EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-10949 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr18:65704160-65705520 
Target genes
Number: 6             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr18:65704163-65704176TAATAATTAATTA-6.18
Lhx3MA0135.1chr18:65704170-65704183TAATTAATTAATA+6.25
Lhx3MA0135.1chr18:65704166-65704179TAATTAATTAATT+6.78
Lhx3MA0135.1chr18:65704167-65704180AATTAATTAATTA-6.78
NR2C2MA0504.1chr18:65704423-65704438TAACCTCTGACCTCT-6.91
Nr2f6MA0677.1chr18:65704423-65704437TAACCTCTGACCTC-6.04
POU6F1MA0628.1chr18:65704168-65704178ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:65704172-65704182ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr18:65704168-65704178ATTAATTAAT-6.02
POU6F1MA0628.1chr18:65704172-65704182ATTAATTAAT-6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr18:65704430-65704447TGACCTCTAAATGTCCT-6.51
RXRGMA0856.1chr18:65704423-65704437TAACCTCTGACCTC-6.04
Rarb(var.2)MA0858.1chr18:65704430-65704447TGACCTCTAAATGTCCT-6.45
Enhancer Sequence
TAATAATAAT TAATTAATTA ATAAGAATTG CAACACTAAG GAGATGTCTC CGTTAATAAA 60
GTATTACCTG CTGCAAAAGC AGGAAGGCCT GAATTTAGAA CCCCAGTGCC CATATAAAAA 120
TGCTGGGCAT GGTGGCACAT ATCTGTGATC CCAGGATCCG TGATGAGGGA GACAGGTGGA 180
TCGCTGAAAT GGTCAGTTCA AGGTTCAGTG AAAGAAACTG GCCTCAAAAA GTAAAAAGAC 240
TGACTGAGGA AGACACTGAG TACTAACCTC TGACCTCTAA ATGTCCTTGT ATATGCATGT 300
GCCCATACAT AACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACGCT AATTCAGAAT 360
TAGCGTGCCT TTCACATGTA AACTTGTAAG TCCCACATCT GCAGCAACAC CTGCCTCTTC 420
TGCAGCTCTC ACACCAAGCG AAAATATCAT CTGCCCTAAG TCATCCAAGG ACCTGGTACC 480
AGTTAGCTAC TGCATCTACA ACCCAGTTCC TGCTGGAATT ATTCAAAGCT GGTTGCCCCT 540
GCCTGCTTTG TACCACTCCT TGAAAACCCC CAATAAAGGC CCTGCCTCCG TGTTCTGTCC 600
CCTTACCCCA GCTAAACAAA ACCTGGAGTA CTTCCTGTGG CCAGGGGTAA CATTGTTACC 660
TGGCATCAGG CATAAAAAAG TTACCCTAAT GGCAAGGGAG GGTCCTTTGC TGGGACTTAG 720
GCCCCTGCTG GAGGACTCCC TGGAGGACTT CCTGGAAGAC CTCACCTCTA GCTGCAAGGA 780
CAGCCCATAT AGATAATGGC AGCTGCTCCC TGGACCAAGG AAATGGCAGA CGTTTGCTGA 840
TCTTTCCGAG TTCATCTAAG TTTGGTAATT GTCTGGTGGT CGTGGGCACA CGTTTGCCTT 900
TTATTTATTT GTTCTCTTTA TTTGTTTGTT TATGTGCTAA TCAAAGGACA AAGCCTAACT 960
ATGGAGCCCA GGCTGATCTC TAATTCACTT CAGTCCACTG CCCTAGCCTC ATAAAAGCTG 1020
AAATTACAAG CATCTGCCTC TGTGCCTGGT GTTTGTGTGC ATGCATTCCT GCCTTGAGGT 1080
TCAGGGGCTA AGGGCGGTGA CTCAGCTCAG GAACTGGTGA GCGGCTCCTT TTGTGGATGC 1140
CATCATCTTT CACAGCCATC CTGACCTATG CTTGTTTAGA GCCTTAATGA TAAGGCAGAG 1200
GGACAGAATG GGGTTCACAT ACCAGGGCCA GTGGACAACG GTCAAGTTAA TCCTGCGGCA 1260
TGCTGGGCAT AATGGTCCAT ACCTGTTAGT CCCAGCTCAC AGGAAGCTAT GCAGGAGCAT 1320
CACTCCTCCA AGTTGCAGGT CAGCCTGAGC TCCGGTGTGA 1360