EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-09540 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr17:24695120-24696740 
Target genes
Number: 40             
NameEnsembl ID
Atp6v0cENSMUSG00000024121
Ntn3ENSMUSG00000079662
1600002H07RikENSMUSG00000024118
CcnfENSMUSG00000072082
D330041H03RikENSMUSG00000073437
Rnps1ENSMUSG00000034681
Eci1ENSMUSG00000024132
Dnase1l2ENSMUSG00000024136
E4f1ENSMUSG00000024137
PgpENSMUSG00000043445
9930021D14RikENSMUSG00000045744
Mlst8ENSMUSG00000024142
Caskin1ENSMUSG00000033597
Traf7ENSMUSG00000052752
2610019E17RikENSMUSG00000093565
Rab26ENSMUSG00000079657
Pkd1ENSMUSG00000032855
Tsc2ENSMUSG00000002496
Nthl1ENSMUSG00000041429
Slc9a3r2ENSMUSG00000002504
NpwENSMUSG00000071230
Zfp598ENSMUSG00000041130
Syngr3ENSMUSG00000007021
GferENSMUSG00000040888
Noxo1ENSMUSG00000019320
Tbl3ENSMUSG00000040688
Rps2ENSMUSG00000044533
Snora78ENSMUSG00000089255
Snhg9ENSMUSG00000090101
Snora64ENSMUSG00000077709
Ndufb10ENSMUSG00000040048
Sepx1ENSMUSG00000075705
Hs3st6ENSMUSG00000039628
HaghENSMUSG00000024158
Nubp2ENSMUSG00000039183
Spsb3ENSMUSG00000024160
Mrps34ENSMUSG00000038880
Nme3ENSMUSG00000073435
Mapk8ip3ENSMUSG00000024163
Hn1lENSMUSG00000024165
TF binding sites/motifs
Number: 1             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid5aMA0602.1chr17:24695215-24695229TCTCTCAATATTAG-7.12
Enhancer Sequence
AAGGTGAGTG AGCCTTCCAC CCCTAACTGG TCTTATTAAC ATGGGGACAG TGGACAACTC 60
TTGGAATAGC CATTTCTTGG GCTAGACTGA GCTGTTCTCT CAATATTAGG AGGACCCACT 120
GCCTGTCACA TTTCTTCTGG TTTTGGGGTC TGAGTCTTTG ATTACCGCTC TTGCCTATAT 180
AGGTCCCAAG AAAATCTTAG TCAGGTAATG TCACCCCTGG CATCTCATAC TGGTGATAGT 240
TTAGTTGTGG GAGTACTCAG GACTATAACG AAGGGTTCTG TAAGGACAAA AATACCCTAC 300
AGAACATCTT GTAACAATGT GGGGCTTATT CTATCTCCGT GCCCTGGAAC TATGAGGTCC 360
TGTAGCCTGG TTGAGGGCCT CTTAACATGG ACATCTCCAC TGCCTGAATA CTGGTGTCCT 420
TTCTGAGCTC CTTACTATGT GTGTGCAGAG TCCTGGTTTG AAGCCAGGAG AGAGATGGGC 480
CTCAAGATGC ATGCAGAGTG ATGGAAGGCA TGGCTGGCCT CTCTGACCCT TCTCCCTGGA 540
CTAACAATTG GTATAATCCG GAGACTACCC CATCCATACT GATGCCACTG TGCTAGGCTG 600
TTTCCCTCCC CCGCCCCCCC AGCTCGCTCT CTTAAACTTG AATTCATTAA TTTAAACATC 660
ATTTCCGGCC CTGGAAGCCA GCCTTGCTTG CCATAAATAG AAGGGAACAA AAAGCAAAGA 720
GAACAAAAAC AGAGTGAGGA TATTACACTT AACTGGCTCT GCTGCTAGGC TACAAAAGGC 780
CCATTAGTGC TGAAAGGCAC CCAGAGTGAG GCCAGTCTAG GGGCTCTGTT CCTCAGTCTC 840
TGAGACCTAA GACTGTGCCT ACATGGTGGT TTCCATTTCC TTCTGTCCTA TCTCTGGTTG 900
GAAATATTTG TGGGGGATCA TCCTTGCTGA TTGAAGGGAC TCTGTTCTCC CAGGGAGAAG 960
ATGAAGCTGG GCCTCAGGGG CGGGGGGTTG GGGGGAGGAC TGGGGGCTTT CTCCTTACTC 1020
TGCTGGCCTA GCCTGCCAGA GGGAGGAGGC AGCTGGCTCC TGTGGGATGG GTTACATAAC 1080
ATCCACAAAT GGCCCCTCAG AACTGTTCCC CCTGAGCCCT GTTTCCAGCA TGGCGGCCAG 1140
CAATGGGCTG GTGGGGGGTG GCTGGCACTC ACCCTCCTGC TGACCACATG TGTCTGGAAT 1200
GTGCAGATGT TTCCTTTGGG GCTCCAGCTG GCCCTTACAC CCTCCTACCC CCTACATCTA 1260
GACTAAGGAG CGGGCACCTA GGCCACTCCC CACAGCTGAG GAAAAAACCA AGGTTGCTTA 1320
GCTCTTGGTC TGGGCTGTAG CTTGTGGGCA GCCTGTTGAG AGCCTTCTAT TGCAGCTCTG 1380
GAAAAAGGTT GGTCTTAACA ACTGGCCCAT CTTAGTAAGG GCTTGTACTG TTTACAGTGA 1440
CCCTCCTTGC TCTCCACCTT TGCATAGACC TATACACTTG CCTTTATATT CTTGCTATCC 1500
TTGTCTCAAA GATTTGCCCT GAGAGTGCCT GCTTTCCCTG TCTCACAGTG TCACCCCAAC 1560
TTGTGTAGCC TATGTGTGGA GACCCAGGGA GCACCCTGTT CCTCTTTATT AGAGGAAAAT 1620