC CTCTCACCCC 3540
TGACTGCTGT GGCTGCTCAG CTGTCACACC CTGAGGGGGG GGGGGGAAGT CAAGAAAGCA 3600
AAGAGTTGCT CCTGTAGGCT CAGCCTGGCG ATAATCAGAC ACAGAGACAT TTCACAGCTG 3660
AAGGAAACAC TAAGTGTCAA TCCTCAAACC CTTCTCCTTT ACAGATAAAC CGAGCCTCAA 3720
GGAAAGATGC AGCTCAGAGC CAAGGTGGGA GGGTGGGAAG TCTGGAAGGC TCCTTGAAAC 3780
CAGGATATAA 3790