EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-08154 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr15:82771420-82773920 
Target genes
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EWSR1-FLI1MA0149.1chr15:82772623-82772641GGAAAGAAGGAAGCTTGG+6.15
NEUROD2MA0668.1chr15:82772947-82772957GCCATATGGT+6.02
POU1F1MA0784.1chr15:82772241-82772255CTGATTTGCATATG-6.07
POU1F1MA0784.1chr15:82772249-82772263CATATGCTAATTAA+6.18
POU2F2MA0507.1chr15:82772241-82772254CTGATTTGCATAT+6.5
POU3F1MA0786.1chr15:82772250-82772262ATATGCTAATTA+6.44
POU3F2MA0787.1chr15:82772250-82772262ATATGCTAATTA+6.62
RFX1MA0509.2chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC+6.44
RFX1MA0509.2chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC-6.46
RFX2MA0600.2chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC-6.86
RFX2MA0600.2chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC+7.01
RFX3MA0798.1chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC-7.04
RFX3MA0798.1chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC+7.2
RFX4MA0799.1chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC-6.42
RFX5MA0510.2chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC+7.24
RFX5MA0510.2chr15:82772365-82772381GGTTGCCATGGGAACC-7.29
TCF3MA0522.2chr15:82773034-82773044AACACCTGCT+6.02
ZNF263MA0528.1chr15:82772530-82772551AGTGGAAGGGGAGGAAGGAGA+6.07
Number of super-enhancer constituents: 2             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04671chr15:82771154-82771936E14.5_Brain
mSE_11078chr15:82770325-82774378Olfactory_bulb
Enhancer Sequence
CACTCCACAC ACCCTCAGCA CTTGCTGGAA CGAATAAATT ACCTCATTTA GCCACAGAGC 60
ACGCCTGGCT GGAGTGTTGG CAGTTCAGCC AAGAGCCCTC GCGTGGAAAC CACCACGCTG 120
AAGGTGGCAA TATTTCACCT CACCTAGAAG TGTACTGTGA GCGCTGGAGT CTCAATGGAG 180
CAAGTGTTTG TGTGTGGCTG GGGAGGGAGG TACTGGATGA TAAGCACTGG TTTAAATACA 240
TACGACATGG AGAAACCTCC AACCCCAACT GGACAGGGCC CACCATGCTC TCTGAGTCTC 300
TTCACCATTC CACAGGGGAC AAAACAGGAA AAGCACCTCC ATTTCATTGA GGTGGGCACT 360
GAACAAGAGA TGGCCCAAAG AGGCCTCGTT TGTCAGGCTG GCATCAATGG GGCTTGTTCC 420
TCCCTACTTG GGTGAGTGGT AACAGGGGTG GGACACAGCA GCAGAGCCAC TGGAGAGCAG 480
CAGTCCTGTA CCTTTCACAC AAGCAGGGAT GGGCAGGGGA GAAAAGATGA GCCAGACCCT 540
GCTGGAGCCT AGGCAGGGAA TCACCGTGGC TTCTCCCCAT GTGTGCCAGC CCATTCCTCG 600
GCATCCCAGT TGGCCATGCT CCCAGAGCCC TATGGGGCAG GCAGGCCCAG GCAGCAAAGA 660
CCCTCACTGG AGGTCCCAAC AAGCCCCAGC ACAAGGCTGT ATGCCAGGGA TGGACTGGGT 720
CCCGGTACCC ACAAACATCC CGGCACGTTT ATCTGCCAGA AGCCCTAGCC ATGGCCACAG 780
ACCCTGCTAG GACACCCTAG GCCCCACCCT GTTTGCCAGG CCTGATTTGC ATATGCTAAT 840
TAAGACACAC ATCCCTTGCT CCCCTTGGAG CCAGCTTGTT TGGGGAACGG CTGGATCTGG 900
CTATACCTGT ACCGTGCTGA TGTCACGCCG AGCTATTTCC AGCCTGGTTG CCATGGGAAC 960
CACAAGGCCT CAGCTCCAGT TAGGAGTTCA ATATATAATT TACTTACTCC CCCATCCCCC 1020
CCAGCCCCAC CCCGAAGAGA CTGGGGCGTA TGGGGAACAA TCGGCTAAAA TATACAATAA 1080
CACCCTTCAC TTCCCTCAGA GGCCTGTGAG AGTGGAAGGG GAGGAAGGAG AGCCACACAG 1140
TGGAACGGTA AATCCATTTT TGGAAAAGGG GGACGGTAGT GGGGAGATCG CTTCCTTCTT 1200
TGAGGAAAGA AGGAAGCTTG GCACTTGGGT GCTTCCACAG AGACTCAGGC TTGGCCAGGG 1260
GTGACCCAGA GCCTTCTGCC CTGTGACAGC CCAATGCCGT CAGGCATGCT TTCATCAGGA 1320
ACTTCAGTTC CTCAGGAAGA ACCTGCCTGG CCCCACGAGA GCTCCTAGGC TTATAAAATC 1380
ACTACTAACT CAGCTGCCTC AGCTTCGGCA CCTCTTAAAC ACACAGATGT TCCCAGGTCC 1440
TGCTGCCAAA TACAGGGGCC ACCTGCTACC TCCAGGCCCG GTGTGTGGTG TACCTTTGAT 1500
GGACCCAGAT GCTGGCTGAG GCCAGGGGCC ATATGGTCAC TTAAAGGTGG CACTTGCCTT 1560
ACTGAGGCTC AGGCCCTGCT ACTCTGCGCC TGACAGTTCT ACAGGCAGTA TTTAAACACC 1620
TGCTCTGTAC TCCCTGCGCT TTGGGGTGCT AGGGAGCCTG GAGGGCTCAG GCACAGACCT 1680
GTGCACAGGG AGGCCCCAAG CCAACTGCAG GAGAATGGAC CCTGGTACTG AGAAGGTCCA 1740
CTTTACCAGT AACGTGAGCA CAGGGCTGCT GCAAGGACAT CTCAGTATGT GTCTATCAGA 1800
GGTAGGCAGG GGACATTGCT GAGGCACAAA TACAAGTTGC CTCTCTGATG CTGCCTTTGT 1860
GCCGCACAGG CAGGCAGGCA GACACCCCGC GCAGGACTAC CTGCTGGCCC AGCCTAAGTG 1920
CTCCCAGCTT CCCCAGCCAC ACTTAAGCTT GGATAGCCAT GGAAGGCCAC AGCGGTCCTC 1980
TCTGGGTGTT GGGGGAAGAC AGAGGGTCCT AGCTTGGGGG TTCTCTCATC CTCAGCTTCA 2040
GGACCTCTGG GTTTGGGGAT CAACAGGACC CAGGAGGACT TTGCAAGTCA CCTCCTTTTC 2100
TTACCTTTAC TTCCTTTCCC CTAAAATTAC TCCACTTTAC TCTCATTCCC AATCTTTAGA 2160
ACCCTAAGTA TCAGAACCCA CATTTCCTTG ATGGAAAAAC TGAGGCAGTA AATGAACTAC 2220
TAAACAAACC GTCAGACTAA GACTTCTAAG AGCTTGACGT TCTTCCTCAA GAGCCTACAC 2280
TGACCCCATG GTGGACAGGA ACAAGATGAG ACCAGTCTAC TCCCCGAAGC AGGGATGTAT 2340
CCTCCTATGC TATAGAAACT ACCACCCTAC CACAGCCAGG TCTCTCCCAG CAAGCCTGGT 2400
TCTCCCTCCC ACCTCAGTGC CTAGACTCCC CTAGCCCCAA CCCTCCCAGA CAGAAGCCCA 2460
AACCATGGCC TACGGCATGG CTCTTGGCTC AGCGAAGTTC 2500