EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-10684 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr18:38683360-38684720 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CEBPAMA0102.3chr18:38683673-38683684TATTATGCAAT-6.02
ESRRBMA0141.3chr18:38684012-38684023TTTGACCTTGA-6.14
Foxd3MA0041.1chr18:38683393-38683405AAACAAACATAC-6.37
Enhancer Sequence
CAGCCAAGGC TATACAGACA AACCCTGTCT TAAAAACAAA CATACAAAAA GGCCAGGGAC 60
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACGGACTCAG ACTCAGACTC TGACACACAC 120
TTGCCGGAGC AAACCGAATA CGCAGCACAA ATGTTAGGAG GCCTGTAAAC CCTTGCTAGG 180
ATGTGAAGTG ATCTGCTTGG GAGTGGCTCC TACAGGGTTA ATCAAACCTG TCTCAGGAAA 240
AGCAAGCAGA GCTGCTGATG GAGTGGCGAG GGATGTGAGG CAGGCTGTTT ATGTTTTAGG 300
GATGCAGTAC TTCTATTATG CAATCACCTT GTTTATGTCA CTGCTAATTG AAGTAAATTG 360
CTTTCTGCAA TCAAATTGGG AAGTTCTTCC TTCCGATCAT GCAAAGACTT GGACTCCAGT 420
ACCTAGTTTC CAGTATTTAG TCTGACTTGA GTCTTGCCCT TTAATTAATT GCGTACATTC 480
CATCAGTTTC TTTAAACGTG CAGTTGGTTT GTTGTTGAGT AGTCAGTGTG CTGGGCTGAT 540
TCTGAGATTC CCCTCCAGGG TAGGAAGTGT TCCCGCTCCT CTTCCTTCAC CCCAGCCAGA 600
TCAGGATGAT GATGGGGGGA GGGGCGGGTG CAGATCCTGG AGGATGCTGG GCTTTGACCT 660
TGAGGGCAAA TGTGAGAGGT AAATGTAGCT GAACTGGATT CCTCTTGGTG TTCTTGCCTA 720
GTACAAAGGG CTGTTGGTTT TCCTGGACCA CATGTTGGGG TCCTTTGTCA CTTCCTGTGC 780
CTCTACTTTT GTAAGCTAAA CAGGGAAAGG GGAGCCAGGC AGATAGAGAG CCGGAGAGTC 840
AGAACTACAT AGATACAAAT GAGCCTCCTA GTTCTCTGAT GTGCCGCCAC TACACACACA 900
GACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CATCACTTTT TGTCACGTTC 960
AGAGAGAGGC CTGGCCAGAG TCACAGCCAG AGCAGAGGAC GCATCATTTA TCAGAAGATG 1020
ACAAGTGTCC TGGACAACTC TGGGGTGGGA GGAAGGGACT GAGGAGTAGC AAGAAGATTC 1080
TCACCGCCTG CTCCCAGTTT TTGTCATGGG CAGATAAGAG GGAAGTGTCT GATGGTGGAC 1140
CTAGCTGTTA GCTTGGTTAC TTTAGAAGGT CTCTCAACTT TTCCCAGGAA CAAAACCAAA 1200
ACAATAGGTT AAAAAATATC CCCTGTCATT CATTCTTGCC TCCTAAAAGA AGATAAAGAG 1260
AATTATCTAT GAGGCTGTGT CGCATGTCAC ACCTTAAGCT AGACTTAGTA TATTGTCATG 1320
GACTTAACCC TGTGCCCTGC AGAGGACACT CTTTAAAGCT 1360