EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-11290 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr19:5387210-5388310 
Target genes
Number: 35             
NameEnsembl ID
B3gnt1ENSMUSG00000047379
Brms1ENSMUSG00000080268
Cd248ENSMUSG00000056481
Tmem151aENSMUSG00000061451
Cnih2ENSMUSG00000024873
Rab1bENSMUSG00000024870
Pacs1ENSMUSG00000024855
Sf3b2ENSMUSG00000024853
Gal3st3ENSMUSG00000047658
Cst6ENSMUSG00000024846
Banf1ENSMUSG00000024844
Eif1adENSMUSG00000024841
Sart1ENSMUSG00000039148
4930481A15RikENSMUSG00000086938
Gm6293ENSMUSG00000051133
Drap1ENSMUSG00000024914
AI837181ENSMUSG00000047423
Fosl1ENSMUSG00000024912
FibpENSMUSG00000024911
CtswENSMUSG00000024910
Efemp2ENSMUSG00000024909
Mus81ENSMUSG00000024906
Snx32ENSMUSG00000056185
Gm962ENSMUSG00000049562
Rnaseh2cENSMUSG00000024925
Kat5ENSMUSG00000024926
RelaENSMUSG00000024927
Pcnxl3ENSMUSG00000054874
Ehbp1l1ENSMUSG00000024937
Fam89bENSMUSG00000024939
Sssca1ENSMUSG00000079478
Scyl1ENSMUSG00000024941
Dpf2ENSMUSG00000024826
Pola2ENSMUSG00000024833
Sac3d1ENSMUSG00000024790
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
KLF16MA0741.1chr19:5388288-5388299GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr19:5388288-5388298GCCCCGCCCC+6.02
NFYAMA0060.3chr19:5387754-5387765GGCCAATCAGA+6.02
Number of super-enhancer constituents: 1             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_12324chr19:5388095-5391637Spleen
Enhancer Sequence
GATAAGAGCA CTTGCTGTTC TTACAGAGGA CCCAAATTTG GTTCTCAGAA TCCATATGGC 60
AACTCACAGC CATCTAATTC AGTTCCAGGG GATCCGATGC CTTCTTCTGA CCTCTGCTGG 120
CACGGGCACA TGAGGGTAAA ATACTCAAAT GCATTAACAT AAAAACAATC CTTTGTTTAA 180
AAGATTAATG TCCTGTGGTG GATCACACTT CAGCAATGCT CTCTTTGCAT AGATCCTATG 240
GGCAGACTGT GGGTTCCTGC CACTGGCTAC TATTTATGCT CCTCAACATG TTCCTCTGCC 300
CACAACTGAA CTACTGGAAT TTAGCAGGTT CTATGCCTGA CTCTCGTTCT CATTCCACAT 360
GTTCTAAGGC ACTTCTTTGG TTTCCTGAAT ACACACCAGC CCAAAGTCAC TCTATCTCAC 420
TTAAACTGTA AGGTTTCCCA TATACACCAA ACATAAAGTT CTCCCAAAAC TGTGTCATTC 480
TCCCCTGCCT CAAATCTGCT TCTCTTCTAA ACTCAGTTCC AACAGATGAC ACCTCCATTC 540
ACCAGGCCAA TCAGACCGAA TTCCTATTCA ATCTGTCCAC TTCTCTCCGG CCCGCTGCAT 600
AGAGAAACAT GCATACTATT AGCCCTCACC TGGTTGCTTG GACCTCCCTC CCGATCTCTT 660
GATCTCTGGT CCTACGTTTG ACAAGCTCTC AACCCACTGA TCTTCATAAA ATATCATGCA 720
ATTCAAGTCA CTTGCTTACT CAAATCCTTG GCTCCCTACC ATCCTCATAA CAAAGCCCAA 780
ACTTCTCAAC AGGGCTTACA GCGCTGGTTC AGACCCAAGC CTATCTTACT GCTTCATGTC 840
TCCGCTATGA GCTATTGGTC GATTGTCTGT ACACGCTCGT CCCACCTCAT TCACCCACCC 900
AATGCATTGC TGTGAAGTGC CAGGAAGACA GGGAAGGCAG GAAGACTCCT GTCTTCTTAA 960
AGCTTAACGT GGAGACGTCA ACGTTTAACC CCAAACACCC GGAGGACGTC TTTAACCCGA 1020
GAGGCAGATG GCCCTCGAGG TCCTCCCGTA CCCTCCGTCC TGGGCATCCC AAGACCCTGC 1080
CCCGCCCCCG GGCCCCGCCC 1100