EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-10659 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr18:37993010-37997280 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 24             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr18:37995416-37995429CTTAAATAAACAT+6.14
Foxd3MA0041.1chr18:37997000-37997012AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:37997004-37997016AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:37997008-37997020AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:37997012-37997024AAACAAACAAAC-6.32
Foxd3MA0041.1chr18:37997016-37997028AAACAAACAAAC-6.32
KLF4MA0039.3chr18:37993212-37993223AGAGGGTGTGG-6.02
MLXMA0663.1chr18:37993188-37993198ATCACGTGAT+6.02
MLXMA0663.1chr18:37993188-37993198ATCACGTGAT-6.02
MLXIPLMA0664.1chr18:37993188-37993198ATCACGTGAT+6.02
MLXIPLMA0664.1chr18:37993188-37993198ATCACGTGAT-6.02
Myod1MA0499.1chr18:37996200-37996213GGCAGCTGTTCCC+6.24
Nr5a2MA0505.1chr18:37993866-37993881GCTGTCCTTGAACTC-7.06
PHOX2AMA0713.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA-6.62
PRDM1MA0508.2chr18:37995316-37995326TCACTTTCAC+6.02
PROP1MA0715.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr18:37994086-37994097TAATTAAATTA-6.62
STAT3MA0144.2chr18:37995156-37995167CTTCCCAGAAG-6.14
TBR1MA0802.1chr18:37995320-37995330TTTCACACCT-6.02
TBX20MA0689.1chr18:37995320-37995331TTTCACACCTA-6.14
TBX2MA0688.1chr18:37995320-37995331TTTCACACCTA-6.32
ZNF740MA0753.2chr18:37995996-37996009CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr18:37995997-37996010CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 6             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04059chr18:37994789-37996075Cortex
mSE_04454chr18:37994825-37996113E14.5_Brain
mSE_04922chr18:37994544-37996145E14.5_Heart
mSE_05544chr18:37994499-37996840E14.5_Limb
mSE_09499chr18:37994107-37997052MEF
mSE_10743chr18:37994532-37996143Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
AGTGTTTCCC ATGGGTGTGA TAGGGTGGGG ATCTGAGGGA GGGGTGTTGC CAGCATAGCT 60
ATGGATGAAG TATAAGTCTG TGTGGCTTCT CTGGAAGACC AGATGATCTT TAGTGACATA 120
GCTCCAGGTT GAGGGATAGC AAAGGGGTCA AGAGGCCCTA AAATGCCCAA GCAGAGTGAT 180
CACGTGATCC ACTGAGGCTG TGAGAGGGTG TGGGGGTTGC AAATCTCACT GTGAGCTGGG 240
TATGGAGGCA CATATCTGTA ACCTCGGTAT TCCCTCTGCC AAGGCAGGAG GATTTCCACG 300
AGTTTGAAAT CAGTCTGGGT TACAAAGTAA GACCCTGTCT CAAAAAGACC AAAACAAACC 360
AGTCTGACTC TGGAAAGTGC CAGCGCAGGT CACGTACACC ACAGCTCTGC CACTTGTTGA 420
CCCTGGGACA TGGAGCAGTT TGTTTGTTCT CTTTAAAGTT CAGCTTCCTC CACCAAGAAA 480
ATGGTAGGAT GGCTCTACCA GGTTACAGTG AGAACTGAAG AAAGGGCACA GAGTGTGGTA 540
CTGGGCCTGG CACATTCGAG ATCCTGTTAG CGGATGCTCC CAACAGAGTA TAACATGGCC 600
ATTCATTTCT GCTCCCCGGC CTCCACCCCA GGACCAGTGC AGTTTCCCCA CTAAGCTTAG 660
AAAGAACCTC TGTCACAGCT GTACCATCAA CCCTGCCAGT GGTTTAGGTG AGAAGTCACC 720
GAGGTTGCTC TGCGGGGCAA ACAGATTCAG CTCCCTAACA TGCGAGAGCA TAGGCTTTGA 780
AAGCAGGCCA GTCTGGGGGC ATAGCCTTGG GGGCATAGCC TTGGCTGTCT GGGAACCCAC 840
TCCATATATG GACCAGGCTG TCCTTGAACT CAAGAGATCT ACCTGCCTCT GCCTCTGCCT 900
CCTGAGTGCT GAGGTCATAG TTGTGTGATA CTCTTGCTTT ATAAGGTGCC GGAGAGCAAG 960
CCCCAGGGCT TTGTGCACGC TGGGCAAGCA CACCCCCCCC CAGAACCAGA ATCTAACTTG 1020
TAGTACCCCC ATGAAGGAGC CTCAGTGAAA CACATTCCCT TGTATTCTAA TCCAAATAAT 1080
TAAATTAAAA TAGAATAAAT TGTAAGAAAG AGAATCTTAA AACCTGTTGA TAAGGACTAA 1140
CTTCTGGCCC AGGAGACTGG AGTCTATGGG AAACTTACAG AAGATTAAGC CCTGCTGGGC 1200
CTCAGGCATG AATGCACGCT TTCTTCTTGA GTATAGCTGG GGGACTGGTA GGTAGAAAGC 1260
CAAGCTAGGA AAAGCATCCC TACCTACTAT CAAGTAGGAT GTGTGCCAAC CAAACTTTAG 1320
GGCTTTGTTT AACCAGTCAT CTCTAAGTTC TGATCATGCT TGGTAGAAAG GGGCCGTGAA 1380
ATCCCACTGA CCTGGAGCTG TGTCCCAGGG CCATGTACCT TCATCGTCCA CAGTCACCTT 1440
TAGATCTAGT CTTGTTTCCC TCTTGGACCT AGAGGCTAAA TTCCTCCGAG TGCCCCCTGC 1500
ATTGTTCTCC CTGATTCGAG TTGCCTGATA AAATCTAGGG TTCCCAGTTG AATATAAATC 1560
TCAGATGAAT ATATGCTTTT TGTTTGTTTT CGAGACAGGG TTTCTCTTGG TAGTCCTGGC 1620
TGTCCTAGAA CTCACTCTGA CCAGGCTGGC CTTAACGTCA GTGATTCACC GACCTCTGCC 1680
TCCTGAATCC TGGGATTAAA GTTGTGCCCC ACCACTGCTT GGTTATATTG GCTATATACC 1740
GTTTTAGTAT AAATCCTTCT TAAACTGTTT ACATGAGGCC AACTATGTAA AAAAGAAAAT 1800
TTCCAAAATT CAGAGATAGC TGAAAACCAT GTATTTTCAC TTACTATGAT TTAGTAATCT 1860
CACCCTTGAT GTCTGAGAGA CTGGATGAGC CTGGCTTATG GCTGACCAAA GGGTAGAGGA 1920
AGGGGACAGA TGATAGGAGC TCTCAACTTC TGGGGGCCAG GGCTGAGATC CCTGAGAGGC 1980
CAGCTGTACA CACTGGGCCT GGGGAGATGC CAGGTTCAGC TCTTGAGGGA AGTAAACAGG 2040
TCTCTTTAGC TGTCATGGCC TTGAGCCCTA AGGCCAGAAG GCAGCCTTTT CAGCCCAAAT 2100
CGAAATGCTA AAAACAGACA TGGAAACAGT ATTTATGGCC CAAAACCTTC CCAGAAGGTC 2160
TCTCTGGAGT AGGGCCATGG CCGCGTGCAT GCTCCCCTGT CAGGGCTCCA CCCCTCCAGC 2220
CCACACAGGA CCTGACCCAA GGCCCCGGCC TTGGGCTCTG TGGGGAATAG ACTCCAGGAC 2280
TGAGGTGGCA GGGTCAGGCC GGGCTCTCAC TTTCACACCT ACTTCCAAAC CCCAGAGCTT 2340
GAGAGACTCT GGAGCCCAGC CCAGCCAGCC TAGAGTGGAG AGAAGGGAGG GACCCCTGAG 2400
AGAGTGCTTA AATAAACATG TGGGGGAGGG GCACCCAAAA GAAGGCTGCG GTTTGCAGCT 2460
GTGCCAGTTT TGGGCTCACT TCCTTGGCTA ACTCTGGTTA TTGTTATTGT GGGGTCTTTG 2520
TCTGCCTTGG ACTGGCAAGA TTAAAAGGAC CAGGGGAAGG TGGTAATGCG TTTGGAGCTG 2580
GAGGGAGGCC AGTACCCTTC CTCTACTGGA AAAGATCCCA TCTCTTTGCA TTTCTAAGTG 2640
TGTTTTCTTC TGAGACAGGA GCCACCCCTG GTCCTTGTCT AGGCCAAGTC TTGGGGGTTA 2700
GAATATAACC AGAAAGGCCT CTGGAGTCTC TGAACTGACA GGGCAGGAGT CCAGGGTCCT 2760
TTCTGCATCT TCAGTGTCTC TCCCTCCTGA TCTCCTCACG TTCTCTCCCA CCAAGTGGCC 2820
ATTTTGAAGG ATTCTCAGAG ATCTCCAGTG TATGCAGCAT GTGGGTCGGC CTGCTTTGTT 2880
GTCATTCAAT GAAGCACTTC CTGCCTTTTT GCTCATAGTA CTTTCTCAGT TCTTCCACAT 2940
TCCTTCCTAA TTGAGTGCTT AGGGGGCGGG CAGACGAAGC TCTATACCCC CCCCCCCCCC 3000
AACACACACC TATCTTCTCT ATCCCCTAAA TCACTTTGGA ATCCTGGCTC TTTGAAACTA 3060
GATCTGGGCC CTTCCCCCTT CCATTGGAGG AGGCTGTCGG TTTGAGGGGA AGGGTGACTG 3120
AGCTTAGAGG GCTGCTACCT CCTGGAGTTA ATTAAGGAAA TGTCAGCCAA TGAAAGGGGT 3180
GGGAGGGGTG GGCAGCTGTT CCCTCCTACC AGGCCTGTTC CCAGAAGGCC TTCAGCTCCA 3240
GGACCTTAGG GACTGGATGT AGTGGGTTGT GAAAACCCAG ACTCCACATT GCCAAGGTGG 3300
AGAAACCCTG GCACATCTCT TGCTTTCCCC TTATACCCAA ACTGGAAATA TTTCCTGTCT 3360
CCATTTCTCA ATCCCTGGTT GATGTCCCAG AATTACTCAA CCTCTCCAGT CTACCTCTCT 3420
GTTAGCTCCA AGGCCAAGGG TGGAGGCACA GGCGAGGGAA AAATGCTCCA GCTTTTGGCT 3480
AGGCTGAGCA AGGCCTTCAA CTCTCTCCGG GTCATAGAGG GTTGCAGAGT CTCCAGCTGG 3540
GAATCTGAGA GCCCAGTGCC CACCTCCCTC CCCGCCACCA GCTCCATTCA GAAGGAATAG 3600
TAGACAGGAT AACGTCACAC TGGATGACGA GGATGGTTAT GAGGGGGAGT GGGGTAGGTA 3660
TTTATTGAGC ACTTGTCAAG TGCCAGGGCA CTGCGTGTCT GTTTTCTTTC ATCCTCACGG 3720
AAGCCCCGAT AGATTATTTC TGTGCTTTGG CTGCGCAGGT AGACTTAGTC ATCTGGGTCT 3780
CATTCTCATG CAGAACCTGC TTTTTAAGCA AGAACACCAC TGTGGCCGGG CGGTGGTGGC 3840
GCACGCCTGT AATCCCAGCG CTTGGGAGGC AGAGGCAGGT GGATTTCTGA GTTCGAGGCC 3900
AGCCTGGTCT GCAGAGTGAG TTCCAGGGCA GCCAGGGCTA CACAGAGAAA CCCTGTCTCG 3960
AAAAACTGAA GGGGAAAAAA AAAGTTAAAA AAACAAACAA ACAAACAAAC AAACAAACAA 4020
AAAAACCACA CACCACCACT CTGAGCTTCT CCAGGAAGTT GGCCTAAGTG GCACAGAGTC 4080
ACCTGCTCCA GGTACTGAGC CCTACCTATG TCGGTGCTGT TCCAAGGACC GTCATTGCCC 4140
AGAGTGAGGG GCAGCCCTCC TTTGCTCCCA GAACAGGAAT AGGTCCAAGT TGGTAGTAGC 4200
AGTAGAGGAA CCTGTTCCCA GCACTCGAGA TAGGGTGTAG GGTGGAGCCC CACTAAAACA 4260
CTTACTGCCT 4270