EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
MM090-07740 
Organism
Mus musculus 
Tissue/cell
Limb_E11.5 
Coordinate
chr15:27725490-27729100 
Target genes
Number: 4             
NameEnsembl ID
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr15:27726251-27726262CTCAAGGTCAT+6.02
EsrrgMA0643.1chr15:27726252-27726262TCAAGGTCAT+6.02
FOXB1MA0845.1chr15:27725685-27725696ATATTTACATT-6.32
RARA(var.2)MA0730.1chr15:27727854-27727871AGGTCACTTAAAAGTCA+6.57
RESTMA0138.2chr15:27728133-27728154ACTGCGGTCCTTGGTGCTGGA-6.6
Rarb(var.2)MA0858.1chr15:27727854-27727871AGGTCACTTAAAAGTCA+6.69
ZNF740MA0753.2chr15:27726342-27726355CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr15:27726343-27726356CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr15:27726344-27726357CCCCCCCCCCCCC+6.03
ZNF740MA0753.2chr15:27726345-27726358CCCCCCCCCCCCC+6.03
Number of super-enhancer constituents: 5             
IDCoordinateTissue/cell
mSE_04050chr15:27725612-27728748Cortex
mSE_04987chr15:27725671-27727204E14.5_Heart
mSE_05507chr15:27725588-27728659E14.5_Limb
mSE_10722chr15:27725603-27729531Olfactory_bulb
mSE_12289chr15:27725943-27727225Spleen
Enhancer Sequence
TAAATATAAC TTTTATTACC GAAACCCATA GGACTTAAAC TCTCTAAGTC CATTTTACCC 60
CCTAGTGGGG GAATCACTCT TAAAAACCAT TCCTTTGGAT TCAATCATGA GCCCTGTACC 120
TATCAGGTTG ACTTCTGAGA GAGATTTTCC TATAGAGCAG GCATATGTAT GGAAATATTT 180
GTTAGTCTCT TCAAAATATT TACATTTTGA TTGCACGTTT AATGGAGTCT CCCACTCAGA 240
GCAAACGGCA GCAGTTTACG GAGTGGAGAT GGCTTGCCGG CTCTCAGTGC ACGCTGCAAA 300
ATCAGCCTGG ATCTCTTCCT CCAAACTGTG CAGAGTTATG CATCTTTCTA AGTTATGAAC 360
TTACGAATCA AACCACTTTG TCAGACAGCT CCTCTGTGAC CTCAACAGCT TCCTGTCTCC 420
TTTGGAGTCT CTTAGCTTCC TGCAGGAGTC ACATTCTTAA GACTAACATT TCACAACGGA 480
TTTTGCCAAT ACAATGTAAA GGCCTCTCGC CTGTACACCG TCCATTTCTA CTGATGGATT 540
CTGGAGGGAA CATAAGAGGT ACAGAAGGCT GAGTTCCGAG CGCGGACTTT CGCCCTCTGC 600
TCCTCTTGTG TTCTGTGTGG GCGTCTACAG AGGTCTTTTC TGGGCATAGC CACTACTCTT 660
TGGGCTGACC GGTCATGCCG TGTGCTGAGC AGCCTCAGAG TGGGCTGATC TACTGATCCT 720
GGGACACTCT GGGCAGTGTG GTCATTCCAC ACTGTTGACT GCTCAAGGTC ATGATTTTCC 780
CAAAACTTTC AAGCCAAGCA TGGGACAAGG ACAGAGGTGT TTATTATTTG AAGGGCCTTT 840
CAAACAGGCT CACCCCCCCC CCCCCCCCGC CTGCACTGTG AGCCAGCTCC GGAACTCTTT 900
ATTGTGAGTG GTCTGGAAAT AGCCCTGTGC TCGCCTCCTC CTCTCCTCTT CCTGTGCCTC 960
CCCATGAATG TAGAACTCTG AATTTACTAG AAACAAATAT TACGGCTTTG TTCTCTGACG 1020
TAGGTTCCTC TTCTTATAGT TCAAAAAGAA CTGGTTTCAG CTGCATTACC CACTCACTGT 1080
GTACCTTAGT TTAGAGTGAG CGTCTATAGC CAAAGCCATC TGAATTCTCT GTGTCATGGA 1140
AGTTAGTCCA GGACCTTGGC CAAAGCATCA CCTCACGTCT CCCTGAACAC AGGGATACAT 1200
AGTCAGTCTA GTCTGCCAGG CCCACCTCCA GAGGCCTGAG TATAGTTTAT TCAGGGCCGT 1260
GGCCAGCTGA GCTGCACCAG GAATCAGGGG CGAGCCTGAG GAAACAGAAC AGGTTCACTC 1320
CATGCGGCTG CTCTCACATG ATGCAACCCC AAGAGACCAA GCACTTCGAG TGGAGAGCTC 1380
CCATGGCACA CCTTCTGCTT CTGACAGCTC GCACTCTCCA GGATGTACAC TCTGAAGGAG 1440
GAGGCCCTCA TCGGACTGGT TATCTGCACT CTAGTGTCTC TATATTGTCA GTGTTAAAGT 1500
CTATCTTCCA GAGATGGGAG GTGGAAGAAG GTCCGGAGCC CCAGTCCCTC CCACAGCCCT 1560
GCTGGCCTGT TTGCCATCCC CTGCTCAACC ACAGTCCCTC TTTGTTTTCC CTCACCCAGC 1620
ACCTATGGCT TATTGGTTTG CTTGCTTGTT TGTTTTTAAG ACGGGGTATT GTTAGGTAAG 1680
CCAGGCTGGC CTCGAACTCA CAATCCTATG TCTGCCTCCT GGGTGCTGGG ATTGCAGGTG 1740
TGCATCACGG CCCAGCAGGC CATTTAAAAC AGGCGTGGGA AGATGGGTCT CTTGCTCACT 1800
GTTTATGCCT TGGCAGCAGC TATCATTTTC TGACGACCTA ACATGGGTGC TGCCAATGCC 1860
TGCTCTTGGA TTGTTCCTGT TCTGAGAAAT GCTTAATGTA AAGCTGGAAC GGGGGAAAGG 1920
CTCCCAACAC CAGGCCCTCT GCAGAATAAT AGCGGCTTGT GTGGCTCCGT AATTATATGC 1980
TCCGCAGAAA GCACTTCTTA ATCACGGGGT CTGGGATTCA TTACTCGGCC TCGGATGTGC 2040
AGTGCCCAGG AGAGGGGCGA TGTTTTTAAT TCTTGGTGCG ACTCCACGTT CTTGAGTTTT 2100
TCTTCCCACA GGGATTTACA TTAGCAGCTG TTCAAACAGA ATAAAACTGT GCTTTCCAAT 2160
TGAATTAAAA AGCCGCACAC AGATCCTCCA TTGTATGTGT TTTTAAGAAC ACGTGGGCAG 2220
GTATGGGTTT GAGATGCCTT CGTGAACCTG GGGTGTTCTC TGGTGGCAGG GTCCCTGTGG 2280
TATGACGCAA ATGCCCAAAC ACGCTGGAAT CTATTGTTAA TGTCACTAAA GACTCTGATA 2340
CCCTACACTT TTTGGAACTG TTTTAGGTCA CTTAAAAGTC ACGAGTTATT TCCGTCTCAT 2400
CTGAGACAGG CAGCTTAGGA GTCGGCTGCT GGAGTGAACG GAGGGAAATC ATGAGATGCT 2460
TTGGGGAGGA TGCTGAGGCC CAGGCTTGTG GAAGGCCACG GGTACCCAGT CTCGACTGAG 2520
GCCTGCTGTC AGGATGAGGA GGTCTGGAGG TGAGGGCGAC TGTGAGTCAC ACTTAGTTCA 2580
GAACAGGCTC CAAAACTGCA TTGCTCTTGG TGTCCACGGT GCAGCCTGGA CTGGCCCCAT 2640
GCTACTGCGG TCCTTGGTGC TGGAGTCTAC ATCTTGAACA TTCTATCCAA GGTGAATCAG 2700
AGGGCGAGAC CGGAGCTCTG TGACTGGGAC GAGCCTTCTT CTGCTGTCTA TACTGTGACT 2760
GGAAGGGCTG GCGTTGTCTT CAGGGCTGGG AATGTGGTTT GGATGGGGCA CGGTAATCAC 2820
TACTACTGCT TGGTCTCCAA GGGAAAAACA CTTGGACATA CTCTATGTTT TGGGGTCAGC 2880
TGGGAGTATG GGTGGCCTGG GTATGGCTTT TTGAGTATAA ACATACCTGG TGACATGATG 2940
AAGTTCCCAT CCCCATCTGT AGACCTCAGG GAAGGAGTGG GGAGACCTGG CCTCATCCTA 3000
AACCCACAGG GTAAAGAAGA GCACAGGAGC TATCAGGCGC AGCCGTGACC TCACCTGTGC 3060
AGACGATAGG GCTGAGCTGA GGACAGCATC CATGGGGGGC AGATAAGCCC TCAGACACTC 3120
TGTAATTGGC ACCCACTGTA AACACATGCT GACTTCATCC TGACATTGTG GTTATACTCG 3180
TGGTCATGAT CAGAATGAGC TGTGGCGCTC AGTGACTCCA GCACAGGCCC TAACCATGCA 3240
GCCACCCATC CCAAGAAATG ATAAGTCATT TCAGGAGTAG CCTTCGGCAC AACAGCATTT 3300
ATTTCTTTGA ATTTCGAGTG ATGGCCCTAG AAAATCAATT GCCCAGTGTA TGACGTTAGC 3360
GTTACAGAGA GAACAGGATT GGACAGTGGG GTCACAGTGG GGGGGAGAGC ACTTGCTTCT 3420
CTCCTTGCTA CCTTGCCGAG CCTATGCTCC AGCTGGGGAA TCCTCAACAT ACCCCTCTGT 3480
GGCCCGGCAA ACAATGTGTC CATTTTCTCT GTGTGTGGCT ACCTTTCAGT GCGCGGGGAG 3540
TTTCTCTGCT CCTTTTTATC AGCCGGTGAT TTATTTGTAG CTCTGGTTTA TTTGTAGTTC 3600
TGTCTACTCT 3610