EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-08244 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr15:85516270-85518990 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RREB1MA0073.1chr15:85517499-85517519CCCCCACCCCCCCACCCCCA+6.95
SP2MA0516.2chr15:85517599-85517616CAGGGGGGGGGAGTTAG-6.04
Spz1MA0111.1chr15:85516781-85516792AGGGTAGCAGC+6.02
Number of super-enhancer constituents: 16             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_02573chr15:85486145-85531265HFSCs
mSE_02940chr15:85441364-85534582TACs
mSE_03674chr15:85515153-85518157Cerebellum
mSE_03998chr15:85515653-85517495Cortex
mSE_03998chr15:85517536-85519348Cortex
mSE_05879chr15:85516267-85518711E14.5_Limb
mSE_06607chr15:85513603-85517494Heart
mSE_06607chr15:85517596-85518324Heart
mSE_06607chr15:85518376-85519830Heart
mSE_07161chr15:85513254-85516840Intestine
mSE_07161chr15:85517553-85518320Intestine
mSE_07955chr15:85513210-85519253Kidney
mSE_08956chr15:85516545-85518806Lung
mSE_09777chr15:85514797-85519202MEF
mSE_10695chr15:85512061-85519827Olfactory_bulb
mSE_12162chr15:85517606-85518202Spleen
Enhancer Sequence
AAAACAATCT CCACATTCAT TTTAATGTCT CCAATTCTGT CTTGTCTTGA TGTCTGACCG 60
GAGCCCATGC TGAATGCATT AGACTGCAGA ATAAATAGAG CATAGTTCTT GCCCTCGAGA 120
GAGAACCCCC CTGTCTAGTG AGCGCTGGGT GCTAACTTTT CTATATAAGC AGGTCAAGGT 180
ACAGAGAGGC TGGAGAGCTT TCCCACAGCC AGAGTCTGGC GTTGGACTCC CGTTTATTTC 240
CTGCCTGTTA GAGGCTGACT TTGGCCGGTT TCTCCTCAGA CACCCAACAC CAGTAAGGAT 300
CTTTCCTTTG GCCTGGAGTT CTGCTGCAAT AAAAAGGAGT TGTCCTGAGG GTCTAGGCCA 360
TGGAGGTTTG GGGTTGCTGG AGACCTCTCT GACAGAGCTA CCATCACCTC TCTGCTGGAG 420
TCTGCAGCTC TGAGTTTTCT GGGGGTCTAG GATACTTCCC TGGCTCAGGG TTTCTATACC 480
TATGTGGTCT GATGTGCTGT GGACCACACT CAGGGTAGCA GCAAGAGATG AGGAGGGAGC 540
CTGGTGTCCC CATTGTTTCC CATAGTCCTG AGGCAGGGAG CTACTTAGAA CTGGGAGCCT 600
GGATGCTGTG TCCCAGGTCA TGATGGGCTC ATAAAAGGCT AGTTCTCCGT GGTAAGTGTG 660
TCAAAGCACA GAGCAAGGGG GACTTCTAAG AGTCCCACCC AGCTGCATTA GTTGGTGTGG 720
CCCACGTTGG GGGCTTGTGT CCCCCAAGCC CACAGAGTCT CTTGCATATC ACAATGGTAT 780
GGAGCTCCTT TGATTCTTTA GGCCTCCATC ACTCAGGTTG TAGGCCCCGT AGCACACCAG 840
GCCAAGTGTG CCTGTGGGAG GAGAGCCATC GGTACCATCG AGAGAACAGT AGAGGACCAT 900
GTGGTGGTGA TCCCTGTCTC GCTCCCCAAC TCCCCCCACT TTACAAGTAC CAGCAGGCCT 960
GAGGCACACA GAGCATCCAC ATGGCTGGCA TGACTAATGC AGATATCTTC AGGAAGGCCA 1020
GGCTCCCACT GAGATGCCCG TGGGCCTACT CCCTTTGGAG GAGGCTTGGG TCGTGGGTTG 1080
AGAGCACCTG AGGAATCCAG GAGACTTCCT GGAGGTGGTG GACCGACAGC CCTGGGCTCT 1140
TCCCTAAAGC TGACCACCAT AGCTATGGCT GCAGGGCCCT GCGCCCAGTC TTACTCCTGC 1200
CACGTCCCAG GGCTCCCTGC CAGGCGCCAC CCCCACCCCC CCACCCCCAC CAGCCCTGAA 1260
CAGGCCACAT CTGCTGCAGC AGCCACGCCA GAGCTCCACC TCCTATCCTG TCCCCATGGA 1320
AACCAAAGTC AGGGGGGGGG AGTTAGCCAC TGACTGGTTT CCATTAGAGC AGCCTGCTTT 1380
TCTGGAGCCC TGCCCCTGAG CTTCTAGGCC TCCCCAGAGA CTTCCTCCTG CATTTGCTGA 1440
GCACCACTCA GTCTGTGCCA GGGAGCTCAA GGGTCCCAGC CCTGCCCACA CTAGCCAGCT 1500
TACATCAGGG AAGTATCAGG TGGGTTCAGG GCCCAGCCAA TCACTAGGGA TGCTTTGGGC 1560
CAGTTATGGT GTTGGGACTG ACCGAAAACC ACCACCACAC AGATTTTGTG TCTTAAAGAA 1620
GCTATGTGCC CAAGTCAGTC CTGCCTGGAT TCCAGAACTC CCACCCAATC GTAGAACCTA 1680
TGGGACCTTA GACCCCTTTT TCCAGTCTCT GGGCCTCGGT TTACCCATCC TCAACATGAG 1740
AGGGTTAGCA GGTTTCTATG TCCCTTGTAG TAGTATTTAA GTAGGGAGGG TGGGAAAGGA 1800
AGAAAGAAGA AAGAAAAAAC GGAGCCACAG CAGTGTGAGC TCCTCTGGGC TCCCAGGCTG 1860
CGGTTTTGTT TGCTTTCAGA GAAGGGGGTT TTGAAGGAAT CTTGGTTGTG GAATGTGTCT 1920
GAGACGGTGG TTGGAGAGGC CGCACACAAG CCAGCCAGAG CCCTTAGCAT CTGTTTGGCA 1980
CCCAGTGACC TAGCTATGAA TGCAGCGACA GGAAGCTCCA GGCCTGCCAG AGGGCTCTGC 2040
AAACGACCAA AGAGGTTTCC AGAGGTCAGA AACCTAGGCC TAGGATGAGA TCCTACTTAA 2100
AAAAAACAAA AAACAAAAAA AAACAAAACA AAAAAAAACC TCCCGTGTGT TCATCCCTAG 2160
GGAGGCCTGG GAAAGGGATA CATACATGGT GGCTTTGCAA AGTTCACCTG AGGGCTATAT 2220
GTGTCTGTGG CAGCTTCAAC CTGGCCTTTA CGCGGGTGGC ATGGTAGTGC ACCACCCTCC 2280
TCCTTCATGG AATCAGGAAG AGAATATGGA TGTATGCGCT GGCACTGACA CTGGCACTGG 2340
CTCTGGGGGC GGGGAGCACC TTTTGAGCAG CCTCCAAATG GGAAGCCGCT TGCATTGCCT 2400
TCAGTGCCTC ACTGTTTGCA TCTGCAAAAT GGGGACAGCG ACCCAGACTC GGTGTGAAAG 2460
CTAGAGGAAA AGAGGGGCCA GAGCTGGATA CATGCAGCAG GTAGGATCTA AGTGGGACCA 2520
GCATGGGGAC CTCATGAACC AAACAGGCCC CGCATCCCAG TTGCTGCTGC ATTCTAGTTG 2580
CTGCTGCCCA GGTACTGAGG CACCTGTCTT CACATTTTCT CTGATTCGTT CCTGATTCAA 2640
GTGCCGTGGC GGTCTCCTAC CCCTAGGTCT CTCAGGCTCA CTGCCCATCC CTCTGTCAGG 2700
GAAAGTAGGG CATGAAGATT 2720