EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-11205 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr18:84237780-84240960 
Target genes
Number: 2             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxo1MA0480.1chr18:84238692-84238703TGTAAACAGGA-6.62
HNF1AMA0046.2chr18:84240378-84240393AGTCAATTATTAATC-6.25
HNF1BMA0153.2chr18:84240379-84240392GTCAATTATTAAT+6.08
HSF1MA0486.2chr18:84240540-84240553GAAAGTTCTAGAA-7.04
HSF2MA0770.1chr18:84240540-84240553GAAAGTTCTAGAA-7.04
HSF4MA0771.1chr18:84239170-84239183TTCTGGAAAGTTC+6.07
HSF4MA0771.1chr18:84240540-84240553GAAAGTTCTAGAA-6.98
KLF13MA0657.1chr18:84239769-84239787AACACAGGGGCGTGGCCG-6
Nr5a2MA0505.1chr18:84240881-84240896GCTAGCCTTGAACTC-6.13
PKNOX1MA0782.1chr18:84240103-84240115TGACACATGTCA-6.62
PKNOX2MA0783.1chr18:84240103-84240115TGACACATGTCA-6.74
RARAMA0729.1chr18:84238444-84238462CATTTACCTTCTGACCTA-6.04
SP2MA0516.2chr18:84240796-84240813TGGGGGGCGGGGGTAGG-6.12
TGIF1MA0796.1chr18:84240103-84240115TGACACATGTCA-6.52
TGIF2MA0797.1chr18:84240103-84240115TGACACATGTCA-6.52
ZNF740MA0753.2chr18:84239485-84239498GTGGGGGGGGGGA-6.3
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_09639chr18:84238063-84240422MEF
mSE_10694chr18:84237649-84240476Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
GCCACGCTTG CTGGGAGCTT TGCTGACCAG GGCTGTTCAG AATTCAGCAG TATGCCCCAC 60
ACTGGCTTTA AAAGTTCCTC TGTTCACTAT AAACTCCTGA GATGGAATAA AAACAAAGCG 120
TTGAGCTTGG GAAGCCAAGA AGCCACGGCC GAAGTAGCCA ACACATCCAC CCAGGCATTA 180
GATGCTGCTC ATCAGAAATG AGGTGGCCAC CTTGCTGCTG ATGTGCATAC TCAGGTGTGA 240
ATTCCTAAAT GCACACCTCA GGGAAAAGGA ATAAATCTTC TAACTAGGAA TGTCCAGCCT 300
TTTGACAGGG CAACATGACA CCGCCATCTA CAGAATCTAT CCTCATGGCC GGGGCAACAG 360
AATTACAAAA CAATGCAAGT CTCAATGTCT TAAGTAAGCT TATGATGTTG TGCTAGCCTG 420
CATCCATAAC TATTCTCCCA CATGAGACCC ACAGGCCATG GGTTAGGTAT CCCTGCATCC 480
AGCAAAGCAG TACCACCCTG CCATTTCCCA AAAGGAAGGT TAAGAGGGCC AGGGGAACTT 540
TGACCTGTCT GTGGAAGCTT AGATCCTATG CATCAAGCTT CCTGGGAGCT TGTAGCTAAA 600
CAAGTGTTGG GACATGTTTG AGCCCTTATA GATAGCCATA CATCTTCCTT GATATTCTAG 660
GTGCCATTTA CCTTCTGACC TAGAGGCTCC CGGCTAACAC CATCTTCACT GTCCCCAGAC 720
ACGAGCATGC TCTCATTTGC CCCTGTACTT CAAGCATCAT GTAATCTTAC GAGGTTGGAG 780
AAGGTCAGAG GGAGAGCAGC CTTCTGTTCA CACTGCATGG CTATGGGCCC TTATGCCTCT 840
CAGCCTTTTG CAGTATTTCT GCCTGGTTCT GAGCAGCCTT GGCCTTTGAG ATGGGAAGGA 900
AGAGCCGGAC TTTGTAAACA GGACAATCTG GAATGCTGTC CCTTTAAGAC TGAAATGCTT 960
GTTTCCTTCC AGTAAGAGAA GTAAATCATA CTACAGAGAG TTGAGCTTTG AAAAAAGCAT 1020
CCATCCATTA AAGTTCACAG ATCCCAGTTC TCAGGTTGTC CCTCCCCTGG CTGTGTCTCA 1080
AGTTACAGCC TTGTACAACC CAAGTCTAAA TAATATTCAC CATGATAAAT GACACCATAA 1140
CTCCGATATC CACAATCAAT CTTTGCTTTA AAGATACATC CATCTTCAAT AATGTTGATG 1200
GGGATTCTGT AAAATGGGAA ACGTGACTGT CTCCCGGCCC CTCCTGACGG AGGGGGAGGG 1260
AGGCCCTGAG TGATGGCTGT CAGCCCACAT CTGGCTGCAA AAATAAATTA GCCTTATGTA 1320
GACAAATGAA AGGGCCAGCT CAGCCTAGGA AGCAGCCATT CCTGAGCACT GGCTAATTTA 1380
TAGGACATCT TTCTGGAAAG TTCCTGGCTG AGGCAACGGT CTCCCTGTCA TCTCTTTAAA 1440
CATTATCTGA TGCTGCAAAT GACCGCCATG GGGAAGGACT GCACACAGTC CAGGGGCAGG 1500
AGGAAGAAAA CCGCCCACAT GCTCAGTCCA ACTCAAAGGC AAAACTCCCC TCTTCTCGGG 1560
AAAGGAAAAT CTTTATTTTA GGCAAATACT TTTTAGATTT CCAACGCCAA TTCACCCCTG 1620
GCTAGTTTGT TGTTGTATTT TCACTTCTTT GGTGGTCTTA GGAAACCCAG ATAAAGTAAA 1680
TAATTTGAGA GTAAAGATGG ATTTGGTGGG GGGGGGGACG ACAAGGAGTC CTCAAAACTC 1740
CTTCTGAGTA TGTTTTATAT GGAAAGACCA CTGTCTTGCA GGCAGGAAGC AGACTACACA 1800
TGCTAAGCAA GCATGAGAAA GAGATATATC CAGTTTTAAG AAATAGTTTC AAAACCAGCC 1860
TAGGGTGAAC ACTTCTAGGA AAGCTCTAAA ATAACCAAGA CCCAACTGCT CCCCAACCAG 1920
AGGGCAGCCA CTCTGTCAGG CTCTTCCCGC CTCTAACCTT GGCCACTCAA GGGACACTTG 1980
GGGCCTGTTA ACACAGGGGC GTGGCCGTGC GCAGGCACAC ACTCCCAGCA GGGAAATGGG 2040
GGGCTCCATG GGGTGTGCCG CAGAGTGATA CAGGACATCT GTTCCCAGGC TGGGAACAAT 2100
CACGGGTTTG GGCCCCAGAG TCTCCTGGGC AGCAGACACA GCCTGCATGG TCCTGGCTGG 2160
GGAGGGTTAA CTCTGAGAGA TGAAGGACTT ACAGTAAGGC TGGGAGACAT AACACACAGG 2220
CTTCCTGGCA AGGGCTCCTG GAGGGTAGGA GGGGACTGCA AAATGAACTC TCTCAGGCTT 2280
TGTGGCCGCC TTTCCCAAGG CCCAGCCTGG CCCCTTTGAT AAATGACACA TGTCATTCTG 2340
TCAGAGCTGA CAGTGCAGCT GGGAGAGCCA CTGATGCATG GCTCCTCTAA AAGGGAAATC 2400
AACTTTTTGG CACCGAGTGA GTCTGTGCCC TGTGTAAGGA TTTTGTTTCT CGAAAAGTAA 2460
AAGATAGACT TGGGATTGGC TGCGCTTGGG GGGTGGGGGT GGGGGCTGAA AAACAGATTG 2520
AACGACAGCT TACGTTTAAC ATGAATTAAC TGGGGTAACG GCGAAATGTG CTAGCCTGCG 2580
ATAAATAAAA GCTACATTAG TCAATTATTA ATCACACTCT AACTTGTAGC CAGAACCCCG 2640
GACTTAAATC TGAGGCCTGA GCTGACTTAT AAACAGATAA GATGGTGTTT GATAGATGTC 2700
TACCAGAGAG TCATCACAAT GGAGTCAGAG GTTCAGTGGA CTCACCACTG GGAACACATG 2760
GAAAGTTCTA GAAACAAGGA GGGTTGAGCA GGGCAAAAGA GACCCGTTCC ATGCAGACAC 2820
AATACCTGCT GATTGTATAA GGAAAAGTAT GCCGGAAAGC AACTTCTGAA TGCTTTTCCC 2880
CTTGGGACCC ATTATATTTT TCTCAATATT CAAGATATTT ACACATTGCC AATTTGTGTT 2940
CCTGTCTGCA GGTAAGACGT TTTGTCTTGA AAAATCTTGT TGCTGGTTTT GAATATGGAC 3000
CTACTGGGCT ATGACTTGGG GGGCGGGGGT AGGCGAAAAG GTATGGAGAG AGGGTTTCTC 3060
TGTGTAGCCC TGGCTGTCCT GGAACTCACT CTATAGACCA AGCTAGCCTT GAACTCACAG 3120
AGATTTACCT GCCTCTGCCT CCCAAGTGCT GGGAGATGGG ACTTATTTCA AAATTATTTA 3180