EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-12178 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr2:30400030-30403570 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 17             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr2:30401030-30401042AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr2:30401034-30401046AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr2:30401038-30401050AAACAAACAAAC-6.32
Foxq1MA0040.1chr2:30402914-30402925TATTGTTTATT+6.62
NR2C2MA0504.1chr2:30401525-30401540ACAGGTCAGAGGTCA+7.58
Nr2f6MA0677.1chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.67
RFX1MA0509.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.43
RFX1MA0509.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.45
RFX2MA0600.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.38
RFX2MA0600.2chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.45
RFX3MA0798.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.35
RFX3MA0798.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.69
RFX4MA0799.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA+6.65
RFX4MA0799.1chr2:30400794-30400810CGTTTCCATGGTTACA-6.67
RXRBMA0855.1chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.1
RXRGMA0856.1chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.38
RxraMA0512.2chr2:30401526-30401540CAGGTCAGAGGTCA+6.27
Enhancer Sequence
ATTCTTGGAC TTCCGTAGAA GAACCCGTAT CACCTTGTTT CAGATTCTCA GTTACATTTT 60
TGATCCAGCG GCAAAAATGC TATCATGGTC CCTGGCTGAT GGGCAGCGAT TCCCACAGGC 120
ATCCTGGCTC CCAGATCTGG GCACTGGGAC TTCCACCCCC TGCACTGAGA GGTGCTCAGC 180
TATACATCTG CCTGCCTATT GCAATGGGGA CAGATTGTAT TGGCTGACAG GTTCCAGTCT 240
CCTCTTCCCA CTTCGTTGAT AGACACACTG AATCCAGCTT CGACAGGGTC CCAGGGTCAC 300
CTCACTCCTT ATAAGATGGG TTTCCTGCCT CAGAAAGAGC ACCTATTTCC TGGAGGGTGG 360
CTGGGAACCT TGGCTATAAT TGAGTCAGTC GTGGGTGCCT CACACCAACC CTGTTTACAG 420
ATAGCCAAGC TGAAGAACTG GAGGGTCTGT CTGATCACGT GCCCATGGCT CAGGGTAGCT 480
GGTGGCACGG AGCCTGCATC TGTAGAATTC TTGAATCTTA ACCTTAGTTT ATAAGCAAAG 540
CAATACCCGG TACCAAGAAG GATGTCATCA AAACCACGTG GTGCAGGACT CGGCCTGGTG 600
GGCGTCCTCC GCACTGCGGA CTGCCACAGG TCTGATCCTC TTTTGAATGA CACACAAACC 660
ACACCCAAAT CTCCTGCTTA TTAGTCCTCC TGGCCACGCC TAAGTCCAAC CCCCGCGCTG 720
TAGGTTCCGC CCCCCGCGGG CAGCGCTGGC CTCCCATTGG CCTCCGTTTC CATGGTTACA 780
CGAGACCTGC GGCGCTGCTG GCTTCCCGAC ACGTGTCCCA CGGAGCCGCC CGGAATTTGA 840
CAGGGGACCA TGTGCGCGGC AGCGCGGGAG CCAGACAAAG ACGGGGAGGC GGTGGGGGAC 900
GAAGCCCGGT GGAGAGACGA AGCCAGGCGG AGAGGCTGGG AGCCGCGCCT CCCGCCTGCT 960
GGACACCTCG CTTTCCTCAT TATTGCTTGA AGAGTGGATT AAACAAACAA ACAAACAAAC 1020
AAAAATTAAT GGGAGAGAGG TGGGAAAGGA TCAGAACCAG CCCCACCTAC TGTCTCTTCT 1080
ACAGGAAAAA CCCACAGGCG AACATCTTTT ATGACTGTGA ACGCGCAGGC TCCCTGCTTA 1140
CACCTCCTGG CCCTGGGCAT CTCAGCCCAC CTTAACTTCA ACCAGTGAGG TTCAAATTCA 1200
GTTGATTTTG CCTGGCTAGT TCTAGTAAGG AAAGCTTTTC TGGCGTGGTT GTTTCGATGC 1260
TTGAAATAAA TGAGATCCAA GCAATTGTGG GGAACCTCTC TGGCCCAAGC ATCCTCTGCC 1320
TCTCTTACTG CCTTCAGGCA ACCTCTCCCA TGAGGCCCTC CTGGGCTCTG GCCCCAGCGC 1380
TGTGGGGCAC GGACTTTGTC CTCTCGCACC CCCATTTCTC CTCTTGCAGC CCTTTGTGAT 1440
GGCTACCATA ACAAATCACT CCAGATTTAG TGTCATAAAA CAACAGCGGA GTTCTACAGG 1500
TCAGAGGTCA AATCTGGATG AATTCAAGGT GTGCAGCAAC ATTGGGTTCC TTCTGCAGAT 1560
TCTCGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTTGC 1620
ACTGGGTTCC TTCTGCAATC TCTATGTCTC TGTCTCTGCT TCTCTCTCTT GTGTGTATGT 1680
GTTTGTGTGT GTATGTGTGT GTGTTAGCAC TGGGTTCCTT CTGTAGTCTC TATTTCTGTC 1740
TCTGCTTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC ACACACACAT ACACACACGA GAAAGAGAGA 1800
GAGAGAGAGA GAGAGAGAGA GAGAGAGGAC TGGGTTCCTT TTGCAGGCTC TCTCTTGTGC 1860
ATGCATGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTTAGC ACTGTGTTCT TTCTGCAGTC ACTCTGTCTG 1920
TTTCTCCCTC TCTCTCGTGT GTGTCTGTGT GTGTGTGTTA GCAGTGGGTT CTTTCTGCAG 1980
TCTCTGTTTC TGTCTCTTCC ACCCCCCCAC CTATCTCCCC CCCCCTCTCT CTCTCTCTTT 2040
CTCTCGTGTG TGTGTCTGTG TGTGTCTCTG TGTGTGTATG TGTGTGTGTG TTAGCAGTGG 2100
GTTCTTTCTG CAGTCTCTTT CTGTTTCTGT CCCCCCCCCT TGTATGTGTG TGTTAGCAGT 2160
GGGTTCTTTC TGCAGTCTCT TTCTATTTCT GTTCCCCCCC CCCCGTGTGT GTGTGTGTGT 2220
GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT AAGGGTCAGC CTCCTTACCT TTCTCCAAGC 2280
AGAGAGCCCA CCCCCTGACT ACCTTCCTGA TCTTTGGCCC TGCTTGCTCT TCAGTTACCT 2340
GCTTTCCCAT CTCAGAGTCC CTCAGTCACT CGGATGAACT AGAAGAAACC CCCGGCTCAA 2400
AGGCTGGTGA GCTGCCTCTG TTCCTCTCTG CTGTGAAACA AGCCATCTGT GTGCCCCAGG 2460
GGTTACGCTT GGGACATTGT TCTGCTAACC AGTTCACCTC TCCAGCTCCC CCCACCCACT 2520
TAGAAGCCTC TTTCTCTTCC AAGTCTTTCT CCCACGATGC CTGCCTGAGG TGGTGCCTGC 2580
ACACTTCAGG TCTCCTCTGA CCATAGGCCA GCACTCTAAA GTATTCCTGC AGCCTCTTCT 2640
ACCTACAAGG AAAGCCAAAA TGGCGCTGGG CCACACACAA ACCCTGATCT GCCCACCCGC 2700
TGGTCTCCCC CAGACCCTTC CCTCTCCTAC CCTTTCCCTT TGCGTCCTGT TTCCTGTATA 2760
TTCCACGGTG TTTGTCACCT CCTGGCCTTT GCCCGGTGGT TCCACTCTGG ATCTTTCTGT 2820
CTGTCCGCCT TCATTCATGT CCCCAGGAAG CTTGACTGAC CCTTCCCAAG CACCTGAATG 2880
TACTTATTGT TTATTAGTCT GGCAGAGCAC AGAGGCCTTG CCTGTCCCCT CTTGTCCCTC 2940
ACAGTCTTGT GTCTTGTTTG GCCACAGAGC TAGCCATGAG CTGGTCCCAG AGTCATGGTG 3000
AACCCTGTGA ATTTCTACTG AAGCTCAAGG ACTTGGTCTA GGGATGCTGA CGAGACCCAC 3060
GGCCAGGACA CACAAGATGC CAGAATGACA GCCGTGACGT GACATCGCTA GCAGCCGCTG 3120
ACACCGGAAG CTGTTGACAC GGGATGCCGC TGGCACCGGA AGCTGCTTGG TAGCATCTCC 3180
AAGCTTGCTT TACATAAGCT CTCAGAATGG CTGGGGAATC CAGCTCTCAC CTGCTCCCCA 3240
CTTTATGGAT GAGAACCTTG GACTCTTCAA GTTGACCATA CCTGCCTTTT GACTAGAGTG 3300
GAGGCCAGGG AAGTTTCTCA TGCTTCCTGC TTGGAGGGGG CGGGGGCGGG CGGGGGTGGG 3360
GGCGGGGGCG GGTGGGGGCA AGCCCCAGCT GTTGTTGAGG TGAGGCATGG TGACTCTTCC 3420
TGGAGGAGGC TGAGGCTGGT CAGGACTTGG GTGGGGCTGA GCAGGCTGCT GGGAAGCCGC 3480
TTCCTTCCGG ACCCTTCCTG TTTCCTTTTC CTCACTGCTC AGCCAAGCGA TTGTCTTGCT 3540