EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12191 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:30546800-30550330 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:30547025-30547043CTGTCCTGACTTCCTTCC-6.28
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:30548611-30548629CCTTGCTTGCCTCCCTCC-6.32
EWSR1-FLI1MA0149.1chr2:30548788-30548806CCCTCCTCCCCTCCCTCC-6.34
RREB1MA0073.1chr2:30549213-30549233CGCCCACCCACCCCACACCA+6.32
ZNF263MA0528.1chr2:30548824-30548845CCCTCCCTCCCTCCCTCTCTC-6.11
ZNF263MA0528.1chr2:30548792-30548813CCTCCCCTCCCTCCCTCTTTC-6.34
ZNF263MA0528.1chr2:30548776-30548797CTCCCTCCAACTCCCTCCTCC-6.53
ZNF263MA0528.1chr2:30548816-30548837CTTTCTCTCCCTCCCTCCCTC-6.61
ZNF263MA0528.1chr2:30548664-30548685CCTCCCTCCATCCTCTCCTCC-6.93
ZNF263MA0528.1chr2:30548762-30548783TCCCTCTCTCCATCCTCCCTC-6.95
ZNF263MA0528.1chr2:30548414-30548435GGGGGAGGATGAGGAGGGGCA+7.05
ZNF263MA0528.1chr2:30548667-30548688CCCTCCATCCTCTCCTCCCTC-7.07
ZNF263MA0528.1chr2:30548695-30548716TCCTTCTCTCCATCCTCCCTC-7.14
ZNF263MA0528.1chr2:30548812-30548833CTCTCTTTCTCTCCCTCCCTC-7.17
ZNF263MA0528.1chr2:30548619-30548640GCCTCCCTCCCTCCCTCCTCT-7.23
ZNF263MA0528.1chr2:30547809-30547830CCCTCCCCCACTCCCTTCTCC-7.29
ZNF263MA0528.1chr2:30548683-30548704CCCTCCTCCCTCTCCTTCTCT-7.41
ZNF263MA0528.1chr2:30548820-30548841CTCTCCCTCCCTCCCTCCCTC-7.43
ZNF263MA0528.1chr2:30548759-30548780CTCTCCCTCTCTCCATCCTCC-7.56
ZNF263MA0528.1chr2:30548692-30548713CTCTCCTTCTCTCCATCCTCC-7.88
ZNF263MA0528.1chr2:30548674-30548695TCCTCTCCTCCCTCCTCCCTC-7.97
ZNF263MA0528.1chr2:30548680-30548701CCTCCCTCCTCCCTCTCCTTC-8.04
ZNF263MA0528.1chr2:30548671-30548692CCATCCTCTCCTCCCTCCTCC-8.28
ZNF263MA0528.1chr2:30548788-30548809CCCTCCTCCCCTCCCTCCCTC-8.89
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_03192chr2:30548980-30568776TACs
mSE_03716chr2:30546867-30551907Cerebellum
mSE_03994chr2:30546808-30550239Cortex
mSE_04383chr2:30546801-30550631E14.5_Brain
mSE_04795chr2:30546977-30549960E14.5_Heart
mSE_05505chr2:30547247-30550216E14.5_Limb
mSE_06656chr2:30547076-30548765Heart
mSE_06656chr2:30548860-30549712Heart
mSE_07479chr2:30547425-30549779Intestine
mSE_07960chr2:30545267-30552235Kidney
mSE_08810chr2:30545244-30548828Liver
mSE_08810chr2:30548888-30549760Liver
mSE_09011chr2:30545254-30548822Lung
mSE_09365chr2:30547112-30549901MEF
mSE_10696chr2:30546901-30551838Olfactory_bulb
mSE_12429chr2:30545437-30549668Spleen
Enhancer Sequence
GGCTAGTTTT ATGTCAACTT GACACTCTGG CAGCAAGCCA GAAGAGAATT TCCTTATTTG 60
GTGATTGATG TGGGCGGGCT GGGCACATGT GTGGGTGGAG CCAACCCTGG GCTGGTGGTC 120
CTGGGTTTCC TAAGAGAGCA AGCCACGCCC AGCAAGCCAG TAAGCAGCAC TCCTTCAAGG 180
CTTCTGCTTC AGCTCCTGCC CTGGGTGCCT GCCCTGTTTG AGTTTCTGTC CTGACTTCCT 240
TCCAGGACAA ACTAAGGACG TGGAAGCAGA AGTCACGGAC GTGGAACCCT TTCCCCCTCA 300
ACTTGGTTTT CATCCGTAGT GTTTCATCAG TCCCAGCCGG AAGGCAAGGA CCAACCCCTG 360
AGGTTGTTCT GACTGCTGCA CACATACAAG GGGAGTACAC AAGACCATGA GCACTGGACC 420
CCCAAGAAAA CCAAAGTGGG TTCCAGGCCC ATCCTGGCCT TCTGGGGACT GCAGTGCAGA 480
CCCTGGTGCC ATCCGGTTAG ACCTCAGAAG TTGAGGCCAG AACTTTGGAA GATGTTGCAG 540
TTGCTTGAAG GCAGGAGAGG GACTGGAGGC CCTTATGAGG CAGAGCAAGA GGTGAAACAC 600
AGTTGTCTGG TGGTGCTGTA GCTCAGGGTG CAAGGCCCTG GGTCTACCCC TAGACATAAA 660
GGAAACAATC AAGAAAAACT CCACCCCATC AGGCAGGCTC TGGGGGTGCC TGCCTTCTCC 720
TAGTCTTTGA TCCTGACCTA TTTTGAGCAC CCCAGAAGTT CTACTCAGAT GGTGGGTCTC 780
CTGCTGCTTG CTGGAGACCT CTTCCCTCAG GAAGCTGCCA CAAGGGTGAT TGAGCTGTCA 840
GTACAAATGA CAGGCTATTA GGTCTGGAGC CATTTTGATC TGAGGTTGGC CAGGGTGTTC 900
CTGTGTTCCT GTACATAGTG GGGACTGGGG GATTCTGGGG TTGAGGGCTT TCTCTTGTTC 960
CTCAACTGTC TCCGACTCTG GTTAGAAAGG CACCTCCGCC ATCTGTCATC CCTCCCCCAC 1020
TCCCTTCTCC GAGGCCCGGC TGTGACTGGG GGCTGGCGTG TCTGGTAAAC AGGCGGCTGG 1080
CAGGTCCCCA GGGCCTGTGG GTGACAGGCC TGGTGCTGGC ACCAACCCCA GGGCAGCATG 1140
CCGAGGAGGA GTGGAGATGA GTTCTGGGGA CCAGGGAAGA TTTCCTGCCA TGTCTGAGAG 1200
AGTCGTGGCT GTGTCCTGTC CCTGGCTCTC CAGACCTCCG TGGCCGCTAT GACTGTCCAC 1260
CCCTTCTCCA ACGCTTCAGC CCCAGCCTTC ACATCTTCCC TCCAGCTGCC TTCAGAGAAT 1320
TCAAGTCAAT ATCTGGTGTG AAAGGCTGTC GGGTTCTCTC TACCTGGGTG AGGCTAGGCA 1380
GCCAGCTCTG TGCCCTGGGG AGCCACACTC CACCACCAGA GAAACTGAGG CCAGAGGGCA 1440
GGTGGAAGTG GGGTGCTGAG AGCTCTTAGG ACTCCACCCC CAACCCTTCG GTCAGCTCCC 1500
TGCAGTGAGG GGCCGGGTGC CTTCGCCTCG GTTGTCTTAT CTGGGGAATG GGAGGGAGGT 1560
CAGGTCTGTA GGAAAGGGGT CCTGCCAGTC TTTCTCAGCT CCCTCACCTC CCCTGGGGGA 1620
GGATGAGGAG GGGCAGGAAT CTGTCCAGGT CGGTTCCCGG CTCCCCCTCC TCCAACACGG 1680
CGCTGCCAGT TCCCTCCCCT CCTCTCTCCT GCCTTCTGGC TGCCAGCCCC TCCCCACACG 1740
GCCCCAGACC CCAGCTGCGG TGTCTTTACA GCTCTGACCA GCCGCTCAGC CTCTCCGACT 1800
CCTCCCTCCC TCCTTGCTTG CCTCCCTCCC TCCCTCCTCT CCACTTCTCT CCAACATCCT 1860
TCCTCCTCCC TCCATCCTCT CCTCCCTCCT CCCTCTCCTT CTCTCCATCC TCCCTCCATC 1920
CTCTCTCATC CCTCCCCCCT CCATTTTCTC TCATCCCTCC TCTCCCTCTC TCCATCCTCC 1980
CTCCAACTCC CTCCTCCCCT CCCTCCCTCT TTCTCTCTTT CTCTCCCTCC CTCCCTCCCT 2040
CTCTCTCTCT CTCCCGGGGA AGAAAGGTCA CGGTGCAGCT GATTACTCAG AGCTCAGTTG 2100
CTGTAGCAAC CGGCGGGGGA AGTGGGACAG GCTGGCTTTG AGGACGCGCG AGGTCGGCCG 2160
CGGGCGGCTG GAGCCGGCGC GGGCCCCGGT GCGCGGGAGG CCGCCTGCAG CCCGGTTCTG 2220
CGCGCTGCGG CCCGGCTCCG GGTTGCGGTT TTAATGAGGA GCCCGCGCCC CTCCCGGGAC 2280
TGCTAGGAGA GAGTTTCTGC TCCTAGTCTC GGTTCCCCCG GCTCGGTGTA GGTATCCGCC 2340
CTCCGCCTGG GTTCTGCCAG CGCCTCCTTT CTTCTCTCCC AGCCGCGTGA GAGCAGCTGC 2400
CTCCCCCTGC GTGCGCCCAC CCACCCCACA CCAGCTTTAG CCAGGTGTCC AAGGAGACCC 2460
CAACACCCTG TCCATCCCCC TCAGCCTTTG TTATTACCAG GGAGACCCAG CAGGAGACAG 2520
GTGCACAGGG GCTGGCTTAA AGACCCACCG TGAGCGAGCC TGAACCTCTC TCTAAGCCCT 2580
GAGAGCCTAG AAGACTCGGC TGGATTGCTG GAGAAAGCCA GACCCCTGCT GTCCTTGGCT 2640
CCTCTCCAGC TAGCAGCCAG ATGAGCAAGG TTAGAAGAGA CTGGGTTAGC AGGGGTCCAG 2700
CCTTGACAGG AAGGGAAGAG GATCCAATCC CCAGCCTGTC ACCTCCACCT CCACCACATA 2760
CACACACACA CACACACACA CACACACAGC CTGGGGAAGT GACCAGGCCA CTTTAGGAAC 2820
CGGTTGACAT CTTTTTCAAA TGTTAAACTA TGGCTGGGAG GTGTATTGTC AGAGGTAGAG 2880
CATTTGCCTA GAATTAGAGG GAGCCCTGGG TTCAAATCCA GCATCACACC TAAAAATTAG 2940
AATACACAGT TATTTACCCC AATCATTCCA CTCCTAGGTA AGTGTGTCAG AGATAGGAAA 3000
ACCAATGTCC GTACAAAGAA GGGTCATGGA TGCTCAGGGC GCCACTATTG ATACAACACA 3060
AATCCCGGAA GCAGCCCAAG GTGTGCCCAC CACTCCAGAA GCTGCGGAGC ATGAGAGAGC 3120
ATAGCCTGCT TGCTCAGATT TCTCCAACAC TCTAGAAAAT GCTACCTGAT CTATGAAAGC 3180
AGAGTGCAGT TCTGAGGGTG CTGGGGGCCT GAGAAGGACT ACAGAGGGGC TCGGGAATCC 3240
CACTGGGCCA GGCTGATTGC TTCCTGGGTG AACAAAGGAA AATAGAGGTT CCAGCCGCAC 3300
AGGTCCCTAC TTGTACAGTC ACACAGGGAA GAGAGGCCCT AGCACGTGCA AAGGTCCAGT 3360
GGCCAGGGTG GGATCAGTGA GGGGAACATT GCAGGATATC CTGTGGCCCC TGTATGACTC 3420
TAGCACCCTT GAGTATGGTT TGCCTGAGTT TGTGCTACCC TGCTCTCAGG GATGCTGCTT 3480
GCTGGTCCTG GGCCTCCGAG TCTTACCTGG TAAATGTGTG CATTTAATTC 3530