EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12198 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:30612020-30616490 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr2:30615561-30615576AGTTAATGAGTAATT-6.09
INSM1MA0155.1chr2:30613004-30613016TGCCCCCAGACA-6.44
LMX1BMA0703.2chr2:30616221-30616232TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr2:30616218-30616231TAATTAATTAAAT+6
NR2C2MA0504.1chr2:30616323-30616338AGAGGTCAGAGGTCA+8.73
Nr2f6MA0677.1chr2:30616324-30616338GAGGTCAGAGGTCA+7.42
Nr5a2MA0505.1chr2:30616331-30616346GAGGTCAAGGTCAGA+6.92
Nr5a2MA0505.1chr2:30613701-30613716AAGTTCAAGGTCACC+8.12
PHOX2AMA0713.1chr2:30616222-30616233TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr2:30616222-30616233TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr2:30616222-30616233TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr2:30616222-30616233TAATTAAATTA-6.62
RARA(var.2)MA0730.1chr2:30615591-30615608TGACCTCAGACTGACCT-7.04
RXRBMA0855.1chr2:30616324-30616338GAGGTCAGAGGTCA+6.84
RXRGMA0856.1chr2:30616324-30616338GAGGTCAGAGGTCA+6.91
Rarb(var.2)MA0858.1chr2:30615591-30615608TGACCTCAGACTGACCT-6.86
RxraMA0512.2chr2:30616324-30616338GAGGTCAGAGGTCA+6.88
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_05351chr2:30612996-30615801E14.5_Heart
mSE_08073chr2:30613070-30617061Kidney
Enhancer Sequence
ATTGTTCCTG ACAGCTCTTG AATGTGCCAA AAATGTGGCT GACTCAACCA CACCCCAGAA 60
CTCCAAGCCT GACACAAGAC AAACGCAGTA ACCTGAGGGA ACCCAGGCAC ATGGGACTCC 120
TGACTCACAG TGTCTGGACT CTGCTGCACA GTTAGGGTGG GATCTGACAA GTATGCACAG 180
TGGGGGTTCT GGGCGCAGTC CTGGCAGAGG GCTTGCCATT GAATTCTCAG ATTCTGTCCC 240
CAGCCTTGCA CAAAACGGGC ATGGTGGCAT GCACCTTACG CCCGGCAGCC ACAAGCCACA 300
AGGTGCAGGG GACATCTCTT GGTTAGGAAC GTGTTTGCCT GGGACACATA AGGACCATGG 360
AAAATCCAGG TGGCACGACA TCTGTAATTC CAGGGCTGAG AAGGCAGAGA GAGGAGAAGC 420
CCCCAGAGCT CACTGACTTG CCAGCCTTGC CAACTGGGCT CTAGGTTCAA TGAATTCCCC 480
AGTCTCAAAA AATAAGTTGG GGGCTAAGAA GATGGCTTGG AGGGTAAAGT GCTTGGGGAC 540
AAGCATAAGT CTCTGAACCT GGGTCTCAGA ACCCGTATAA GAACCGGCAC AGCCGTACAT 600
GCGCCTGGAA TCCCAGCACA AGCTTTCTGT TAGCCAACCT TAATCCGTTA TGCAGAGGTG 660
ATTGACAAGA GAGACCACAC CCCAAGCAAG ATGGAAGGCG ATGAAACCCG AGGTTTCCCT 720
CTGACCTCCA CACACCCTGT GGCATGTGAG GGCCTGCACT CATACACACA AACACTATGT 780
TCCCTTCCAC TATGTAGCAA GTTTAAAGCA GTCTAGGATC CATGAGTTTC TGTCCCAAAA 840
TAACCAACAA ACTTGACCGC AAAGCTAATG GTAGGGGAGC CAGCTAGAGG GAGAGACCTT 900
TGGGGAATGT CCTAGAAGGG GCAGCCTTAC CTTGGATCCC ACAAACCTGA TTCTTAGCTT 960
GAAGGCCAAG CCTAGGTGTG TCCCTGCCCC CAGACATTCA GTCTCAAGTT CCCATTGCCT 1020
AAGGCAGTGG TCCCCTGCGT TGAGACTTGT ATTTGTGAAG CAGATGGAGG TTGAGCAGGC 1080
GTAAAGTTCA AGGCTGGTCC TGTCCCAACC CCTACTAGTT CAGAGGGCTC TTGTGAGCTG 1140
GGACTTGAAC CCAGAGTCTT GGTTTTTTTG TTTTGTAGTT AATATTTATT TGCTTTCTGA 1200
TCTGTGTATC AGGTCTATGG CTGGTATCTG AGAAGATCAG AAGAGACTGT CAGATGCCCT 1260
GGAACTGGAA TTGCAGATCC TGTGAGCCAC TGTGTGGGTG CTGGGAATTG AATGTGGAAT 1320
CCATGGTCTT GTGTCCATTA ATTATGTCTT TACTTCAGCA CTACTACACT GAGTCCCTGC 1380
CTCGCTGACC CAGAACACAG CACCGTTAGC CAGCCATTGC CAGGAGACAA GAAGAGTCTG 1440
AATCTCCCGT GTTCCCCCTC TCCTTGGACT GCACTTAGTG CATACTGGGT AAGCTTGGTT 1500
TCCAGGCCCT GGGGGGTTTG GAGAGAGACT GTACTCCTAG TCCAGCAGGG TTCCCCAAGT 1560
ATACATGCAC ACATACATGT TTGCTTGGCC ACTTGTCGGG GAAGCACAGG GAAAGGACAG 1620
GACAGCACAC GCCGAGTACT ACCAATGCTA GAGATGGGAA GGGTAGAAGT AGGAGGATCA 1680
GAAGTTCAAG GTCACCTTCA CAATGATCAA GTTGGAGGCC AGCCTGGGCT ACATGAGATG 1740
CCATCTCAAA AAGTAAAGCA TGGTTTGGGC TGTGCAGGAA AAAAATCAGT CCAACCCACC 1800
CCCTTCCTGC AAATTCCTGA CCAGGTTTGG CTAGGCAGAG ATCAGATCCA CAGCAGTAGC 1860
AGCAGTTTCA GACTCTGGGG GTCAGGGGAA TCCCAGACGG TGTTATCTGC AAAGTGGTGT 1920
GTGTCTCCTC CAGAAGCCTA AGCAAGCATT GGCCGTTGTC CGGTAGGGGG TGGGAATTGG 1980
ACCGGAGCCA GAAGCAGGAA CCAGACTTTC CGCTGGGCAG GGCTCCGCAG CTGGGCTGTA 2040
ACTAGAGTCT CCTGGGTTTC TCAGGGGCAG GACCCCCTCA GGTCTGGAAT GCAGCCTGGG 2100
CCCAGGGAAG GCTAACAAAT GGTGAAGGCT TTGAAATCTC AGCTCCGCCC TCTCTCGGGG 2160
TTGAACAAAC AGCCCCTCCT CCCACCTCTG TTGGAAGCGC CCAACCCTAG GCTGCCACTC 2220
AAGTTTCTCC TCGTCCTCAG GCTGGGGTTA CAGCTGCCCC ATTCTGCGGG CCTCTGTGGT 2280
CCCAGGACTG TGGGGAGAGA GAAGCAGAAA GACTCAGGTC CCCTCTCCCT GCCTTCTCGG 2340
GGTTCTGACC CGAGCTAGAT TCTAACCCTG GCTCACTAGG AAGGGCCAGA TTCAGCAGGG 2400
AGAAACGGGA GAAGTGGCAG GAGCTCCCTC ACCCCCATAA GGAATGTCCA GCGTAGAATT 2460
CTATTCTCAA GCGCCAGGAG CTGGACTGGC CAGAGAACGT TTGTTTGCAT TTCAGCAAAA 2520
ACCTCCTTTG TCTAATGTTG TCTAGCAGTT CCCAGGAGTT GAGGTGGAGG GAGGAAGGTG 2580
TGGCCCTGAA ACTAAGGTGC CACACCCCAC ACCCACCACA CCGTGTAGAA AGCACTGGGG 2640
GCTCAGGCTT CATCAGCTTC TTATACGCAG GGTTCCAGCT GAAGAGCTTT TCCCAGAGAC 2700
CTTGATTCTG AGAGAGGTGC GCACACAAGG CCTGCCCCAG CTCCAAGGTC AGGGAATTGA 2760
ACCCTAGAGT GTTCTTTAAA AGTGCCCTGC CCACTTTCCA AGGAAGCCCT TTCTTCATTC 2820
CTAAACCCAC CTTGGAGTCC CGCTCTCAAA GAGCCCTTGC TTGCCTAGAT TCAGTCCATA 2880
ACTCTGTAGT CTCCTGCCCG TGTGCTCCCA AGACCTCACC TCATTCCAAC CCTTTCTCTT 2940
CATCTCCACC CCATCCTCAG CGACATGGGT GCCAGGACAA GCCTCCAGCT CTCCCTAGCT 3000
CTCTTAGTCC TTCCTGGGCT CCCAGCCCAC ACTTCATGGC TTGCCTCTTT GGCCCCTTCT 3060
GAACAACCAT GTTCACAAAC ATGGTGCAGG AGCAGACTAC TGGAGGTTCA GGGAGACCGG 3120
TGACACTGGA GACCAACCCT GATGTGGATG GAGGCTGGCT TGCTGCCACC AACCCTAGAG 3180
GGACAGAGTG TGCCATGGGC AATGGGCTGA GCGAGTTGGG GTAGGGTCTG CAGGTCTTTG 3240
CCACCTCTCC AGGCCAAGTC ACCAACTAGT CCCATATACC CTCTGCTGCA GACAGAGCGT 3300
TCTGGATGGT CCCTAAATTG TTAAATCCTC CAGCCAGGCC ACCAGGCCTC AAGGGCCCTG 3360
CCCATTGCTA GACAGAGTGG CATTGTGTGT TTGTGTGTTT GTGTGTTTGT GCACACGCGT 3420
GAGGATGAAT AACAGCCTCT CCTTCATGTG TAGGGTTCCT CTCTTGCCAG TCCTTCTGCC 3480
TTCCCAGGAA GAATTTCCCC CAGCTTTCCA CAGGCCATTA ACTCAGTGCC CTGACTTGAG 3540
GAGTTAATGA GTAATTCGGC TGGACAGGGT CTGACCTCAG ACTGACCTTG GGTCCCCTGC 3600
ATCCCTGCAG CTTGCTTTCC TGGTAGAGTA TGTGACAGTT TTGGGGTGAG CCCAATAGTG 3660
GGCTCTGAGT TTTGAGCACC CTGCCCCCAG TCACCCTATT CCTGAGCCTC AGTTTCCCAA 3720
CAGTCTTAGG CAGGTGTCCA CTTGTAATCA AGAGACAGTT GAACCCATGA GGACCCTGTA 3780
AGTAGCCTCT TTGTCATGTA AAACCGGGCT GGAGCAGTGG CTGTGTCTGG CAGTCCTGGA 3840
GGAGGGCGGG TGGCCTGACC CCTGGCTTCC TCTGCTGGGC CTCACCTCCT TGCTGACACT 3900
GAAGAAGCAA AAGAATTGAG AAATCTGGGG CAGCTGTGTG AATGCACACT GCTGAGGAGG 3960
AGCAGCCCCT GGTAACTTGG CAAGCTGGTA GCTCGCTCGC TCGCTCAGCC GAATGGGCTG 4020
AATGAGTGGG CCAGAGCCTG AGCGTGAGCC GGAGCCCAGG GTGCCCATGG GTATCACCCA 4080
GCCAGAGGTA AAAGGGCCTG GATGTCTGGG AGGTGGGAGA AAGGTTAGTA GATTCAAGAG 4140
GCCAATGCCT CACTTTGGGC CAAAAAGAAA TACATGGTGT GGTGGGGTTG CATTTTTTTA 4200
ATTAATTAAA TTATTTATTT AGTGTCTATG TGAGCCAGCC TGTTGTGTGA GTGTGTGTAC 4260
GCATTCACGT GGATACTCAT GCAAGTCCGT GCCCACTTGT TATAGAGGTC AGAGGTCAAG 4320
GTCAGATGTC TTCATCAATC ACTCGTCATG AGGAACTCCT TAACCAAACC TCAGCCAGCT 4380
AGCTAGACAA CAACTCACAG GAGTCGGTCC TTTCCTTCAC CGTGTGAATT GTGAGGATAA 4440
ACCCAGGTTA CCAGACTTGG CAGCACACAT 4470