EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-09564 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr17:25541160-25545110 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 21             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr17:25543389-25543407GAAAGGAAGGATGGACAG+6.04
Myod1MA0499.1chr17:25541809-25541822CGCAGCTGTTACC+6.02
RFX1MA0509.2chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA-6.23
RFX1MA0509.2chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA+6.26
RFX2MA0600.2chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA-6.04
RFX2MA0600.2chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA+6.13
RFX3MA0798.1chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA+6.09
RFX3MA0798.1chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA-6.19
RFX5MA0510.2chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA-6.42
RFX5MA0510.2chr17:25541296-25541312TGTTGCCATGCCAACA+6.45
RREB1MA0073.1chr17:25542287-25542307TGGGGGTGGGGGGTGGGGGT-6.17
RREB1MA0073.1chr17:25542291-25542311GGTGGGGGGTGGGGGTGGGG-6.17
RREB1MA0073.1chr17:25542290-25542310GGGTGGGGGGTGGGGGTGGG-6.27
RREB1MA0073.1chr17:25541785-25541805CGGGGGTGGGGGGTGGGGGG-6.36
RREB1MA0073.1chr17:25543610-25543630CCCCACCCCTCCCCCCACCC+6.57
RREB1MA0073.1chr17:25542283-25542303GGGGTGGGGGTGGGGGGTGG-7.47
SNAI2MA0745.2chr17:25542014-25542024AACAGGTGCA+6.02
ZNF263MA0528.1chr17:25541786-25541807GGGGGTGGGGGGTGGGGGGGA+6.34
ZNF263MA0528.1chr17:25543604-25543625CCCCTCCCCCACCCCTCCCCC-7.11
ZNF740MA0753.2chr17:25542385-25542398GGGGGGGGGGCAG-6.33
ZfxMA0146.2chr17:25542240-25542254TGGGCCTAGGCCTG+6.22
Enhancer Sequence
CAAGCCTTTC TCACAGGTCA GTGCCCAGGG AGCTCTCTGT AGGCATTTGT CCTGGTCTCC 60
CGTCAGGTCT CAGGGGCGGA GCACTCACTC TGCAGGATGT GATGATTGAA GGAGGTTTCT 120
CTTTCTTCCC TGAGGCTGTT GCCATGCCAA CAGGCTGATA ATAAGGTGAG GAGGAACCTG 180
GAGACCCAAT TAGGGCAAAG GCAGAGGGGA TCCCCAGCCC AGCTCCATTT CCAAAGGTTT 240
CCATCAGACC TGGCCCAGCT CGGCTACCCA TTCCTGCATT GTACCACTGG TCTCAAGATG 300
GGGGAATGTA TGTGAATATC CTTTTCAGGT CTGGGATTTG GGAAAGATAG GGATGACAGG 360
AGGGGTCAGG ACAAGGCAGT CAGTCCTGTT GGGGTCATCG GAGTGATCCC ACACAAGAAA 420
CACAGGCATG GGTGGCAGCT TCCTTTCCCC TGTCCCTCCT TGAGGAACTC AGTGTGTCCT 480
ACTCCACCCC CACCCCTCAT TAGACCCCTG TACTTGGGCC AGCTGGTCCG ACCCAGAGCT 540
TTCCAGAAGT GGACCGTTGA GTGTGTGCGC ATTTGTTCCA GCTACCACAG GACCAGCTGT 600
ACCTCCGCCT AGGTCCCTCC TAGGACGGGG GTGGGGGGTG GGGGGGATGC GCAGCTGTTA 660
CCTAAGGTCA CCTGGGTCTC AATCTCTCGG CTCTCCTTCC ATCAGTACAG GAGGCATCCA 720
GAGCTGAGAC AAGTGGTTTG TCGCCAGATG CTCAGGGCTC AGTACTGCCA CAGGCAGTGG 780
CACCACACGC TAGCTCCACC AGGTTCAGGG TTTGTCCCCC CCACCCCCAC CCCCACTTCA 840
GGTAGGCTGG AGGGAACAGG TGCAGGGTAG TTGATGCGAT GCATCCCCTC TGTCCAAAGC 900
TCAGGATCTT GGGGTGGGGG GAATCTTGGC CATGTCCTCC CCTCACCACC TCTCTAACCC 960
GCCCCCTCCG CCCCCCAATG CCTAGTCAAC CTGCTTCCTG CTCTCCATTC CCATTCTTTG 1020
AGACCTTTTT CCTTTATCCC CACCCCCATG GCCAGGCCCA GGGAACATGG CCTGGGAGCC 1080
TGGGCCTAGG CCTGCGTGAC TCACGGCAGG CTGGGCTGAG CTGGGGGTGG GGGTGGGGGG 1140
TGGGGGTGGG GAGTGAGGGC AGCCGACCAA ACATGGAGCT GTTTGTTCTC CAGCTGCCTG 1200
CTCTGCTCAG GGTCACCCAG GGGAAGGGGG GGGGGCAGGC TGTCTGTGGG AGAATACTTC 1260
CTCCTGAGGC CAGGGTGTGG GAGCCACTCC CCACTCTAGC CCCTCAAACG GGGAGGCCAG 1320
GTCACTGGGA ATACTCAGCT CTAGCTGCCA GAACATTCTA TTTCATCCTC ATCCTCCCCC 1380
AACCCTGTGA GGCACTCTGC TTCCCTGTCC CTGATTAACA ACTGCGGTGA GCTGGTCCCC 1440
ATAGCCTGGG TCATGTACGG CAGCACCACC CCCCTAGCTC ATTGCTCTGG CCCTAGATAA 1500
AGTGTGTGCC TGGTCAGCCG CAGGGGCAGG CTCTACAGCG GGGCACCCAG AGCCTGGCTT 1560
GGATACCAGA CGTGTACCCA CGTGTAAACT ACTATCTGAT CCAGTGTACT GTACATGTCT 1620
CAAACACACA CAACAGGGGC ACTTGGAGTG CATTGTAAAC ACACCCTATG AGGTCTTCAA 1680
AGGGGGCAGG ACCCCAGGTC TTCCCAGGCC AAGCCCCCCT ATCCGCAGAG ACTGACATCG 1740
TGGAGCCCCG CTGAATACAT GCCAATGGCT CTAATTGTGC AGTTTTTAAA GCCATGCTAA 1800
TTAGAAAGTG CGCTAATGTC TCTGCTTAGC TCTTAATAAA GAGCTTGATT CGGGATCTTT 1860
TCAAGGGATA ATTGAGTGGA AAAGTGCCTG ATCCCACCCC TCTAGTCCCT GTGCCTGCAG 1920
GAAGGCAGGC TGTGTGGGCG AGAAACCTCA CCCAGACTCT GCCAGCCACT TGGTGGCAGC 1980
ATGCACACCC CGCCCCACCC CCAGAACACC ATGGGGTGCT GCTTGGAAGG GGAGCCCCTG 2040
CTTCTCACAT TTTCCAGACT CTCCCGGTTA GTCCTCACTG AGGACCAATC ATAGTGACAG 2100
CCCCTCCCCA CCAGCTGCTC CACTCAGGAC TACCAGTGTA ATCCCGGGAG GAGGCAAGAG 2160
GGCCTGGCTT GACCTCTGCC CAGTGGGATT CCCCAAGAGC ATCCTGAACA ACCTTCTCCA 2220
GTGGTCCTGG AAAGGAAGGA TGGACAGTAG ACAAAAACTG AGCCAGGTGA CTTACTGGGG 2280
AGGAGGACGG CTGGTCCACA GGATGGGCTC TCAGGGACCT CTCTGCTGGA ATTCTCTGGG 2340
CCAGAAATAA CTGCCTGGGC CTCGCTGCAC AGCTGCCTGA AGCTCAAATT AGTGACCCAA 2400
GGGGATTGGA CACTCCTTCC ATGGGAACAT GGCCTGGTAT TCTTCCCCTC CCCCACCCCT 2460
CCCCCCACCC CCAGGGTCTG GCTCCTTTCT GCAGAACTGT GGTGAGCCCA TCTGGAAGGA 2520
GCCCCCATGT GGCTTCTGTT CTCCATGGCT AGGTAGTATG GATAGGGGCC GGCCTGGGAG 2580
AGCACAGAGC AGGGCCCTTC TGTGGGACCC AGGACTGCCT ACTGTAGTCC TGTGGGATCC 2640
TATGGTGCCT GGGCCTGGAG GCTGGGAAGA AACTCAAGGG AAGGGTCACG GGGTCTCTCT 2700
CTTCACTATG CAGTTTTGCC CCTTTCTGCC TAGGCTGCCC TATCCAGGAT TTGGCCTCCT 2760
TCCTGTATCT CTGCTGCCTT AACCAGCTCC TCATAGTGCC CATTGAGGAT GAAGAAAGTT 2820
ATACTGGGAG GAGTCACTAC CAGTCACATT ATTGCCAGCA AGGCCCCCTG AGTCACGCCT 2880
CTCTCATGTC CCCACTGTAT GCTCATCACA CAGGTTGCCC TCTATCTGTA GACTTTATCT 2940
GTCCCTCAAG AGATGGAAAG GCTGAGTGGA CCAGTGCTCA GGTGCTCAAC TCCTCTGCAG 3000
GCTAGGGGCA GGCAGCAGCC TCTCTGGGTG GGCCTCGGCT CCCCAGTCCA TGTGGCTGGG 3060
CCCCTTCTCT TTTCTACATA CTACTAGAGA CACTACCATC TCCACCTTAG TGAGAAAACC 3120
CAGCCTACAC TTGTGATCTG AGATGTGTGT GTCGACTGCT GCAAACACAA ATTTGTACTG 3180
ACATGGGAGC TGGGATCCCA GGCATACTAG GAAAGGGGAC AGACAGGGCA CCTTGTGGCA 3240
TGATGGCTGG CATCCATGGG AAACCAGGAA CCCTGCTGCA GGCTGTGTTC CAACTGGGTC 3300
CTTGACCCCC ACCCCCAATC CATCTATGCA AAGCCTGGCT ATCCCCACCA CTGTTGCCTG 3360
GCAACCGGGT ATTTATTTAA AAGGGAAACC TCACAGCAAT GCCTACCACC AGCCTGCTCT 3420
CCCAGCCTGG CGCAAACCCC TCTCTAGTTT TTCCGCTCCC ACACCCTCAG AGACATTGCT 3480
CTACCTCTCC CTGAGCCCCA AGTCCATCCT AACCCTACCA TCTACCCCCT GAAGCCCTAG 3540
AAGCACTGGG GGATAGTGGA TAACACTTCA ATAACTGTAC TTTTCTAGCA GGGTGGAGGG 3600
CAGCTGCTAT GGTCACAGAT CCTGCCAGTC TGCCCAGCTC AAAAGCCCTC TGTGCCTGGG 3660
ACTCCCTGGC TACAATGTGT GGGCACCGAT GTATAAGATC CCAGATTTTG GTATGTTAGT 3720
GAGGCAGAGC CTCCTGGAGC TGCTAGGCTA CTGGGAGCTC TGTATAGAGG GAGGCCTTAC 3780
CCCCCTCCCC CCTAGTGGAC AGTATCTAGA ACCTTCGAGT TCCAGGTACT GGTGGTGAGT 3840
TTGGCACCTT CCCTCCCGAG GAACCCTAAA CCTAGTTGGA TGCTGGAAGA CACTGAATCT 3900
ATGCTGTTCG AGGCTGTCCA GCCCCTCCCT CCCTGTCAGG CCCCCTGTCC 3950