EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-11431 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr19:9063910-9067010 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF4MA0039.3chr19:9065430-9065441GCAGGGTGTGG-6.62
Klf1MA0493.1chr19:9065432-9065443AGGGTGTGGCC-6.32
MAXMA0058.3chr19:9066667-9066677ACCACGTGCT+6.02
RREB1MA0073.1chr19:9064728-9064748CCCCACCCCACCCCACTCCC+6.86
Number of super-enhancer constituents: 17             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_01383chr19:8994548-9073615Th_Cells
mSE_02641chr19:9054909-9074458HFSCs
mSE_03059chr19:9054745-9074150TACs
mSE_05150chr19:9061661-9064852E14.5_Heart
mSE_05150chr19:9064861-9068304E14.5_Heart
mSE_05857chr19:9062074-9064637E14.5_Limb
mSE_05857chr19:9064834-9065588E14.5_Limb
mSE_06812chr19:9061840-9068684Heart
mSE_07393chr19:9062646-9064635Intestine
mSE_07393chr19:9064685-9068396Intestine
mSE_09164chr19:9062081-9068452Lung
mSE_09412chr19:9061611-9064856MEF
mSE_09412chr19:9064869-9073830MEF
mSE_10675chr19:9062829-9064508Embryonic_stem_cells
mSE_10675chr19:9064700-9068064Embryonic_stem_cells
mSE_11286chr19:9062080-9064814Placenta
mSE_11286chr19:9064828-9068382Placenta
Enhancer Sequence
AGCCCGCAGG TAGGGAAGCG GAGCGCTGGG CGGTAAGGTG TGGGGCCAGG GTTCGGGCGA 60
CCAGGGGAGA GAGGGACTCG GACAAGGTGC ATTTGCGGTA GTGTCACTAC GAGGGTTCCG 120
ACTGTTGGGA GCAAACCTGG CCGCTTGCGG CCGCCGGGGC AGGCGACGCG TCACGCTTCG 180
GGAGTAAAGC TCTTTCTCCG GAGTTGGGGC CAAGTTTAAC TAAGTTAGAA AATCGCTTCG 240
AAGTGTGCTT TGCTGCGCTT TTAGTTTTTT CCCGCGGATG TATTGTCGTT CCAACTGCAG 300
TGCAGGGCGT TCCTGATCTG GTGGTCCCTG ACCGATTCCA TCTCTTTGGG GCGGCGGCTC 360
AGAGCGCTAC TTGGTTCCTA TACCATGTTT ACTGGAGAAG TTTCCAAGAG CCCCATCGCC 420
CCTCCCGCGC CCCTGCACCG CGTGCCCCCT CTGCTGTCTT TCGCGGCTCC CCACACCTCC 480
ATCTCGAACT TCGCGTCCGG ATTCCCCTCG GCCCCACCCT GCTCTGTACC ACCAGCCTCT 540
CCCTTTCTGG CTCCTAGCGG CGACTTTAAC AGCTCCCCTT CAACTGCCCC GCCCTAGTCT 600
TGCCCCTCTG TGTTTCCAGA TCCAGAAAAC TCCCTTCTTT CTCCAGGGCG TCGGAGCCTG 660
GAAGTTTGCA GCGTGCCTCC CTGTGGGATG GGTGGGAGTG GGAGGGGGGG TGGGGGACAT 720
AATTAGGGAG ATTCCTGCGC TGGGTGGGCG GGGAGGGGGC TGTGCAATCG ACACAGTCCC 780
CAGAACCTCC CTTGCTCCTT CTAGGGGCGG TGCTTTCTCC CCACCCCACC CCACTCCCAA 840
ACTCGTCCGG GCGGGATGGC CCCCGCCCCA GCGCCTGGCT GGATTCCAGC AGCCTGAGGA 900
ATGTAGTGGT TGGAGCCGGT GACTAATTCA AACCAGAATT CGGGGGTGGG GGTGGGGGTG 960
AGGGGCAAAG CGGAGGGGGA AAGAGGCCGT GTGTAGGCGG TGGGGGCCGG AGCGCAGGGC 1020
GTAGGTGAAG GACTTCCCTG CTCTCCTTTG GAACCCTTCA CTTTTGCAGT GCGCGCCAGC 1080
GGAGAGGGCG GGGGGCAAGA TCCTACTGTG GGGTTGGAAA GGCAACATGC TTAGGGTGTG 1140
TGCAGAGAGC TGTGTTATGT AAGGCTTTCC CATGCAGGGA GGGGATGTGC AGTGTGCGGG 1200
AGCCTGGGCC TCCTCTGGCT GGAGCCCCTT TCAGTGCCGA GGCAGATTTG GGGGACGCAG 1260
AACCTTGGTG GCGTTGGGTT GACATCAGGG CTAGCTGTAC ATGGCGATGA GCACTGAAGA 1320
CTCTTGGGGT GACCCGGGGA TATCCTACAA GTCAAATGGA GTGGAGCCTT GACAACGTAG 1380
TGTCCCTGGT ATGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGCTTGC 1440
CTGCTCACTC TATTGTCACT TCTGCACAAT GTGACCACAG AAGATTGTGC GCATGATGTC 1500
TGGGTTGGCA CCCTGGTTTG GCAGGGTGTG GCCCTAGGCT GTCTCTGAGG ACACACGTGT 1560
CCAGGGGTAC TTGTCTCAAT GTCCCTGTTC TGTGGAGGGG ATTTGCAGAA AAGCTTCTGG 1620
AGGTAGTTGG GGGGATGGGG GTGGGGGATC CTTGGAAAGT GACCTGGAAT TCCCAGGAGA 1680
AAAAGGACTC CCAACAAATG GTTTTGAAAC AGTTTGCCCT TAAACTTTAG CAATGGCAGG 1740
AACCATCTTA CTGTACCTAA CGTATACTAG ATGGGATGAA TTCACAAGAT CCAATGATTC 1800
ATGTCCTCAT ATCAATGATA CTGTCCTCAT AGGTGACTGG GAGAGGGGAG GGCACACAGG 1860
AAGATGCTAT GGGCAATGTG GGCAATGTTT AGGGCCTCTC CCCACACTGA GAATGGCTTA 1920
GGTGAGTAGA ACTGTTTTGG TCCTGCCCTA TTAGGGAAGT CTCTGGGGGT AGGGTGGGTC 1980
TCTTTTCCTT TTCCCAAGCT GAATGAACTA GTAGCTTCCT TTTCTTGAAA AACTATGGGG 2040
GTGTGGGGGA GGGCAGGCCT GTATCTGGTC TGTAGAGTGT GCAGATTGTG CAGTAGAAGG 2100
GAACCCCTCA TTTAAGGGCC ACTTCCTCGG CCTGAGCTGA GTTATGGGGC AAGGGGAGTG 2160
TGGGAAAGGA ACTGGGAACA AGGGAGCTGA TCTAGTAAAG GACTGGAGGG GGGCGTAGGG 2220
ATGACATCTG GAAGATGTCT GAACTCCTTT CTAAAGCTCT TGTCCCTAAG AGATTATGCA 2280
AAGGGACATT GTGAAGAGAA CCAGGACATT CAGAGAGACA GGCACGTGAG TCATCCAAGA 2340
CTTAGTGCTA ATGGTTTGGA AGTCAGCAGT GATACCCTGA GGGTCTTGGC CTAGCACTCC 2400
ACAGCTCCAA GTCCAGAAAA GGACAAGAGA GAGAAAGAGT AGACCGGGGA GCTCACTTCA 2460
GGCCTAGAGA GGCTCTGCTT AGAGGTTCAG AGCCCTACAG GCCTTACGCT CCACTTGGAA 2520
CTGTCTGTCG GGTTCTGGCA GAGCACACCA CTCTGAGCCT GAGGAGCTGG TTTGAGGGGT 2580
TGGGGTAAAG CTGTGGGAGT GGAGGATGTG TTGGGCACTG GGGTGTGGTC ACTACCTTTT 2640
TCAGAACTTG GGAACTGCCT GGAGACAGAC AAGAGAAGCA AACTGGGAGA GCTAGTCCGA 2700
CTTCTGAAGG GATCTTTGCC TGGACACCCC CAAGTTTCTC TCCTTGGGGC TGGGCTGACC 2760
ACGTGCTTAT ATTCACTTGG GTTAGAGGAA GGGAGGTGGC TGCCAATTTA GAATGTGCAA 2820
TACACCTGGG CCCCTTCAGG CTTCAGCCAG GGCTCCCAGG AACTTGCAAT TCCTTGAGTT 2880
GACCATTGGA TCATCTGGCC GGCTTCCAAA GCCTTCTTGA TCATAGTATC GTCCATGTCT 2940
GAGTGTGTCC AAAAAGTGTC CGAACGGGGG TTGTTGTGGC AATGTTTCTG CGGAAATGTC 3000
TGTGTACTTT GACGAAGCTC CCCCTTTCTC TTTCCTAGCC CCAGTTTCCG TTGGTGCTAA 3060
AGCTCAAATA ATTGGTCTTG GGCCCGTCAC TGTTTGCATT 3100